Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0VMD1

Protein Details
Accession A0A4U0VMD1    Localization Confidence High Confidence Score 22
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
168-191GEDEVKPKTKKPRTKKAKDDVDEABasic
193-215GEGEVKPKTRKPRAKKAVKVEAEBasic
245-264APKPATRKGRGRKAKSAELVHydrophilic
292-323GSEPEAEKPKPKPKPQKRKAKGRGKKAAATEEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
173-185KPKTKKPRTKKAK
197-211VKPKTRKPRAKKAVK
224-236PVKKASKSAKAKR
245-259APKPATRKGRGRKAK
299-318KPKPKPKPQKRKAKGRGKKA
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 14, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001510  Znf_PARP  
IPR036957  Znf_PARP_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00645  zf-PARP  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50064  ZF_PARP_2  
Amino Acid Sequences MSYRVELSKTNRAGCRAPHCKDAGTKIDKDDLRQGVLITIKEHTSWMWRHWGCVTPEIIRNWKTSSDGDMDMVDGYEDLPSDMQEKVQRAFEQGHVDDADWGGDPEMNRWTGKRQGMFVKVKTPKKKAVSANDGDDEDGAEDEPSDTPAKVNGKTKKRGKVDDDEVDGEDEVKPKTKKPRTKKAKDDVDEADGEGEVKPKTRKPRAKKAVKVEAEDDAPEVAPPVKKASKSAKAKRDEDEDDHVAPKPATRKGRGRKAKSAELVEDEFDDAQDSAPAVIATLERNVVDDDLGSEPEAEKPKPKPKPQKRKAKGRGKKAAATEED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.59
3 0.59
4 0.58
5 0.58
6 0.57
7 0.57
8 0.58
9 0.57
10 0.56
11 0.53
12 0.52
13 0.48
14 0.54
15 0.5
16 0.49
17 0.5
18 0.42
19 0.38
20 0.36
21 0.33
22 0.28
23 0.3
24 0.27
25 0.2
26 0.19
27 0.17
28 0.17
29 0.17
30 0.15
31 0.18
32 0.2
33 0.22
34 0.31
35 0.3
36 0.32
37 0.35
38 0.4
39 0.36
40 0.38
41 0.38
42 0.32
43 0.37
44 0.38
45 0.42
46 0.38
47 0.37
48 0.35
49 0.34
50 0.33
51 0.29
52 0.29
53 0.26
54 0.24
55 0.23
56 0.21
57 0.19
58 0.16
59 0.15
60 0.1
61 0.06
62 0.05
63 0.05
64 0.04
65 0.04
66 0.04
67 0.05
68 0.06
69 0.07
70 0.09
71 0.13
72 0.15
73 0.17
74 0.21
75 0.21
76 0.22
77 0.24
78 0.25
79 0.28
80 0.26
81 0.26
82 0.23
83 0.22
84 0.2
85 0.18
86 0.15
87 0.08
88 0.08
89 0.06
90 0.07
91 0.07
92 0.08
93 0.1
94 0.11
95 0.11
96 0.12
97 0.16
98 0.22
99 0.26
100 0.26
101 0.28
102 0.33
103 0.41
104 0.46
105 0.43
106 0.46
107 0.49
108 0.56
109 0.6
110 0.6
111 0.59
112 0.59
113 0.65
114 0.63
115 0.64
116 0.64
117 0.59
118 0.57
119 0.51
120 0.46
121 0.38
122 0.3
123 0.21
124 0.13
125 0.1
126 0.06
127 0.04
128 0.04
129 0.04
130 0.04
131 0.06
132 0.07
133 0.06
134 0.06
135 0.1
136 0.13
137 0.15
138 0.23
139 0.3
140 0.37
141 0.46
142 0.53
143 0.59
144 0.62
145 0.65
146 0.62
147 0.62
148 0.61
149 0.56
150 0.51
151 0.43
152 0.38
153 0.32
154 0.26
155 0.19
156 0.13
157 0.1
158 0.08
159 0.12
160 0.13
161 0.17
162 0.27
163 0.36
164 0.45
165 0.54
166 0.65
167 0.71
168 0.81
169 0.87
170 0.86
171 0.88
172 0.81
173 0.76
174 0.67
175 0.59
176 0.49
177 0.38
178 0.28
179 0.18
180 0.16
181 0.1
182 0.1
183 0.07
184 0.1
185 0.13
186 0.17
187 0.27
188 0.37
189 0.47
190 0.54
191 0.66
192 0.73
193 0.82
194 0.85
195 0.85
196 0.85
197 0.79
198 0.73
199 0.63
200 0.55
201 0.45
202 0.37
203 0.27
204 0.17
205 0.13
206 0.1
207 0.09
208 0.09
209 0.09
210 0.09
211 0.14
212 0.18
213 0.18
214 0.24
215 0.33
216 0.41
217 0.5
218 0.59
219 0.62
220 0.67
221 0.7
222 0.69
223 0.67
224 0.62
225 0.56
226 0.54
227 0.48
228 0.42
229 0.39
230 0.36
231 0.3
232 0.25
233 0.24
234 0.22
235 0.26
236 0.31
237 0.37
238 0.47
239 0.55
240 0.66
241 0.74
242 0.76
243 0.79
244 0.8
245 0.81
246 0.77
247 0.72
248 0.64
249 0.58
250 0.51
251 0.42
252 0.35
253 0.28
254 0.21
255 0.16
256 0.14
257 0.1
258 0.08
259 0.08
260 0.08
261 0.06
262 0.07
263 0.07
264 0.06
265 0.06
266 0.07
267 0.07
268 0.08
269 0.09
270 0.09
271 0.1
272 0.11
273 0.11
274 0.1
275 0.09
276 0.1
277 0.11
278 0.11
279 0.11
280 0.1
281 0.11
282 0.16
283 0.21
284 0.2
285 0.25
286 0.33
287 0.43
288 0.53
289 0.63
290 0.69
291 0.76
292 0.86
293 0.9
294 0.93
295 0.93
296 0.95
297 0.95
298 0.94
299 0.93
300 0.93
301 0.93
302 0.9
303 0.86
304 0.82