Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0UUL0

Protein Details
Accession A0A4U0UUL0    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-24SSDGERSPKRQRRSYSPPSPALPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
347-355RPERAGKKR
389-392KRQK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12, cyto 4.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013942  Mediator_Med19_fun  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF08633  Rox3  
Amino Acid Sequences MSSDGERSPKRQRRSYSPPSPALPETKPFVHQPETPPPSVHMSPSWQAQTSTLQQVGGAPFPTPPSTTGFFSQQRGAGSDGGESGQQTPATAYEGLRDDEGDAEMADAQQSGEVEDDVSMLSAPAAEADAEHRRTDHERQEGTLDDSPLTETLPPPPPRLYKLRSKPIASARPHPSQNLIDLYSLQGVQASVTRHDAAGNKINKLRKSYEGKVKQLGLSGRSKAQMGNGALAGLIVPEWDYDVGEGKTLWEQDRGAEFPLGNPETEQEVLGKLSSALSMRPGHFPRSEHEQWKNVLGLDEPKGTPIVAATKPYGLLSAANPAVAKTAPGIRHSAPASPGEGLGGAARPERAGKKRRYDEASYSGYHEGYDDDGYSTGGDLGSRRGSASKRQKTGGPGGGGGGGNGPAAPSRKTSALAV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.84
3 0.84
4 0.84
5 0.81
6 0.76
7 0.73
8 0.67
9 0.63
10 0.56
11 0.49
12 0.45
13 0.41
14 0.41
15 0.39
16 0.41
17 0.4
18 0.41
19 0.43
20 0.49
21 0.53
22 0.51
23 0.49
24 0.45
25 0.48
26 0.44
27 0.4
28 0.32
29 0.31
30 0.32
31 0.37
32 0.37
33 0.31
34 0.31
35 0.3
36 0.32
37 0.31
38 0.34
39 0.29
40 0.26
41 0.24
42 0.27
43 0.26
44 0.23
45 0.19
46 0.14
47 0.14
48 0.16
49 0.17
50 0.15
51 0.15
52 0.18
53 0.2
54 0.23
55 0.25
56 0.3
57 0.32
58 0.34
59 0.35
60 0.33
61 0.31
62 0.3
63 0.29
64 0.23
65 0.2
66 0.18
67 0.15
68 0.13
69 0.12
70 0.11
71 0.1
72 0.11
73 0.1
74 0.1
75 0.1
76 0.1
77 0.12
78 0.13
79 0.11
80 0.13
81 0.15
82 0.16
83 0.15
84 0.15
85 0.13
86 0.13
87 0.13
88 0.09
89 0.07
90 0.07
91 0.07
92 0.06
93 0.06
94 0.05
95 0.05
96 0.05
97 0.05
98 0.05
99 0.05
100 0.05
101 0.05
102 0.05
103 0.06
104 0.05
105 0.05
106 0.04
107 0.04
108 0.04
109 0.03
110 0.03
111 0.03
112 0.03
113 0.03
114 0.03
115 0.07
116 0.13
117 0.15
118 0.15
119 0.15
120 0.18
121 0.23
122 0.3
123 0.33
124 0.36
125 0.35
126 0.36
127 0.38
128 0.37
129 0.36
130 0.33
131 0.26
132 0.18
133 0.17
134 0.17
135 0.15
136 0.14
137 0.1
138 0.07
139 0.12
140 0.2
141 0.22
142 0.24
143 0.28
144 0.3
145 0.34
146 0.4
147 0.4
148 0.42
149 0.49
150 0.56
151 0.58
152 0.58
153 0.6
154 0.62
155 0.66
156 0.59
157 0.58
158 0.55
159 0.55
160 0.54
161 0.49
162 0.44
163 0.36
164 0.35
165 0.29
166 0.24
167 0.18
168 0.17
169 0.16
170 0.13
171 0.12
172 0.09
173 0.07
174 0.05
175 0.05
176 0.08
177 0.08
178 0.08
179 0.1
180 0.1
181 0.1
182 0.12
183 0.14
184 0.14
185 0.21
186 0.22
187 0.23
188 0.27
189 0.31
190 0.31
191 0.34
192 0.33
193 0.33
194 0.39
195 0.43
196 0.49
197 0.52
198 0.54
199 0.53
200 0.51
201 0.44
202 0.4
203 0.35
204 0.28
205 0.24
206 0.22
207 0.21
208 0.2
209 0.2
210 0.17
211 0.17
212 0.18
213 0.16
214 0.15
215 0.13
216 0.12
217 0.12
218 0.11
219 0.1
220 0.04
221 0.03
222 0.02
223 0.02
224 0.02
225 0.03
226 0.03
227 0.03
228 0.03
229 0.06
230 0.06
231 0.07
232 0.07
233 0.07
234 0.08
235 0.1
236 0.11
237 0.1
238 0.1
239 0.12
240 0.14
241 0.14
242 0.14
243 0.14
244 0.13
245 0.12
246 0.18
247 0.17
248 0.14
249 0.14
250 0.13
251 0.14
252 0.15
253 0.14
254 0.08
255 0.09
256 0.09
257 0.09
258 0.08
259 0.06
260 0.06
261 0.06
262 0.06
263 0.06
264 0.1
265 0.13
266 0.15
267 0.22
268 0.23
269 0.27
270 0.29
271 0.3
272 0.3
273 0.36
274 0.4
275 0.41
276 0.44
277 0.45
278 0.43
279 0.45
280 0.42
281 0.33
282 0.28
283 0.22
284 0.21
285 0.19
286 0.2
287 0.18
288 0.17
289 0.17
290 0.16
291 0.14
292 0.12
293 0.15
294 0.13
295 0.15
296 0.16
297 0.16
298 0.17
299 0.17
300 0.16
301 0.11
302 0.11
303 0.09
304 0.14
305 0.13
306 0.13
307 0.13
308 0.13
309 0.14
310 0.12
311 0.12
312 0.08
313 0.14
314 0.15
315 0.17
316 0.22
317 0.21
318 0.27
319 0.28
320 0.29
321 0.25
322 0.25
323 0.25
324 0.21
325 0.2
326 0.15
327 0.14
328 0.11
329 0.1
330 0.09
331 0.08
332 0.08
333 0.09
334 0.09
335 0.14
336 0.21
337 0.3
338 0.38
339 0.46
340 0.56
341 0.64
342 0.72
343 0.75
344 0.74
345 0.72
346 0.71
347 0.66
348 0.57
349 0.52
350 0.45
351 0.38
352 0.31
353 0.24
354 0.17
355 0.15
356 0.14
357 0.11
358 0.1
359 0.11
360 0.11
361 0.1
362 0.1
363 0.08
364 0.08
365 0.08
366 0.07
367 0.11
368 0.13
369 0.13
370 0.14
371 0.18
372 0.22
373 0.32
374 0.43
375 0.49
376 0.52
377 0.55
378 0.59
379 0.61
380 0.67
381 0.64
382 0.56
383 0.46
384 0.41
385 0.42
386 0.37
387 0.29
388 0.21
389 0.14
390 0.11
391 0.1
392 0.09
393 0.09
394 0.12
395 0.13
396 0.16
397 0.2
398 0.22