Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0VGJ3

Protein Details
Accession A0A4U0VGJ3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
109-133ARPPSPNFKPKRPSLPRPESPLRKPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
113-133SPNFKPKRPSLPRPESPLRKP
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 15, cyto 11.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036859  CAP-Gly_dom_sf  
IPR000938  CAP-Gly_domain  
IPR032108  CLIP1_ZNF  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005856  C:cytoskeleton  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF01302  CAP_GLY  
PF16641  CLIP1_ZNF  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50245  CAP_GLY_2  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MYGVVRFIGTVKDKAGDFVGVELDRKFAARGKNSGDVDGIKYFKTVVRGAGIFLPLHRAEKRSTPGASNDYFPNTPGTPSYSTLNNKNAYTPPTPALPHKFSQTMGPGARPPSPNFKPKRPSLPRPESPLRKPPNLAPTPARNLSQSVRGGRPPGLSTATTPSKNNFRSSTTTRPTASQTPRPYSRTGSRLGHRQRDIAEEDSTPVGYAATSNGRTPSMNSVPSFSQPLRSPSRLGSAGGQDVEIQRLKRELGERERRLEEQAANLAEMESSVKELSALLPADGMTPGGSMNKNSMNEEDEHSAAQLRQLLREKNEKISLMTQEFDTHRADFRSTLDSLEMASTETERVYEEQKTDLLAQVEGLQRHNEQLREEVAADGGRGAGKEDFDSIVSELKRLEELVAELEDGLEESRRGEAEARGEVEFLRGEVERGRSELKREREKAASLQVKGVSDGAGNKELNQKDDEIRGLKAIIHGLSSTPAPSAHGNGYVTDADELKRLQDALDESKAEKEDLENELEQLRRDAAVTNGHVNGNGHMRNESERTAKVPESDKPLPLRQRSGTIKPTFAEHAKRSGMSEPLPAADDDEDVNGAPVEGVYCEMCEARDHDTLDCTRLNGSHSHHAEASAAHGDDHEREHDGEESLNYTPGKENRDAATTAAAGSNKPSAADEDKWCALCEEDGHLAFDCPQEQY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.26
3 0.21
4 0.17
5 0.16
6 0.19
7 0.16
8 0.18
9 0.16
10 0.16
11 0.15
12 0.15
13 0.16
14 0.17
15 0.25
16 0.29
17 0.35
18 0.4
19 0.48
20 0.49
21 0.49
22 0.46
23 0.4
24 0.38
25 0.36
26 0.32
27 0.23
28 0.22
29 0.22
30 0.22
31 0.24
32 0.22
33 0.2
34 0.24
35 0.24
36 0.25
37 0.27
38 0.27
39 0.22
40 0.21
41 0.24
42 0.2
43 0.24
44 0.25
45 0.25
46 0.26
47 0.34
48 0.39
49 0.4
50 0.41
51 0.4
52 0.44
53 0.48
54 0.46
55 0.41
56 0.39
57 0.38
58 0.35
59 0.32
60 0.31
61 0.25
62 0.25
63 0.23
64 0.25
65 0.23
66 0.25
67 0.27
68 0.29
69 0.34
70 0.39
71 0.44
72 0.43
73 0.4
74 0.43
75 0.44
76 0.42
77 0.4
78 0.37
79 0.32
80 0.33
81 0.34
82 0.37
83 0.41
84 0.41
85 0.4
86 0.41
87 0.41
88 0.37
89 0.4
90 0.37
91 0.36
92 0.33
93 0.33
94 0.32
95 0.33
96 0.39
97 0.37
98 0.36
99 0.39
100 0.44
101 0.51
102 0.54
103 0.61
104 0.63
105 0.68
106 0.76
107 0.75
108 0.79
109 0.81
110 0.84
111 0.81
112 0.82
113 0.84
114 0.82
115 0.79
116 0.79
117 0.76
118 0.71
119 0.67
120 0.65
121 0.65
122 0.6
123 0.57
124 0.53
125 0.53
126 0.55
127 0.55
128 0.49
129 0.4
130 0.4
131 0.37
132 0.38
133 0.36
134 0.34
135 0.34
136 0.35
137 0.37
138 0.36
139 0.36
140 0.3
141 0.28
142 0.26
143 0.23
144 0.23
145 0.27
146 0.3
147 0.3
148 0.3
149 0.31
150 0.37
151 0.39
152 0.42
153 0.38
154 0.37
155 0.42
156 0.48
157 0.54
158 0.5
159 0.52
160 0.48
161 0.47
162 0.48
163 0.5
164 0.5
165 0.49
166 0.5
167 0.54
168 0.58
169 0.59
170 0.57
171 0.54
172 0.54
173 0.49
174 0.48
175 0.47
176 0.46
177 0.53
178 0.58
179 0.61
180 0.56
181 0.55
182 0.5
183 0.48
184 0.47
185 0.4
186 0.33
187 0.25
188 0.25
189 0.22
190 0.2
191 0.15
192 0.11
193 0.08
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.1
198 0.11
199 0.12
200 0.13
201 0.14
202 0.14
203 0.16
204 0.21
205 0.21
206 0.24
207 0.23
208 0.25
209 0.25
210 0.26
211 0.29
212 0.22
213 0.23
214 0.22
215 0.27
216 0.31
217 0.32
218 0.32
219 0.3
220 0.35
221 0.31
222 0.29
223 0.26
224 0.21
225 0.21
226 0.19
227 0.18
228 0.14
229 0.13
230 0.15
231 0.15
232 0.13
233 0.12
234 0.13
235 0.13
236 0.15
237 0.19
238 0.24
239 0.32
240 0.43
241 0.45
242 0.49
243 0.52
244 0.5
245 0.48
246 0.44
247 0.35
248 0.26
249 0.27
250 0.22
251 0.19
252 0.18
253 0.15
254 0.11
255 0.1
256 0.08
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.05
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.07
265 0.08
266 0.07
267 0.07
268 0.07
269 0.07
270 0.07
271 0.07
272 0.04
273 0.04
274 0.04
275 0.06
276 0.07
277 0.07
278 0.09
279 0.12
280 0.13
281 0.14
282 0.15
283 0.15
284 0.16
285 0.18
286 0.18
287 0.15
288 0.14
289 0.13
290 0.13
291 0.11
292 0.11
293 0.12
294 0.1
295 0.14
296 0.18
297 0.21
298 0.23
299 0.32
300 0.32
301 0.33
302 0.36
303 0.32
304 0.29
305 0.3
306 0.3
307 0.23
308 0.22
309 0.17
310 0.18
311 0.18
312 0.18
313 0.17
314 0.14
315 0.14
316 0.14
317 0.15
318 0.13
319 0.14
320 0.15
321 0.14
322 0.13
323 0.12
324 0.11
325 0.11
326 0.1
327 0.08
328 0.05
329 0.05
330 0.05
331 0.05
332 0.05
333 0.05
334 0.05
335 0.06
336 0.08
337 0.09
338 0.1
339 0.1
340 0.11
341 0.11
342 0.11
343 0.12
344 0.11
345 0.09
346 0.08
347 0.11
348 0.14
349 0.13
350 0.14
351 0.13
352 0.13
353 0.15
354 0.17
355 0.15
356 0.13
357 0.14
358 0.15
359 0.14
360 0.15
361 0.12
362 0.11
363 0.09
364 0.08
365 0.06
366 0.06
367 0.05
368 0.04
369 0.05
370 0.05
371 0.05
372 0.06
373 0.07
374 0.07
375 0.07
376 0.08
377 0.07
378 0.11
379 0.11
380 0.11
381 0.1
382 0.1
383 0.1
384 0.1
385 0.09
386 0.06
387 0.06
388 0.07
389 0.07
390 0.06
391 0.06
392 0.05
393 0.05
394 0.05
395 0.04
396 0.04
397 0.03
398 0.04
399 0.05
400 0.05
401 0.06
402 0.07
403 0.09
404 0.11
405 0.13
406 0.14
407 0.14
408 0.14
409 0.14
410 0.13
411 0.11
412 0.08
413 0.08
414 0.06
415 0.07
416 0.09
417 0.12
418 0.11
419 0.13
420 0.17
421 0.16
422 0.23
423 0.3
424 0.36
425 0.43
426 0.46
427 0.49
428 0.49
429 0.5
430 0.47
431 0.49
432 0.46
433 0.37
434 0.37
435 0.35
436 0.31
437 0.29
438 0.26
439 0.17
440 0.12
441 0.13
442 0.12
443 0.14
444 0.14
445 0.15
446 0.22
447 0.22
448 0.24
449 0.23
450 0.23
451 0.21
452 0.23
453 0.25
454 0.2
455 0.19
456 0.18
457 0.17
458 0.16
459 0.15
460 0.14
461 0.11
462 0.1
463 0.1
464 0.09
465 0.1
466 0.09
467 0.08
468 0.07
469 0.07
470 0.09
471 0.09
472 0.11
473 0.11
474 0.14
475 0.14
476 0.14
477 0.16
478 0.14
479 0.14
480 0.12
481 0.12
482 0.1
483 0.11
484 0.11
485 0.09
486 0.1
487 0.09
488 0.09
489 0.11
490 0.13
491 0.16
492 0.19
493 0.2
494 0.2
495 0.22
496 0.23
497 0.2
498 0.17
499 0.14
500 0.15
501 0.16
502 0.19
503 0.16
504 0.16
505 0.19
506 0.2
507 0.19
508 0.16
509 0.15
510 0.11
511 0.12
512 0.12
513 0.12
514 0.16
515 0.18
516 0.2
517 0.21
518 0.21
519 0.21
520 0.21
521 0.2
522 0.21
523 0.21
524 0.18
525 0.17
526 0.19
527 0.21
528 0.23
529 0.24
530 0.22
531 0.22
532 0.24
533 0.27
534 0.27
535 0.28
536 0.29
537 0.3
538 0.36
539 0.38
540 0.4
541 0.41
542 0.48
543 0.52
544 0.53
545 0.55
546 0.48
547 0.54
548 0.56
549 0.58
550 0.6
551 0.55
552 0.53
553 0.47
554 0.47
555 0.44
556 0.42
557 0.42
558 0.35
559 0.38
560 0.38
561 0.38
562 0.37
563 0.36
564 0.34
565 0.28
566 0.29
567 0.23
568 0.22
569 0.23
570 0.2
571 0.19
572 0.15
573 0.14
574 0.11
575 0.11
576 0.1
577 0.09
578 0.09
579 0.07
580 0.06
581 0.06
582 0.05
583 0.05
584 0.05
585 0.06
586 0.06
587 0.06
588 0.07
589 0.07
590 0.08
591 0.09
592 0.11
593 0.15
594 0.2
595 0.21
596 0.21
597 0.26
598 0.27
599 0.29
600 0.28
601 0.23
602 0.2
603 0.2
604 0.21
605 0.21
606 0.25
607 0.32
608 0.34
609 0.36
610 0.35
611 0.34
612 0.33
613 0.28
614 0.26
615 0.2
616 0.17
617 0.14
618 0.14
619 0.15
620 0.16
621 0.19
622 0.17
623 0.16
624 0.16
625 0.18
626 0.2
627 0.19
628 0.19
629 0.17
630 0.17
631 0.16
632 0.19
633 0.17
634 0.16
635 0.22
636 0.25
637 0.3
638 0.31
639 0.34
640 0.34
641 0.38
642 0.37
643 0.32
644 0.31
645 0.25
646 0.23
647 0.22
648 0.2
649 0.16
650 0.18
651 0.19
652 0.16
653 0.16
654 0.17
655 0.18
656 0.24
657 0.29
658 0.31
659 0.35
660 0.38
661 0.38
662 0.38
663 0.34
664 0.29
665 0.25
666 0.22
667 0.21
668 0.22
669 0.22
670 0.23
671 0.23
672 0.22
673 0.22
674 0.23