Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0UGD4

Protein Details
Accession A0A4U0UGD4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
580-599ELGRAGREKRRRFREEALTQBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
584-591AGREKRRR
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 13.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039601  Rrn5  
Gene Ontology GO:0000500  C:RNA polymerase I upstream activating factor complex  
GO:0042790  P:nucleolar large rRNA transcription by RNA polymerase I  
Amino Acid Sequences MSSVPIAPTSHEATNSNYQQPPSTDCDPEDATASGAADSGFSDVANSLGAQDNQRSGQASPSHRPAKPRLRSGAANYSDLFNAVVRDVSREPDKEVNRLPPSLIGTSHWSSFEKEMFFEALARCRPGNLLELSRAIGTKSEAEIHVYLRLLQDRVLECDTSLPAKESFSIAELPAAYEVSKVCEAALANAADVLARKVDLSDGRVERAKHGDTWIIDEDLATSIEASLRSEESVKSTIAPDAEKASGEQRVPPVQIRSAELLSPEAFLTLSRNIFMNAKPESGNNWRDLVVEEDGPSSPAIFRTAFDDFYNLAVSLTRRIVQTTLFQANSRLRASDASRRHHELTAEVREVDVRTAVKLLSLRTEWRAHWAGVPRRCGLDVYTEIGKYLDGRPGTKNGVELTPEEVEMELGVGREQDAAGDEPALPGGDGELAESDFDSDDFTELGDDGTTIDLDNLKRDIDETYKTESEDLGGGIAEGVQPNRKRKRVLGPASAKLEDQHIEALDMRAGAEETHRLWKSLGKDKGRANPEALPQAPPVPKLKYAETGARSNVGTTMRYETIWERSGKGVPEYEFKRTEELGRAGREKRRRFREEALTQAHGLQPDPRAEKAKRDLSAEDLSAEDLPDMKSDPDIEAEDIISDAEGEVD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.4
3 0.43
4 0.42
5 0.41
6 0.43
7 0.44
8 0.43
9 0.4
10 0.4
11 0.37
12 0.34
13 0.38
14 0.36
15 0.34
16 0.32
17 0.25
18 0.21
19 0.19
20 0.18
21 0.13
22 0.11
23 0.1
24 0.07
25 0.07
26 0.08
27 0.07
28 0.06
29 0.07
30 0.06
31 0.07
32 0.07
33 0.07
34 0.07
35 0.11
36 0.13
37 0.15
38 0.18
39 0.2
40 0.21
41 0.23
42 0.23
43 0.19
44 0.25
45 0.3
46 0.34
47 0.38
48 0.47
49 0.53
50 0.53
51 0.6
52 0.63
53 0.66
54 0.69
55 0.71
56 0.69
57 0.67
58 0.7
59 0.71
60 0.71
61 0.63
62 0.56
63 0.48
64 0.42
65 0.36
66 0.31
67 0.25
68 0.15
69 0.13
70 0.1
71 0.11
72 0.1
73 0.14
74 0.15
75 0.19
76 0.24
77 0.24
78 0.28
79 0.35
80 0.37
81 0.39
82 0.44
83 0.49
84 0.47
85 0.47
86 0.43
87 0.38
88 0.39
89 0.34
90 0.3
91 0.23
92 0.25
93 0.26
94 0.27
95 0.25
96 0.23
97 0.23
98 0.26
99 0.27
100 0.22
101 0.2
102 0.21
103 0.2
104 0.19
105 0.2
106 0.19
107 0.21
108 0.22
109 0.24
110 0.22
111 0.21
112 0.22
113 0.2
114 0.23
115 0.22
116 0.22
117 0.22
118 0.23
119 0.24
120 0.23
121 0.22
122 0.17
123 0.14
124 0.12
125 0.12
126 0.12
127 0.14
128 0.14
129 0.17
130 0.18
131 0.18
132 0.18
133 0.17
134 0.17
135 0.16
136 0.19
137 0.16
138 0.16
139 0.2
140 0.19
141 0.23
142 0.23
143 0.21
144 0.18
145 0.2
146 0.2
147 0.16
148 0.16
149 0.14
150 0.13
151 0.13
152 0.14
153 0.13
154 0.12
155 0.12
156 0.13
157 0.11
158 0.12
159 0.11
160 0.11
161 0.1
162 0.1
163 0.08
164 0.08
165 0.08
166 0.1
167 0.1
168 0.1
169 0.09
170 0.11
171 0.11
172 0.11
173 0.15
174 0.11
175 0.11
176 0.11
177 0.11
178 0.09
179 0.09
180 0.08
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.08
186 0.09
187 0.11
188 0.17
189 0.18
190 0.21
191 0.24
192 0.25
193 0.25
194 0.29
195 0.28
196 0.22
197 0.23
198 0.24
199 0.21
200 0.25
201 0.24
202 0.2
203 0.18
204 0.16
205 0.15
206 0.12
207 0.12
208 0.07
209 0.06
210 0.05
211 0.06
212 0.07
213 0.06
214 0.07
215 0.07
216 0.08
217 0.09
218 0.09
219 0.11
220 0.13
221 0.12
222 0.12
223 0.12
224 0.13
225 0.13
226 0.13
227 0.11
228 0.12
229 0.12
230 0.12
231 0.12
232 0.12
233 0.14
234 0.14
235 0.15
236 0.16
237 0.18
238 0.19
239 0.21
240 0.21
241 0.21
242 0.22
243 0.22
244 0.21
245 0.19
246 0.18
247 0.16
248 0.16
249 0.13
250 0.12
251 0.1
252 0.08
253 0.07
254 0.07
255 0.08
256 0.09
257 0.09
258 0.09
259 0.09
260 0.1
261 0.12
262 0.13
263 0.15
264 0.14
265 0.15
266 0.15
267 0.15
268 0.19
269 0.24
270 0.25
271 0.22
272 0.22
273 0.21
274 0.21
275 0.22
276 0.2
277 0.14
278 0.12
279 0.11
280 0.11
281 0.1
282 0.11
283 0.1
284 0.07
285 0.06
286 0.06
287 0.08
288 0.07
289 0.07
290 0.1
291 0.12
292 0.13
293 0.12
294 0.13
295 0.12
296 0.12
297 0.13
298 0.09
299 0.08
300 0.08
301 0.08
302 0.08
303 0.09
304 0.1
305 0.09
306 0.1
307 0.1
308 0.11
309 0.13
310 0.15
311 0.18
312 0.17
313 0.17
314 0.2
315 0.21
316 0.23
317 0.21
318 0.17
319 0.14
320 0.16
321 0.19
322 0.24
323 0.29
324 0.31
325 0.35
326 0.39
327 0.4
328 0.39
329 0.37
330 0.32
331 0.31
332 0.3
333 0.27
334 0.23
335 0.21
336 0.2
337 0.2
338 0.16
339 0.12
340 0.07
341 0.07
342 0.07
343 0.07
344 0.08
345 0.09
346 0.09
347 0.1
348 0.11
349 0.13
350 0.16
351 0.18
352 0.17
353 0.22
354 0.23
355 0.21
356 0.24
357 0.3
358 0.34
359 0.36
360 0.4
361 0.35
362 0.33
363 0.33
364 0.3
365 0.23
366 0.2
367 0.17
368 0.17
369 0.17
370 0.16
371 0.16
372 0.15
373 0.15
374 0.11
375 0.11
376 0.12
377 0.12
378 0.14
379 0.15
380 0.19
381 0.21
382 0.2
383 0.2
384 0.17
385 0.17
386 0.17
387 0.16
388 0.16
389 0.14
390 0.14
391 0.12
392 0.11
393 0.09
394 0.08
395 0.07
396 0.04
397 0.04
398 0.04
399 0.04
400 0.04
401 0.04
402 0.04
403 0.04
404 0.05
405 0.06
406 0.06
407 0.07
408 0.07
409 0.06
410 0.07
411 0.07
412 0.05
413 0.04
414 0.04
415 0.04
416 0.04
417 0.04
418 0.04
419 0.04
420 0.04
421 0.05
422 0.05
423 0.04
424 0.04
425 0.05
426 0.05
427 0.05
428 0.05
429 0.05
430 0.05
431 0.05
432 0.05
433 0.04
434 0.04
435 0.04
436 0.04
437 0.04
438 0.04
439 0.05
440 0.07
441 0.08
442 0.1
443 0.1
444 0.1
445 0.1
446 0.11
447 0.13
448 0.13
449 0.17
450 0.18
451 0.23
452 0.24
453 0.24
454 0.24
455 0.22
456 0.19
457 0.16
458 0.13
459 0.08
460 0.06
461 0.06
462 0.05
463 0.05
464 0.05
465 0.05
466 0.06
467 0.12
468 0.17
469 0.27
470 0.36
471 0.41
472 0.45
473 0.51
474 0.61
475 0.65
476 0.69
477 0.7
478 0.69
479 0.71
480 0.72
481 0.65
482 0.55
483 0.44
484 0.39
485 0.29
486 0.22
487 0.17
488 0.13
489 0.13
490 0.14
491 0.14
492 0.11
493 0.1
494 0.09
495 0.08
496 0.08
497 0.07
498 0.07
499 0.09
500 0.11
501 0.19
502 0.19
503 0.2
504 0.21
505 0.25
506 0.31
507 0.38
508 0.45
509 0.43
510 0.49
511 0.55
512 0.63
513 0.63
514 0.59
515 0.53
516 0.49
517 0.48
518 0.49
519 0.43
520 0.37
521 0.33
522 0.37
523 0.36
524 0.33
525 0.33
526 0.29
527 0.33
528 0.34
529 0.35
530 0.35
531 0.37
532 0.42
533 0.42
534 0.42
535 0.39
536 0.38
537 0.35
538 0.3
539 0.29
540 0.23
541 0.2
542 0.18
543 0.22
544 0.2
545 0.2
546 0.22
547 0.22
548 0.26
549 0.3
550 0.29
551 0.26
552 0.28
553 0.32
554 0.31
555 0.31
556 0.3
557 0.27
558 0.35
559 0.36
560 0.39
561 0.39
562 0.38
563 0.39
564 0.36
565 0.38
566 0.37
567 0.39
568 0.39
569 0.42
570 0.47
571 0.49
572 0.56
573 0.62
574 0.65
575 0.7
576 0.74
577 0.76
578 0.77
579 0.8
580 0.82
581 0.8
582 0.79
583 0.75
584 0.67
585 0.6
586 0.55
587 0.48
588 0.38
589 0.31
590 0.25
591 0.23
592 0.27
593 0.3
594 0.32
595 0.37
596 0.39
597 0.47
598 0.52
599 0.57
600 0.53
601 0.53
602 0.52
603 0.5
604 0.52
605 0.44
606 0.36
607 0.28
608 0.26
609 0.22
610 0.2
611 0.14
612 0.11
613 0.11
614 0.11
615 0.12
616 0.11
617 0.12
618 0.13
619 0.14
620 0.16
621 0.17
622 0.17
623 0.17
624 0.16
625 0.15
626 0.14
627 0.12
628 0.09
629 0.07