Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4V5N511

Protein Details
Accession A0A4V5N511    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
386-415ATWKSGKRSAYWKKHRRHRRCQTIVDETRSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
392-404KRSAYWKKHRRHR
552-559RGRRGRKG
Subcellular Location(s) mito 15, cyto_nucl 6, nucl 5.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MPSHIKPNTWLFLRLPSNSLKCIEIKPNTIIDIGRLGAFSADLLLGRPYYYTYQLLEKEEGETSSRLRIVPPSELNAEVVGTDDGVESPGNIEETIPVEEGGGILADPKNNRLTVDSTSRQTLTQREIEDLKESSAGQDVIAKILAHHGGLDEKTAFSKAKYMVRKRSKYLKRFTVLPMEVGSLIEYLLEKEPGRIMEMREEMVGLVGAWSNAHYSGGEEVERDESGEERGGGRWLVVDETGGLVVAALAERMGILRKPEDEVTEGGDADDDGHVNGHGAGDHDVEMTSEGASTTKGNHATNDTSSIPFPHRDHPIPATSNTLTVLHPAVQPNLSLLKYFGYDTNIPDPTHPLHTHLKTLSWLQLLHPTQDPTYTAPPLASPTEIATWKSGKRSAYWKKHRRHRRCQTIVDETRSGAFSGFVVASPMDPTTILTHTLPLIRGGGTVTIFSPTPEPLVNLIDLYSKDRRAAFITLLASDPTLTPENVNKDDFPLDPRLLLAPTLQTSRARAWQVLPGRTHPVMTSRGGSEGFVFTARRVVPLEGGVEAKGNFRGRRGRKGGVGGGDKVVGEGDRGSGGVMSSESAAAETAGTPVEVA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.41
3 0.42
4 0.43
5 0.42
6 0.42
7 0.36
8 0.34
9 0.38
10 0.44
11 0.42
12 0.43
13 0.43
14 0.44
15 0.43
16 0.41
17 0.35
18 0.27
19 0.25
20 0.21
21 0.17
22 0.14
23 0.13
24 0.11
25 0.11
26 0.09
27 0.07
28 0.06
29 0.06
30 0.07
31 0.08
32 0.08
33 0.08
34 0.09
35 0.1
36 0.13
37 0.16
38 0.18
39 0.19
40 0.25
41 0.28
42 0.32
43 0.31
44 0.29
45 0.28
46 0.27
47 0.26
48 0.23
49 0.21
50 0.18
51 0.2
52 0.22
53 0.2
54 0.2
55 0.24
56 0.25
57 0.31
58 0.33
59 0.32
60 0.33
61 0.34
62 0.33
63 0.27
64 0.24
65 0.16
66 0.14
67 0.1
68 0.07
69 0.07
70 0.06
71 0.06
72 0.07
73 0.07
74 0.05
75 0.06
76 0.07
77 0.08
78 0.08
79 0.08
80 0.08
81 0.1
82 0.12
83 0.11
84 0.1
85 0.1
86 0.1
87 0.09
88 0.08
89 0.06
90 0.04
91 0.06
92 0.07
93 0.1
94 0.11
95 0.14
96 0.17
97 0.18
98 0.19
99 0.19
100 0.22
101 0.24
102 0.32
103 0.33
104 0.32
105 0.35
106 0.35
107 0.34
108 0.34
109 0.33
110 0.3
111 0.31
112 0.3
113 0.3
114 0.31
115 0.31
116 0.32
117 0.28
118 0.23
119 0.19
120 0.18
121 0.15
122 0.16
123 0.14
124 0.11
125 0.13
126 0.13
127 0.12
128 0.13
129 0.12
130 0.1
131 0.13
132 0.13
133 0.09
134 0.09
135 0.09
136 0.1
137 0.11
138 0.12
139 0.1
140 0.1
141 0.11
142 0.13
143 0.13
144 0.11
145 0.16
146 0.19
147 0.26
148 0.35
149 0.43
150 0.52
151 0.62
152 0.68
153 0.69
154 0.76
155 0.78
156 0.78
157 0.79
158 0.78
159 0.7
160 0.69
161 0.66
162 0.65
163 0.55
164 0.47
165 0.38
166 0.3
167 0.26
168 0.22
169 0.19
170 0.09
171 0.08
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.07
176 0.09
177 0.08
178 0.09
179 0.11
180 0.11
181 0.13
182 0.14
183 0.14
184 0.18
185 0.19
186 0.19
187 0.17
188 0.17
189 0.14
190 0.12
191 0.11
192 0.05
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.06
204 0.08
205 0.07
206 0.07
207 0.08
208 0.09
209 0.09
210 0.08
211 0.08
212 0.07
213 0.08
214 0.09
215 0.08
216 0.07
217 0.08
218 0.09
219 0.08
220 0.08
221 0.07
222 0.07
223 0.07
224 0.06
225 0.06
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.04
230 0.03
231 0.03
232 0.03
233 0.03
234 0.02
235 0.02
236 0.02
237 0.02
238 0.02
239 0.02
240 0.04
241 0.04
242 0.06
243 0.07
244 0.08
245 0.1
246 0.11
247 0.12
248 0.13
249 0.13
250 0.14
251 0.14
252 0.13
253 0.11
254 0.1
255 0.08
256 0.07
257 0.07
258 0.04
259 0.03
260 0.04
261 0.04
262 0.04
263 0.04
264 0.03
265 0.04
266 0.04
267 0.05
268 0.05
269 0.06
270 0.06
271 0.05
272 0.06
273 0.06
274 0.05
275 0.04
276 0.04
277 0.04
278 0.04
279 0.05
280 0.05
281 0.05
282 0.08
283 0.11
284 0.11
285 0.12
286 0.14
287 0.16
288 0.16
289 0.18
290 0.17
291 0.15
292 0.15
293 0.15
294 0.15
295 0.17
296 0.18
297 0.19
298 0.23
299 0.24
300 0.27
301 0.28
302 0.3
303 0.29
304 0.28
305 0.28
306 0.23
307 0.22
308 0.2
309 0.18
310 0.14
311 0.13
312 0.13
313 0.09
314 0.11
315 0.11
316 0.12
317 0.11
318 0.1
319 0.1
320 0.12
321 0.11
322 0.1
323 0.09
324 0.09
325 0.09
326 0.1
327 0.1
328 0.11
329 0.12
330 0.14
331 0.19
332 0.2
333 0.2
334 0.2
335 0.21
336 0.19
337 0.23
338 0.21
339 0.22
340 0.27
341 0.28
342 0.31
343 0.29
344 0.28
345 0.24
346 0.26
347 0.24
348 0.18
349 0.17
350 0.14
351 0.22
352 0.22
353 0.22
354 0.23
355 0.21
356 0.19
357 0.2
358 0.2
359 0.15
360 0.18
361 0.16
362 0.15
363 0.13
364 0.14
365 0.15
366 0.15
367 0.12
368 0.09
369 0.1
370 0.13
371 0.14
372 0.14
373 0.14
374 0.17
375 0.18
376 0.21
377 0.23
378 0.22
379 0.24
380 0.34
381 0.42
382 0.5
383 0.6
384 0.66
385 0.72
386 0.81
387 0.89
388 0.89
389 0.9
390 0.9
391 0.9
392 0.9
393 0.88
394 0.86
395 0.85
396 0.81
397 0.75
398 0.64
399 0.53
400 0.46
401 0.38
402 0.3
403 0.19
404 0.13
405 0.08
406 0.09
407 0.08
408 0.07
409 0.07
410 0.07
411 0.07
412 0.08
413 0.08
414 0.06
415 0.06
416 0.07
417 0.09
418 0.1
419 0.11
420 0.11
421 0.12
422 0.13
423 0.15
424 0.14
425 0.12
426 0.12
427 0.1
428 0.11
429 0.1
430 0.1
431 0.09
432 0.09
433 0.08
434 0.09
435 0.09
436 0.09
437 0.1
438 0.09
439 0.1
440 0.1
441 0.11
442 0.12
443 0.13
444 0.13
445 0.12
446 0.12
447 0.12
448 0.13
449 0.17
450 0.19
451 0.18
452 0.21
453 0.22
454 0.23
455 0.24
456 0.26
457 0.22
458 0.23
459 0.23
460 0.21
461 0.21
462 0.19
463 0.16
464 0.14
465 0.13
466 0.12
467 0.12
468 0.12
469 0.13
470 0.18
471 0.24
472 0.27
473 0.29
474 0.25
475 0.26
476 0.28
477 0.27
478 0.26
479 0.26
480 0.23
481 0.21
482 0.22
483 0.21
484 0.19
485 0.18
486 0.15
487 0.13
488 0.15
489 0.17
490 0.18
491 0.18
492 0.21
493 0.24
494 0.29
495 0.29
496 0.29
497 0.29
498 0.34
499 0.4
500 0.43
501 0.42
502 0.4
503 0.43
504 0.42
505 0.41
506 0.34
507 0.31
508 0.29
509 0.29
510 0.28
511 0.22
512 0.24
513 0.24
514 0.23
515 0.2
516 0.18
517 0.16
518 0.15
519 0.14
520 0.12
521 0.18
522 0.18
523 0.18
524 0.19
525 0.19
526 0.19
527 0.2
528 0.21
529 0.17
530 0.17
531 0.15
532 0.15
533 0.15
534 0.15
535 0.19
536 0.23
537 0.23
538 0.29
539 0.39
540 0.43
541 0.54
542 0.59
543 0.6
544 0.6
545 0.66
546 0.65
547 0.63
548 0.61
549 0.52
550 0.46
551 0.41
552 0.35
553 0.28
554 0.23
555 0.15
556 0.11
557 0.09
558 0.09
559 0.08
560 0.08
561 0.08
562 0.08
563 0.08
564 0.08
565 0.08
566 0.07
567 0.08
568 0.08
569 0.08
570 0.07
571 0.08
572 0.07
573 0.07
574 0.07
575 0.07
576 0.07