Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0VGX8

Protein Details
Accession A0A4U0VGX8    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
292-314QPARRTARPRSRTPPERRRNATNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
204-205RR
295-310RRTARPRSRTPPERRR
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 14, cyto 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019416  NCBP3  
Gene Ontology GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0000340  F:RNA 7-methylguanosine cap binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF10309  NCBP3  
Amino Acid Sequences MAVDEMRLDVDMDMDIDLDYGGEEVDLDIARLKAEAAALEAVRNGGYTEGMNGVEEAAEEGEVDVHALVAKVHVRGVNSFGPQDAENFAREHYSDELFSRVEWVDDTSINLVYDTELAAEEALLAFSAEEVMDPLEFRPAKRLTTHPDVALFARRATVSDVKVRGAHKHSRFYLDNPKYDPENRMAKRRPDDRGYRTRDYGLKRRRRDMEDDRTSRRGSQGEPWNEDLYDDDPVSVAARKERTNSYSSAESGRKRPRVTEELFPDKSSGRLRNRSASPARDGDGRFGFGEEQPARRTARPRSRTPPERRRNATNGCARDDLRKELFPGRKPAAPSALTNGHSNGAVELFPNHGSPPKIPRELFPNHKRHDARDIDREYRQVEAAVGRYSLDGADERGAHDRADNRTQRDGKPNGDLMSRISGGRDDGRLLSRPKSSSEDAGFSFKGAGSGDSFSFKGASKGNAAEGALVKELFPMKAGDGGRDLFEGRIKGRGNQRRRAEDLF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.07
3 0.06
4 0.06
5 0.05
6 0.05
7 0.04
8 0.04
9 0.04
10 0.04
11 0.04
12 0.06
13 0.06
14 0.06
15 0.08
16 0.08
17 0.09
18 0.09
19 0.09
20 0.08
21 0.09
22 0.09
23 0.09
24 0.12
25 0.12
26 0.12
27 0.12
28 0.12
29 0.11
30 0.11
31 0.09
32 0.07
33 0.07
34 0.07
35 0.08
36 0.09
37 0.1
38 0.1
39 0.1
40 0.09
41 0.08
42 0.08
43 0.07
44 0.06
45 0.05
46 0.05
47 0.05
48 0.05
49 0.05
50 0.06
51 0.04
52 0.04
53 0.05
54 0.05
55 0.05
56 0.07
57 0.09
58 0.09
59 0.12
60 0.14
61 0.15
62 0.16
63 0.21
64 0.23
65 0.23
66 0.23
67 0.21
68 0.21
69 0.2
70 0.2
71 0.19
72 0.16
73 0.15
74 0.15
75 0.15
76 0.15
77 0.15
78 0.16
79 0.16
80 0.16
81 0.16
82 0.16
83 0.18
84 0.17
85 0.16
86 0.17
87 0.14
88 0.13
89 0.12
90 0.13
91 0.13
92 0.13
93 0.14
94 0.12
95 0.13
96 0.13
97 0.12
98 0.1
99 0.08
100 0.08
101 0.07
102 0.06
103 0.05
104 0.05
105 0.05
106 0.05
107 0.04
108 0.04
109 0.04
110 0.03
111 0.03
112 0.03
113 0.03
114 0.03
115 0.03
116 0.03
117 0.04
118 0.04
119 0.04
120 0.05
121 0.05
122 0.12
123 0.13
124 0.13
125 0.2
126 0.22
127 0.24
128 0.27
129 0.33
130 0.33
131 0.41
132 0.43
133 0.37
134 0.37
135 0.36
136 0.34
137 0.34
138 0.28
139 0.19
140 0.18
141 0.17
142 0.16
143 0.19
144 0.23
145 0.19
146 0.25
147 0.26
148 0.26
149 0.3
150 0.3
151 0.32
152 0.33
153 0.4
154 0.39
155 0.45
156 0.46
157 0.48
158 0.49
159 0.48
160 0.54
161 0.5
162 0.49
163 0.44
164 0.44
165 0.41
166 0.42
167 0.39
168 0.34
169 0.38
170 0.37
171 0.44
172 0.48
173 0.52
174 0.58
175 0.62
176 0.62
177 0.59
178 0.66
179 0.65
180 0.69
181 0.69
182 0.65
183 0.6
184 0.58
185 0.56
186 0.54
187 0.55
188 0.55
189 0.57
190 0.58
191 0.65
192 0.68
193 0.66
194 0.69
195 0.69
196 0.69
197 0.7
198 0.7
199 0.67
200 0.63
201 0.59
202 0.51
203 0.44
204 0.35
205 0.27
206 0.3
207 0.34
208 0.36
209 0.38
210 0.39
211 0.37
212 0.35
213 0.33
214 0.26
215 0.17
216 0.14
217 0.11
218 0.08
219 0.07
220 0.07
221 0.08
222 0.08
223 0.07
224 0.09
225 0.12
226 0.13
227 0.16
228 0.19
229 0.21
230 0.22
231 0.23
232 0.23
233 0.22
234 0.22
235 0.24
236 0.25
237 0.25
238 0.3
239 0.37
240 0.39
241 0.38
242 0.39
243 0.41
244 0.44
245 0.45
246 0.44
247 0.43
248 0.46
249 0.46
250 0.44
251 0.39
252 0.31
253 0.31
254 0.29
255 0.3
256 0.29
257 0.36
258 0.38
259 0.44
260 0.45
261 0.5
262 0.5
263 0.46
264 0.43
265 0.37
266 0.36
267 0.33
268 0.32
269 0.28
270 0.24
271 0.22
272 0.18
273 0.17
274 0.17
275 0.12
276 0.19
277 0.16
278 0.18
279 0.17
280 0.2
281 0.22
282 0.24
283 0.29
284 0.32
285 0.42
286 0.46
287 0.53
288 0.59
289 0.67
290 0.75
291 0.8
292 0.81
293 0.8
294 0.83
295 0.81
296 0.79
297 0.77
298 0.73
299 0.71
300 0.68
301 0.61
302 0.55
303 0.52
304 0.46
305 0.44
306 0.41
307 0.38
308 0.33
309 0.3
310 0.3
311 0.35
312 0.4
313 0.38
314 0.42
315 0.39
316 0.39
317 0.41
318 0.41
319 0.38
320 0.34
321 0.3
322 0.28
323 0.31
324 0.29
325 0.28
326 0.26
327 0.21
328 0.2
329 0.19
330 0.14
331 0.09
332 0.08
333 0.07
334 0.07
335 0.08
336 0.08
337 0.09
338 0.09
339 0.12
340 0.13
341 0.16
342 0.23
343 0.28
344 0.34
345 0.34
346 0.36
347 0.4
348 0.46
349 0.53
350 0.56
351 0.58
352 0.55
353 0.64
354 0.64
355 0.6
356 0.63
357 0.61
358 0.57
359 0.57
360 0.6
361 0.56
362 0.56
363 0.55
364 0.46
365 0.39
366 0.33
367 0.24
368 0.19
369 0.17
370 0.16
371 0.15
372 0.14
373 0.13
374 0.12
375 0.12
376 0.1
377 0.09
378 0.07
379 0.08
380 0.1
381 0.1
382 0.12
383 0.16
384 0.16
385 0.15
386 0.18
387 0.22
388 0.26
389 0.35
390 0.39
391 0.4
392 0.48
393 0.54
394 0.56
395 0.6
396 0.6
397 0.54
398 0.54
399 0.54
400 0.47
401 0.43
402 0.38
403 0.31
404 0.3
405 0.28
406 0.22
407 0.18
408 0.17
409 0.18
410 0.2
411 0.19
412 0.16
413 0.18
414 0.21
415 0.26
416 0.28
417 0.3
418 0.33
419 0.33
420 0.35
421 0.39
422 0.39
423 0.4
424 0.4
425 0.4
426 0.36
427 0.39
428 0.36
429 0.29
430 0.27
431 0.2
432 0.18
433 0.15
434 0.14
435 0.11
436 0.13
437 0.14
438 0.16
439 0.16
440 0.15
441 0.16
442 0.15
443 0.17
444 0.18
445 0.19
446 0.21
447 0.22
448 0.23
449 0.24
450 0.23
451 0.22
452 0.21
453 0.21
454 0.18
455 0.17
456 0.15
457 0.16
458 0.18
459 0.15
460 0.14
461 0.13
462 0.13
463 0.19
464 0.19
465 0.18
466 0.2
467 0.21
468 0.21
469 0.21
470 0.21
471 0.17
472 0.2
473 0.21
474 0.19
475 0.25
476 0.26
477 0.32
478 0.42
479 0.5
480 0.56
481 0.63
482 0.71
483 0.72