Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0TRN9

Protein Details
Accession A0A4U0TRN9    Localization Confidence High Confidence Score 17.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
12-33ADDDRSKRKREANSPSPCLKRKBasic
338-363ADEVTIGKKKRGRKYKKGAGADTRAVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
321-325KAKKA
344-356GKKKRGRKYKKGA
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto 12
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004875  DDE_SF_endonuclease_dom  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF03184  DDE_1  
Amino Acid Sequences MSHVLPFSIVHADDDRSKRKREANSPSPCLKRKLLSISVYSRMLSDDLSKLKLAQLFQKRHASAIRASKSGALDWNRFVTYDKDDSWFDVIGKVLQDPAVLQENIDNMDETGIMLSKLHSVKVLVRTGDDRGYRGARVKRTTITAVECISASGEALDPMIIWPASTHRANWTTQSTPGWYCAYSDGGYTDSYLSLQWLKLVFDPQTKERANRRPRVLICDGFGTHETLEILEFCFANNIILCRLPSHTSHKLQPCDVSVFGPLKAAYRDQVERLERGGVGTIGKEHFIYLYNPARRITYEDLEKARLERATKEADKEAADKAKKAEKAKQAMTATPTADEVTIGKKKRGRKYKKGAGADTRAVEEEAKAAYIG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.42
3 0.44
4 0.49
5 0.53
6 0.59
7 0.66
8 0.69
9 0.72
10 0.73
11 0.78
12 0.8
13 0.82
14 0.83
15 0.78
16 0.74
17 0.68
18 0.62
19 0.59
20 0.6
21 0.59
22 0.55
23 0.57
24 0.57
25 0.56
26 0.53
27 0.45
28 0.37
29 0.31
30 0.26
31 0.2
32 0.18
33 0.19
34 0.2
35 0.22
36 0.22
37 0.21
38 0.24
39 0.26
40 0.24
41 0.28
42 0.35
43 0.39
44 0.46
45 0.55
46 0.51
47 0.52
48 0.54
49 0.48
50 0.45
51 0.5
52 0.47
53 0.39
54 0.39
55 0.39
56 0.36
57 0.34
58 0.34
59 0.29
60 0.28
61 0.29
62 0.32
63 0.28
64 0.28
65 0.28
66 0.24
67 0.24
68 0.25
69 0.24
70 0.24
71 0.25
72 0.26
73 0.26
74 0.24
75 0.18
76 0.16
77 0.15
78 0.13
79 0.13
80 0.11
81 0.1
82 0.09
83 0.09
84 0.08
85 0.1
86 0.13
87 0.13
88 0.12
89 0.13
90 0.14
91 0.15
92 0.15
93 0.13
94 0.08
95 0.08
96 0.08
97 0.07
98 0.06
99 0.05
100 0.05
101 0.05
102 0.05
103 0.1
104 0.1
105 0.11
106 0.11
107 0.12
108 0.16
109 0.22
110 0.25
111 0.2
112 0.21
113 0.23
114 0.24
115 0.28
116 0.24
117 0.19
118 0.2
119 0.21
120 0.21
121 0.27
122 0.3
123 0.32
124 0.35
125 0.37
126 0.36
127 0.37
128 0.38
129 0.34
130 0.31
131 0.27
132 0.24
133 0.21
134 0.19
135 0.16
136 0.13
137 0.1
138 0.07
139 0.05
140 0.04
141 0.04
142 0.04
143 0.04
144 0.03
145 0.04
146 0.05
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.06
151 0.1
152 0.11
153 0.11
154 0.15
155 0.17
156 0.18
157 0.21
158 0.23
159 0.2
160 0.22
161 0.22
162 0.2
163 0.18
164 0.2
165 0.18
166 0.14
167 0.13
168 0.12
169 0.13
170 0.11
171 0.11
172 0.09
173 0.09
174 0.09
175 0.08
176 0.08
177 0.06
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.06
182 0.06
183 0.07
184 0.07
185 0.08
186 0.09
187 0.11
188 0.12
189 0.14
190 0.17
191 0.17
192 0.25
193 0.25
194 0.3
195 0.36
196 0.45
197 0.51
198 0.56
199 0.59
200 0.6
201 0.61
202 0.63
203 0.6
204 0.52
205 0.43
206 0.38
207 0.33
208 0.26
209 0.25
210 0.18
211 0.13
212 0.12
213 0.1
214 0.08
215 0.08
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.05
221 0.06
222 0.06
223 0.06
224 0.07
225 0.07
226 0.07
227 0.08
228 0.08
229 0.09
230 0.11
231 0.12
232 0.15
233 0.23
234 0.29
235 0.32
236 0.4
237 0.46
238 0.47
239 0.47
240 0.46
241 0.4
242 0.36
243 0.33
244 0.26
245 0.22
246 0.2
247 0.18
248 0.18
249 0.15
250 0.14
251 0.15
252 0.15
253 0.13
254 0.17
255 0.19
256 0.19
257 0.26
258 0.27
259 0.27
260 0.27
261 0.27
262 0.22
263 0.21
264 0.19
265 0.13
266 0.11
267 0.1
268 0.11
269 0.1
270 0.11
271 0.1
272 0.09
273 0.09
274 0.11
275 0.12
276 0.16
277 0.24
278 0.28
279 0.3
280 0.31
281 0.31
282 0.31
283 0.35
284 0.34
285 0.32
286 0.34
287 0.37
288 0.39
289 0.41
290 0.41
291 0.36
292 0.33
293 0.3
294 0.27
295 0.24
296 0.26
297 0.32
298 0.34
299 0.37
300 0.37
301 0.36
302 0.37
303 0.35
304 0.37
305 0.37
306 0.35
307 0.34
308 0.35
309 0.4
310 0.44
311 0.48
312 0.51
313 0.51
314 0.58
315 0.6
316 0.63
317 0.59
318 0.57
319 0.55
320 0.5
321 0.42
322 0.34
323 0.31
324 0.23
325 0.2
326 0.17
327 0.14
328 0.17
329 0.24
330 0.25
331 0.31
332 0.35
333 0.45
334 0.55
335 0.65
336 0.68
337 0.72
338 0.81
339 0.85
340 0.9
341 0.91
342 0.89
343 0.88
344 0.85
345 0.79
346 0.7
347 0.62
348 0.53
349 0.44
350 0.36
351 0.26
352 0.21
353 0.15