FuNGI

A0A4T0FR38

Protein Details

Accession

A0A4T0FR38

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
7-27	PKPSAKRGPSAPYKQPRSSKV	Hydrophilic
36-85	KDYRDAHNTKAKKRTPKRASPKTDSDSDETLQHQRSKPLQAKKNIQRQAP	Hydrophilic
98-122	LQSSAKPRNRYNEKLKKSSRPLDFS	Hydrophilic
259-278	MRKVSPKKAAKRKQSGEGKK	Basic
441-473	SSAAARKEPTQPKPKPRPKPQPKSQQNQRQIST	Hydrophilic
631-652	TLNALSTSKPKRKLKLDPSTTS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
45-54	KAKKRTPKRA
222-280	PPAKGKKAVVEDKKKSAKSTGKQPSRKEIASGKKELDMRKVSPKKAAKRKQSGEGKKAA
445-462	ARKEPTQPKPKPRPKPQP

Subcellular Location(s)

nucl 25, cyto_nucl 14.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039024 RTC4 IPR028094 RTC4_C
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005634 C:nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF14474 RTC4

Amino Acid Sequences

MDNPFAPKPSAKRGPSAPYKQPRSSKVESISLDQAKDYRDAHNTKAKKRTPKRASPKTDSDSDETLQHQRSKPLQAKKNIQRQAPTRVTAETTSYPSLQSSAKPRNRYNEKLKKSSRPLDFSSSEAETEVEEDKPKQRNRTNFMLDAITGAGSQYVCLYDNFARSRFSIRRSPSPEMEEEVVRTPYRYDLRMSESASPPSLEDAFTALPPSSSRSNSPAHSPPAKGKKAVVEDKKKSAKSTGKQPSRKEIASGKKELDMRKVSPKKAAKRKQSGEGKKAATAQKDQSNKTKIKVSRSVNFEDNEDKPATKKRRSNNHISESTDDDSDNGNDGEKGDDDYVEVTNFPAKMRDKKLKCLDKIDTNKKADKTDTIKKATKPAPKKDEGMFGKYDVLNDYISTHSQELRQDSPQLSGGSRKAPTVAVKVSDDESDDEEVGKSDKSSAAARKEPTQPKPKPRPKPQPKSQQNQRQISTFFKPSVRAADMDLCPVCDTELPQLRSQHFKKVLKDFLSIAKASPRSTNPHGMKAHVLAESELCKAHELDTNIIPEGHNKGYPREHDWDKLTKRIIKLTKKIAAVIKSKEDSKFWLKAREDYEKMGSRKANGMTVQFENFEDEQPGYYGEIGLMVISFTLNALSTSKPKRKLKLDPSTTSPLPPKDFIRRVLVPEVANILISEDNGVSMEEAEKIRIESREYGNAVFSGDIKDLSWRPQLPTELISDSD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.64
2	0.69
3	0.71
4	0.71
5	0.72
6	0.78
7	0.8
8	0.82
9	0.79
10	0.78
11	0.75
12	0.73
13	0.68
14	0.67
15	0.61
16	0.58
17	0.59
18	0.54
19	0.48
20	0.41
21	0.38
22	0.31
23	0.33
24	0.3
25	0.26
26	0.31
27	0.34
28	0.4
29	0.47
30	0.53
31	0.58
32	0.66
33	0.69
34	0.72
35	0.79
36	0.84
37	0.84
38	0.87
39	0.9
40	0.91
41	0.92
42	0.9
43	0.9
44	0.84
45	0.81
46	0.74
47	0.68
48	0.61
49	0.52
50	0.46
51	0.4
52	0.4
53	0.39
54	0.41
55	0.39
56	0.42
57	0.46
58	0.54
59	0.59
60	0.63
61	0.66
62	0.69
63	0.77
64	0.8
65	0.84
66	0.81
67	0.78
68	0.76
69	0.73
70	0.74
71	0.69
72	0.63
73	0.54
74	0.49
75	0.47
76	0.4
77	0.39
78	0.31
79	0.29
80	0.28
81	0.27
82	0.25
83	0.23
84	0.24
85	0.2
86	0.22
87	0.27
88	0.35
89	0.42
90	0.5
91	0.55
92	0.63
93	0.71
94	0.75
95	0.77
96	0.77
97	0.79
98	0.81
99	0.84
100	0.83
101	0.84
102	0.84
103	0.81
104	0.76
105	0.72
106	0.69
107	0.63
108	0.55
109	0.49
110	0.41
111	0.33
112	0.27
113	0.22
114	0.15
115	0.15
116	0.15
117	0.12
118	0.12
119	0.15
120	0.22
121	0.3
122	0.36
123	0.44
124	0.5
125	0.58
126	0.62
127	0.7
128	0.69
129	0.63
130	0.6
131	0.52
132	0.44
133	0.35
134	0.29
135	0.19
136	0.12
137	0.09
138	0.08
139	0.06
140	0.06
141	0.06
142	0.06
143	0.07
144	0.07
145	0.11
146	0.13
147	0.19
148	0.21
149	0.22
150	0.23
151	0.23
152	0.31
153	0.32
154	0.35
155	0.37
156	0.4
157	0.49
158	0.55
159	0.6
160	0.57
161	0.57
162	0.54
163	0.49
164	0.46
165	0.37
166	0.31
167	0.28
168	0.25
169	0.2
170	0.19
171	0.16
172	0.2
173	0.22
174	0.21
175	0.21
176	0.22
177	0.29
178	0.32
179	0.34
180	0.34
181	0.34
182	0.34
183	0.32
184	0.29
185	0.23
186	0.21
187	0.19
188	0.13
189	0.11
190	0.11
191	0.11
192	0.11
193	0.12
194	0.09
195	0.09
196	0.09
197	0.12
198	0.14
199	0.15
200	0.17
201	0.21
202	0.24
203	0.25
204	0.31
205	0.33
206	0.36
207	0.38
208	0.38
209	0.42
210	0.49
211	0.5
212	0.45
213	0.42
214	0.42
215	0.46
216	0.53
217	0.55
218	0.55
219	0.57
220	0.65
221	0.7
222	0.65
223	0.59
224	0.58
225	0.57
226	0.52
227	0.58
228	0.6
229	0.63
230	0.69
231	0.71
232	0.71
233	0.68
234	0.63
235	0.56
236	0.54
237	0.54
238	0.53
239	0.52
240	0.44
241	0.43
242	0.47
243	0.45
244	0.44
245	0.38
246	0.35
247	0.43
248	0.48
249	0.46
250	0.5
251	0.56
252	0.59
253	0.66
254	0.72
255	0.71
256	0.75
257	0.78
258	0.78
259	0.81
260	0.8
261	0.75
262	0.73
263	0.64
264	0.56
265	0.57
266	0.51
267	0.43
268	0.39
269	0.37
270	0.36
271	0.4
272	0.41
273	0.43
274	0.47
275	0.46
276	0.44
277	0.48
278	0.44
279	0.47
280	0.52
281	0.5
282	0.49
283	0.52
284	0.54
285	0.49
286	0.46
287	0.4
288	0.36
289	0.31
290	0.28
291	0.23
292	0.19
293	0.18
294	0.26
295	0.32
296	0.36
297	0.41
298	0.46
299	0.57
300	0.63
301	0.72
302	0.72
303	0.73
304	0.69
305	0.65
306	0.59
307	0.51
308	0.46
309	0.36
310	0.26
311	0.19
312	0.16
313	0.14
314	0.13
315	0.08
316	0.07
317	0.07
318	0.07
319	0.07
320	0.06
321	0.07
322	0.06
323	0.06
324	0.06
325	0.07
326	0.07
327	0.06
328	0.06
329	0.05
330	0.07
331	0.07
332	0.07
333	0.11
334	0.14
335	0.2
336	0.27
337	0.36
338	0.37
339	0.46
340	0.56
341	0.59
342	0.59
343	0.59
344	0.57
345	0.56
346	0.63
347	0.63
348	0.61
349	0.57
350	0.59
351	0.54
352	0.52
353	0.44
354	0.41
355	0.38
356	0.39
357	0.42
358	0.44
359	0.47
360	0.46
361	0.53
362	0.54
363	0.56
364	0.56
365	0.58
366	0.59
367	0.58
368	0.6
369	0.54
370	0.56
371	0.5
372	0.45
373	0.37
374	0.3
375	0.29
376	0.26
377	0.24
378	0.16
379	0.14
380	0.11
381	0.1
382	0.11
383	0.09
384	0.09
385	0.1
386	0.1
387	0.1
388	0.12
389	0.14
390	0.16
391	0.18
392	0.19
393	0.21
394	0.21
395	0.21
396	0.22
397	0.2
398	0.17
399	0.18
400	0.18
401	0.19
402	0.19
403	0.18
404	0.16
405	0.17
406	0.18
407	0.19
408	0.19
409	0.17
410	0.17
411	0.18
412	0.18
413	0.16
414	0.15
415	0.12
416	0.13
417	0.12
418	0.11
419	0.1
420	0.09
421	0.09
422	0.09
423	0.08
424	0.06
425	0.06
426	0.07
427	0.09
428	0.13
429	0.18
430	0.22
431	0.27
432	0.29
433	0.34
434	0.42
435	0.48
436	0.52
437	0.58
438	0.6
439	0.66
440	0.76
441	0.8
442	0.82
443	0.85
444	0.88
445	0.89
446	0.92
447	0.91
448	0.92
449	0.91
450	0.91
451	0.91
452	0.9
453	0.88
454	0.85
455	0.77
456	0.69
457	0.62
458	0.57
459	0.51
460	0.43
461	0.36
462	0.3
463	0.31
464	0.28
465	0.3
466	0.27
467	0.23
468	0.22
469	0.25
470	0.24
471	0.25
472	0.24
473	0.19
474	0.18
475	0.17
476	0.15
477	0.09
478	0.1
479	0.15
480	0.22
481	0.24
482	0.28
483	0.32
484	0.34
485	0.43
486	0.43
487	0.45
488	0.47
489	0.5
490	0.53
491	0.57
492	0.62
493	0.56
494	0.56
495	0.48
496	0.45
497	0.43
498	0.37
499	0.29
500	0.28
501	0.27
502	0.26
503	0.29
504	0.26
505	0.29
506	0.34
507	0.43
508	0.4
509	0.46
510	0.46
511	0.44
512	0.43
513	0.38
514	0.36
515	0.27
516	0.24
517	0.17
518	0.17
519	0.17
520	0.15
521	0.14
522	0.11
523	0.11
524	0.11
525	0.13
526	0.15
527	0.16
528	0.18
529	0.21
530	0.22
531	0.21
532	0.21
533	0.19
534	0.17
535	0.2
536	0.18
537	0.18
538	0.18
539	0.22
540	0.28
541	0.31
542	0.35
543	0.37
544	0.39
545	0.42
546	0.46
547	0.51
548	0.49
549	0.52
550	0.53
551	0.51
552	0.5
553	0.54
554	0.58
555	0.57
556	0.62
557	0.64
558	0.64
559	0.6
560	0.63
561	0.59
562	0.57
563	0.53
564	0.5
565	0.47
566	0.44
567	0.46
568	0.44
569	0.4
570	0.39
571	0.39
572	0.43
573	0.4
574	0.46
575	0.45
576	0.49
577	0.54
578	0.56
579	0.52
580	0.48
581	0.52
582	0.51
583	0.5
584	0.5
585	0.46
586	0.4
587	0.43
588	0.41
589	0.38
590	0.33
591	0.34
592	0.32
593	0.33
594	0.32
595	0.27
596	0.25
597	0.25
598	0.23
599	0.22
600	0.19
601	0.17
602	0.16
603	0.15
604	0.16
605	0.11
606	0.11
607	0.1
608	0.08
609	0.08
610	0.07
611	0.06
612	0.05
613	0.04
614	0.04
615	0.04
616	0.04
617	0.03
618	0.04
619	0.04
620	0.05
621	0.07
622	0.09
623	0.18
624	0.28
625	0.36
626	0.45
627	0.53
628	0.61
629	0.69
630	0.77
631	0.8
632	0.82
633	0.83
634	0.79
635	0.79
636	0.78
637	0.7
638	0.64
639	0.6
640	0.55
641	0.5
642	0.48
643	0.47
644	0.49
645	0.54
646	0.53
647	0.54
648	0.52
649	0.52
650	0.53
651	0.52
652	0.41
653	0.38
654	0.37
655	0.28
656	0.25
657	0.2
658	0.16
659	0.12
660	0.12
661	0.11
662	0.08
663	0.08
664	0.08
665	0.08
666	0.07
667	0.07
668	0.08
669	0.1
670	0.11
671	0.12
672	0.13
673	0.14
674	0.18
675	0.19
676	0.22
677	0.26
678	0.3
679	0.37
680	0.38
681	0.37
682	0.35
683	0.33
684	0.3
685	0.24
686	0.2
687	0.15
688	0.14
689	0.14
690	0.12
691	0.18
692	0.19
693	0.24
694	0.31
695	0.31
696	0.34
697	0.4
698	0.44
699	0.41
700	0.41
701	0.4

A0A4T0FR38

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer