Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0V9M6

Protein Details
Accession A0A4U0V9M6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
84-106EKHDGEPRERKRRKLHGEDDTDCBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
76-97AKARRDRDEKHDGEPRERKRRK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 11.5, cyto 4.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019339  CIR_N_dom  
IPR039875  LENG1-like  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF10197  Cir_N  
Amino Acid Sequences MVLHLLGKKSWNVYNTANVERVRRDEAEAQAREEAEEQRMQDEDAARRIALLRGEPVAPLLPEAVTPGDSDARGNAKARRDRDEKHDGEPRERKRRKLHGEDDTDCEIRFAREDAEAGQRAKTVLVKKDVDDAPLIDHAGHVQLIPAPDEKAIRKAGKNDAAEVEKAQKRKREEDQVTMRFSNAAGFKNGMEKPWYASNKLAGVEERGASKTVVLTEVSEKDVWGNEDPRRKDRERSRISSGDPFAAMKHAQRQLKQSSFDKERWQRERMTELEELKRTEEKQERLDRRRELVDNTGLDGFSLDAPHTTERKCSERD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.41
3 0.42
4 0.44
5 0.41
6 0.44
7 0.43
8 0.44
9 0.4
10 0.36
11 0.37
12 0.38
13 0.43
14 0.49
15 0.46
16 0.45
17 0.42
18 0.4
19 0.36
20 0.32
21 0.27
22 0.21
23 0.22
24 0.2
25 0.19
26 0.2
27 0.19
28 0.2
29 0.23
30 0.22
31 0.24
32 0.24
33 0.22
34 0.22
35 0.23
36 0.23
37 0.2
38 0.18
39 0.16
40 0.17
41 0.17
42 0.16
43 0.16
44 0.15
45 0.13
46 0.11
47 0.1
48 0.08
49 0.08
50 0.09
51 0.09
52 0.08
53 0.08
54 0.09
55 0.1
56 0.1
57 0.11
58 0.12
59 0.14
60 0.16
61 0.19
62 0.22
63 0.29
64 0.36
65 0.39
66 0.45
67 0.48
68 0.5
69 0.55
70 0.61
71 0.55
72 0.55
73 0.59
74 0.53
75 0.57
76 0.62
77 0.64
78 0.65
79 0.67
80 0.69
81 0.71
82 0.79
83 0.8
84 0.81
85 0.8
86 0.78
87 0.81
88 0.76
89 0.71
90 0.64
91 0.54
92 0.44
93 0.35
94 0.26
95 0.18
96 0.16
97 0.11
98 0.08
99 0.08
100 0.09
101 0.11
102 0.15
103 0.18
104 0.18
105 0.17
106 0.16
107 0.16
108 0.16
109 0.19
110 0.18
111 0.19
112 0.25
113 0.26
114 0.26
115 0.32
116 0.32
117 0.29
118 0.25
119 0.21
120 0.16
121 0.16
122 0.15
123 0.08
124 0.07
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.04
129 0.04
130 0.05
131 0.06
132 0.07
133 0.07
134 0.07
135 0.08
136 0.1
137 0.1
138 0.13
139 0.17
140 0.19
141 0.2
142 0.23
143 0.29
144 0.34
145 0.34
146 0.31
147 0.29
148 0.28
149 0.27
150 0.23
151 0.25
152 0.21
153 0.24
154 0.26
155 0.29
156 0.32
157 0.38
158 0.43
159 0.47
160 0.48
161 0.53
162 0.6
163 0.59
164 0.59
165 0.53
166 0.47
167 0.36
168 0.32
169 0.26
170 0.19
171 0.15
172 0.12
173 0.13
174 0.13
175 0.19
176 0.19
177 0.16
178 0.16
179 0.15
180 0.17
181 0.24
182 0.26
183 0.22
184 0.23
185 0.24
186 0.25
187 0.25
188 0.23
189 0.16
190 0.16
191 0.16
192 0.15
193 0.14
194 0.13
195 0.13
196 0.12
197 0.12
198 0.1
199 0.09
200 0.1
201 0.09
202 0.09
203 0.11
204 0.12
205 0.14
206 0.13
207 0.13
208 0.12
209 0.13
210 0.15
211 0.15
212 0.19
213 0.22
214 0.3
215 0.34
216 0.4
217 0.46
218 0.47
219 0.54
220 0.59
221 0.65
222 0.66
223 0.68
224 0.7
225 0.67
226 0.68
227 0.66
228 0.58
229 0.48
230 0.4
231 0.34
232 0.26
233 0.24
234 0.22
235 0.16
236 0.22
237 0.27
238 0.31
239 0.34
240 0.41
241 0.47
242 0.52
243 0.55
244 0.52
245 0.55
246 0.56
247 0.57
248 0.6
249 0.61
250 0.65
251 0.66
252 0.65
253 0.61
254 0.6
255 0.63
256 0.55
257 0.51
258 0.47
259 0.46
260 0.49
261 0.47
262 0.43
263 0.4
264 0.42
265 0.37
266 0.41
267 0.44
268 0.42
269 0.48
270 0.57
271 0.65
272 0.69
273 0.76
274 0.72
275 0.7
276 0.71
277 0.66
278 0.6
279 0.57
280 0.56
281 0.48
282 0.45
283 0.41
284 0.33
285 0.29
286 0.24
287 0.18
288 0.12
289 0.11
290 0.09
291 0.08
292 0.11
293 0.17
294 0.2
295 0.21
296 0.26
297 0.31