Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0FIM3

Protein Details
Accession A0A4T0FIM3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
223-252PDDSPKQRITRQNKRGSKKRRSREDDDESFBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
232-244TRQNKRGSKKRRS
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 16
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006594  LisH  
Pfam View protein in Pfam  
PF08513  LisH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50896  LISH  
Amino Acid Sequences MNAELNGYIYDYLYKNNLVKTAQQFLSETQQKPVQNALPEPSVKIDTPKSYLFEWFMINLELQYQNQFRSPNYYEINHNLQQRYDISQKKYMMKQRVQPRPPYPPNGQQGAAGAGAAAQMVRPGMSIGAAGGGAGAGAGGGGAGMIGMSPGMSPSMPPPPMPGHHPSPQLHQAMQLQAQHQQAQVHAQQQAQAQAQAQQQQQQQQQQQQQHYPQQPQINGYSPDDSPKQRITRQNKRGSKKRRSREDDDESFNNDDGGGTPSQENNSPAITPSDILANMDQQQTPNDENGQQQQQQQVNTGTSGNAPQQTSHTPSQTPQQSLPPPPGASAQQPPPPPQSTQPNDSFIDFNMLNDLPQMNELNDIFNDPLS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.22
3 0.24
4 0.28
5 0.26
6 0.33
7 0.36
8 0.42
9 0.39
10 0.38
11 0.37
12 0.36
13 0.44
14 0.45
15 0.41
16 0.37
17 0.42
18 0.41
19 0.41
20 0.45
21 0.4
22 0.36
23 0.38
24 0.37
25 0.37
26 0.37
27 0.36
28 0.33
29 0.31
30 0.27
31 0.29
32 0.3
33 0.28
34 0.32
35 0.33
36 0.32
37 0.31
38 0.33
39 0.31
40 0.27
41 0.25
42 0.21
43 0.2
44 0.18
45 0.17
46 0.13
47 0.14
48 0.13
49 0.13
50 0.17
51 0.17
52 0.18
53 0.21
54 0.22
55 0.2
56 0.27
57 0.3
58 0.32
59 0.34
60 0.35
61 0.36
62 0.41
63 0.47
64 0.43
65 0.46
66 0.4
67 0.37
68 0.37
69 0.34
70 0.34
71 0.36
72 0.38
73 0.37
74 0.43
75 0.47
76 0.51
77 0.57
78 0.6
79 0.62
80 0.61
81 0.64
82 0.67
83 0.73
84 0.72
85 0.74
86 0.72
87 0.73
88 0.73
89 0.72
90 0.68
91 0.66
92 0.65
93 0.6
94 0.54
95 0.43
96 0.38
97 0.32
98 0.26
99 0.17
100 0.11
101 0.07
102 0.06
103 0.05
104 0.04
105 0.02
106 0.03
107 0.03
108 0.03
109 0.03
110 0.03
111 0.04
112 0.04
113 0.04
114 0.03
115 0.04
116 0.04
117 0.03
118 0.03
119 0.03
120 0.02
121 0.02
122 0.02
123 0.01
124 0.01
125 0.01
126 0.01
127 0.01
128 0.01
129 0.01
130 0.01
131 0.01
132 0.01
133 0.01
134 0.01
135 0.02
136 0.02
137 0.02
138 0.03
139 0.03
140 0.03
141 0.05
142 0.11
143 0.12
144 0.12
145 0.15
146 0.17
147 0.19
148 0.23
149 0.25
150 0.25
151 0.3
152 0.35
153 0.33
154 0.36
155 0.41
156 0.38
157 0.33
158 0.31
159 0.28
160 0.24
161 0.25
162 0.22
163 0.16
164 0.2
165 0.21
166 0.19
167 0.19
168 0.17
169 0.15
170 0.17
171 0.18
172 0.16
173 0.17
174 0.16
175 0.18
176 0.18
177 0.21
178 0.18
179 0.17
180 0.14
181 0.17
182 0.19
183 0.22
184 0.21
185 0.23
186 0.25
187 0.31
188 0.35
189 0.36
190 0.39
191 0.4
192 0.46
193 0.46
194 0.48
195 0.47
196 0.48
197 0.5
198 0.5
199 0.47
200 0.46
201 0.45
202 0.42
203 0.39
204 0.36
205 0.33
206 0.3
207 0.28
208 0.25
209 0.2
210 0.22
211 0.24
212 0.23
213 0.22
214 0.26
215 0.29
216 0.34
217 0.44
218 0.51
219 0.58
220 0.67
221 0.74
222 0.77
223 0.82
224 0.85
225 0.86
226 0.87
227 0.86
228 0.86
229 0.87
230 0.86
231 0.85
232 0.85
233 0.84
234 0.78
235 0.74
236 0.66
237 0.59
238 0.52
239 0.43
240 0.33
241 0.24
242 0.18
243 0.12
244 0.13
245 0.09
246 0.09
247 0.1
248 0.11
249 0.12
250 0.14
251 0.15
252 0.13
253 0.14
254 0.13
255 0.13
256 0.14
257 0.14
258 0.12
259 0.11
260 0.11
261 0.11
262 0.12
263 0.11
264 0.11
265 0.14
266 0.15
267 0.16
268 0.14
269 0.16
270 0.18
271 0.19
272 0.19
273 0.18
274 0.18
275 0.21
276 0.26
277 0.31
278 0.31
279 0.32
280 0.38
281 0.39
282 0.38
283 0.39
284 0.35
285 0.31
286 0.28
287 0.26
288 0.19
289 0.16
290 0.18
291 0.18
292 0.19
293 0.18
294 0.18
295 0.21
296 0.25
297 0.3
298 0.32
299 0.31
300 0.29
301 0.3
302 0.39
303 0.42
304 0.41
305 0.38
306 0.42
307 0.46
308 0.48
309 0.52
310 0.48
311 0.42
312 0.39
313 0.4
314 0.34
315 0.33
316 0.36
317 0.36
318 0.37
319 0.4
320 0.43
321 0.47
322 0.47
323 0.45
324 0.46
325 0.51
326 0.51
327 0.55
328 0.55
329 0.53
330 0.52
331 0.51
332 0.44
333 0.34
334 0.34
335 0.27
336 0.22
337 0.22
338 0.2
339 0.18
340 0.19
341 0.18
342 0.12
343 0.15
344 0.17
345 0.12
346 0.16
347 0.17
348 0.17
349 0.17
350 0.19