Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0V6T2

Protein Details
Accession A0A4U0V6T2    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
54-74TGFPEHKKRTIEKRFLSKRAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
58-67EHKKRTIEKR
414-420GGGRRWK
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 10.5, cyto 5.5, cysk 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013929  RNA_pol_II_AP1_C  
IPR013930  RNA_pol_II_AP1_N  
IPR039913  RPAP1/Rba50  
Gene Ontology GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF08620  RPAP1_C  
PF08621  RPAP1_N  
Amino Acid Sequences MIRGERFEIDLGSDDEGNVAAAAPPPPGSFVTDVLERQPGAANPPKAPTLKSRTGFPEHKKRTIEKRFLSKRAAQPPQDLAKPSVNIPEIESQDDDAKPGSLADEKRRIDEENRQRLADMSPAQLEEERQELLSSLSPAMIERLLKRSNIESGSNESSQWTMQPPKTTPGTEKPKNTTSNSVTFAAPAMDHGDADTLHREALDIPPIDTLPHDTIHFPRPTQPPDLDPSSATFLQDLHEKYFPSLPADPSKLEWMRSPNNNTYQPPVSAFHAADLRFSFTGELLAPRTASLIPVTAGLHHHGDSPEAAGYTVAELARLSRSTYAAQRCIAYQSLGRFLYRLGKGEFGDPGEPGEDVTGAECSFGELARGLWHAVEQERVIEMLVLESEGLGVGGGRHVSARAYATEAVHLWRKGGGRRWKAG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.13
3 0.13
4 0.11
5 0.08
6 0.07
7 0.06
8 0.08
9 0.09
10 0.09
11 0.1
12 0.1
13 0.13
14 0.13
15 0.16
16 0.16
17 0.17
18 0.2
19 0.22
20 0.22
21 0.23
22 0.25
23 0.21
24 0.2
25 0.22
26 0.19
27 0.23
28 0.31
29 0.32
30 0.31
31 0.34
32 0.38
33 0.37
34 0.39
35 0.4
36 0.41
37 0.47
38 0.46
39 0.49
40 0.51
41 0.58
42 0.65
43 0.65
44 0.68
45 0.66
46 0.72
47 0.72
48 0.74
49 0.76
50 0.78
51 0.78
52 0.75
53 0.79
54 0.8
55 0.81
56 0.8
57 0.77
58 0.76
59 0.76
60 0.76
61 0.69
62 0.65
63 0.66
64 0.64
65 0.59
66 0.53
67 0.46
68 0.43
69 0.4
70 0.36
71 0.35
72 0.3
73 0.27
74 0.27
75 0.29
76 0.26
77 0.27
78 0.26
79 0.21
80 0.24
81 0.23
82 0.21
83 0.15
84 0.14
85 0.12
86 0.11
87 0.11
88 0.13
89 0.17
90 0.24
91 0.32
92 0.32
93 0.35
94 0.37
95 0.39
96 0.38
97 0.45
98 0.48
99 0.5
100 0.52
101 0.49
102 0.47
103 0.46
104 0.42
105 0.37
106 0.29
107 0.2
108 0.19
109 0.19
110 0.19
111 0.18
112 0.18
113 0.13
114 0.12
115 0.1
116 0.09
117 0.09
118 0.09
119 0.09
120 0.1
121 0.1
122 0.09
123 0.08
124 0.08
125 0.08
126 0.09
127 0.09
128 0.09
129 0.1
130 0.16
131 0.17
132 0.18
133 0.2
134 0.2
135 0.24
136 0.24
137 0.25
138 0.21
139 0.25
140 0.28
141 0.27
142 0.25
143 0.21
144 0.19
145 0.17
146 0.16
147 0.15
148 0.16
149 0.18
150 0.22
151 0.23
152 0.27
153 0.3
154 0.3
155 0.31
156 0.35
157 0.43
158 0.44
159 0.48
160 0.49
161 0.53
162 0.56
163 0.54
164 0.52
165 0.46
166 0.44
167 0.42
168 0.39
169 0.32
170 0.27
171 0.25
172 0.18
173 0.14
174 0.1
175 0.08
176 0.06
177 0.06
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.07
182 0.08
183 0.06
184 0.06
185 0.06
186 0.06
187 0.06
188 0.07
189 0.11
190 0.1
191 0.1
192 0.1
193 0.11
194 0.1
195 0.1
196 0.11
197 0.08
198 0.09
199 0.09
200 0.1
201 0.13
202 0.19
203 0.2
204 0.17
205 0.23
206 0.28
207 0.3
208 0.32
209 0.31
210 0.27
211 0.31
212 0.33
213 0.27
214 0.22
215 0.21
216 0.21
217 0.2
218 0.17
219 0.13
220 0.11
221 0.11
222 0.15
223 0.15
224 0.14
225 0.15
226 0.15
227 0.16
228 0.19
229 0.18
230 0.18
231 0.19
232 0.18
233 0.21
234 0.23
235 0.22
236 0.21
237 0.27
238 0.24
239 0.23
240 0.24
241 0.26
242 0.3
243 0.35
244 0.4
245 0.39
246 0.45
247 0.48
248 0.46
249 0.45
250 0.41
251 0.36
252 0.33
253 0.29
254 0.24
255 0.22
256 0.21
257 0.18
258 0.2
259 0.19
260 0.18
261 0.17
262 0.17
263 0.14
264 0.15
265 0.13
266 0.09
267 0.11
268 0.09
269 0.1
270 0.09
271 0.1
272 0.09
273 0.09
274 0.1
275 0.09
276 0.09
277 0.08
278 0.07
279 0.07
280 0.09
281 0.09
282 0.09
283 0.1
284 0.11
285 0.12
286 0.12
287 0.14
288 0.12
289 0.13
290 0.12
291 0.13
292 0.11
293 0.1
294 0.09
295 0.07
296 0.07
297 0.07
298 0.08
299 0.07
300 0.06
301 0.06
302 0.07
303 0.09
304 0.1
305 0.11
306 0.1
307 0.13
308 0.15
309 0.23
310 0.28
311 0.29
312 0.3
313 0.3
314 0.29
315 0.3
316 0.28
317 0.23
318 0.2
319 0.19
320 0.24
321 0.24
322 0.23
323 0.2
324 0.2
325 0.27
326 0.26
327 0.28
328 0.23
329 0.26
330 0.26
331 0.28
332 0.29
333 0.23
334 0.22
335 0.18
336 0.17
337 0.14
338 0.13
339 0.11
340 0.1
341 0.08
342 0.07
343 0.07
344 0.08
345 0.07
346 0.07
347 0.07
348 0.07
349 0.07
350 0.07
351 0.07
352 0.07
353 0.07
354 0.09
355 0.1
356 0.1
357 0.09
358 0.1
359 0.12
360 0.13
361 0.16
362 0.14
363 0.14
364 0.14
365 0.14
366 0.14
367 0.11
368 0.1
369 0.08
370 0.08
371 0.07
372 0.06
373 0.05
374 0.05
375 0.05
376 0.04
377 0.03
378 0.03
379 0.03
380 0.05
381 0.05
382 0.06
383 0.06
384 0.07
385 0.08
386 0.1
387 0.12
388 0.12
389 0.16
390 0.18
391 0.19
392 0.21
393 0.21
394 0.24
395 0.28
396 0.27
397 0.24
398 0.26
399 0.3
400 0.35
401 0.43
402 0.5