FuNGI

A0A4U0UZ41

Protein Details

Accession

A0A4U0UZ41

Localization Confidence

High

Confidence Score

25.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
278-301	ASPPATKKAKKTKKIQSQPAKDDT	Hydrophilic
413-440	LSVTKGKGFTKEKNKKKRGESSVVRESY	Hydrophilic
453-488	QQSQPQAAKPKEKKPKPARRPKKRSRLDRALSREAG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
284-291	KKAKKTKK
420-430	GFTKEKNKKKR
460-479	AKPKEKKPKPARRPKKRSRL

Subcellular Location(s)

nucl 23, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007718 Srp40_C
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus
Pfam	View protein in Pfam PF05022 SRP40_C

Amino Acid Sequences

MARTKKSESGLPSRLWKYTTAPPQLRDILRQLGHFFHEIGYTETLDTLVTEAKKRGVELDAEEWKSGVEAAAGGDLLALRESWREAKGEYPTLRGDAVSRKQSNKPVVPVADKLEIKAGESSSEGSSSESEDETEGKQAGLVDDEAESTSDDSSEDESNSDSSDKEDAKVGAKRKRAATAESSEDQSSSSEEDSSDSSDEEAAPPAKRAKTTKRAKSSSDSSSDSSSDSEAEVPSGVKVKAAASVASSSASDTSPSDDSSSDSSSSDDSSSSESESSASPPATKKAKKTKKIQSQPAKDDTDSASSATLAPSSPTKTKLTEDVLLVPASALNSAETSAGDMHPDRLKRIAPPPQPTPPSSSLKRVPATEQNVKRLKKENVAFSRIPKDTVVDERFKSNEYVSYEYADKAFQDLSVTKGKGFTKEKNKKKRGESSVVRESYGPALASVAADVGQQSQPQAAKPKEKKPKPARRPKKRSRLDRALSREAGWLDDYSQGELDEMEDFSPSEYNPLGLPENLYDFMGGCGFDPMGGFDPLGAYRGGAIDFTPKGIKFDD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.55
2	0.5
3	0.45
4	0.41
5	0.44
6	0.5
7	0.51
8	0.53
9	0.53
10	0.58
11	0.63
12	0.6
13	0.56
14	0.51
15	0.49
16	0.45
17	0.46
18	0.41
19	0.36
20	0.37
21	0.33
22	0.29
23	0.21
24	0.21
25	0.2
26	0.2
27	0.2
28	0.17
29	0.16
30	0.15
31	0.14
32	0.12
33	0.11
34	0.09
35	0.12
36	0.13
37	0.16
38	0.18
39	0.22
40	0.23
41	0.24
42	0.25
43	0.23
44	0.24
45	0.26
46	0.32
47	0.35
48	0.36
49	0.35
50	0.32
51	0.29
52	0.26
53	0.21
54	0.14
55	0.06
56	0.05
57	0.05
58	0.06
59	0.06
60	0.05
61	0.05
62	0.05
63	0.05
64	0.05
65	0.05
66	0.05
67	0.06
68	0.09
69	0.12
70	0.13
71	0.14
72	0.15
73	0.2
74	0.26
75	0.33
76	0.32
77	0.33
78	0.33
79	0.33
80	0.32
81	0.27
82	0.25
83	0.25
84	0.31
85	0.37
86	0.4
87	0.44
88	0.5
89	0.58
90	0.63
91	0.6
92	0.58
93	0.55
94	0.55
95	0.53
96	0.5
97	0.47
98	0.45
99	0.39
100	0.35
101	0.33
102	0.28
103	0.26
104	0.25
105	0.21
106	0.15
107	0.15
108	0.17
109	0.13
110	0.13
111	0.12
112	0.11
113	0.11
114	0.12
115	0.12
116	0.1
117	0.1
118	0.1
119	0.12
120	0.11
121	0.13
122	0.12
123	0.1
124	0.11
125	0.1
126	0.1
127	0.1
128	0.09
129	0.08
130	0.07
131	0.08
132	0.07
133	0.07
134	0.07
135	0.07
136	0.06
137	0.06
138	0.06
139	0.06
140	0.09
141	0.09
142	0.09
143	0.09
144	0.1
145	0.1
146	0.11
147	0.11
148	0.08
149	0.09
150	0.13
151	0.13
152	0.13
153	0.15
154	0.16
155	0.2
156	0.25
157	0.31
158	0.34
159	0.39
160	0.43
161	0.44
162	0.49
163	0.47
164	0.46
165	0.45
166	0.43
167	0.43
168	0.39
169	0.38
170	0.31
171	0.29
172	0.25
173	0.19
174	0.16
175	0.11
176	0.1
177	0.08
178	0.08
179	0.09
180	0.09
181	0.1
182	0.1
183	0.09
184	0.09
185	0.09
186	0.09
187	0.08
188	0.1
189	0.1
190	0.1
191	0.12
192	0.16
193	0.17
194	0.21
195	0.26
196	0.33
197	0.42
198	0.52
199	0.59
200	0.65
201	0.67
202	0.68
203	0.69
204	0.65
205	0.6
206	0.55
207	0.48
208	0.4
209	0.37
210	0.34
211	0.27
212	0.22
213	0.17
214	0.13
215	0.1
216	0.1
217	0.08
218	0.07
219	0.07
220	0.06
221	0.06
222	0.09
223	0.08
224	0.07
225	0.08
226	0.08
227	0.1
228	0.11
229	0.1
230	0.08
231	0.09
232	0.09
233	0.09
234	0.09
235	0.07
236	0.07
237	0.07
238	0.07
239	0.06
240	0.08
241	0.09
242	0.09
243	0.1
244	0.09
245	0.11
246	0.12
247	0.13
248	0.11
249	0.11
250	0.11
251	0.1
252	0.11
253	0.1
254	0.08
255	0.07
256	0.09
257	0.09
258	0.09
259	0.08
260	0.08
261	0.08
262	0.08
263	0.09
264	0.09
265	0.08
266	0.09
267	0.1
268	0.15
269	0.22
270	0.24
271	0.31
272	0.41
273	0.51
274	0.57
275	0.67
276	0.72
277	0.76
278	0.82
279	0.85
280	0.84
281	0.83
282	0.81
283	0.77
284	0.7
285	0.59
286	0.51
287	0.42
288	0.34
289	0.26
290	0.2
291	0.14
292	0.11
293	0.11
294	0.09
295	0.08
296	0.05
297	0.06
298	0.07
299	0.1
300	0.12
301	0.15
302	0.16
303	0.18
304	0.19
305	0.23
306	0.25
307	0.24
308	0.23
309	0.23
310	0.22
311	0.2
312	0.18
313	0.14
314	0.1
315	0.08
316	0.07
317	0.05
318	0.04
319	0.04
320	0.05
321	0.05
322	0.05
323	0.05
324	0.06
325	0.06
326	0.07
327	0.07
328	0.1
329	0.13
330	0.14
331	0.15
332	0.16
333	0.18
334	0.21
335	0.28
336	0.35
337	0.38
338	0.44
339	0.48
340	0.53
341	0.55
342	0.52
343	0.51
344	0.47
345	0.47
346	0.44
347	0.45
348	0.43
349	0.46
350	0.47
351	0.42
352	0.41
353	0.42
354	0.47
355	0.5
356	0.49
357	0.52
358	0.57
359	0.57
360	0.57
361	0.57
362	0.54
363	0.53
364	0.54
365	0.55
366	0.54
367	0.59
368	0.56
369	0.53
370	0.56
371	0.48
372	0.44
373	0.34
374	0.29
375	0.26
376	0.32
377	0.32
378	0.29
379	0.3
380	0.31
381	0.32
382	0.32
383	0.3
384	0.23
385	0.23
386	0.22
387	0.26
388	0.23
389	0.25
390	0.25
391	0.24
392	0.23
393	0.19
394	0.15
395	0.12
396	0.11
397	0.09
398	0.1
399	0.1
400	0.14
401	0.2
402	0.2
403	0.19
404	0.24
405	0.25
406	0.31
407	0.36
408	0.41
409	0.46
410	0.56
411	0.66
412	0.73
413	0.81
414	0.81
415	0.85
416	0.87
417	0.84
418	0.84
419	0.83
420	0.81
421	0.81
422	0.74
423	0.65
424	0.55
425	0.47
426	0.39
427	0.31
428	0.22
429	0.12
430	0.11
431	0.11
432	0.1
433	0.09
434	0.07
435	0.05
436	0.05
437	0.05
438	0.07
439	0.08
440	0.08
441	0.09
442	0.12
443	0.13
444	0.16
445	0.25
446	0.28
447	0.38
448	0.46
449	0.56
450	0.64
451	0.7
452	0.78
453	0.81
454	0.87
455	0.87
456	0.91
457	0.92
458	0.93
459	0.96
460	0.96
461	0.96
462	0.95
463	0.95
464	0.94
465	0.94
466	0.92
467	0.91
468	0.88
469	0.85
470	0.77
471	0.67
472	0.61
473	0.5
474	0.42
475	0.34
476	0.25
477	0.18
478	0.21
479	0.2
480	0.17
481	0.17
482	0.15
483	0.14
484	0.13
485	0.12
486	0.09
487	0.09
488	0.08
489	0.08
490	0.08
491	0.09
492	0.1
493	0.09
494	0.1
495	0.1
496	0.11
497	0.11
498	0.14
499	0.15
500	0.15
501	0.17
502	0.15
503	0.19
504	0.19
505	0.19
506	0.16
507	0.14
508	0.14
509	0.13
510	0.11
511	0.08
512	0.09
513	0.09
514	0.09
515	0.08
516	0.1
517	0.12
518	0.12
519	0.12
520	0.1
521	0.12
522	0.12
523	0.14
524	0.11
525	0.08
526	0.08
527	0.1
528	0.1
529	0.08
530	0.09
531	0.13
532	0.14
533	0.17
534	0.21
535	0.2

A0A4U0UZ41

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer