FuNGI

A0A4T0FL02

Protein Details

Accession

A0A4T0FL02

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
25-45	AASLPRRREPQPQPQSQPQSP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
570-583	KKLERKSSKMGMKL

Subcellular Location(s)

nucl 23, cyto_nucl 14

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR020708 DNA-dir_RNA_polK_14-18kDa_CS IPR006110 Pol_omega/Rpo6/RPB6 IPR036161 RPB6/omega-like_sf
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF01192 RNA_pol_Rpb6
PROSITE	View protein in PROSITE PS01111 RNA_POL_K_14KD

Amino Acid Sequences

MAAIDNTANNANNVRALAVDKLRRAASLPRRREPQPQPQSQPQSPSPLPPSQSTQTSPSSPTFYEPVDDDDAEHDNGYGYNYDAATETGQQVQVKEGGNMLTFSIVEHTPTKQTSRQLSKEERALLTLSQLQHQLLSKHGSSLLNRSNSATARVNAFNKLVNGGQLKQMLNERPPSRLLRSNTVSGAVGGRGSRDDARQAARANMLKRLGSRRQPQNNDSQPEKQIKRRSSLGDISKFDSILNNQPQILESNLLLVPPTNATRDRKHSLESTNSFGTPSSAGNGDKFEYERMLNTSTRSLGLSPSNTDGEQADSDDDNSIIYEEVEETNAASGSDVQLVQLDEESPSKSTQRRRRQVHFTPSAYIDELRKTLGPDRLAQLLGPQFVSEFGIGGDTQTPEDDKDVVYDDEDTQEMLRSTQSIENMQHPTIDEDIPLTEQIDTNSVYGGMRKTRDSSYMKPLPQVHMAALSADNAGSQAMLTRSMTTLPKASLPHADLGKHKKVKSQRSFGSFRLLKNKPSIQSNKDLYDTDPKLSPFPALTFTDSEGRTNSLRNRSISPASQKAVSEEPPKKLERKSSKMGMKLKRLFSVRKTITVIMSDNEDVDGMEEEDNVEAMQEDSNVVASGNVPANGTAAAVPNEERVTTPYMTKYERARILGTRALQISMNAPVLVPIEAGETDPLQIAIKELSANKVPLIVRRYLPDGSYEDWQCQELITD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.15
2	0.13
3	0.14
4	0.18
5	0.24
6	0.29
7	0.3
8	0.34
9	0.34
10	0.34
11	0.35
12	0.39
13	0.43
14	0.48
15	0.55
16	0.59
17	0.64
18	0.68
19	0.76
20	0.75
21	0.75
22	0.75
23	0.76
24	0.76
25	0.8
26	0.86
27	0.79
28	0.77
29	0.7
30	0.68
31	0.59
32	0.58
33	0.54
34	0.51
35	0.49
36	0.46
37	0.49
38	0.45
39	0.48
40	0.44
41	0.43
42	0.42
43	0.41
44	0.41
45	0.38
46	0.37
47	0.33
48	0.33
49	0.31
50	0.27
51	0.26
52	0.23
53	0.25
54	0.25
55	0.24
56	0.21
57	0.21
58	0.24
59	0.22
60	0.21
61	0.16
62	0.12
63	0.12
64	0.13
65	0.11
66	0.09
67	0.1
68	0.1
69	0.11
70	0.11
71	0.12
72	0.12
73	0.13
74	0.14
75	0.14
76	0.17
77	0.18
78	0.17
79	0.18
80	0.21
81	0.2
82	0.19
83	0.18
84	0.17
85	0.16
86	0.16
87	0.14
88	0.11
89	0.1
90	0.09
91	0.11
92	0.09
93	0.11
94	0.13
95	0.15
96	0.18
97	0.21
98	0.25
99	0.27
100	0.34
101	0.41
102	0.49
103	0.53
104	0.58
105	0.64
106	0.65
107	0.67
108	0.65
109	0.56
110	0.48
111	0.43
112	0.34
113	0.29
114	0.28
115	0.23
116	0.2
117	0.21
118	0.19
119	0.2
120	0.22
121	0.2
122	0.19
123	0.23
124	0.2
125	0.2
126	0.24
127	0.24
128	0.24
129	0.31
130	0.35
131	0.34
132	0.34
133	0.35
134	0.35
135	0.33
136	0.36
137	0.32
138	0.26
139	0.27
140	0.31
141	0.31
142	0.3
143	0.3
144	0.27
145	0.24
146	0.25
147	0.2
148	0.2
149	0.21
150	0.19
151	0.22
152	0.24
153	0.24
154	0.24
155	0.29
156	0.29
157	0.29
158	0.37
159	0.34
160	0.32
161	0.36
162	0.39
163	0.39
164	0.43
165	0.43
166	0.43
167	0.46
168	0.47
169	0.43
170	0.4
171	0.35
172	0.27
173	0.24
174	0.16
175	0.13
176	0.09
177	0.09
178	0.08
179	0.11
180	0.12
181	0.12
182	0.15
183	0.17
184	0.2
185	0.24
186	0.25
187	0.24
188	0.28
189	0.31
190	0.3
191	0.32
192	0.31
193	0.28
194	0.31
195	0.37
196	0.39
197	0.43
198	0.51
199	0.57
200	0.65
201	0.7
202	0.69
203	0.72
204	0.73
205	0.7
206	0.65
207	0.59
208	0.55
209	0.57
210	0.58
211	0.55
212	0.56
213	0.54
214	0.55
215	0.56
216	0.54
217	0.51
218	0.55
219	0.55
220	0.53
221	0.51
222	0.48
223	0.43
224	0.39
225	0.33
226	0.27
227	0.21
228	0.23
229	0.25
230	0.23
231	0.23
232	0.23
233	0.23
234	0.22
235	0.21
236	0.14
237	0.09
238	0.11
239	0.11
240	0.1
241	0.1
242	0.08
243	0.08
244	0.08
245	0.09
246	0.09
247	0.14
248	0.18
249	0.23
250	0.3
251	0.34
252	0.34
253	0.36
254	0.38
255	0.38
256	0.43
257	0.41
258	0.38
259	0.35
260	0.34
261	0.31
262	0.26
263	0.22
264	0.15
265	0.12
266	0.09
267	0.09
268	0.1
269	0.1
270	0.11
271	0.11
272	0.11
273	0.11
274	0.11
275	0.11
276	0.1
277	0.11
278	0.12
279	0.14
280	0.14
281	0.15
282	0.16
283	0.15
284	0.15
285	0.14
286	0.12
287	0.12
288	0.13
289	0.13
290	0.13
291	0.15
292	0.15
293	0.15
294	0.15
295	0.13
296	0.12
297	0.11
298	0.1
299	0.09
300	0.08
301	0.09
302	0.08
303	0.08
304	0.06
305	0.06
306	0.06
307	0.04
308	0.04
309	0.04
310	0.04
311	0.05
312	0.05
313	0.05
314	0.05
315	0.05
316	0.05
317	0.05
318	0.04
319	0.04
320	0.04
321	0.05
322	0.05
323	0.05
324	0.06
325	0.06
326	0.06
327	0.06
328	0.06
329	0.05
330	0.06
331	0.07
332	0.07
333	0.08
334	0.11
335	0.16
336	0.25
337	0.34
338	0.45
339	0.54
340	0.6
341	0.67
342	0.74
343	0.78
344	0.78
345	0.75
346	0.66
347	0.59
348	0.53
349	0.46
350	0.37
351	0.29
352	0.2
353	0.14
354	0.13
355	0.11
356	0.1
357	0.1
358	0.14
359	0.17
360	0.18
361	0.18
362	0.19
363	0.2
364	0.2
365	0.18
366	0.17
367	0.14
368	0.13
369	0.12
370	0.1
371	0.08
372	0.08
373	0.09
374	0.06
375	0.05
376	0.04
377	0.05
378	0.05
379	0.05
380	0.06
381	0.05
382	0.06
383	0.06
384	0.06
385	0.06
386	0.07
387	0.07
388	0.06
389	0.06
390	0.08
391	0.08
392	0.08
393	0.09
394	0.09
395	0.09
396	0.09
397	0.08
398	0.07
399	0.08
400	0.07
401	0.07
402	0.06
403	0.06
404	0.08
405	0.1
406	0.11
407	0.13
408	0.14
409	0.19
410	0.21
411	0.21
412	0.19
413	0.18
414	0.18
415	0.17
416	0.16
417	0.11
418	0.09
419	0.09
420	0.09
421	0.09
422	0.08
423	0.06
424	0.06
425	0.07
426	0.08
427	0.08
428	0.08
429	0.08
430	0.08
431	0.07
432	0.09
433	0.1
434	0.12
435	0.13
436	0.14
437	0.17
438	0.18
439	0.26
440	0.3
441	0.32
442	0.39
443	0.44
444	0.44
445	0.46
446	0.47
447	0.43
448	0.41
449	0.37
450	0.28
451	0.22
452	0.21
453	0.16
454	0.14
455	0.11
456	0.08
457	0.07
458	0.06
459	0.05
460	0.05
461	0.04
462	0.03
463	0.05
464	0.05
465	0.06
466	0.07
467	0.07
468	0.08
469	0.11
470	0.12
471	0.12
472	0.13
473	0.13
474	0.16
475	0.17
476	0.18
477	0.2
478	0.21
479	0.23
480	0.23
481	0.25
482	0.28
483	0.34
484	0.42
485	0.44
486	0.43
487	0.46
488	0.53
489	0.62
490	0.65
491	0.67
492	0.64
493	0.65
494	0.69
495	0.64
496	0.65
497	0.57
498	0.51
499	0.52
500	0.48
501	0.44
502	0.47
503	0.51
504	0.44
505	0.5
506	0.54
507	0.49
508	0.55
509	0.56
510	0.51
511	0.48
512	0.45
513	0.39
514	0.41
515	0.38
516	0.31
517	0.3
518	0.28
519	0.27
520	0.27
521	0.25
522	0.17
523	0.16
524	0.18
525	0.17
526	0.19
527	0.19
528	0.2
529	0.25
530	0.24
531	0.24
532	0.21
533	0.21
534	0.2
535	0.24
536	0.28
537	0.31
538	0.35
539	0.37
540	0.4
541	0.42
542	0.46
543	0.47
544	0.47
545	0.45
546	0.42
547	0.42
548	0.39
549	0.37
550	0.36
551	0.35
552	0.37
553	0.36
554	0.39
555	0.42
556	0.45
557	0.48
558	0.49
559	0.55
560	0.56
561	0.58
562	0.61
563	0.65
564	0.68
565	0.72
566	0.76
567	0.74
568	0.74
569	0.74
570	0.7
571	0.67
572	0.66
573	0.63
574	0.59
575	0.62
576	0.54
577	0.51
578	0.51
579	0.47
580	0.43
581	0.4
582	0.36
583	0.26
584	0.27
585	0.22
586	0.18
587	0.16
588	0.14
589	0.11
590	0.1
591	0.1
592	0.08
593	0.08
594	0.07
595	0.08
596	0.08
597	0.08
598	0.06
599	0.05
600	0.05
601	0.05
602	0.06
603	0.05
604	0.06
605	0.06
606	0.06
607	0.06
608	0.06
609	0.06
610	0.06
611	0.09
612	0.11
613	0.11
614	0.11
615	0.11
616	0.12
617	0.11
618	0.11
619	0.09
620	0.09
621	0.1
622	0.11
623	0.11
624	0.13
625	0.14
626	0.14
627	0.14
628	0.15
629	0.18
630	0.19
631	0.21
632	0.23
633	0.27
634	0.3
635	0.34
636	0.38
637	0.42
638	0.46
639	0.46
640	0.46
641	0.45
642	0.47
643	0.48
644	0.44
645	0.4
646	0.36
647	0.34
648	0.31
649	0.27
650	0.24
651	0.22
652	0.21
653	0.15
654	0.14
655	0.14
656	0.15
657	0.14
658	0.11
659	0.08
660	0.09
661	0.09
662	0.1
663	0.1
664	0.09
665	0.1
666	0.1
667	0.1
668	0.09
669	0.09
670	0.1
671	0.09
672	0.1
673	0.13
674	0.14
675	0.18
676	0.21
677	0.22
678	0.21
679	0.26
680	0.26
681	0.3
682	0.33
683	0.33
684	0.32
685	0.35
686	0.39
687	0.36
688	0.35
689	0.33
690	0.32
691	0.3
692	0.35
693	0.33
694	0.31
695	0.31
696	0.31
697	0.26

A0A4T0FL02

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer