Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0FP79

Protein Details
Accession A0A4T0FP79    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
88-128RERDYERRRYSDRPRRDREDERYERARRRDDYDRRARRDDRBasic
134-174RYERRDRDRERDRDRDRDRYDDRRPRRSDRDRDDRRRGGDRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
95-198RRYSDRPRRDREDERYERARRRDDYDRRARRDDRERDVERYERRDRDRERDRDRDRDRYDDRRPRRSDRDRDDRRRGGDRDRGGRDGRDGRDDRDRSYGTPKRR
Subcellular Location(s) cyto 9cyto_nucl 9, nucl 7, E.R. 4, mito 3, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR003954  RRM_dom_euk  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12231  RRM2_U2AF65  
cd12232  RRM3_U2AF65  
Amino Acid Sequences MHSFSSQYVAVSLHLLWEKIATTESRDALLVFGLEGATVLVNLCCTFAGHISLYSPLQQIHLFNHNGDVSEARNVLSGLLLCYRDRERERDYERRRYSDRPRRDREDERYERARRRDDYDRRARRDDRERDVERYERRDRDRERDRDRDRDRYDDRRPRRSDRDRDDRRRGGDRDRGGRDGRDGRDDRDRSYGTPKRRSPTPEGTVPLSQRKKQRSYWDIKPPGFEGITALQAKYSGIFAMSGVQRAVAFPGQSSFSNLPPTLEDFTGSRATRRVFIGDIKPNHNEENLTKLFNDKMSTIEEVAKIPGDATVNVTVKHDRGYAYVEFRNPEEAKLALQFDGTIFQGEPIQVKRPEEVLEELQRKQGSGISGTVPDSDQKIFVGSLPSFLNDEQVMELLSSFGELRSFNLVKEGTTDVSKGFAFCEYKDPALTDIAIQGLNGMEVGDRKLVVQRSSTGPMGKIGAGGTSTIAQILPMASETQAIRSNVLLLLNMVTAEELKDDLDYQEICEDITEECSQYGEILKLKIPRPPKPDDPVFRTPGVTTASGEDFRFEEVSEEMGVGRIFLLFRTEEQASKALKGLAGRVFGGRTVVGAYGRIEDVEDAPLPPEMPTDDAPMPPDDGIPPPPPPS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.15
3 0.14
4 0.15
5 0.14
6 0.14
7 0.16
8 0.12
9 0.17
10 0.22
11 0.23
12 0.22
13 0.22
14 0.22
15 0.2
16 0.19
17 0.14
18 0.08
19 0.08
20 0.06
21 0.06
22 0.06
23 0.05
24 0.05
25 0.04
26 0.05
27 0.05
28 0.06
29 0.06
30 0.06
31 0.06
32 0.07
33 0.08
34 0.09
35 0.12
36 0.12
37 0.13
38 0.14
39 0.16
40 0.16
41 0.18
42 0.18
43 0.15
44 0.17
45 0.18
46 0.19
47 0.21
48 0.27
49 0.26
50 0.25
51 0.29
52 0.27
53 0.26
54 0.25
55 0.22
56 0.16
57 0.19
58 0.19
59 0.14
60 0.15
61 0.14
62 0.13
63 0.13
64 0.12
65 0.1
66 0.13
67 0.14
68 0.14
69 0.18
70 0.21
71 0.28
72 0.31
73 0.36
74 0.38
75 0.46
76 0.54
77 0.61
78 0.67
79 0.7
80 0.73
81 0.74
82 0.74
83 0.73
84 0.77
85 0.76
86 0.79
87 0.79
88 0.81
89 0.82
90 0.85
91 0.85
92 0.83
93 0.84
94 0.8
95 0.78
96 0.78
97 0.78
98 0.77
99 0.76
100 0.75
101 0.67
102 0.67
103 0.69
104 0.7
105 0.73
106 0.76
107 0.78
108 0.77
109 0.81
110 0.8
111 0.79
112 0.79
113 0.77
114 0.75
115 0.75
116 0.72
117 0.68
118 0.69
119 0.67
120 0.63
121 0.62
122 0.62
123 0.6
124 0.62
125 0.67
126 0.68
127 0.7
128 0.74
129 0.76
130 0.76
131 0.78
132 0.79
133 0.8
134 0.8
135 0.8
136 0.74
137 0.73
138 0.71
139 0.7
140 0.74
141 0.74
142 0.76
143 0.76
144 0.78
145 0.78
146 0.82
147 0.83
148 0.83
149 0.82
150 0.84
151 0.85
152 0.89
153 0.9
154 0.85
155 0.8
156 0.78
157 0.72
158 0.69
159 0.67
160 0.64
161 0.63
162 0.6
163 0.6
164 0.53
165 0.5
166 0.48
167 0.47
168 0.42
169 0.42
170 0.4
171 0.38
172 0.46
173 0.46
174 0.42
175 0.41
176 0.4
177 0.34
178 0.42
179 0.46
180 0.45
181 0.53
182 0.56
183 0.54
184 0.59
185 0.63
186 0.61
187 0.64
188 0.61
189 0.57
190 0.54
191 0.53
192 0.51
193 0.47
194 0.49
195 0.44
196 0.43
197 0.46
198 0.51
199 0.54
200 0.56
201 0.63
202 0.63
203 0.66
204 0.7
205 0.73
206 0.74
207 0.69
208 0.64
209 0.55
210 0.48
211 0.4
212 0.31
213 0.22
214 0.15
215 0.18
216 0.16
217 0.15
218 0.12
219 0.12
220 0.12
221 0.1
222 0.09
223 0.05
224 0.04
225 0.05
226 0.05
227 0.09
228 0.09
229 0.1
230 0.09
231 0.1
232 0.09
233 0.09
234 0.11
235 0.08
236 0.07
237 0.06
238 0.08
239 0.09
240 0.09
241 0.14
242 0.13
243 0.14
244 0.17
245 0.17
246 0.17
247 0.16
248 0.18
249 0.16
250 0.15
251 0.14
252 0.11
253 0.14
254 0.18
255 0.18
256 0.16
257 0.17
258 0.18
259 0.2
260 0.2
261 0.19
262 0.15
263 0.19
264 0.25
265 0.29
266 0.32
267 0.32
268 0.34
269 0.34
270 0.33
271 0.3
272 0.25
273 0.18
274 0.22
275 0.2
276 0.18
277 0.17
278 0.17
279 0.17
280 0.17
281 0.17
282 0.1
283 0.11
284 0.12
285 0.13
286 0.13
287 0.13
288 0.13
289 0.12
290 0.12
291 0.11
292 0.08
293 0.08
294 0.08
295 0.07
296 0.06
297 0.07
298 0.11
299 0.12
300 0.12
301 0.14
302 0.13
303 0.13
304 0.14
305 0.13
306 0.09
307 0.1
308 0.13
309 0.14
310 0.17
311 0.18
312 0.19
313 0.18
314 0.18
315 0.23
316 0.2
317 0.18
318 0.16
319 0.14
320 0.14
321 0.14
322 0.15
323 0.09
324 0.09
325 0.08
326 0.07
327 0.08
328 0.07
329 0.06
330 0.05
331 0.06
332 0.06
333 0.07
334 0.09
335 0.09
336 0.14
337 0.15
338 0.16
339 0.17
340 0.17
341 0.18
342 0.18
343 0.19
344 0.18
345 0.23
346 0.25
347 0.25
348 0.27
349 0.26
350 0.24
351 0.22
352 0.2
353 0.15
354 0.13
355 0.14
356 0.11
357 0.12
358 0.13
359 0.13
360 0.11
361 0.1
362 0.11
363 0.1
364 0.09
365 0.08
366 0.09
367 0.08
368 0.09
369 0.11
370 0.1
371 0.11
372 0.11
373 0.12
374 0.12
375 0.12
376 0.13
377 0.09
378 0.1
379 0.08
380 0.07
381 0.07
382 0.06
383 0.06
384 0.04
385 0.04
386 0.04
387 0.04
388 0.04
389 0.05
390 0.05
391 0.06
392 0.13
393 0.13
394 0.13
395 0.16
396 0.16
397 0.15
398 0.18
399 0.18
400 0.13
401 0.13
402 0.14
403 0.1
404 0.12
405 0.12
406 0.1
407 0.09
408 0.11
409 0.12
410 0.12
411 0.18
412 0.18
413 0.19
414 0.19
415 0.19
416 0.17
417 0.17
418 0.16
419 0.11
420 0.1
421 0.1
422 0.09
423 0.08
424 0.07
425 0.06
426 0.05
427 0.05
428 0.04
429 0.04
430 0.04
431 0.06
432 0.06
433 0.06
434 0.07
435 0.12
436 0.15
437 0.16
438 0.17
439 0.19
440 0.22
441 0.26
442 0.28
443 0.25
444 0.22
445 0.22
446 0.22
447 0.19
448 0.15
449 0.12
450 0.1
451 0.09
452 0.08
453 0.08
454 0.07
455 0.07
456 0.06
457 0.06
458 0.05
459 0.06
460 0.05
461 0.05
462 0.05
463 0.06
464 0.05
465 0.08
466 0.08
467 0.11
468 0.16
469 0.16
470 0.16
471 0.16
472 0.17
473 0.16
474 0.16
475 0.13
476 0.09
477 0.09
478 0.08
479 0.08
480 0.07
481 0.05
482 0.05
483 0.05
484 0.05
485 0.05
486 0.05
487 0.06
488 0.06
489 0.07
490 0.09
491 0.09
492 0.09
493 0.1
494 0.1
495 0.09
496 0.09
497 0.09
498 0.07
499 0.11
500 0.11
501 0.1
502 0.1
503 0.11
504 0.11
505 0.11
506 0.12
507 0.11
508 0.13
509 0.14
510 0.18
511 0.24
512 0.26
513 0.31
514 0.37
515 0.42
516 0.47
517 0.53
518 0.58
519 0.6
520 0.68
521 0.71
522 0.72
523 0.71
524 0.69
525 0.63
526 0.56
527 0.47
528 0.42
529 0.36
530 0.29
531 0.22
532 0.2
533 0.22
534 0.23
535 0.23
536 0.2
537 0.17
538 0.18
539 0.17
540 0.14
541 0.13
542 0.11
543 0.13
544 0.12
545 0.11
546 0.09
547 0.1
548 0.1
549 0.08
550 0.08
551 0.07
552 0.07
553 0.07
554 0.1
555 0.09
556 0.1
557 0.16
558 0.17
559 0.17
560 0.2
561 0.26
562 0.25
563 0.25
564 0.27
565 0.23
566 0.23
567 0.23
568 0.26
569 0.24
570 0.24
571 0.23
572 0.23
573 0.22
574 0.21
575 0.21
576 0.16
577 0.12
578 0.12
579 0.12
580 0.11
581 0.12
582 0.12
583 0.13
584 0.13
585 0.13
586 0.12
587 0.12
588 0.13
589 0.14
590 0.14
591 0.12
592 0.13
593 0.14
594 0.14
595 0.12
596 0.13
597 0.11
598 0.14
599 0.15
600 0.2
601 0.21
602 0.22
603 0.24
604 0.25
605 0.25
606 0.21
607 0.21
608 0.17
609 0.19
610 0.23
611 0.24