FuNGI

A0A4U0VI54

Protein Details

Accession

A0A4U0VI54

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-23	MAEKDGKKRKRHSNGEEPPNKKS	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
6-14	GKKRKRHSN
445-450	RMGRRR

Subcellular Location(s)

nucl 21, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR009668 RNA_pol-assoc_fac_A49-like
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF06870 RNA_pol_I_A49

Amino Acid Sequences

MAEKDGKKRKRHSNGEEPPNKKSATETPNASAGKIKVTYSDEDLLRPVLVSTPGLTAPSIPFELYAKARSTNGASNTSKPGTHHVLLHSSKHPRLDYTAAPAVSDQYLSHYIAVFNPATSDLQITPAHHLSLRSVPRKTAPIDEDQPKKQRATYAAQREDLGKVFGTKKAQKFIASRTDNAIVKDVKGKGQKSDVQDAILESMANASAAATPQKQDADEDLLASKPIPRPNLSAATVEDVYPFHTLIPASDARLIPIKDWQDAARNNEEVMLGHRFPAFHLTPIGKGDDVLKLQALRYLALLLAFHDALTGGGRNGKKVPKKDVLLKKLGPVQEIWPEALIESVRLRFASPASGHTELPKWYLENLYTHMCALSLYIDDWRTNTTSLKEDLKMENKQISQYFVELGAKVGPPTEREREVGKLSKAQASAVRVASLKLPLEFPKARMGRRR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.9
2	0.92
3	0.92
4	0.85
5	0.79
6	0.73
7	0.64
8	0.53
9	0.47
10	0.46
11	0.43
12	0.46
13	0.46
14	0.43
15	0.5
16	0.5
17	0.46
18	0.41
19	0.35
20	0.33
21	0.3
22	0.27
23	0.25
24	0.28
25	0.3
26	0.3
27	0.35
28	0.3
29	0.29
30	0.3
31	0.27
32	0.23
33	0.2
34	0.15
35	0.12
36	0.12
37	0.12
38	0.12
39	0.13
40	0.13
41	0.14
42	0.13
43	0.13
44	0.12
45	0.15
46	0.14
47	0.12
48	0.13
49	0.13
50	0.17
51	0.18
52	0.21
53	0.2
54	0.21
55	0.22
56	0.23
57	0.26
58	0.28
59	0.29
60	0.34
61	0.34
62	0.36
63	0.41
64	0.4
65	0.38
66	0.33
67	0.36
68	0.35
69	0.35
70	0.34
71	0.31
72	0.38
73	0.39
74	0.43
75	0.43
76	0.43
77	0.44
78	0.46
79	0.44
80	0.37
81	0.39
82	0.39
83	0.34
84	0.34
85	0.37
86	0.31
87	0.3
88	0.28
89	0.25
90	0.21
91	0.2
92	0.12
93	0.11
94	0.14
95	0.14
96	0.15
97	0.13
98	0.14
99	0.14
100	0.17
101	0.13
102	0.11
103	0.11
104	0.11
105	0.11
106	0.11
107	0.12
108	0.09
109	0.13
110	0.14
111	0.15
112	0.18
113	0.18
114	0.19
115	0.18
116	0.18
117	0.17
118	0.23
119	0.3
120	0.32
121	0.32
122	0.34
123	0.36
124	0.4
125	0.4
126	0.38
127	0.34
128	0.34
129	0.4
130	0.46
131	0.49
132	0.51
133	0.56
134	0.52
135	0.5
136	0.45
137	0.42
138	0.4
139	0.42
140	0.45
141	0.48
142	0.49
143	0.49
144	0.48
145	0.45
146	0.41
147	0.34
148	0.25
149	0.15
150	0.14
151	0.15
152	0.17
153	0.22
154	0.27
155	0.3
156	0.34
157	0.35
158	0.37
159	0.38
160	0.41
161	0.45
162	0.41
163	0.39
164	0.37
165	0.41
166	0.37
167	0.35
168	0.33
169	0.23
170	0.21
171	0.26
172	0.23
173	0.23
174	0.27
175	0.27
176	0.26
177	0.31
178	0.35
179	0.34
180	0.39
181	0.34
182	0.29
183	0.29
184	0.26
185	0.22
186	0.17
187	0.12
188	0.06
189	0.05
190	0.05
191	0.04
192	0.04
193	0.03
194	0.03
195	0.04
196	0.05
197	0.05
198	0.06
199	0.07
200	0.08
201	0.08
202	0.08
203	0.09
204	0.12
205	0.12
206	0.12
207	0.11
208	0.11
209	0.11
210	0.1
211	0.12
212	0.11
213	0.14
214	0.16
215	0.17
216	0.19
217	0.23
218	0.27
219	0.26
220	0.24
221	0.21
222	0.22
223	0.2
224	0.18
225	0.15
226	0.1
227	0.1
228	0.1
229	0.09
230	0.06
231	0.07
232	0.07
233	0.07
234	0.1
235	0.09
236	0.1
237	0.13
238	0.13
239	0.13
240	0.17
241	0.17
242	0.13
243	0.18
244	0.19
245	0.16
246	0.17
247	0.18
248	0.21
249	0.24
250	0.28
251	0.26
252	0.25
253	0.24
254	0.24
255	0.23
256	0.16
257	0.16
258	0.15
259	0.12
260	0.12
261	0.13
262	0.12
263	0.12
264	0.18
265	0.16
266	0.13
267	0.16
268	0.16
269	0.17
270	0.18
271	0.19
272	0.13
273	0.12
274	0.13
275	0.13
276	0.13
277	0.12
278	0.11
279	0.11
280	0.11
281	0.13
282	0.12
283	0.09
284	0.09
285	0.09
286	0.08
287	0.08
288	0.08
289	0.06
290	0.08
291	0.07
292	0.07
293	0.06
294	0.06
295	0.06
296	0.07
297	0.06
298	0.05
299	0.11
300	0.11
301	0.13
302	0.18
303	0.25
304	0.31
305	0.37
306	0.45
307	0.47
308	0.52
309	0.61
310	0.66
311	0.66
312	0.67
313	0.63
314	0.59
315	0.57
316	0.53
317	0.44
318	0.35
319	0.31
320	0.29
321	0.28
322	0.25
323	0.19
324	0.18
325	0.17
326	0.16
327	0.13
328	0.09
329	0.1
330	0.1
331	0.1
332	0.11
333	0.11
334	0.11
335	0.12
336	0.17
337	0.16
338	0.18
339	0.23
340	0.25
341	0.25
342	0.26
343	0.29
344	0.24
345	0.25
346	0.23
347	0.18
348	0.17
349	0.2
350	0.19
351	0.19
352	0.21
353	0.23
354	0.22
355	0.21
356	0.19
357	0.16
358	0.14
359	0.12
360	0.1
361	0.07
362	0.07
363	0.1
364	0.12
365	0.12
366	0.13
367	0.16
368	0.16
369	0.17
370	0.19
371	0.19
372	0.22
373	0.25
374	0.29
375	0.29
376	0.31
377	0.37
378	0.41
379	0.43
380	0.43
381	0.46
382	0.43
383	0.46
384	0.43
385	0.4
386	0.35
387	0.31
388	0.28
389	0.24
390	0.24
391	0.19
392	0.19
393	0.17
394	0.16
395	0.15
396	0.16
397	0.15
398	0.17
399	0.23
400	0.28
401	0.28
402	0.3
403	0.33
404	0.37
405	0.43
406	0.46
407	0.43
408	0.44
409	0.45
410	0.48
411	0.45
412	0.43
413	0.41
414	0.38
415	0.4
416	0.34
417	0.33
418	0.28
419	0.28
420	0.28
421	0.27
422	0.25
423	0.2
424	0.23
425	0.24
426	0.32
427	0.34
428	0.33
429	0.39
430	0.43

A0A4U0VI54

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer