Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0TRF8

Protein Details
Accession A0A4U0TRF8    Localization Confidence High Confidence Score 23.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
12-38TSPSHSPEPVPDRKRKQEKIPEDDKLAHydrophilic
41-71VSAPEPPSKKARRAEKKGKSKPKTTQPTTVSHydrophilic
296-326QADAGQKKARKTKSRRHKKHINQLHGRPLRCBasic
397-431ARSSKGPTPHAQKRDKEQRRDERRKRHDARTVAPGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
46-63PPSKKARRAEKKGKSKPK
302-315KKARKTKSRRHKKH
337-361KKRYGKDAVKPAPGRDRRAPPVRAA
401-424KGPTPHAQKRDKEQRRDERRKRHD
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSKHSPEEAVATSPSHSPEPVPDRKRKQEKIPEDDKLAIDVSAPEPPSKKARRAEKKGKSKPKTTQPTTVSSAAEASQTGTTTTGTQDASTSAPTGTRADYGIWIGNLPFSATKDSLKQFLKEEGGIEGREIMRLHMPPPTDKAMASKSSNRGFAYVDFAREEILDKAMGLTEYMMGGRRVLIKNAKSFEGRPEKKVGGEEGVEARVMKKESSKRIFVGNLGFDVTREELEELFGVAGEVEDVFMATFQDSGKSKGFAWIRFMEAEAAEAAVRGFVYVKADEDGSGGESEDGDEDQADAGQKKARKTKSRRHKKHINQLHGRPLRCEFAEDPQTRYKKRYGKDAVKPAPGRDRRAPPVRAARDPAASGANRESIHASAAGEAPTDDLSSLISAAAAARSSKGPTPHAQKRDKEQRRDERRKRHDARTVAPGAALAGAQRATGAIVEGKGRKVVFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.21
3 0.19
4 0.18
5 0.25
6 0.33
7 0.42
8 0.48
9 0.56
10 0.64
11 0.74
12 0.84
13 0.83
14 0.85
15 0.86
16 0.88
17 0.88
18 0.87
19 0.82
20 0.76
21 0.72
22 0.61
23 0.52
24 0.42
25 0.32
26 0.23
27 0.19
28 0.16
29 0.17
30 0.17
31 0.18
32 0.19
33 0.23
34 0.32
35 0.37
36 0.44
37 0.48
38 0.59
39 0.67
40 0.76
41 0.84
42 0.84
43 0.89
44 0.92
45 0.94
46 0.91
47 0.9
48 0.89
49 0.89
50 0.89
51 0.84
52 0.83
53 0.76
54 0.74
55 0.7
56 0.63
57 0.53
58 0.42
59 0.37
60 0.28
61 0.24
62 0.17
63 0.14
64 0.11
65 0.1
66 0.1
67 0.1
68 0.1
69 0.1
70 0.11
71 0.12
72 0.11
73 0.11
74 0.11
75 0.12
76 0.12
77 0.12
78 0.12
79 0.09
80 0.1
81 0.11
82 0.12
83 0.12
84 0.12
85 0.12
86 0.12
87 0.13
88 0.14
89 0.14
90 0.13
91 0.12
92 0.11
93 0.11
94 0.1
95 0.1
96 0.09
97 0.09
98 0.12
99 0.13
100 0.15
101 0.2
102 0.22
103 0.28
104 0.3
105 0.3
106 0.29
107 0.32
108 0.33
109 0.28
110 0.27
111 0.22
112 0.22
113 0.2
114 0.17
115 0.16
116 0.13
117 0.15
118 0.14
119 0.12
120 0.14
121 0.15
122 0.15
123 0.16
124 0.17
125 0.17
126 0.21
127 0.24
128 0.21
129 0.21
130 0.24
131 0.25
132 0.28
133 0.29
134 0.31
135 0.34
136 0.36
137 0.4
138 0.36
139 0.33
140 0.3
141 0.28
142 0.28
143 0.22
144 0.21
145 0.17
146 0.17
147 0.16
148 0.15
149 0.15
150 0.09
151 0.09
152 0.08
153 0.07
154 0.07
155 0.07
156 0.07
157 0.06
158 0.05
159 0.04
160 0.04
161 0.05
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.07
166 0.12
167 0.13
168 0.16
169 0.22
170 0.24
171 0.29
172 0.31
173 0.32
174 0.28
175 0.29
176 0.34
177 0.39
178 0.38
179 0.36
180 0.39
181 0.38
182 0.37
183 0.38
184 0.3
185 0.21
186 0.19
187 0.17
188 0.14
189 0.13
190 0.12
191 0.11
192 0.1
193 0.1
194 0.1
195 0.09
196 0.14
197 0.2
198 0.3
199 0.34
200 0.36
201 0.35
202 0.38
203 0.38
204 0.33
205 0.3
206 0.21
207 0.17
208 0.16
209 0.14
210 0.11
211 0.11
212 0.1
213 0.07
214 0.07
215 0.07
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.05
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.03
224 0.03
225 0.02
226 0.02
227 0.02
228 0.02
229 0.02
230 0.02
231 0.02
232 0.03
233 0.03
234 0.03
235 0.03
236 0.07
237 0.07
238 0.11
239 0.12
240 0.13
241 0.13
242 0.19
243 0.22
244 0.21
245 0.25
246 0.23
247 0.24
248 0.23
249 0.23
250 0.17
251 0.14
252 0.13
253 0.08
254 0.07
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.04
259 0.04
260 0.03
261 0.04
262 0.04
263 0.06
264 0.06
265 0.07
266 0.08
267 0.08
268 0.08
269 0.08
270 0.08
271 0.07
272 0.07
273 0.06
274 0.06
275 0.05
276 0.05
277 0.06
278 0.05
279 0.04
280 0.04
281 0.04
282 0.04
283 0.05
284 0.06
285 0.06
286 0.07
287 0.11
288 0.14
289 0.2
290 0.28
291 0.37
292 0.46
293 0.55
294 0.65
295 0.72
296 0.81
297 0.86
298 0.88
299 0.9
300 0.9
301 0.92
302 0.91
303 0.91
304 0.89
305 0.84
306 0.85
307 0.8
308 0.71
309 0.63
310 0.55
311 0.48
312 0.39
313 0.36
314 0.27
315 0.28
316 0.37
317 0.36
318 0.38
319 0.42
320 0.48
321 0.47
322 0.49
323 0.5
324 0.48
325 0.49
326 0.56
327 0.58
328 0.62
329 0.69
330 0.76
331 0.75
332 0.76
333 0.75
334 0.69
335 0.69
336 0.64
337 0.62
338 0.59
339 0.6
340 0.6
341 0.67
342 0.65
343 0.63
344 0.68
345 0.67
346 0.64
347 0.61
348 0.55
349 0.49
350 0.47
351 0.4
352 0.35
353 0.29
354 0.26
355 0.23
356 0.24
357 0.22
358 0.22
359 0.22
360 0.17
361 0.18
362 0.17
363 0.15
364 0.12
365 0.13
366 0.12
367 0.1
368 0.1
369 0.1
370 0.09
371 0.09
372 0.07
373 0.06
374 0.06
375 0.06
376 0.06
377 0.05
378 0.05
379 0.05
380 0.05
381 0.06
382 0.06
383 0.07
384 0.08
385 0.1
386 0.13
387 0.16
388 0.2
389 0.24
390 0.32
391 0.42
392 0.5
393 0.58
394 0.65
395 0.67
396 0.74
397 0.81
398 0.83
399 0.83
400 0.84
401 0.86
402 0.88
403 0.93
404 0.93
405 0.93
406 0.93
407 0.94
408 0.92
409 0.91
410 0.89
411 0.86
412 0.81
413 0.79
414 0.73
415 0.62
416 0.53
417 0.43
418 0.34
419 0.26
420 0.2
421 0.1
422 0.08
423 0.08
424 0.08
425 0.08
426 0.07
427 0.07
428 0.07
429 0.08
430 0.08
431 0.1
432 0.16
433 0.19
434 0.2
435 0.24