Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4V5N786

Protein Details
Accession A0A4V5N786    Localization Confidence High Confidence Score 15.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
27-46EERRGAKGGRTNKRRKIDAQBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
30-42RGAKGGRTNKRRK
274-278KRRAK
287-301GKGGRHFVQRKAREE
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 14, cyto 11
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039119  ABT1/Esf2  
IPR034353  ABT1/ESF2_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
CDD cd12263  RRM_ABT1_like  
Amino Acid Sequences MSIRKRNEFLEHGGSDDEGLGDESEDEERRGAKGGRTNKRRKIDAQSDDKSIHSVNERQEADVAVLEDHDGEPIDGTTTSAGRFALGADFEDDEQPRNALDPTTAQTRPKSVLAAEKVARKSGVLYISRIPPFMKPSTLRHFLLPHASKGLGRVFLTPETQTSHSARVKRGGNKKKSFTDGWVEFTSKNEAKAAAERLNGEILGGKKGGFYRDDMWNVKYLRGFKWTHLTEQIANENAQRVARLREEVRRTRKENKAFVDDVERVKMVEGMVRKRRAKDEGTVAVGGKGGRHFVQRKAREEKKLEGIGRDTDDAAEQRRVVSKIFT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.28
3 0.23
4 0.16
5 0.09
6 0.09
7 0.07
8 0.07
9 0.07
10 0.08
11 0.1
12 0.11
13 0.11
14 0.12
15 0.13
16 0.13
17 0.18
18 0.19
19 0.22
20 0.29
21 0.39
22 0.48
23 0.59
24 0.68
25 0.73
26 0.79
27 0.8
28 0.79
29 0.79
30 0.79
31 0.78
32 0.77
33 0.72
34 0.68
35 0.63
36 0.56
37 0.47
38 0.37
39 0.31
40 0.26
41 0.27
42 0.27
43 0.34
44 0.34
45 0.33
46 0.33
47 0.31
48 0.27
49 0.23
50 0.19
51 0.1
52 0.09
53 0.08
54 0.08
55 0.08
56 0.07
57 0.06
58 0.05
59 0.06
60 0.06
61 0.07
62 0.06
63 0.06
64 0.07
65 0.07
66 0.07
67 0.08
68 0.08
69 0.07
70 0.07
71 0.07
72 0.07
73 0.07
74 0.08
75 0.08
76 0.09
77 0.09
78 0.12
79 0.12
80 0.12
81 0.12
82 0.12
83 0.1
84 0.11
85 0.11
86 0.09
87 0.09
88 0.1
89 0.12
90 0.18
91 0.2
92 0.21
93 0.22
94 0.24
95 0.26
96 0.24
97 0.23
98 0.18
99 0.24
100 0.24
101 0.28
102 0.29
103 0.32
104 0.32
105 0.32
106 0.3
107 0.23
108 0.22
109 0.2
110 0.23
111 0.18
112 0.19
113 0.21
114 0.27
115 0.27
116 0.27
117 0.24
118 0.2
119 0.23
120 0.23
121 0.24
122 0.22
123 0.28
124 0.34
125 0.38
126 0.37
127 0.35
128 0.35
129 0.32
130 0.38
131 0.33
132 0.27
133 0.23
134 0.23
135 0.2
136 0.21
137 0.21
138 0.14
139 0.13
140 0.13
141 0.13
142 0.14
143 0.15
144 0.13
145 0.12
146 0.13
147 0.14
148 0.16
149 0.16
150 0.21
151 0.23
152 0.26
153 0.27
154 0.3
155 0.34
156 0.4
157 0.49
158 0.53
159 0.59
160 0.63
161 0.67
162 0.65
163 0.64
164 0.57
165 0.5
166 0.48
167 0.4
168 0.37
169 0.33
170 0.31
171 0.26
172 0.26
173 0.29
174 0.21
175 0.2
176 0.16
177 0.15
178 0.15
179 0.18
180 0.21
181 0.18
182 0.18
183 0.18
184 0.18
185 0.18
186 0.17
187 0.13
188 0.12
189 0.1
190 0.1
191 0.1
192 0.09
193 0.1
194 0.11
195 0.13
196 0.11
197 0.13
198 0.15
199 0.2
200 0.25
201 0.26
202 0.26
203 0.3
204 0.3
205 0.3
206 0.29
207 0.26
208 0.24
209 0.28
210 0.28
211 0.25
212 0.34
213 0.33
214 0.34
215 0.35
216 0.35
217 0.31
218 0.33
219 0.34
220 0.26
221 0.25
222 0.23
223 0.21
224 0.19
225 0.17
226 0.15
227 0.13
228 0.15
229 0.17
230 0.21
231 0.23
232 0.3
233 0.39
234 0.48
235 0.56
236 0.61
237 0.65
238 0.7
239 0.76
240 0.76
241 0.76
242 0.72
243 0.7
244 0.63
245 0.58
246 0.55
247 0.5
248 0.43
249 0.37
250 0.31
251 0.23
252 0.23
253 0.22
254 0.15
255 0.15
256 0.19
257 0.25
258 0.34
259 0.43
260 0.47
261 0.5
262 0.56
263 0.59
264 0.57
265 0.56
266 0.56
267 0.53
268 0.53
269 0.49
270 0.44
271 0.38
272 0.35
273 0.27
274 0.2
275 0.15
276 0.14
277 0.14
278 0.23
279 0.26
280 0.34
281 0.44
282 0.5
283 0.58
284 0.65
285 0.72
286 0.73
287 0.75
288 0.73
289 0.72
290 0.72
291 0.67
292 0.61
293 0.57
294 0.52
295 0.49
296 0.44
297 0.35
298 0.27
299 0.27
300 0.26
301 0.26
302 0.25
303 0.22
304 0.23
305 0.28
306 0.29