FuNGI

A0A4U0U4C8

Protein Details

Accession

A0A4U0U4C8

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
120-141	IANRETDYQKRRFRRNVEGEGE	Hydrophilic
209-228	TNGHGEVKPRARKRRWDLST	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
220-221	RK

Subcellular Location(s)

plas 19, nucl 3, cyto 3, cyto_nucl 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011989 ARM-like IPR016024 ARM-type_fold IPR015016 SF3b_su1 IPR038737 SF3b_su1-like
Gene Ontology	GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0003729 F:mRNA binding GO:0000245 P:spliceosomal complex assembly
Pfam	View protein in Pfam PF08920 SF3b1

Amino Acid Sequences

MSDADFERVRKAQVSRNASGKKTSSGASGQRTNNTKASLTEAFDTELYGESGGSGVDKYAGFNTSIPADDGDEDEVMGDADDGRLVGQYTATAAQIGEWATGDAAEGEDMIQSKEKQAQIANRETDYQKRRFRRNVEGEGEGKTYRETMQEREIEREEDRVRLLVEEKAKARIAAGEEDDEMEGVVEHVATLKEDGMDVDVKVEEQSSTNGHGEVKPRARKRRWDLSTETAATNGDAHTNGHATNGEAVAKKSRWDTTSAVGSEAAPEVKRRSKWDVAAAAGGATPAPGPGATPVQSMMGFGTDISNRNAPLSDEELDEMFPLEGYKILEAPPGYEPLRAPARRAAPSATPMNTNIGGFMMQESVDPRSMGKQLPSDIPGVGDLQFFKAEDMNYFGKLVDGADENQLSVEELKQRKIMRLLLKVKNGTPPMRKTALRQITDNARHFGAGPLFDQILPLLMEKSLEDQERHLLVKVIDRVLYKLDDLVRPYVHKILVVIEPLLIDQDYYARVEGREIISNLSKAAGLAHMISTMRPDIDHVDEYVRNTTARAFAVVASALGIPTLLPFLKAVCKSKKSWQARHTGVKIIQQIPILMGCAVLPHLKGLVDCIAENLNDEQAKVRTVTSLALAALAEASNPFGIESFDDILNPLWTGARKQRGKGLAGFLKAVGYIIPLMDEEYSNYYTGQIVEILLREFQSPDEEMKKVVLKVVSQCAGTSGVTAQYLKEKVLNDFFKSFWVRRMALDKRNYKQVVETTMDLGNKVGVGEIVERIVNNLKDESEAYRKMTVETIEKVISAMGAADINERLEERLVDGILHAFQEQSVEDIVLLNGFGTVVNALGTRCKPYLPQIVSTILWRLNNKSATVRQQAADLVTRIAIVMKQCNEDNLMGKLSTVLYEYLGEEYPEVLGSILGAMRSIVTVVGISSMQPPIKDLLPRLTPILRNRHEKVQENTIDLVGRIADRGPESVNAREWMRICFELLDMLKAHKKGIRRAANNTFGFIAKAIGPQDVLATLLNNLRVQERQSRVCTAVAIGIVAETCAPFTVLPALMNEYRVPELNVQNGVLKSLSFLFEYIGEMAKDYVYAVTPLIEDALIDRDQVHRQTAAAVVKHIALGVVGLGCEDAMLHLLNLLYPNIFETSPHVIDRVIEAIDAVRLAVGTGAVMNYVWAGLFHPARKVRTPYWRLYNDAYVQSADAMVPYYPPIEDEKFKRFELMVMI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.53
2	0.53
3	0.6
4	0.64
5	0.61
6	0.63
7	0.57
8	0.51
9	0.46
10	0.42
11	0.37
12	0.38
13	0.42
14	0.43
15	0.48
16	0.49
17	0.54
18	0.58
19	0.58
20	0.56
21	0.52
22	0.46
23	0.39
24	0.41
25	0.37
26	0.35
27	0.32
28	0.28
29	0.27
30	0.25
31	0.24
32	0.18
33	0.15
34	0.13
35	0.11
36	0.09
37	0.07
38	0.07
39	0.07
40	0.07
41	0.05
42	0.05
43	0.08
44	0.08
45	0.09
46	0.11
47	0.13
48	0.13
49	0.14
50	0.16
51	0.15
52	0.16
53	0.16
54	0.15
55	0.15
56	0.14
57	0.15
58	0.15
59	0.13
60	0.12
61	0.11
62	0.1
63	0.08
64	0.08
65	0.06
66	0.05
67	0.05
68	0.05
69	0.05
70	0.05
71	0.06
72	0.06
73	0.06
74	0.06
75	0.06
76	0.08
77	0.1
78	0.1
79	0.09
80	0.08
81	0.08
82	0.1
83	0.11
84	0.09
85	0.08
86	0.08
87	0.08
88	0.08
89	0.08
90	0.06
91	0.06
92	0.05
93	0.05
94	0.05
95	0.06
96	0.07
97	0.08
98	0.11
99	0.12
100	0.15
101	0.21
102	0.23
103	0.25
104	0.3
105	0.37
106	0.41
107	0.49
108	0.5
109	0.45
110	0.48
111	0.48
112	0.52
113	0.52
114	0.54
115	0.55
116	0.61
117	0.69
118	0.74
119	0.79
120	0.8
121	0.82
122	0.82
123	0.78
124	0.74
125	0.66
126	0.59
127	0.54
128	0.43
129	0.34
130	0.25
131	0.21
132	0.17
133	0.22
134	0.21
135	0.23
136	0.31
137	0.37
138	0.38
139	0.43
140	0.44
141	0.41
142	0.39
143	0.41
144	0.35
145	0.31
146	0.3
147	0.25
148	0.23
149	0.22
150	0.23
151	0.21
152	0.24
153	0.27
154	0.28
155	0.31
156	0.31
157	0.3
158	0.28
159	0.26
160	0.24
161	0.23
162	0.23
163	0.2
164	0.2
165	0.21
166	0.2
167	0.16
168	0.13
169	0.09
170	0.07
171	0.05
172	0.05
173	0.04
174	0.04
175	0.05
176	0.05
177	0.06
178	0.07
179	0.07
180	0.07
181	0.07
182	0.08
183	0.09
184	0.1
185	0.09
186	0.1
187	0.09
188	0.09
189	0.1
190	0.1
191	0.08
192	0.08
193	0.1
194	0.11
195	0.14
196	0.15
197	0.16
198	0.17
199	0.19
200	0.23
201	0.3
202	0.37
203	0.43
204	0.51
205	0.61
206	0.67
207	0.75
208	0.79
209	0.82
210	0.78
211	0.76
212	0.74
213	0.71
214	0.71
215	0.63
216	0.54
217	0.44
218	0.38
219	0.31
220	0.25
221	0.17
222	0.11
223	0.09
224	0.09
225	0.1
226	0.11
227	0.11
228	0.11
229	0.11
230	0.1
231	0.12
232	0.12
233	0.14
234	0.14
235	0.15
236	0.2
237	0.2
238	0.22
239	0.23
240	0.27
241	0.25
242	0.28
243	0.3
244	0.29
245	0.36
246	0.34
247	0.31
248	0.27
249	0.26
250	0.22
251	0.21
252	0.17
253	0.11
254	0.13
255	0.17
256	0.23
257	0.27
258	0.31
259	0.38
260	0.42
261	0.46
262	0.51
263	0.49
264	0.44
265	0.42
266	0.37
267	0.29
268	0.23
269	0.18
270	0.1
271	0.07
272	0.05
273	0.04
274	0.04
275	0.03
276	0.04
277	0.06
278	0.09
279	0.1
280	0.1
281	0.11
282	0.12
283	0.12
284	0.12
285	0.1
286	0.08
287	0.07
288	0.07
289	0.09
290	0.09
291	0.11
292	0.13
293	0.15
294	0.14
295	0.15
296	0.16
297	0.14
298	0.16
299	0.18
300	0.17
301	0.16
302	0.16
303	0.16
304	0.15
305	0.14
306	0.12
307	0.08
308	0.06
309	0.06
310	0.05
311	0.06
312	0.07
313	0.07
314	0.07
315	0.07
316	0.1
317	0.1
318	0.12
319	0.12
320	0.15
321	0.16
322	0.16
323	0.16
324	0.19
325	0.28
326	0.27
327	0.28
328	0.3
329	0.35
330	0.37
331	0.38
332	0.36
333	0.29
334	0.34
335	0.36
336	0.31
337	0.27
338	0.25
339	0.27
340	0.24
341	0.22
342	0.17
343	0.12
344	0.11
345	0.09
346	0.09
347	0.06
348	0.05
349	0.06
350	0.07
351	0.09
352	0.09
353	0.1
354	0.09
355	0.12
356	0.14
357	0.16
358	0.17
359	0.18
360	0.2
361	0.22
362	0.24
363	0.22
364	0.2
365	0.18
366	0.16
367	0.14
368	0.12
369	0.1
370	0.09
371	0.09
372	0.09
373	0.09
374	0.09
375	0.1
376	0.09
377	0.09
378	0.13
379	0.13
380	0.14
381	0.14
382	0.13
383	0.12
384	0.11
385	0.11
386	0.08
387	0.08
388	0.08
389	0.1
390	0.1
391	0.1
392	0.1
393	0.1
394	0.09
395	0.08
396	0.08
397	0.14
398	0.15
399	0.17
400	0.22
401	0.23
402	0.26
403	0.3
404	0.35
405	0.34
406	0.42
407	0.5
408	0.51
409	0.56
410	0.55
411	0.53
412	0.52
413	0.5
414	0.47
415	0.44
416	0.42
417	0.42
418	0.45
419	0.44
420	0.42
421	0.48
422	0.5
423	0.45
424	0.43
425	0.41
426	0.46
427	0.52
428	0.51
429	0.42
430	0.33
431	0.31
432	0.3
433	0.29
434	0.21
435	0.14
436	0.12
437	0.11
438	0.12
439	0.11
440	0.11
441	0.08
442	0.08
443	0.07
444	0.07
445	0.06
446	0.05
447	0.06
448	0.06
449	0.08
450	0.1
451	0.12
452	0.12
453	0.13
454	0.16
455	0.17
456	0.18
457	0.16
458	0.15
459	0.14
460	0.18
461	0.2
462	0.17
463	0.18
464	0.18
465	0.18
466	0.18
467	0.18
468	0.13
469	0.13
470	0.14
471	0.14
472	0.15
473	0.17
474	0.16
475	0.16
476	0.18
477	0.18
478	0.16
479	0.14
480	0.13
481	0.13
482	0.14
483	0.13
484	0.12
485	0.09
486	0.09
487	0.09
488	0.08
489	0.06
490	0.04
491	0.03
492	0.04
493	0.05
494	0.05
495	0.06
496	0.06
497	0.06
498	0.07
499	0.09
500	0.1
501	0.12
502	0.12
503	0.14
504	0.14
505	0.14
506	0.14
507	0.12
508	0.1
509	0.07
510	0.07
511	0.06
512	0.05
513	0.05
514	0.05
515	0.06
516	0.06
517	0.06
518	0.06
519	0.06
520	0.06
521	0.05
522	0.06
523	0.08
524	0.1
525	0.11
526	0.1
527	0.13
528	0.13
529	0.15
530	0.15
531	0.14
532	0.11
533	0.11
534	0.11
535	0.11
536	0.1
537	0.1
538	0.09
539	0.08
540	0.09
541	0.08
542	0.07
543	0.06
544	0.05
545	0.04
546	0.04
547	0.04
548	0.03
549	0.03
550	0.04
551	0.03
552	0.04
553	0.04
554	0.05
555	0.09
556	0.12
557	0.18
558	0.22
559	0.26
560	0.29
561	0.37
562	0.46
563	0.51
564	0.57
565	0.58
566	0.62
567	0.65
568	0.69
569	0.63
570	0.58
571	0.51
572	0.47
573	0.45
574	0.37
575	0.33
576	0.26
577	0.24
578	0.19
579	0.17
580	0.13
581	0.08
582	0.06
583	0.04
584	0.04
585	0.04
586	0.05
587	0.04
588	0.04
589	0.05
590	0.05
591	0.05
592	0.06
593	0.07
594	0.07
595	0.07
596	0.07
597	0.08
598	0.07
599	0.08
600	0.08
601	0.08
602	0.07
603	0.07
604	0.08
605	0.08
606	0.09
607	0.09
608	0.09
609	0.07
610	0.08
611	0.08
612	0.07
613	0.07
614	0.07
615	0.06
616	0.06
617	0.05
618	0.05
619	0.04
620	0.04
621	0.03
622	0.03
623	0.03
624	0.03
625	0.03
626	0.03
627	0.03
628	0.04
629	0.05
630	0.06
631	0.07
632	0.07
633	0.07
634	0.07
635	0.07
636	0.07
637	0.06
638	0.05
639	0.06
640	0.08
641	0.13
642	0.22
643	0.24
644	0.25
645	0.31
646	0.34
647	0.36
648	0.36
649	0.37
650	0.32
651	0.3
652	0.3
653	0.24
654	0.2
655	0.18
656	0.15
657	0.08
658	0.05
659	0.04
660	0.03
661	0.04
662	0.03
663	0.04
664	0.04
665	0.05
666	0.05
667	0.08
668	0.09
669	0.09
670	0.09
671	0.09
672	0.09
673	0.09
674	0.08
675	0.06
676	0.05
677	0.06
678	0.06
679	0.06
680	0.06
681	0.06
682	0.07
683	0.07
684	0.07
685	0.08
686	0.09
687	0.11
688	0.13
689	0.13
690	0.13
691	0.14
692	0.16
693	0.14
694	0.16
695	0.14
696	0.13
697	0.16
698	0.2
699	0.19
700	0.17
701	0.17
702	0.16
703	0.16
704	0.14
705	0.11
706	0.08
707	0.07
708	0.08
709	0.08
710	0.07
711	0.1
712	0.11
713	0.11
714	0.14
715	0.14
716	0.16
717	0.23
718	0.25
719	0.24
720	0.24
721	0.24
722	0.25
723	0.28
724	0.27
725	0.24
726	0.27
727	0.25
728	0.26
729	0.34
730	0.36
731	0.4
732	0.48
733	0.51
734	0.49
735	0.57
736	0.56
737	0.48
738	0.45
739	0.4
740	0.36
741	0.31
742	0.29
743	0.22
744	0.24
745	0.24
746	0.2
747	0.17
748	0.12
749	0.09
750	0.08
751	0.06
752	0.04
753	0.04
754	0.05
755	0.05
756	0.06
757	0.06
758	0.06
759	0.07
760	0.11
761	0.11
762	0.11
763	0.11
764	0.11
765	0.12
766	0.13
767	0.16
768	0.18
769	0.19
770	0.2
771	0.22
772	0.22
773	0.22
774	0.23
775	0.21
776	0.19
777	0.19
778	0.2
779	0.17
780	0.17
781	0.16
782	0.14
783	0.12
784	0.08
785	0.06
786	0.04
787	0.04
788	0.04
789	0.05
790	0.05
791	0.05
792	0.06
793	0.06
794	0.06
795	0.06
796	0.06
797	0.06
798	0.07
799	0.07
800	0.07
801	0.07
802	0.07
803	0.07
804	0.07
805	0.06
806	0.05
807	0.05
808	0.06
809	0.06
810	0.06
811	0.06
812	0.05
813	0.05
814	0.06
815	0.06
816	0.05
817	0.05
818	0.04
819	0.03
820	0.03
821	0.03
822	0.03
823	0.03
824	0.03
825	0.04
826	0.04
827	0.04
828	0.08
829	0.09
830	0.12
831	0.12
832	0.13
833	0.14
834	0.2
835	0.3
836	0.29
837	0.31
838	0.3
839	0.33
840	0.33
841	0.32
842	0.29
843	0.22
844	0.22
845	0.21
846	0.22
847	0.25
848	0.26
849	0.27
850	0.3
851	0.32
852	0.37
853	0.41
854	0.39
855	0.33
856	0.33
857	0.33
858	0.29
859	0.26
860	0.19
861	0.15
862	0.12
863	0.12
864	0.1
865	0.1
866	0.09
867	0.09
868	0.13
869	0.14
870	0.17
871	0.17
872	0.18
873	0.2
874	0.2
875	0.2
876	0.17
877	0.17
878	0.15
879	0.14
880	0.14
881	0.12
882	0.11
883	0.1
884	0.08
885	0.07
886	0.08
887	0.09
888	0.1
889	0.1
890	0.09
891	0.08
892	0.08
893	0.08
894	0.07
895	0.07
896	0.05
897	0.04
898	0.04
899	0.04
900	0.05
901	0.04
902	0.04
903	0.04
904	0.04
905	0.04
906	0.04
907	0.04
908	0.03
909	0.04
910	0.04
911	0.05
912	0.05
913	0.05
914	0.07
915	0.1
916	0.11
917	0.1
918	0.12
919	0.13
920	0.16
921	0.18
922	0.18
923	0.22
924	0.24
925	0.25
926	0.28
927	0.3
928	0.33
929	0.37
930	0.46
931	0.45
932	0.51
933	0.53
934	0.59
935	0.62
936	0.64
937	0.61
938	0.61
939	0.57
940	0.53
941	0.5
942	0.42
943	0.35
944	0.28
945	0.23
946	0.14
947	0.11
948	0.08
949	0.08
950	0.08
951	0.09
952	0.1
953	0.11
954	0.14
955	0.17
956	0.2
957	0.22
958	0.23
959	0.23
960	0.26
961	0.25
962	0.24
963	0.24
964	0.22
965	0.21
966	0.19
967	0.18
968	0.19
969	0.19
970	0.19
971	0.15
972	0.18
973	0.22
974	0.22
975	0.24
976	0.22
977	0.27
978	0.33
979	0.43
980	0.49
981	0.51
982	0.59
983	0.65
984	0.72
985	0.67
986	0.6
987	0.51
988	0.41
989	0.36
990	0.28
991	0.2
992	0.11
993	0.13
994	0.13
995	0.12
996	0.11
997	0.11
998	0.11
999	0.1
1000	0.1
1001	0.07
1002	0.07
1003	0.08
1004	0.1
1005	0.12
1006	0.12
1007	0.13
1008	0.14
1009	0.16
1010	0.19
1011	0.26
1012	0.31
1013	0.35
1014	0.38
1015	0.42
1016	0.42
1017	0.41
1018	0.38
1019	0.29
1020	0.25
1021	0.19
1022	0.15
1023	0.11
1024	0.09
1025	0.08
1026	0.07
1027	0.06
1028	0.04
1029	0.04
1030	0.04
1031	0.05
1032	0.05
1033	0.06
1034	0.09
1035	0.1
1036	0.1
1037	0.11
1038	0.16
1039	0.16
1040	0.18
1041	0.18
1042	0.17
1043	0.18
1044	0.18
1045	0.19
1046	0.2
1047	0.23
1048	0.25
1049	0.26
1050	0.25
1051	0.28
1052	0.27
1053	0.26
1054	0.2
1055	0.17
1056	0.14
1057	0.14
1058	0.15
1059	0.11
1060	0.11
1061	0.11
1062	0.11
1063	0.13
1064	0.12
1065	0.13
1066	0.11
1067	0.11
1068	0.11
1069	0.1
1070	0.1
1071	0.09
1072	0.08
1073	0.07
1074	0.08
1075	0.08
1076	0.08
1077	0.08
1078	0.08
1079	0.08
1080	0.07
1081	0.06
1082	0.07
1083	0.1
1084	0.1
1085	0.1
1086	0.11
1087	0.14
1088	0.19
1089	0.21
1090	0.23
1091	0.19
1092	0.2
1093	0.21
1094	0.26
1095	0.28
1096	0.24
1097	0.24
1098	0.22
1099	0.22
1100	0.22
1101	0.2
1102	0.14
1103	0.08
1104	0.07
1105	0.06
1106	0.06
1107	0.05
1108	0.05
1109	0.05
1110	0.04
1111	0.04
1112	0.04
1113	0.03
1114	0.05
1115	0.05
1116	0.05
1117	0.06
1118	0.06
1119	0.07
1120	0.09
1121	0.09
1122	0.08
1123	0.08
1124	0.1
1125	0.11
1126	0.11
1127	0.1
1128	0.14
1129	0.21
1130	0.23
1131	0.24
1132	0.23
1133	0.21
1134	0.22
1135	0.24
1136	0.21
1137	0.14
1138	0.11
1139	0.11
1140	0.11
1141	0.11
1142	0.1
1143	0.08
1144	0.06
1145	0.05
1146	0.05
1147	0.05
1148	0.05
1149	0.04
1150	0.05
1151	0.05
1152	0.05
1153	0.05
1154	0.05
1155	0.05
1156	0.05
1157	0.05
1158	0.04
1159	0.06
1160	0.11
1161	0.15
1162	0.17
1163	0.25
1164	0.31
1165	0.36
1166	0.43
1167	0.49
1168	0.52
1169	0.59
1170	0.65
1171	0.66
1172	0.7
1173	0.7
1174	0.68
1175	0.66
1176	0.65
1177	0.6
1178	0.56
1179	0.48
1180	0.39
1181	0.35
1182	0.3
1183	0.25
1184	0.17
1185	0.12
1186	0.1
1187	0.08
1188	0.08
1189	0.09
1190	0.09
1191	0.09
1192	0.11
1193	0.16
1194	0.2
1195	0.27
1196	0.32
1197	0.4
1198	0.43
1199	0.44
1200	0.46
1201	0.41

A0A4U0U4C8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer