Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0FDM6

Protein Details
Accession A0A4T0FDM6    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
56-81ASTSAATPKKVRKRSKASSASLNRYHHydrophilic
86-111SESTEDVAQRRKRKQKAQHYDYNCISHydrophilic
635-655VGEGAQKRKVRRDIQRKPANNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
64-70KKVRKRS
Subcellular Location(s) mito 12.5, cyto_mito 10.333, cyto_nucl 7.333, cyto 7, nucl 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045116  Clp1/Grc3  
IPR032319  CLP1_P  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0051731  F:polynucleotide 5'-hydroxyl-kinase activity  
GO:0006396  P:RNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF16575  CLP1_P  
Amino Acid Sequences MVLSAIAKRKLERSRSESGQTNGSDVQNDTDTQEIAINAFFVDSAIQEEEMQRQEASTSAATPKKVRKRSKASSASLNRYHDKSGSESTEDVAQRRKRKQKAQHYDYNCISHFGTFPETTLFDEKCIYVGLSDEASLILAGKCSLQVLKGTLSILGGRIGASEVQHKVYAPTCFPLPTLSAIDDTTALKGIPQSLAHNKVVLKLTELDDGLQGLGNAIPDFKSAFECPYQGSYDGWDQIKGLYPILEPTANVYSFLVPPSWTSAARNITDNSLRSAEPYIGIVKGWKNTGKSSFTRFLCNTLRSSHKRVAYLECDVGQSEFMPSGCVSLHVLDEYLLGPPFTHPRIPTKSHFIGELSPANDPPNYIEAVRDLIEHYHEHVAHSLSDSGDYTPVPLIINTQGWVKGLGAEMLQGIFNAAGNFELIEMSASSISESVDEEDGLARVEEEEETSIKIDAIATAENPMLTRYHSADYRNLMTTTYFHAKISANGAVLWDFTLPLTHHTPLCVDYISDLSYMCILNGEDVVYQHTLAAINATVVALIEGHAEVESDGSLVRRDDLLPYKQCRVLGYGLVRAIDSSVNQLQILTPLDASTCRRVDVLAKGKIDLPVYASLDWTQDSIDYGNVLYVTNEAAVGEGAQKRKVRRDIQRKPANN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.62
2 0.66
3 0.7
4 0.69
5 0.62
6 0.6
7 0.51
8 0.48
9 0.43
10 0.38
11 0.34
12 0.27
13 0.28
14 0.22
15 0.22
16 0.2
17 0.18
18 0.17
19 0.15
20 0.16
21 0.13
22 0.12
23 0.11
24 0.1
25 0.08
26 0.08
27 0.07
28 0.05
29 0.06
30 0.05
31 0.08
32 0.09
33 0.1
34 0.11
35 0.12
36 0.17
37 0.18
38 0.2
39 0.17
40 0.16
41 0.16
42 0.16
43 0.18
44 0.14
45 0.14
46 0.2
47 0.24
48 0.26
49 0.33
50 0.42
51 0.49
52 0.58
53 0.66
54 0.7
55 0.77
56 0.84
57 0.88
58 0.88
59 0.83
60 0.84
61 0.83
62 0.81
63 0.78
64 0.74
65 0.67
66 0.6
67 0.57
68 0.49
69 0.42
70 0.38
71 0.37
72 0.35
73 0.33
74 0.31
75 0.29
76 0.34
77 0.33
78 0.31
79 0.33
80 0.37
81 0.43
82 0.53
83 0.62
84 0.65
85 0.74
86 0.82
87 0.84
88 0.88
89 0.88
90 0.88
91 0.85
92 0.84
93 0.78
94 0.72
95 0.61
96 0.52
97 0.44
98 0.35
99 0.29
100 0.22
101 0.23
102 0.18
103 0.18
104 0.18
105 0.18
106 0.19
107 0.23
108 0.21
109 0.17
110 0.18
111 0.18
112 0.16
113 0.16
114 0.13
115 0.08
116 0.09
117 0.1
118 0.09
119 0.09
120 0.08
121 0.07
122 0.07
123 0.07
124 0.07
125 0.06
126 0.05
127 0.06
128 0.06
129 0.06
130 0.07
131 0.07
132 0.07
133 0.09
134 0.11
135 0.12
136 0.13
137 0.13
138 0.13
139 0.13
140 0.12
141 0.11
142 0.1
143 0.08
144 0.07
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.08
149 0.11
150 0.12
151 0.14
152 0.15
153 0.14
154 0.16
155 0.19
156 0.21
157 0.18
158 0.18
159 0.18
160 0.18
161 0.18
162 0.17
163 0.15
164 0.15
165 0.16
166 0.14
167 0.14
168 0.14
169 0.14
170 0.14
171 0.13
172 0.1
173 0.09
174 0.08
175 0.07
176 0.08
177 0.09
178 0.09
179 0.1
180 0.14
181 0.2
182 0.26
183 0.26
184 0.28
185 0.27
186 0.29
187 0.31
188 0.27
189 0.23
190 0.2
191 0.21
192 0.21
193 0.21
194 0.16
195 0.14
196 0.14
197 0.11
198 0.09
199 0.07
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.06
208 0.06
209 0.09
210 0.09
211 0.11
212 0.12
213 0.13
214 0.13
215 0.15
216 0.16
217 0.14
218 0.14
219 0.14
220 0.15
221 0.18
222 0.17
223 0.15
224 0.14
225 0.14
226 0.17
227 0.15
228 0.13
229 0.1
230 0.1
231 0.11
232 0.12
233 0.12
234 0.08
235 0.11
236 0.13
237 0.12
238 0.13
239 0.12
240 0.12
241 0.12
242 0.13
243 0.1
244 0.08
245 0.08
246 0.12
247 0.13
248 0.12
249 0.13
250 0.18
251 0.21
252 0.22
253 0.23
254 0.2
255 0.22
256 0.24
257 0.23
258 0.21
259 0.19
260 0.18
261 0.16
262 0.17
263 0.14
264 0.11
265 0.12
266 0.1
267 0.08
268 0.09
269 0.1
270 0.1
271 0.12
272 0.14
273 0.15
274 0.16
275 0.19
276 0.23
277 0.26
278 0.27
279 0.31
280 0.36
281 0.35
282 0.39
283 0.37
284 0.38
285 0.37
286 0.37
287 0.33
288 0.29
289 0.36
290 0.35
291 0.4
292 0.4
293 0.39
294 0.39
295 0.4
296 0.41
297 0.36
298 0.33
299 0.29
300 0.24
301 0.21
302 0.19
303 0.16
304 0.12
305 0.08
306 0.06
307 0.06
308 0.05
309 0.05
310 0.05
311 0.06
312 0.05
313 0.06
314 0.06
315 0.06
316 0.06
317 0.05
318 0.06
319 0.05
320 0.06
321 0.05
322 0.06
323 0.05
324 0.05
325 0.05
326 0.06
327 0.08
328 0.09
329 0.11
330 0.12
331 0.18
332 0.24
333 0.29
334 0.31
335 0.36
336 0.37
337 0.36
338 0.35
339 0.3
340 0.25
341 0.24
342 0.24
343 0.17
344 0.14
345 0.14
346 0.14
347 0.13
348 0.12
349 0.11
350 0.09
351 0.09
352 0.09
353 0.09
354 0.08
355 0.1
356 0.1
357 0.09
358 0.08
359 0.07
360 0.09
361 0.09
362 0.11
363 0.12
364 0.12
365 0.12
366 0.14
367 0.14
368 0.12
369 0.13
370 0.12
371 0.09
372 0.09
373 0.09
374 0.08
375 0.08
376 0.07
377 0.07
378 0.06
379 0.07
380 0.07
381 0.06
382 0.07
383 0.08
384 0.09
385 0.08
386 0.09
387 0.09
388 0.09
389 0.1
390 0.09
391 0.08
392 0.08
393 0.08
394 0.07
395 0.06
396 0.06
397 0.06
398 0.06
399 0.04
400 0.04
401 0.04
402 0.04
403 0.04
404 0.04
405 0.04
406 0.04
407 0.04
408 0.04
409 0.04
410 0.03
411 0.04
412 0.04
413 0.04
414 0.04
415 0.04
416 0.04
417 0.05
418 0.05
419 0.05
420 0.05
421 0.06
422 0.06
423 0.06
424 0.06
425 0.07
426 0.07
427 0.07
428 0.06
429 0.05
430 0.04
431 0.05
432 0.05
433 0.05
434 0.06
435 0.07
436 0.07
437 0.08
438 0.08
439 0.07
440 0.07
441 0.07
442 0.06
443 0.07
444 0.07
445 0.06
446 0.07
447 0.08
448 0.08
449 0.08
450 0.08
451 0.07
452 0.08
453 0.1
454 0.11
455 0.14
456 0.17
457 0.2
458 0.23
459 0.27
460 0.29
461 0.29
462 0.27
463 0.24
464 0.22
465 0.21
466 0.22
467 0.24
468 0.21
469 0.19
470 0.22
471 0.22
472 0.23
473 0.26
474 0.22
475 0.17
476 0.16
477 0.17
478 0.14
479 0.13
480 0.12
481 0.08
482 0.06
483 0.05
484 0.08
485 0.07
486 0.11
487 0.15
488 0.16
489 0.16
490 0.17
491 0.18
492 0.17
493 0.19
494 0.15
495 0.11
496 0.11
497 0.12
498 0.12
499 0.11
500 0.1
501 0.08
502 0.1
503 0.09
504 0.08
505 0.08
506 0.07
507 0.07
508 0.08
509 0.08
510 0.07
511 0.07
512 0.1
513 0.09
514 0.09
515 0.09
516 0.09
517 0.09
518 0.08
519 0.09
520 0.07
521 0.06
522 0.06
523 0.06
524 0.05
525 0.05
526 0.05
527 0.04
528 0.04
529 0.04
530 0.04
531 0.05
532 0.05
533 0.05
534 0.05
535 0.05
536 0.05
537 0.04
538 0.05
539 0.05
540 0.07
541 0.07
542 0.09
543 0.09
544 0.1
545 0.16
546 0.23
547 0.3
548 0.37
549 0.41
550 0.45
551 0.47
552 0.48
553 0.43
554 0.4
555 0.35
556 0.34
557 0.33
558 0.32
559 0.3
560 0.29
561 0.27
562 0.23
563 0.21
564 0.16
565 0.13
566 0.14
567 0.15
568 0.16
569 0.16
570 0.16
571 0.15
572 0.17
573 0.19
574 0.14
575 0.12
576 0.11
577 0.12
578 0.15
579 0.19
580 0.23
581 0.21
582 0.21
583 0.21
584 0.22
585 0.26
586 0.34
587 0.39
588 0.39
589 0.39
590 0.39
591 0.42
592 0.43
593 0.4
594 0.3
595 0.24
596 0.23
597 0.24
598 0.23
599 0.22
600 0.2
601 0.21
602 0.2
603 0.17
604 0.12
605 0.1
606 0.11
607 0.11
608 0.1
609 0.09
610 0.09
611 0.1
612 0.1
613 0.1
614 0.08
615 0.08
616 0.08
617 0.08
618 0.08
619 0.06
620 0.07
621 0.06
622 0.07
623 0.12
624 0.16
625 0.18
626 0.25
627 0.3
628 0.35
629 0.45
630 0.54
631 0.58
632 0.65
633 0.74
634 0.79
635 0.85