Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0FXD1

Protein Details
Accession A0A4T0FXD1    Localization Confidence High Confidence Score 21.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
105-130GEDDAKKWAKRLKRKQKEAAERVAKABasic
293-320EGDVGFKKPKTKKKKKSTRKAESREEEGBasic
353-376VALARQRRNKLKKSARQKKPEEIAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
110-123KKWAKRLKRKQKEA
299-313KKPKTKKKKKSTRKA
358-372QRRNKLKKSARQKKP
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12.833, mito_nucl 11.666, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045347  HIND  
IPR005011  SNU66/SART1  
Gene Ontology GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF19252  HIND  
PF03343  SART-1  
Amino Acid Sequences MSQVAESLSLEETNAMRIKLGLKPIQAEPEADKGGEDKEKSAESNYATLKADEQKHKDDESQRLKIEKSVASFTPPPPSHTTYRARNKLELNKRLKGKTLGDDTGEDDAKKWAKRLKRKQKEAAERVAKAQAEQDNLYQQEDYNESHLSGLKVSHDMEDFAEGKDHILTLKDGGVLDEDDDELQNLDLAEDERGKERAELRKGIKAHQYTGLDDEEFGADGTAKKAGLLSKYDDELGGASESGFRLGDAPAPASSKAANEEDNALTQGDEKVNKTLLSLDYLKNQEASDFLKEGDVGFKKPKTKKKKKSTRKAESREEEGEQNQMEVDVKPPPPRERANLEHSNFIDDDDLQVALARQRRNKLKKSARQKKPEEIAAELKSLEEVDNQQQSSSAGGLEFDDTSEFIRTVQLAPQQESYESRVKAEPDADLDVGLSGPTADAAAMAEDMDVTVEDVDGIKQQEGSGEAEEAVKEEDSTPETSASAYAQPTAGKGLGSLLASLKQQGQIETLTPEQRAKEEQQQANIKFLAEQRAREIHREEERMRIRSDTSKTQQQRDYENRQREARSAQEDKEAFERNYKPSVDIKYFDETGRSQSTKEAWKYLNYKFHGKGQGTKGKEKMLKKVENERKQLAMTAGETPLNMMSSFQARQEAMGSAHMVLSVGNRGAAPQTDTMFDAGAGLSKGKKRDDGDRAGSVGVSERGMSAGVASVNTNASGDTAKAHTPQLPQQGTSSFVPLGGTQSTASGTPSEKRTKSSFAPIGGGTGGGTGSASGGGTPQAGIKLGSKISFGKRKSEVDDGGRDNKQVKLG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.16
3 0.15
4 0.17
5 0.2
6 0.22
7 0.3
8 0.3
9 0.3
10 0.35
11 0.37
12 0.42
13 0.4
14 0.38
15 0.34
16 0.35
17 0.34
18 0.29
19 0.27
20 0.21
21 0.25
22 0.28
23 0.26
24 0.22
25 0.24
26 0.26
27 0.27
28 0.29
29 0.28
30 0.25
31 0.3
32 0.3
33 0.31
34 0.3
35 0.29
36 0.31
37 0.35
38 0.41
39 0.43
40 0.47
41 0.5
42 0.53
43 0.56
44 0.59
45 0.59
46 0.61
47 0.61
48 0.63
49 0.6
50 0.6
51 0.58
52 0.54
53 0.53
54 0.46
55 0.4
56 0.38
57 0.34
58 0.36
59 0.4
60 0.38
61 0.42
62 0.39
63 0.4
64 0.42
65 0.47
66 0.45
67 0.49
68 0.55
69 0.55
70 0.65
71 0.69
72 0.67
73 0.68
74 0.72
75 0.75
76 0.77
77 0.76
78 0.74
79 0.72
80 0.75
81 0.72
82 0.69
83 0.66
84 0.61
85 0.59
86 0.58
87 0.53
88 0.47
89 0.46
90 0.42
91 0.4
92 0.35
93 0.27
94 0.2
95 0.23
96 0.27
97 0.27
98 0.29
99 0.32
100 0.4
101 0.51
102 0.62
103 0.68
104 0.74
105 0.83
106 0.88
107 0.92
108 0.94
109 0.9
110 0.9
111 0.87
112 0.77
113 0.7
114 0.65
115 0.54
116 0.44
117 0.42
118 0.34
119 0.3
120 0.29
121 0.28
122 0.28
123 0.29
124 0.29
125 0.23
126 0.2
127 0.19
128 0.2
129 0.19
130 0.16
131 0.16
132 0.15
133 0.16
134 0.18
135 0.16
136 0.14
137 0.14
138 0.13
139 0.14
140 0.15
141 0.16
142 0.14
143 0.15
144 0.14
145 0.17
146 0.16
147 0.14
148 0.15
149 0.13
150 0.13
151 0.13
152 0.12
153 0.09
154 0.09
155 0.09
156 0.09
157 0.1
158 0.11
159 0.11
160 0.11
161 0.12
162 0.1
163 0.1
164 0.09
165 0.09
166 0.08
167 0.08
168 0.08
169 0.07
170 0.06
171 0.06
172 0.06
173 0.05
174 0.06
175 0.06
176 0.08
177 0.09
178 0.1
179 0.11
180 0.13
181 0.13
182 0.16
183 0.22
184 0.29
185 0.33
186 0.4
187 0.41
188 0.47
189 0.48
190 0.5
191 0.52
192 0.46
193 0.43
194 0.42
195 0.41
196 0.35
197 0.37
198 0.33
199 0.24
200 0.22
201 0.2
202 0.13
203 0.11
204 0.1
205 0.07
206 0.06
207 0.06
208 0.07
209 0.07
210 0.07
211 0.07
212 0.09
213 0.11
214 0.13
215 0.15
216 0.18
217 0.19
218 0.21
219 0.21
220 0.19
221 0.17
222 0.14
223 0.13
224 0.09
225 0.07
226 0.06
227 0.07
228 0.07
229 0.07
230 0.07
231 0.05
232 0.06
233 0.07
234 0.1
235 0.09
236 0.11
237 0.11
238 0.13
239 0.13
240 0.13
241 0.13
242 0.11
243 0.13
244 0.14
245 0.14
246 0.13
247 0.16
248 0.16
249 0.16
250 0.16
251 0.13
252 0.11
253 0.11
254 0.12
255 0.11
256 0.12
257 0.13
258 0.14
259 0.15
260 0.15
261 0.15
262 0.16
263 0.14
264 0.17
265 0.19
266 0.18
267 0.22
268 0.24
269 0.24
270 0.22
271 0.21
272 0.17
273 0.15
274 0.17
275 0.14
276 0.12
277 0.12
278 0.11
279 0.11
280 0.12
281 0.16
282 0.15
283 0.15
284 0.19
285 0.22
286 0.3
287 0.38
288 0.48
289 0.54
290 0.64
291 0.73
292 0.8
293 0.88
294 0.9
295 0.94
296 0.95
297 0.95
298 0.95
299 0.92
300 0.91
301 0.85
302 0.79
303 0.71
304 0.62
305 0.53
306 0.43
307 0.37
308 0.26
309 0.21
310 0.15
311 0.12
312 0.11
313 0.08
314 0.09
315 0.11
316 0.13
317 0.17
318 0.21
319 0.24
320 0.29
321 0.32
322 0.35
323 0.38
324 0.41
325 0.46
326 0.5
327 0.48
328 0.47
329 0.44
330 0.42
331 0.35
332 0.29
333 0.22
334 0.13
335 0.12
336 0.08
337 0.08
338 0.05
339 0.05
340 0.05
341 0.08
342 0.12
343 0.15
344 0.18
345 0.25
346 0.35
347 0.44
348 0.51
349 0.59
350 0.65
351 0.71
352 0.79
353 0.83
354 0.83
355 0.85
356 0.83
357 0.81
358 0.75
359 0.71
360 0.62
361 0.54
362 0.5
363 0.41
364 0.35
365 0.26
366 0.21
367 0.16
368 0.15
369 0.11
370 0.07
371 0.07
372 0.1
373 0.13
374 0.13
375 0.13
376 0.13
377 0.13
378 0.12
379 0.11
380 0.07
381 0.04
382 0.05
383 0.05
384 0.05
385 0.05
386 0.05
387 0.04
388 0.04
389 0.05
390 0.06
391 0.05
392 0.05
393 0.05
394 0.06
395 0.06
396 0.09
397 0.12
398 0.13
399 0.14
400 0.16
401 0.16
402 0.16
403 0.17
404 0.19
405 0.2
406 0.19
407 0.19
408 0.2
409 0.2
410 0.21
411 0.2
412 0.16
413 0.12
414 0.14
415 0.12
416 0.1
417 0.09
418 0.08
419 0.07
420 0.06
421 0.04
422 0.02
423 0.02
424 0.02
425 0.02
426 0.02
427 0.02
428 0.02
429 0.03
430 0.03
431 0.03
432 0.03
433 0.02
434 0.02
435 0.02
436 0.02
437 0.02
438 0.02
439 0.02
440 0.02
441 0.03
442 0.03
443 0.05
444 0.06
445 0.06
446 0.06
447 0.06
448 0.07
449 0.08
450 0.09
451 0.08
452 0.07
453 0.08
454 0.08
455 0.08
456 0.08
457 0.07
458 0.05
459 0.05
460 0.05
461 0.06
462 0.08
463 0.09
464 0.1
465 0.09
466 0.1
467 0.09
468 0.09
469 0.09
470 0.09
471 0.08
472 0.08
473 0.09
474 0.09
475 0.09
476 0.1
477 0.09
478 0.07
479 0.06
480 0.07
481 0.07
482 0.07
483 0.08
484 0.07
485 0.08
486 0.08
487 0.09
488 0.1
489 0.11
490 0.12
491 0.12
492 0.13
493 0.12
494 0.13
495 0.14
496 0.15
497 0.14
498 0.15
499 0.16
500 0.15
501 0.16
502 0.19
503 0.2
504 0.27
505 0.34
506 0.36
507 0.41
508 0.49
509 0.48
510 0.48
511 0.44
512 0.35
513 0.28
514 0.28
515 0.3
516 0.24
517 0.24
518 0.24
519 0.31
520 0.32
521 0.33
522 0.34
523 0.32
524 0.36
525 0.41
526 0.38
527 0.41
528 0.46
529 0.46
530 0.44
531 0.39
532 0.36
533 0.37
534 0.4
535 0.39
536 0.39
537 0.46
538 0.49
539 0.55
540 0.57
541 0.53
542 0.58
543 0.57
544 0.63
545 0.62
546 0.66
547 0.64
548 0.64
549 0.62
550 0.56
551 0.51
552 0.47
553 0.46
554 0.42
555 0.38
556 0.41
557 0.4
558 0.38
559 0.39
560 0.37
561 0.3
562 0.32
563 0.35
564 0.3
565 0.35
566 0.34
567 0.32
568 0.33
569 0.39
570 0.35
571 0.34
572 0.34
573 0.33
574 0.34
575 0.31
576 0.29
577 0.24
578 0.25
579 0.29
580 0.26
581 0.22
582 0.23
583 0.28
584 0.33
585 0.35
586 0.36
587 0.32
588 0.38
589 0.44
590 0.47
591 0.51
592 0.46
593 0.51
594 0.47
595 0.53
596 0.54
597 0.5
598 0.52
599 0.52
600 0.57
601 0.54
602 0.58
603 0.54
604 0.54
605 0.59
606 0.55
607 0.55
608 0.57
609 0.59
610 0.59
611 0.67
612 0.7
613 0.72
614 0.75
615 0.68
616 0.61
617 0.54
618 0.51
619 0.41
620 0.33
621 0.25
622 0.21
623 0.19
624 0.17
625 0.16
626 0.15
627 0.13
628 0.12
629 0.1
630 0.08
631 0.08
632 0.11
633 0.13
634 0.13
635 0.16
636 0.15
637 0.16
638 0.17
639 0.17
640 0.14
641 0.15
642 0.15
643 0.12
644 0.12
645 0.11
646 0.09
647 0.08
648 0.08
649 0.08
650 0.08
651 0.08
652 0.07
653 0.08
654 0.1
655 0.1
656 0.12
657 0.12
658 0.13
659 0.14
660 0.15
661 0.15
662 0.14
663 0.13
664 0.1
665 0.08
666 0.08
667 0.08
668 0.08
669 0.12
670 0.15
671 0.2
672 0.22
673 0.28
674 0.3
675 0.39
676 0.47
677 0.51
678 0.54
679 0.53
680 0.52
681 0.46
682 0.42
683 0.33
684 0.27
685 0.19
686 0.13
687 0.1
688 0.09
689 0.09
690 0.09
691 0.09
692 0.06
693 0.07
694 0.07
695 0.07
696 0.08
697 0.08
698 0.09
699 0.09
700 0.09
701 0.07
702 0.08
703 0.08
704 0.08
705 0.09
706 0.11
707 0.13
708 0.15
709 0.17
710 0.21
711 0.25
712 0.31
713 0.39
714 0.39
715 0.38
716 0.38
717 0.38
718 0.37
719 0.34
720 0.31
721 0.21
722 0.19
723 0.18
724 0.16
725 0.18
726 0.14
727 0.14
728 0.11
729 0.12
730 0.13
731 0.12
732 0.13
733 0.12
734 0.14
735 0.18
736 0.25
737 0.34
738 0.34
739 0.39
740 0.43
741 0.47
742 0.5
743 0.55
744 0.53
745 0.47
746 0.49
747 0.43
748 0.4
749 0.34
750 0.29
751 0.18
752 0.13
753 0.1
754 0.06
755 0.06
756 0.04
757 0.04
758 0.05
759 0.05
760 0.04
761 0.05
762 0.06
763 0.06
764 0.06
765 0.08
766 0.08
767 0.09
768 0.11
769 0.13
770 0.16
771 0.18
772 0.19
773 0.2
774 0.25
775 0.34
776 0.42
777 0.41
778 0.45
779 0.5
780 0.54
781 0.57
782 0.6
783 0.57
784 0.56
785 0.62
786 0.59
787 0.61
788 0.57
789 0.54
790 0.49