Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0VM79

Protein Details
Accession A0A4U0VM79    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
452-477AAGTRHRSHSRRPPPPEIRKIRIKVHBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
456-473RHRSHSRRPPPPEIRKIR
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 11.5, cyto 4.5, cysk 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000270  PB1_dom  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Pfam View protein in Pfam  
PF00564  PB1  
PF13181  TPR_8  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51745  PB1  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MSLKQEIETWVAALAAYDNNEFDSAQRCFGQIADTSKILFNMGVLHATLGEHGQAVDCYQRAVQLDQYLAVAYFQQGVSNFLMGDFEEALANFNDTLLYLRGNNNIDYEQLGLKFKLYSCEVLFNRGLCYIYLQQKDVGMQDLIFAAREKSVPDHDVIEEAIKEQAEGYTVFSIPVGVIYRPNEAKVKNLKIKDYLGKARLVAAQDRLNVDPRRQAALAAMALDDRPGDKLSYAALNLVRPDLRSRSGRQQSEPPLNRNVFPPTPPPELDPPEPSLEKRYSSSSGHSSLSSLQQARPCAKPLRLDLGVAAFEQQKLSPAKPPRLGTKRSESERPALRREQSGGSARTADSRKQRQQGRLSQREMPLPEMQILEDPLEAYSAQASAPQQQQQQLPMHQRSRSSALNPPYMPIAIAEENEDEEAAHEGSSADSLHDLSSDEPLAFEIMPPRPTAAGTRHRSHSRRPPPPEIRKIRIKVHAEDMRYVMTAPTVTFAELTELIRVKFGLGASRFRLKIKDEEGDLVTLSDQEDLEMAVGICRVSAAKERAEMGKMEVWMQEVR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.09
3 0.1
4 0.1
5 0.1
6 0.11
7 0.12
8 0.12
9 0.12
10 0.17
11 0.17
12 0.19
13 0.2
14 0.2
15 0.19
16 0.2
17 0.22
18 0.2
19 0.24
20 0.25
21 0.25
22 0.26
23 0.26
24 0.26
25 0.23
26 0.18
27 0.13
28 0.13
29 0.13
30 0.12
31 0.11
32 0.11
33 0.11
34 0.11
35 0.11
36 0.08
37 0.07
38 0.06
39 0.06
40 0.07
41 0.07
42 0.08
43 0.11
44 0.1
45 0.11
46 0.11
47 0.14
48 0.16
49 0.18
50 0.2
51 0.2
52 0.21
53 0.2
54 0.2
55 0.18
56 0.15
57 0.14
58 0.11
59 0.08
60 0.09
61 0.09
62 0.1
63 0.1
64 0.14
65 0.14
66 0.14
67 0.13
68 0.11
69 0.12
70 0.1
71 0.11
72 0.08
73 0.08
74 0.07
75 0.08
76 0.09
77 0.09
78 0.1
79 0.08
80 0.07
81 0.07
82 0.07
83 0.09
84 0.08
85 0.09
86 0.1
87 0.13
88 0.18
89 0.2
90 0.21
91 0.21
92 0.2
93 0.2
94 0.18
95 0.18
96 0.15
97 0.15
98 0.17
99 0.15
100 0.15
101 0.16
102 0.16
103 0.19
104 0.19
105 0.21
106 0.2
107 0.29
108 0.28
109 0.32
110 0.33
111 0.29
112 0.28
113 0.25
114 0.24
115 0.16
116 0.2
117 0.21
118 0.27
119 0.29
120 0.28
121 0.28
122 0.28
123 0.29
124 0.26
125 0.22
126 0.14
127 0.12
128 0.11
129 0.11
130 0.1
131 0.1
132 0.09
133 0.07
134 0.08
135 0.08
136 0.09
137 0.11
138 0.14
139 0.16
140 0.16
141 0.18
142 0.17
143 0.17
144 0.17
145 0.15
146 0.12
147 0.11
148 0.11
149 0.09
150 0.08
151 0.07
152 0.07
153 0.07
154 0.07
155 0.09
156 0.09
157 0.09
158 0.09
159 0.09
160 0.09
161 0.07
162 0.08
163 0.08
164 0.07
165 0.1
166 0.11
167 0.16
168 0.16
169 0.18
170 0.21
171 0.2
172 0.28
173 0.33
174 0.41
175 0.44
176 0.46
177 0.47
178 0.46
179 0.5
180 0.49
181 0.47
182 0.45
183 0.4
184 0.39
185 0.36
186 0.34
187 0.32
188 0.28
189 0.23
190 0.2
191 0.2
192 0.21
193 0.23
194 0.21
195 0.26
196 0.26
197 0.25
198 0.26
199 0.25
200 0.27
201 0.25
202 0.24
203 0.18
204 0.19
205 0.18
206 0.13
207 0.11
208 0.08
209 0.08
210 0.08
211 0.07
212 0.04
213 0.05
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.07
219 0.08
220 0.08
221 0.09
222 0.09
223 0.1
224 0.1
225 0.11
226 0.11
227 0.1
228 0.13
229 0.13
230 0.16
231 0.19
232 0.23
233 0.32
234 0.4
235 0.42
236 0.42
237 0.47
238 0.5
239 0.57
240 0.57
241 0.5
242 0.49
243 0.47
244 0.45
245 0.4
246 0.38
247 0.28
248 0.26
249 0.28
250 0.27
251 0.29
252 0.28
253 0.29
254 0.29
255 0.32
256 0.32
257 0.29
258 0.26
259 0.25
260 0.25
261 0.23
262 0.23
263 0.2
264 0.19
265 0.18
266 0.19
267 0.2
268 0.2
269 0.23
270 0.22
271 0.23
272 0.22
273 0.21
274 0.19
275 0.17
276 0.18
277 0.18
278 0.16
279 0.15
280 0.17
281 0.2
282 0.22
283 0.22
284 0.24
285 0.25
286 0.26
287 0.28
288 0.28
289 0.32
290 0.29
291 0.28
292 0.24
293 0.21
294 0.19
295 0.15
296 0.14
297 0.08
298 0.08
299 0.08
300 0.08
301 0.11
302 0.12
303 0.13
304 0.19
305 0.24
306 0.3
307 0.35
308 0.38
309 0.43
310 0.49
311 0.52
312 0.5
313 0.54
314 0.55
315 0.54
316 0.57
317 0.5
318 0.5
319 0.54
320 0.53
321 0.49
322 0.47
323 0.45
324 0.41
325 0.41
326 0.36
327 0.33
328 0.35
329 0.31
330 0.27
331 0.26
332 0.24
333 0.27
334 0.27
335 0.27
336 0.3
337 0.38
338 0.44
339 0.51
340 0.58
341 0.6
342 0.67
343 0.72
344 0.74
345 0.73
346 0.7
347 0.68
348 0.64
349 0.6
350 0.52
351 0.46
352 0.37
353 0.29
354 0.27
355 0.21
356 0.19
357 0.15
358 0.15
359 0.11
360 0.09
361 0.08
362 0.06
363 0.07
364 0.06
365 0.06
366 0.05
367 0.05
368 0.05
369 0.07
370 0.07
371 0.12
372 0.15
373 0.19
374 0.22
375 0.26
376 0.27
377 0.31
378 0.34
379 0.35
380 0.4
381 0.44
382 0.47
383 0.45
384 0.45
385 0.44
386 0.45
387 0.42
388 0.37
389 0.37
390 0.37
391 0.42
392 0.4
393 0.37
394 0.33
395 0.3
396 0.26
397 0.19
398 0.18
399 0.12
400 0.12
401 0.13
402 0.12
403 0.12
404 0.12
405 0.12
406 0.07
407 0.07
408 0.08
409 0.07
410 0.07
411 0.06
412 0.06
413 0.06
414 0.07
415 0.07
416 0.05
417 0.06
418 0.06
419 0.06
420 0.06
421 0.07
422 0.07
423 0.09
424 0.09
425 0.09
426 0.08
427 0.09
428 0.09
429 0.09
430 0.09
431 0.12
432 0.15
433 0.16
434 0.17
435 0.17
436 0.17
437 0.18
438 0.21
439 0.24
440 0.31
441 0.37
442 0.42
443 0.48
444 0.57
445 0.6
446 0.65
447 0.69
448 0.69
449 0.73
450 0.76
451 0.79
452 0.81
453 0.88
454 0.89
455 0.88
456 0.85
457 0.85
458 0.82
459 0.79
460 0.78
461 0.73
462 0.66
463 0.67
464 0.65
465 0.57
466 0.54
467 0.47
468 0.39
469 0.34
470 0.3
471 0.2
472 0.15
473 0.13
474 0.1
475 0.11
476 0.1
477 0.1
478 0.1
479 0.1
480 0.12
481 0.13
482 0.13
483 0.16
484 0.17
485 0.17
486 0.17
487 0.17
488 0.14
489 0.15
490 0.15
491 0.18
492 0.2
493 0.25
494 0.29
495 0.37
496 0.38
497 0.38
498 0.41
499 0.37
500 0.43
501 0.44
502 0.45
503 0.4
504 0.43
505 0.42
506 0.39
507 0.35
508 0.27
509 0.21
510 0.16
511 0.14
512 0.1
513 0.09
514 0.08
515 0.08
516 0.07
517 0.07
518 0.08
519 0.07
520 0.07
521 0.07
522 0.07
523 0.07
524 0.07
525 0.07
526 0.09
527 0.17
528 0.2
529 0.23
530 0.26
531 0.29
532 0.32
533 0.34
534 0.33
535 0.29
536 0.3
537 0.27
538 0.26
539 0.24