FuNGI

A0A4T0FMV6

Protein Details

Accession

A0A4T0FMV6

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
325-344	YTPDKRYQRADWRKRPLTKP	Hydrophilic
686-730	DIATVGKQTDKKRKRKDKKEKSDGDKEKKKDKESKKDKVDIPQFD	Basic
742-766	LDDLSQSTKKPRKQRVKASFEGQFK	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
696-722	KKRKRKDKKEKSDGDKEKKKDKESKKD
753-754	RK

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, mito_nucl 11.5, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR002562 3'-5'_exonuclease_dom IPR012588 Exosome-assoc_fac_Rrp6_N IPR010997 HRDC-like_sf IPR002121 HRDC_dom IPR044876 HRDC_dom_sf IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR045092 Rrp6-like
Gene Ontology	GO:0000176 C:nuclear exosome (RNase complex) GO:0000175 F:3'-5'-RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0000166 F:nucleotide binding GO:0000467 P:exonucleolytic trimming to generate mature 3'-end of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)
Pfam	View protein in Pfam PF01612 DNA_pol_A_exo1 PF00570 HRDC PF08066 PMC2NT
PROSITE	View protein in PROSITE PS50967 HRDC
CDD	cd06147 Rrp6p_like_exo

Amino Acid Sequences

MDLNLEEKTKNLQKSAINLTKISKNLLKGDDLAFQRSIDGEFSGKCEQLENGVVDSINQLLGFVNSNSRQLDADDLVGDSKAVGEVVDQLLEDSSINIDKHTNAYNKPSLKKDLEPAIYNDKSIQRKPQLKWMDKVDNSNTLWQPLITHKPNAKTPLSLTRSDGVLSHPYKTEIETIQYPPHQLSVNTPIQQGTFEETPFTWIDTEDSFNVLLEKLSKATEIAVDLEHHDFRSYHGFVCLMQISIRGEDFIIDTLELRDQLIRLNDTFTNPAIVKVFHGADSDIVWLQRDFGVYVVNLFDTYHATKVLGFNQHSLASLLVKFCSYTPDKRYQRADWRKRPLTKPMLDYARSDTHYLLFIYDILRNTLIEKSTKKNNMLKDVLDRSAQVALKVHHRDLYDYDTGKGFNGWYNVALKWNKRMDPALIEVFRRLHQWRDELARKEDESVHLILSNHQLFDVAIKQPTTPQKVFDLFQKKPPHYVRVQVKSICQAINSALQFADKHADKLHEAIVPRSMNKPTNVHLPVKTGLDHELWNIPQSQPTTTSNTLSSATRSKLFGQDSSKQAPQASTSKLFSGAAESTARKNTKAVDKITSSFDLVSLIPHASTSQDYSVDAFDEYKRPIQIKPPPMPARVDEVLKEDKQKMAEESKASASMNVDADAELPYKSKAERMAESIPVDAGITADDIATVGKQTDKKRKRKDKKEKSDGDKEKKKDKESKKDKVDIPQFDYDNEESVLDRPLDDLSQSTKKPRKQRVKASFEGQFKRPGSSKTQQTSGNRSHTFTKYPQSSYEFADANVVGLEAVETDSSAESECSERPSGGRANLWELSVVEVVCERSVESNV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.46
2	0.55
3	0.55
4	0.5
5	0.49
6	0.51
7	0.51
8	0.49
9	0.48
10	0.42
11	0.39
12	0.43
13	0.43
14	0.41
15	0.38
16	0.39
17	0.4
18	0.37
19	0.37
20	0.31
21	0.28
22	0.26
23	0.23
24	0.22
25	0.16
26	0.15
27	0.13
28	0.13
29	0.18
30	0.21
31	0.21
32	0.2
33	0.2
34	0.19
35	0.21
36	0.25
37	0.21
38	0.19
39	0.19
40	0.19
41	0.18
42	0.18
43	0.14
44	0.1
45	0.08
46	0.08
47	0.07
48	0.08
49	0.1
50	0.1
51	0.16
52	0.17
53	0.21
54	0.21
55	0.22
56	0.22
57	0.2
58	0.24
59	0.19
60	0.19
61	0.16
62	0.16
63	0.15
64	0.14
65	0.13
66	0.08
67	0.07
68	0.06
69	0.05
70	0.05
71	0.04
72	0.07
73	0.08
74	0.09
75	0.08
76	0.08
77	0.09
78	0.09
79	0.09
80	0.06
81	0.07
82	0.11
83	0.11
84	0.11
85	0.13
86	0.14
87	0.17
88	0.23
89	0.27
90	0.27
91	0.34
92	0.41
93	0.47
94	0.52
95	0.54
96	0.55
97	0.55
98	0.56
99	0.56
100	0.57
101	0.54
102	0.51
103	0.5
104	0.52
105	0.48
106	0.44
107	0.41
108	0.4
109	0.41
110	0.42
111	0.47
112	0.48
113	0.56
114	0.58
115	0.64
116	0.68
117	0.67
118	0.7
119	0.69
120	0.69
121	0.63
122	0.68
123	0.62
124	0.58
125	0.53
126	0.54
127	0.46
128	0.38
129	0.35
130	0.28
131	0.26
132	0.25
133	0.33
134	0.29
135	0.35
136	0.38
137	0.43
138	0.48
139	0.52
140	0.48
141	0.41
142	0.42
143	0.46
144	0.46
145	0.42
146	0.4
147	0.36
148	0.35
149	0.32
150	0.29
151	0.21
152	0.26
153	0.25
154	0.24
155	0.23
156	0.24
157	0.24
158	0.25
159	0.26
160	0.18
161	0.21
162	0.23
163	0.25
164	0.28
165	0.29
166	0.28
167	0.25
168	0.26
169	0.23
170	0.2
171	0.22
172	0.25
173	0.3
174	0.3
175	0.3
176	0.29
177	0.27
178	0.28
179	0.24
180	0.21
181	0.16
182	0.15
183	0.15
184	0.15
185	0.18
186	0.17
187	0.17
188	0.12
189	0.11
190	0.12
191	0.12
192	0.15
193	0.12
194	0.13
195	0.12
196	0.12
197	0.12
198	0.1
199	0.09
200	0.08
201	0.09
202	0.09
203	0.09
204	0.09
205	0.09
206	0.09
207	0.1
208	0.09
209	0.1
210	0.09
211	0.1
212	0.11
213	0.14
214	0.14
215	0.13
216	0.13
217	0.12
218	0.13
219	0.2
220	0.19
221	0.17
222	0.17
223	0.17
224	0.16
225	0.2
226	0.18
227	0.12
228	0.11
229	0.12
230	0.12
231	0.13
232	0.12
233	0.09
234	0.09
235	0.08
236	0.09
237	0.08
238	0.07
239	0.06
240	0.07
241	0.07
242	0.08
243	0.08
244	0.07
245	0.07
246	0.07
247	0.1
248	0.12
249	0.13
250	0.13
251	0.15
252	0.16
253	0.17
254	0.19
255	0.16
256	0.17
257	0.15
258	0.16
259	0.14
260	0.14
261	0.13
262	0.14
263	0.14
264	0.11
265	0.12
266	0.11
267	0.1
268	0.1
269	0.11
270	0.09
271	0.08
272	0.09
273	0.08
274	0.08
275	0.09
276	0.09
277	0.07
278	0.07
279	0.08
280	0.07
281	0.08
282	0.07
283	0.07
284	0.06
285	0.06
286	0.06
287	0.08
288	0.09
289	0.1
290	0.09
291	0.1
292	0.11
293	0.13
294	0.16
295	0.19
296	0.19
297	0.2
298	0.21
299	0.21
300	0.21
301	0.19
302	0.15
303	0.11
304	0.11
305	0.1
306	0.09
307	0.08
308	0.08
309	0.08
310	0.13
311	0.15
312	0.2
313	0.25
314	0.35
315	0.4
316	0.46
317	0.51
318	0.53
319	0.6
320	0.66
321	0.71
322	0.71
323	0.77
324	0.79
325	0.81
326	0.79
327	0.77
328	0.76
329	0.69
330	0.63
331	0.6
332	0.57
333	0.5
334	0.48
335	0.43
336	0.37
337	0.34
338	0.31
339	0.25
340	0.2
341	0.2
342	0.18
343	0.13
344	0.09
345	0.08
346	0.09
347	0.1
348	0.1
349	0.09
350	0.1
351	0.09
352	0.1
353	0.11
354	0.11
355	0.13
356	0.15
357	0.18
358	0.26
359	0.31
360	0.35
361	0.39
362	0.42
363	0.46
364	0.45
365	0.43
366	0.41
367	0.4
368	0.35
369	0.31
370	0.27
371	0.2
372	0.22
373	0.21
374	0.15
375	0.14
376	0.14
377	0.2
378	0.22
379	0.22
380	0.21
381	0.21
382	0.22
383	0.22
384	0.26
385	0.22
386	0.21
387	0.21
388	0.18
389	0.18
390	0.17
391	0.15
392	0.1
393	0.08
394	0.09
395	0.08
396	0.09
397	0.1
398	0.1
399	0.15
400	0.18
401	0.17
402	0.23
403	0.26
404	0.27
405	0.27
406	0.28
407	0.24
408	0.23
409	0.26
410	0.23
411	0.2
412	0.19
413	0.19
414	0.19
415	0.18
416	0.19
417	0.17
418	0.17
419	0.18
420	0.2
421	0.22
422	0.28
423	0.34
424	0.35
425	0.37
426	0.36
427	0.34
428	0.33
429	0.31
430	0.25
431	0.21
432	0.18
433	0.14
434	0.13
435	0.13
436	0.13
437	0.16
438	0.15
439	0.13
440	0.12
441	0.12
442	0.1
443	0.11
444	0.12
445	0.09
446	0.1
447	0.1
448	0.1
449	0.15
450	0.2
451	0.26
452	0.24
453	0.24
454	0.27
455	0.29
456	0.29
457	0.33
458	0.35
459	0.3
460	0.38
461	0.44
462	0.41
463	0.47
464	0.5
465	0.47
466	0.41
467	0.49
468	0.5
469	0.49
470	0.53
471	0.47
472	0.45
473	0.43
474	0.43
475	0.35
476	0.26
477	0.2
478	0.16
479	0.19
480	0.18
481	0.14
482	0.12
483	0.12
484	0.12
485	0.12
486	0.16
487	0.11
488	0.12
489	0.13
490	0.14
491	0.14
492	0.16
493	0.17
494	0.15
495	0.15
496	0.15
497	0.19
498	0.18
499	0.19
500	0.21
501	0.22
502	0.23
503	0.25
504	0.27
505	0.24
506	0.32
507	0.34
508	0.35
509	0.32
510	0.32
511	0.31
512	0.3
513	0.28
514	0.2
515	0.19
516	0.17
517	0.16
518	0.14
519	0.15
520	0.14
521	0.14
522	0.14
523	0.12
524	0.14
525	0.15
526	0.15
527	0.16
528	0.18
529	0.23
530	0.23
531	0.25
532	0.22
533	0.23
534	0.23
535	0.2
536	0.21
537	0.18
538	0.18
539	0.19
540	0.2
541	0.2
542	0.24
543	0.25
544	0.27
545	0.29
546	0.33
547	0.36
548	0.39
549	0.38
550	0.34
551	0.33
552	0.29
553	0.27
554	0.26
555	0.26
556	0.25
557	0.24
558	0.24
559	0.24
560	0.23
561	0.19
562	0.18
563	0.14
564	0.13
565	0.14
566	0.15
567	0.16
568	0.23
569	0.23
570	0.21
571	0.22
572	0.25
573	0.31
574	0.36
575	0.37
576	0.36
577	0.38
578	0.4
579	0.42
580	0.39
581	0.3
582	0.24
583	0.21
584	0.17
585	0.14
586	0.12
587	0.1
588	0.09
589	0.07
590	0.08
591	0.08
592	0.07
593	0.08
594	0.1
595	0.1
596	0.1
597	0.11
598	0.12
599	0.12
600	0.11
601	0.11
602	0.1
603	0.11
604	0.13
605	0.15
606	0.17
607	0.19
608	0.2
609	0.22
610	0.3
611	0.37
612	0.43
613	0.48
614	0.55
615	0.57
616	0.58
617	0.59
618	0.52
619	0.5
620	0.43
621	0.38
622	0.29
623	0.29
624	0.32
625	0.31
626	0.34
627	0.28
628	0.28
629	0.29
630	0.29
631	0.29
632	0.28
633	0.31
634	0.29
635	0.3
636	0.29
637	0.29
638	0.27
639	0.24
640	0.2
641	0.19
642	0.17
643	0.15
644	0.13
645	0.11
646	0.12
647	0.12
648	0.11
649	0.09
650	0.09
651	0.09
652	0.1
653	0.11
654	0.13
655	0.18
656	0.22
657	0.24
658	0.29
659	0.32
660	0.34
661	0.35
662	0.32
663	0.26
664	0.21
665	0.19
666	0.13
667	0.09
668	0.06
669	0.05
670	0.05
671	0.04
672	0.04
673	0.04
674	0.05
675	0.05
676	0.05
677	0.05
678	0.09
679	0.16
680	0.24
681	0.36
682	0.46
683	0.56
684	0.68
685	0.79
686	0.86
687	0.91
688	0.94
689	0.95
690	0.96
691	0.97
692	0.96
693	0.93
694	0.93
695	0.93
696	0.92
697	0.9
698	0.85
699	0.83
700	0.81
701	0.81
702	0.8
703	0.8
704	0.8
705	0.82
706	0.86
707	0.86
708	0.87
709	0.83
710	0.83
711	0.82
712	0.77
713	0.73
714	0.69
715	0.6
716	0.52
717	0.52
718	0.42
719	0.35
720	0.28
721	0.22
722	0.16
723	0.16
724	0.19
725	0.13
726	0.13
727	0.11
728	0.12
729	0.12
730	0.11
731	0.12
732	0.16
733	0.23
734	0.25
735	0.34
736	0.41
737	0.49
738	0.58
739	0.68
740	0.73
741	0.76
742	0.86
743	0.87
744	0.88
745	0.87
746	0.84
747	0.81
748	0.79
749	0.74
750	0.66
751	0.63
752	0.55
753	0.54
754	0.51
755	0.47
756	0.46
757	0.49
758	0.56
759	0.53
760	0.57
761	0.6
762	0.62
763	0.67
764	0.66
765	0.67
766	0.6
767	0.57
768	0.58
769	0.55
770	0.55
771	0.51
772	0.53
773	0.5
774	0.5
775	0.53
776	0.51
777	0.5
778	0.48
779	0.48
780	0.38
781	0.32
782	0.33
783	0.27
784	0.22
785	0.2
786	0.15
787	0.09
788	0.08
789	0.08
790	0.05
791	0.05
792	0.05
793	0.05
794	0.06
795	0.06
796	0.07
797	0.08
798	0.07
799	0.08
800	0.11
801	0.12
802	0.16
803	0.17
804	0.18
805	0.18
806	0.24
807	0.28
808	0.3
809	0.33
810	0.31
811	0.36
812	0.37
813	0.36
814	0.32
815	0.26
816	0.25
817	0.23
818	0.19
819	0.13
820	0.13
821	0.14
822	0.13
823	0.13
824	0.11

A0A4T0FMV6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer