FuNGI

A0A4U0USQ0

Protein Details

Accession

A0A4U0USQ0

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
14-63	AKTKPSEASTKKSAKKRKRNDDQDGTPVTTEDSGKKSKKRKADVAAVATP	Hydrophilic
75-102	GSIVGGKSEKKRKHEKKREAASEEPSKD	Basic
129-155	QPGVAQVKPAKKKGKPKLDQLPNGNEE	Hydrophilic
1021-1050	PFPFYQRWDPSQRKKKSKARTDKAFAAPRS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
23-32	TKKSAKKRKR
48-54	KKSKKRK
81-93	KSEKKRKHEKKRE
136-145	KPAKKKGKPK
1033-1041	RKKKSKART

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 13.333, cyto 12.5, nucl 11, mito_nucl 7.499

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR036898 RNA_pol_Rpb7-like_N_sf IPR041178 RPA43_OB IPR045113 Rpb7-like
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006352 P:DNA-templated transcription initiation
Pfam	View protein in Pfam PF17875 RPA43_OB

Amino Acid Sequences

MAPLFSSMSTPDVAKTKPSEASTKKSAKKRKRNDDQDGTPVTTEDSGKKSKKRKADVAAVATPATVQTSALSAAGSIVGGKSEKKRKHEKKREAASEEPSKDDPMVEYSATAPQKETKDSSIVGVEGAQPGVAQVKPAKKKGKPKLDQLPNGNEEVFAEPAVAPGPSKAQQRSRVQGGASHEVSLTDDQRLHSYSPFIHKTETFYLALSPCANDFPLEGLVAEHISPLLLTYHPPLRGVVLKYSNARLSGTPDGQSKDGDGVVLSKAIDEYAVTFVYLTVDLVIFAPTKDSWLEGYVNLQNESLLGLVCYNYFNAAIERQRLPKDWRWVDDASRGNTRVAKGGQGYWVDDSGGRVDGKVVFRVKDFDAAAGGDSGAGSINILGTLLSVEEDRQLDHDGRQHSVGSVSTLWPINDTHLKHTITQLLAQIDQVFPLEGYHWGLEHYTVTLEGYELLHYHELGAVCKDEDEVVIRPMMWAETRARRLGGRDQITADGRHLVDGLPFGRPRLRAGSRPEVRIPAMQRRTIEDEEDGQVEDDEERVAREGGGMALVRLDEVEDYLDDEDGEDDGDFEMDVEGGGVDASEAEGSSEEGSVESESGSESSGETSATSSSSDNNLNENASMSEASWDGIESAAPTPLGKEAAGKAVPGSLVGLTGATVKGQEVKMASPVKSTRTVASKHKSNPGPPDGGRVDEALNSLNESNKSLQGKAPSDLPRESRVEGGSERVKRDNAPPFQGTAETKTRNARKRDSRKLAYLKRTDVLPLDATLATLHQWENSQKYQESQPDGGGSEQHVVQPASEATEAQTDGTGVKSASAGREDYSLDTEDRAPPHDMKRDHAAMEHAEHDKPVQIERQRKALLKAIATGGVDIEDKSYKRKRAEVEDEEPPDEISAKRPALDSSQSHEQQSQFAVASNMPGEVATTKPTVTRRSKLDLAGSQRLLFGSLGVRVPTTQEEKEAVQKKLAGNVKSKVAPPAAKVEASPQRITEFREDNEDAWRDKIELTAVECVDEGITLSTPPFPFYQRWDPSQRKKKSKARTDKAFAAPRSQKTQNGRTESNGGHVESYDKYNVNGGGDALDYDDVADEGWEDEYWEEGALLNGGNDDEGGTRDDPATQLRRETAEQALHEAGEDFPALPDDITKLPLITEAEAQLDDYIVYTELACSAATKWEPSMLTRTVQLMDTEHEDENEDGERIHATWIVRQALRDVVRAKEYDGEGKRVYKKFEMEGLSDEEGEEDEGEDRVRRVEWEDLLEARLLLRKGDEEVVIPA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.24
2	0.27
3	0.3
4	0.35
5	0.38
6	0.44
7	0.46
8	0.53
9	0.58
10	0.64
11	0.67
12	0.72
13	0.79
14	0.8
15	0.85
16	0.89
17	0.9
18	0.92
19	0.94
20	0.95
21	0.94
22	0.9
23	0.88
24	0.82
25	0.73
26	0.62
27	0.51
28	0.41
29	0.33
30	0.29
31	0.24
32	0.25
33	0.32
34	0.39
35	0.48
36	0.56
37	0.61
38	0.69
39	0.75
40	0.79
41	0.79
42	0.82
43	0.83
44	0.8
45	0.76
46	0.67
47	0.57
48	0.47
49	0.38
50	0.27
51	0.2
52	0.12
53	0.08
54	0.07
55	0.08
56	0.09
57	0.09
58	0.09
59	0.07
60	0.07
61	0.07
62	0.07
63	0.06
64	0.05
65	0.06
66	0.08
67	0.12
68	0.21
69	0.31
70	0.38
71	0.47
72	0.58
73	0.68
74	0.79
75	0.86
76	0.88
77	0.89
78	0.93
79	0.94
80	0.9
81	0.85
82	0.82
83	0.81
84	0.72
85	0.66
86	0.56
87	0.48
88	0.41
89	0.35
90	0.28
91	0.22
92	0.22
93	0.17
94	0.16
95	0.16
96	0.23
97	0.24
98	0.23
99	0.21
100	0.24
101	0.28
102	0.32
103	0.34
104	0.3
105	0.33
106	0.33
107	0.33
108	0.29
109	0.26
110	0.21
111	0.18
112	0.16
113	0.14
114	0.13
115	0.1
116	0.08
117	0.08
118	0.11
119	0.1
120	0.11
121	0.16
122	0.25
123	0.33
124	0.42
125	0.51
126	0.56
127	0.67
128	0.75
129	0.8
130	0.79
131	0.82
132	0.84
133	0.85
134	0.87
135	0.83
136	0.81
137	0.73
138	0.67
139	0.57
140	0.46
141	0.37
142	0.3
143	0.23
144	0.14
145	0.12
146	0.1
147	0.1
148	0.11
149	0.09
150	0.07
151	0.07
152	0.12
153	0.16
154	0.22
155	0.29
156	0.36
157	0.46
158	0.54
159	0.6
160	0.62
161	0.6
162	0.54
163	0.52
164	0.5
165	0.49
166	0.42
167	0.35
168	0.29
169	0.26
170	0.27
171	0.26
172	0.2
173	0.15
174	0.16
175	0.17
176	0.19
177	0.21
178	0.21
179	0.19
180	0.21
181	0.22
182	0.29
183	0.33
184	0.31
185	0.33
186	0.32
187	0.37
188	0.38
189	0.38
190	0.3
191	0.26
192	0.28
193	0.25
194	0.26
195	0.21
196	0.17
197	0.13
198	0.14
199	0.14
200	0.11
201	0.1
202	0.11
203	0.11
204	0.1
205	0.1
206	0.09
207	0.09
208	0.1
209	0.09
210	0.07
211	0.06
212	0.05
213	0.05
214	0.05
215	0.06
216	0.06
217	0.07
218	0.11
219	0.16
220	0.17
221	0.18
222	0.18
223	0.2
224	0.25
225	0.26
226	0.29
227	0.29
228	0.32
229	0.34
230	0.37
231	0.36
232	0.32
233	0.31
234	0.25
235	0.26
236	0.29
237	0.28
238	0.27
239	0.29
240	0.3
241	0.3
242	0.29
243	0.24
244	0.2
245	0.17
246	0.14
247	0.11
248	0.1
249	0.09
250	0.1
251	0.09
252	0.07
253	0.07
254	0.07
255	0.07
256	0.05
257	0.06
258	0.07
259	0.08
260	0.07
261	0.07
262	0.07
263	0.09
264	0.09
265	0.07
266	0.06
267	0.05
268	0.06
269	0.06
270	0.07
271	0.06
272	0.06
273	0.08
274	0.08
275	0.09
276	0.09
277	0.1
278	0.1
279	0.12
280	0.13
281	0.12
282	0.16
283	0.18
284	0.19
285	0.19
286	0.18
287	0.15
288	0.14
289	0.14
290	0.1
291	0.06
292	0.05
293	0.04
294	0.05
295	0.06
296	0.06
297	0.06
298	0.06
299	0.06
300	0.07
301	0.08
302	0.12
303	0.15
304	0.19
305	0.22
306	0.27
307	0.29
308	0.33
309	0.39
310	0.42
311	0.5
312	0.51
313	0.5
314	0.51
315	0.51
316	0.49
317	0.5
318	0.48
319	0.41
320	0.41
321	0.39
322	0.35
323	0.36
324	0.34
325	0.31
326	0.26
327	0.25
328	0.22
329	0.22
330	0.24
331	0.22
332	0.23
333	0.19
334	0.18
335	0.16
336	0.14
337	0.14
338	0.11
339	0.12
340	0.1
341	0.09
342	0.1
343	0.14
344	0.15
345	0.19
346	0.2
347	0.19
348	0.2
349	0.23
350	0.23
351	0.23
352	0.22
353	0.18
354	0.16
355	0.15
356	0.15
357	0.12
358	0.11
359	0.06
360	0.05
361	0.05
362	0.04
363	0.04
364	0.03
365	0.03
366	0.03
367	0.03
368	0.03
369	0.03
370	0.03
371	0.03
372	0.03
373	0.03
374	0.04
375	0.04
376	0.06
377	0.07
378	0.07
379	0.08
380	0.11
381	0.12
382	0.14
383	0.19
384	0.18
385	0.2
386	0.21
387	0.19
388	0.17
389	0.17
390	0.15
391	0.12
392	0.11
393	0.1
394	0.11
395	0.12
396	0.12
397	0.12
398	0.12
399	0.13
400	0.18
401	0.19
402	0.21
403	0.26
404	0.27
405	0.27
406	0.29
407	0.3
408	0.25
409	0.26
410	0.24
411	0.19
412	0.19
413	0.18
414	0.17
415	0.12
416	0.12
417	0.1
418	0.07
419	0.06
420	0.06
421	0.06
422	0.06
423	0.07
424	0.07
425	0.07
426	0.07
427	0.08
428	0.08
429	0.07
430	0.07
431	0.06
432	0.05
433	0.06
434	0.05
435	0.05
436	0.05
437	0.05
438	0.05
439	0.05
440	0.07
441	0.07
442	0.07
443	0.07
444	0.08
445	0.08
446	0.09
447	0.09
448	0.09
449	0.08
450	0.09
451	0.09
452	0.06
453	0.06
454	0.08
455	0.08
456	0.09
457	0.09
458	0.09
459	0.09
460	0.09
461	0.09
462	0.07
463	0.08
464	0.12
465	0.18
466	0.21
467	0.22
468	0.23
469	0.24
470	0.27
471	0.32
472	0.36
473	0.32
474	0.31
475	0.31
476	0.33
477	0.34
478	0.31
479	0.24
480	0.19
481	0.16
482	0.14
483	0.13
484	0.1
485	0.09
486	0.1
487	0.1
488	0.1
489	0.1
490	0.11
491	0.14
492	0.14
493	0.16
494	0.22
495	0.25
496	0.28
497	0.35
498	0.44
499	0.45
500	0.49
501	0.48
502	0.43
503	0.41
504	0.39
505	0.36
506	0.35
507	0.35
508	0.34
509	0.33
510	0.34
511	0.39
512	0.36
513	0.33
514	0.25
515	0.23
516	0.21
517	0.21
518	0.17
519	0.11
520	0.1
521	0.09
522	0.08
523	0.06
524	0.05
525	0.04
526	0.04
527	0.05
528	0.05
529	0.05
530	0.05
531	0.05
532	0.05
533	0.06
534	0.05
535	0.04
536	0.04
537	0.04
538	0.04
539	0.04
540	0.04
541	0.03
542	0.03
543	0.04
544	0.03
545	0.04
546	0.05
547	0.05
548	0.04
549	0.05
550	0.05
551	0.04
552	0.04
553	0.04
554	0.04
555	0.04
556	0.04
557	0.03
558	0.03
559	0.03
560	0.03
561	0.03
562	0.02
563	0.02
564	0.02
565	0.02
566	0.02
567	0.02
568	0.02
569	0.02
570	0.02
571	0.02
572	0.02
573	0.02
574	0.03
575	0.03
576	0.04
577	0.04
578	0.04
579	0.04
580	0.04
581	0.04
582	0.04
583	0.04
584	0.04
585	0.04
586	0.04
587	0.04
588	0.04
589	0.04
590	0.05
591	0.05
592	0.05
593	0.05
594	0.05
595	0.05
596	0.06
597	0.06
598	0.07
599	0.09
600	0.11
601	0.11
602	0.12
603	0.12
604	0.12
605	0.12
606	0.11
607	0.09
608	0.07
609	0.07
610	0.06
611	0.06
612	0.06
613	0.06
614	0.05
615	0.05
616	0.04
617	0.04
618	0.04
619	0.04
620	0.04
621	0.04
622	0.04
623	0.04
624	0.05
625	0.05
626	0.06
627	0.05
628	0.06
629	0.06
630	0.09
631	0.09
632	0.09
633	0.08
634	0.08
635	0.08
636	0.07
637	0.07
638	0.04
639	0.04
640	0.04
641	0.04
642	0.03
643	0.04
644	0.04
645	0.03
646	0.04
647	0.04
648	0.07
649	0.07
650	0.08
651	0.08
652	0.08
653	0.14
654	0.16
655	0.16
656	0.17
657	0.18
658	0.2
659	0.22
660	0.23
661	0.2
662	0.22
663	0.26
664	0.31
665	0.36
666	0.4
667	0.41
668	0.48
669	0.48
670	0.48
671	0.51
672	0.47
673	0.45
674	0.38
675	0.41
676	0.33
677	0.32
678	0.28
679	0.22
680	0.19
681	0.14
682	0.15
683	0.09
684	0.08
685	0.08
686	0.08
687	0.08
688	0.08
689	0.1
690	0.11
691	0.14
692	0.15
693	0.15
694	0.17
695	0.21
696	0.22
697	0.21
698	0.27
699	0.27
700	0.29
701	0.3
702	0.3
703	0.29
704	0.3
705	0.3
706	0.25
707	0.21
708	0.2
709	0.18
710	0.2
711	0.22
712	0.23
713	0.25
714	0.25
715	0.25
716	0.25
717	0.31
718	0.36
719	0.33
720	0.35
721	0.33
722	0.32
723	0.32
724	0.33
725	0.27
726	0.23
727	0.25
728	0.22
729	0.24
730	0.3
731	0.38
732	0.43
733	0.48
734	0.52
735	0.57
736	0.66
737	0.74
738	0.77
739	0.74
740	0.75
741	0.8
742	0.79
743	0.77
744	0.72
745	0.63
746	0.55
747	0.5
748	0.42
749	0.34
750	0.27
751	0.19
752	0.14
753	0.14
754	0.12
755	0.12
756	0.1
757	0.09
758	0.07
759	0.08
760	0.07
761	0.06
762	0.08
763	0.1
764	0.14
765	0.16
766	0.19
767	0.18
768	0.21
769	0.25
770	0.28
771	0.3
772	0.27
773	0.26
774	0.23
775	0.24
776	0.22
777	0.17
778	0.13
779	0.1
780	0.1
781	0.09
782	0.1
783	0.1
784	0.09
785	0.1
786	0.09
787	0.09
788	0.09
789	0.09
790	0.07
791	0.09
792	0.09
793	0.08
794	0.08
795	0.06
796	0.06
797	0.07
798	0.07
799	0.05
800	0.05
801	0.06
802	0.07
803	0.08
804	0.09
805	0.09
806	0.09
807	0.11
808	0.11
809	0.11
810	0.13
811	0.13
812	0.12
813	0.12
814	0.13
815	0.15
816	0.15
817	0.17
818	0.18
819	0.2
820	0.25
821	0.31
822	0.3
823	0.31
824	0.37
825	0.36
826	0.34
827	0.31
828	0.29
829	0.23
830	0.23
831	0.24
832	0.19
833	0.17
834	0.16
835	0.16
836	0.16
837	0.15
838	0.15
839	0.18
840	0.23
841	0.32
842	0.34
843	0.41
844	0.43
845	0.45
846	0.46
847	0.46
848	0.43
849	0.36
850	0.36
851	0.29
852	0.26
853	0.24
854	0.2
855	0.13
856	0.1
857	0.1
858	0.07
859	0.08
860	0.09
861	0.1
862	0.17
863	0.24
864	0.29
865	0.32
866	0.38
867	0.42
868	0.49
869	0.59
870	0.59
871	0.58
872	0.59
873	0.58
874	0.53
875	0.48
876	0.38
877	0.28
878	0.22
879	0.17
880	0.13
881	0.16
882	0.16
883	0.16
884	0.17
885	0.18
886	0.21
887	0.26
888	0.25
889	0.25
890	0.33
891	0.34
892	0.35
893	0.37
894	0.33
895	0.29
896	0.28
897	0.24
898	0.15
899	0.15
900	0.14
901	0.11
902	0.12
903	0.1
904	0.09
905	0.07
906	0.07
907	0.07
908	0.06
909	0.07
910	0.09
911	0.09
912	0.09
913	0.13
914	0.17
915	0.26
916	0.31
917	0.36
918	0.39
919	0.45
920	0.49
921	0.48
922	0.5
923	0.47
924	0.48
925	0.49
926	0.44
927	0.38
928	0.34
929	0.32
930	0.27
931	0.21
932	0.15
933	0.09
934	0.1
935	0.11
936	0.11
937	0.11
938	0.1
939	0.11
940	0.14
941	0.18
942	0.16
943	0.17
944	0.19
945	0.21
946	0.3
947	0.35
948	0.32
949	0.3
950	0.33
951	0.32
952	0.38
953	0.43
954	0.37
955	0.36
956	0.38
957	0.41
958	0.4
959	0.4
960	0.36
961	0.35
962	0.33
963	0.3
964	0.34
965	0.31
966	0.29
967	0.28
968	0.32
969	0.34
970	0.37
971	0.35
972	0.29
973	0.3
974	0.31
975	0.35
976	0.34
977	0.3
978	0.27
979	0.33
980	0.34
981	0.32
982	0.36
983	0.36
984	0.3
985	0.27
986	0.27
987	0.2
988	0.19
989	0.19
990	0.14
991	0.13
992	0.14
993	0.17
994	0.17
995	0.16
996	0.16
997	0.15
998	0.13
999	0.11
1000	0.09
1001	0.05
1002	0.06
1003	0.06
1004	0.06
1005	0.1
1006	0.1
1007	0.12
1008	0.13
1009	0.15
1010	0.17
1011	0.25
1012	0.34
1013	0.35
1014	0.42
1015	0.5
1016	0.58
1017	0.67
1018	0.75
1019	0.78
1020	0.78
1021	0.84
1022	0.87
1023	0.88
1024	0.9
1025	0.9
1026	0.9
1027	0.9
1028	0.87
1029	0.85
1030	0.85
1031	0.82
1032	0.72
1033	0.71
1034	0.68
1035	0.63
1036	0.63
1037	0.58
1038	0.56
1039	0.55
1040	0.63
1041	0.62
1042	0.61
1043	0.59
1044	0.55
1045	0.58
1046	0.51
1047	0.48
1048	0.42
1049	0.33
1050	0.27
1051	0.24
1052	0.23
1053	0.19
1054	0.22
1055	0.2
1056	0.17
1057	0.17
1058	0.2
1059	0.21
1060	0.19
1061	0.18
1062	0.15
1063	0.12
1064	0.12
1065	0.11
1066	0.09
1067	0.08
1068	0.06
1069	0.06
1070	0.06
1071	0.05
1072	0.05
1073	0.05
1074	0.04
1075	0.05
1076	0.06
1077	0.05
1078	0.06
1079	0.06
1080	0.07
1081	0.08
1082	0.07
1083	0.07
1084	0.06
1085	0.06
1086	0.06
1087	0.06
1088	0.05
1089	0.05
1090	0.05
1091	0.05
1092	0.05
1093	0.05
1094	0.05
1095	0.06
1096	0.1
1097	0.1
1098	0.11
1099	0.11
1100	0.12
1101	0.13
1102	0.19
1103	0.24
1104	0.23
1105	0.26
1106	0.27
1107	0.31
1108	0.32
1109	0.35
1110	0.33
1111	0.32
1112	0.31
1113	0.32
1114	0.31
1115	0.26
1116	0.25
1117	0.22
1118	0.16
1119	0.12
1120	0.12
1121	0.08
1122	0.07
1123	0.09
1124	0.09
1125	0.08
1126	0.08
1127	0.1
1128	0.11
1129	0.13
1130	0.13
1131	0.12
1132	0.11
1133	0.14
1134	0.16
1135	0.14
1136	0.15
1137	0.14
1138	0.16
1139	0.15
1140	0.16
1141	0.13
1142	0.11
1143	0.1
1144	0.08
1145	0.07
1146	0.06
1147	0.07
1148	0.06
1149	0.06
1150	0.07
1151	0.08
1152	0.07
1153	0.07
1154	0.08
1155	0.13
1156	0.14
1157	0.16
1158	0.16
1159	0.2
1160	0.21
1161	0.23
1162	0.28
1163	0.25
1164	0.25
1165	0.26
1166	0.27
1167	0.24
1168	0.25
1169	0.23
1170	0.19
1171	0.19
1172	0.22
1173	0.24
1174	0.22
1175	0.21
1176	0.22
1177	0.2
1178	0.2
1179	0.19
1180	0.14
1181	0.11
1182	0.11
1183	0.12
1184	0.1
1185	0.12
1186	0.13
1187	0.12
1188	0.17
1189	0.23
1190	0.29
1191	0.29
1192	0.29
1193	0.3
1194	0.35
1195	0.36
1196	0.38
1197	0.34
1198	0.33
1199	0.36
1200	0.36
1201	0.35
1202	0.33
1203	0.34
1204	0.37
1205	0.38
1206	0.39
1207	0.38
1208	0.45
1209	0.53
1210	0.51
1211	0.54
1212	0.51
1213	0.52
1214	0.5
1215	0.54
1216	0.51
1217	0.44
1218	0.44
1219	0.43
1220	0.39
1221	0.34
1222	0.3
1223	0.23
1224	0.19
1225	0.17
1226	0.13
1227	0.09
1228	0.08
1229	0.08
1230	0.1
1231	0.11
1232	0.11
1233	0.12
1234	0.13
1235	0.14
1236	0.17
1237	0.23
1238	0.25
1239	0.28
1240	0.31
1241	0.3
1242	0.31
1243	0.29
1244	0.25
1245	0.21
1246	0.23
1247	0.18
1248	0.16
1249	0.16
1250	0.16
1251	0.19
1252	0.22
1253	0.22

A0A4U0USQ0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer