Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0TTX4

Protein Details
Accession A0A4U0TTX4    Localization Confidence High Confidence Score 27
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-38IDAPSNRKTKKAQRDTERHGKGRKRKHDETIDLPDGBasic
63-83APAVKAPKTKKQKRILSDSGNHydrophilic
130-155ADRKARTLARNLRKRRKDKEARGIFABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
9-28RKTKKAQRDTERHGKGRKRK
132-150RKARTLARNLRKRRKDKEA
301-310KGEGRKEKIR
337-344RRKGGKRG
Subcellular Location(s) nucl 25
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034228  Nop6_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12400  RRM_Nop6  
Amino Acid Sequences MSIDAPSNRKTKKAQRDTERHGKGRKRKHDETIDLPDGVEQEGEPTPDLILEKTGNENVAGTAPAVKAPKTKKQKRILSDSGNGVDNEERPTGDATKRAPTKTTQAPTEQPKSMDANSTSSKTRPDVTPADRKARTLARNLRKRRKDKEARGIFATPGIAAANGVTAAVEDNASGDAAPDPENTDPTAIKSGAKFILFIGNLPFATTDTALQAHFKKLSPFTLRHRTEPSTGKSKGFAFLEFENYDRMETCLKKYHHTLFDPDDYREDKGKFGGVGGERAKAGNTRARQINVELTAGGGGKGEGRKEKIRDKNVHLEEERARRAEQEMSEQAAAGLRRKGGKRGVVGREKVDERVNEEVGMHPSRLAMMKG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.75
2 0.77
3 0.86
4 0.89
5 0.91
6 0.9
7 0.87
8 0.85
9 0.85
10 0.84
11 0.84
12 0.86
13 0.85
14 0.83
15 0.85
16 0.86
17 0.84
18 0.82
19 0.81
20 0.73
21 0.63
22 0.55
23 0.46
24 0.36
25 0.29
26 0.2
27 0.1
28 0.1
29 0.11
30 0.12
31 0.11
32 0.11
33 0.1
34 0.11
35 0.12
36 0.1
37 0.11
38 0.11
39 0.12
40 0.15
41 0.17
42 0.16
43 0.15
44 0.15
45 0.13
46 0.13
47 0.12
48 0.09
49 0.1
50 0.1
51 0.13
52 0.14
53 0.14
54 0.21
55 0.26
56 0.36
57 0.45
58 0.55
59 0.62
60 0.71
61 0.79
62 0.8
63 0.84
64 0.83
65 0.79
66 0.74
67 0.69
68 0.61
69 0.54
70 0.46
71 0.37
72 0.3
73 0.23
74 0.21
75 0.17
76 0.14
77 0.13
78 0.16
79 0.18
80 0.18
81 0.21
82 0.21
83 0.29
84 0.34
85 0.34
86 0.34
87 0.33
88 0.39
89 0.43
90 0.46
91 0.41
92 0.4
93 0.46
94 0.52
95 0.54
96 0.5
97 0.41
98 0.39
99 0.39
100 0.35
101 0.34
102 0.27
103 0.26
104 0.26
105 0.28
106 0.26
107 0.24
108 0.26
109 0.23
110 0.24
111 0.21
112 0.24
113 0.29
114 0.34
115 0.43
116 0.45
117 0.52
118 0.49
119 0.48
120 0.47
121 0.47
122 0.44
123 0.44
124 0.49
125 0.51
126 0.61
127 0.7
128 0.76
129 0.79
130 0.84
131 0.82
132 0.83
133 0.84
134 0.84
135 0.85
136 0.83
137 0.77
138 0.72
139 0.65
140 0.54
141 0.44
142 0.33
143 0.22
144 0.14
145 0.1
146 0.06
147 0.05
148 0.04
149 0.03
150 0.03
151 0.03
152 0.02
153 0.02
154 0.03
155 0.03
156 0.03
157 0.03
158 0.03
159 0.03
160 0.04
161 0.03
162 0.03
163 0.04
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.07
168 0.07
169 0.08
170 0.08
171 0.09
172 0.08
173 0.08
174 0.11
175 0.1
176 0.11
177 0.1
178 0.12
179 0.13
180 0.13
181 0.12
182 0.1
183 0.14
184 0.13
185 0.13
186 0.12
187 0.11
188 0.11
189 0.11
190 0.11
191 0.07
192 0.08
193 0.07
194 0.06
195 0.06
196 0.07
197 0.07
198 0.1
199 0.11
200 0.12
201 0.13
202 0.14
203 0.16
204 0.17
205 0.23
206 0.25
207 0.28
208 0.34
209 0.43
210 0.45
211 0.45
212 0.49
213 0.46
214 0.47
215 0.5
216 0.46
217 0.44
218 0.44
219 0.41
220 0.38
221 0.36
222 0.35
223 0.29
224 0.25
225 0.2
226 0.18
227 0.22
228 0.2
229 0.2
230 0.17
231 0.16
232 0.16
233 0.13
234 0.14
235 0.14
236 0.15
237 0.18
238 0.25
239 0.26
240 0.29
241 0.35
242 0.41
243 0.43
244 0.44
245 0.45
246 0.42
247 0.49
248 0.47
249 0.42
250 0.39
251 0.34
252 0.34
253 0.34
254 0.3
255 0.23
256 0.22
257 0.22
258 0.18
259 0.17
260 0.2
261 0.16
262 0.21
263 0.21
264 0.21
265 0.2
266 0.2
267 0.2
268 0.17
269 0.2
270 0.21
271 0.22
272 0.28
273 0.33
274 0.34
275 0.36
276 0.36
277 0.38
278 0.33
279 0.31
280 0.24
281 0.19
282 0.18
283 0.16
284 0.13
285 0.08
286 0.06
287 0.09
288 0.1
289 0.14
290 0.17
291 0.22
292 0.29
293 0.36
294 0.46
295 0.52
296 0.61
297 0.66
298 0.69
299 0.75
300 0.73
301 0.75
302 0.66
303 0.63
304 0.6
305 0.6
306 0.57
307 0.49
308 0.44
309 0.37
310 0.39
311 0.38
312 0.33
313 0.32
314 0.31
315 0.33
316 0.32
317 0.3
318 0.28
319 0.26
320 0.25
321 0.21
322 0.2
323 0.19
324 0.26
325 0.29
326 0.36
327 0.4
328 0.45
329 0.5
330 0.57
331 0.64
332 0.66
333 0.68
334 0.65
335 0.65
336 0.6
337 0.56
338 0.52
339 0.44
340 0.4
341 0.42
342 0.39
343 0.32
344 0.3
345 0.3
346 0.3
347 0.3
348 0.25
349 0.2
350 0.19
351 0.2