Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0UEQ0

Protein Details
Accession A0A4U0UEQ0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1148-1167PSYVRKPKTGTKRRMSEGGEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
169-179RKIADKRKHKR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034104  Lsm1  
IPR010920  LSM_dom_sf  
IPR044642  PTHR15588  
IPR047575  Sm  
IPR001163  Sm_dom_euk/arc  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Gene Ontology GO:0000932  C:P-body  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0000956  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF01423  LSM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS52002  SM  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
PS50157  ZINC_FINGER_C2H2_2  
CDD cd01728  LSm1  
Amino Acid Sequences MANRLPSTHAPGFPPAILIRPGDPNPFDQPPQQHMVNPMMMQQQSQQHQGSPGPPSVPQLPPQMFTTAAQLLDLTDKKLMVVLRDGRKLIGVLRSWDQFGNLVMQDTAERLFVQGLYADIERGLFLVRGENITLLGEIDLDKDDYVPEPYQLAPVEKVFALKKAEDAERKIADKRKHKRLAAEGFEGEHAGEAILRFPAADHLEMMTTSLLFSNGITRKNTVEDPAERRILPPRAARNKVPAEETDEIPIKAVKKLTIRIGKKSIAKLTDESESEDSVISASEDSVISAAEVHESSPSPVKKSKGAPRIQKEKDIPCPRAGCSKRFSCKAGLKYHNEHHNHAGDELTELSKTLQCPIFGCYKSYTDSNGLKYHREHAHLDMSAKEKLEIFDEAKAKKLAIFRAESAVAMPSDDDDSMLPQQHTVAGGSAESSPLSDVDTLPYDASSLPLVSNPSANRRSTRKGEEPARHDDPDIEQEYVDEGIIDYNDHTQSEHELNETDDVPQEVIDLEDDTDDEDAPVPEHLKKKQRKVEAANEFALSYSPWTVPGFGPTERHAVELMYCEVQLTPLQGTWEATEVYQAHKDKEMLRYIIDYPLGQWVIPKEHAQAAYQRLLERNRWRGLGIRVYGMQQMPQTAPSTFYNHRPPHMATPGPQPNRPMAIYGGSHDGGRKPSMPQQQQQMQMNMAHRPPPGPAMPPPTQVLPSQQHAMPSNAHHYPHPQLMMGPPPLPSPQSQYGHGPYGQMQQLGSQNGTNPSSNYHQQHIGYMNVPATYPGMIGMAPNAMPSTGLSGHSLGAGNKTKKSPAAQTLGPTPPYDVRDRPAERKTYSKAGKRKQAEPDEFPWNRQIDFVREKDVPAHLRWDIRDYNPHILDAMAVVRSHNAPIIHKIDKELAEKQKTTRVRKNGGTPTANHGVTASEESEGNEEDKGAQSKAKNENIGGETYHSGNFAFYRDVDRRKAMKFQFKFPEDLLDAAEQVTDPQSRATLRAACKEVLICWKPGKKSPTDQLVQAAFRAYDTLITREQYGKTLILTRRAAECIVDFCPDLLWRDTLLRIVAEAGYGNTEIRNRFCFNGCYADKATVTKRIAAALGQKQVNPPRKGEAQADEDGEPGSGRKGATRYLQGEKEWNEANKQDFDDYSRFLGQRLGPSYVRKPKTGTKRRMSEGGEAETEDTVAGASRESSRKRAKTDESATGTGSGRLSEETEEAASPEDNDDDDDNDAVSVQSDGILDEIED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.27
3 0.26
4 0.25
5 0.24
6 0.22
7 0.27
8 0.29
9 0.32
10 0.33
11 0.34
12 0.38
13 0.41
14 0.41
15 0.41
16 0.44
17 0.44
18 0.48
19 0.46
20 0.42
21 0.42
22 0.44
23 0.4
24 0.35
25 0.33
26 0.33
27 0.32
28 0.3
29 0.31
30 0.34
31 0.34
32 0.4
33 0.37
34 0.33
35 0.36
36 0.39
37 0.38
38 0.35
39 0.34
40 0.3
41 0.29
42 0.32
43 0.34
44 0.33
45 0.34
46 0.38
47 0.37
48 0.38
49 0.39
50 0.37
51 0.32
52 0.3
53 0.31
54 0.24
55 0.21
56 0.19
57 0.17
58 0.15
59 0.2
60 0.21
61 0.17
62 0.16
63 0.16
64 0.16
65 0.19
66 0.2
67 0.16
68 0.23
69 0.3
70 0.36
71 0.41
72 0.42
73 0.39
74 0.39
75 0.37
76 0.33
77 0.31
78 0.27
79 0.26
80 0.3
81 0.31
82 0.32
83 0.31
84 0.28
85 0.23
86 0.21
87 0.21
88 0.17
89 0.16
90 0.14
91 0.14
92 0.14
93 0.14
94 0.13
95 0.1
96 0.09
97 0.08
98 0.1
99 0.09
100 0.09
101 0.09
102 0.09
103 0.11
104 0.11
105 0.1
106 0.09
107 0.09
108 0.09
109 0.09
110 0.09
111 0.07
112 0.07
113 0.1
114 0.12
115 0.13
116 0.14
117 0.13
118 0.13
119 0.13
120 0.13
121 0.09
122 0.08
123 0.07
124 0.07
125 0.08
126 0.08
127 0.08
128 0.08
129 0.08
130 0.09
131 0.1
132 0.14
133 0.13
134 0.13
135 0.14
136 0.14
137 0.17
138 0.18
139 0.19
140 0.18
141 0.18
142 0.19
143 0.18
144 0.21
145 0.19
146 0.22
147 0.23
148 0.21
149 0.23
150 0.26
151 0.33
152 0.35
153 0.39
154 0.42
155 0.43
156 0.45
157 0.5
158 0.53
159 0.55
160 0.59
161 0.65
162 0.68
163 0.74
164 0.75
165 0.77
166 0.79
167 0.8
168 0.76
169 0.71
170 0.61
171 0.53
172 0.49
173 0.4
174 0.3
175 0.19
176 0.13
177 0.07
178 0.07
179 0.06
180 0.06
181 0.06
182 0.06
183 0.06
184 0.06
185 0.11
186 0.12
187 0.12
188 0.12
189 0.13
190 0.14
191 0.14
192 0.14
193 0.1
194 0.08
195 0.07
196 0.07
197 0.07
198 0.06
199 0.06
200 0.14
201 0.17
202 0.21
203 0.22
204 0.24
205 0.25
206 0.29
207 0.3
208 0.26
209 0.28
210 0.32
211 0.36
212 0.4
213 0.42
214 0.38
215 0.39
216 0.43
217 0.42
218 0.41
219 0.43
220 0.48
221 0.55
222 0.6
223 0.61
224 0.62
225 0.64
226 0.61
227 0.56
228 0.47
229 0.45
230 0.43
231 0.4
232 0.36
233 0.31
234 0.28
235 0.26
236 0.27
237 0.2
238 0.2
239 0.21
240 0.2
241 0.23
242 0.28
243 0.36
244 0.44
245 0.46
246 0.51
247 0.55
248 0.57
249 0.58
250 0.59
251 0.56
252 0.49
253 0.48
254 0.43
255 0.4
256 0.38
257 0.33
258 0.31
259 0.27
260 0.24
261 0.21
262 0.19
263 0.16
264 0.12
265 0.11
266 0.07
267 0.05
268 0.05
269 0.06
270 0.05
271 0.06
272 0.06
273 0.05
274 0.05
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.06
279 0.06
280 0.07
281 0.08
282 0.1
283 0.16
284 0.18
285 0.21
286 0.25
287 0.28
288 0.33
289 0.41
290 0.49
291 0.52
292 0.59
293 0.65
294 0.7
295 0.78
296 0.76
297 0.75
298 0.73
299 0.7
300 0.72
301 0.71
302 0.65
303 0.6
304 0.59
305 0.52
306 0.56
307 0.52
308 0.47
309 0.45
310 0.51
311 0.52
312 0.54
313 0.55
314 0.52
315 0.57
316 0.59
317 0.62
318 0.61
319 0.6
320 0.63
321 0.67
322 0.68
323 0.63
324 0.59
325 0.55
326 0.51
327 0.45
328 0.38
329 0.31
330 0.22
331 0.2
332 0.18
333 0.13
334 0.08
335 0.08
336 0.09
337 0.11
338 0.11
339 0.14
340 0.15
341 0.15
342 0.16
343 0.19
344 0.25
345 0.24
346 0.25
347 0.23
348 0.23
349 0.25
350 0.25
351 0.25
352 0.24
353 0.27
354 0.29
355 0.32
356 0.32
357 0.33
358 0.34
359 0.39
360 0.36
361 0.37
362 0.35
363 0.33
364 0.37
365 0.35
366 0.34
367 0.3
368 0.29
369 0.27
370 0.25
371 0.22
372 0.17
373 0.16
374 0.17
375 0.16
376 0.14
377 0.18
378 0.22
379 0.22
380 0.24
381 0.24
382 0.22
383 0.23
384 0.25
385 0.24
386 0.23
387 0.26
388 0.23
389 0.26
390 0.26
391 0.23
392 0.2
393 0.17
394 0.12
395 0.1
396 0.09
397 0.06
398 0.07
399 0.07
400 0.07
401 0.05
402 0.08
403 0.09
404 0.11
405 0.11
406 0.1
407 0.1
408 0.1
409 0.11
410 0.09
411 0.08
412 0.06
413 0.06
414 0.07
415 0.07
416 0.06
417 0.06
418 0.05
419 0.05
420 0.05
421 0.06
422 0.06
423 0.06
424 0.07
425 0.09
426 0.09
427 0.09
428 0.09
429 0.09
430 0.08
431 0.09
432 0.07
433 0.06
434 0.06
435 0.07
436 0.08
437 0.08
438 0.11
439 0.12
440 0.19
441 0.22
442 0.24
443 0.27
444 0.32
445 0.38
446 0.41
447 0.48
448 0.48
449 0.52
450 0.6
451 0.63
452 0.62
453 0.64
454 0.62
455 0.55
456 0.48
457 0.41
458 0.34
459 0.32
460 0.29
461 0.21
462 0.16
463 0.15
464 0.16
465 0.15
466 0.12
467 0.06
468 0.04
469 0.04
470 0.05
471 0.05
472 0.04
473 0.06
474 0.07
475 0.07
476 0.07
477 0.07
478 0.1
479 0.12
480 0.12
481 0.1
482 0.1
483 0.11
484 0.12
485 0.12
486 0.09
487 0.08
488 0.08
489 0.08
490 0.07
491 0.07
492 0.05
493 0.05
494 0.05
495 0.04
496 0.04
497 0.04
498 0.04
499 0.04
500 0.05
501 0.05
502 0.04
503 0.05
504 0.05
505 0.05
506 0.06
507 0.07
508 0.1
509 0.14
510 0.2
511 0.29
512 0.36
513 0.46
514 0.53
515 0.59
516 0.64
517 0.67
518 0.72
519 0.7
520 0.67
521 0.58
522 0.51
523 0.43
524 0.35
525 0.28
526 0.17
527 0.1
528 0.07
529 0.06
530 0.07
531 0.07
532 0.09
533 0.09
534 0.11
535 0.13
536 0.12
537 0.14
538 0.15
539 0.18
540 0.17
541 0.17
542 0.15
543 0.13
544 0.12
545 0.12
546 0.12
547 0.09
548 0.08
549 0.08
550 0.07
551 0.08
552 0.07
553 0.07
554 0.06
555 0.06
556 0.06
557 0.07
558 0.07
559 0.07
560 0.08
561 0.07
562 0.07
563 0.08
564 0.08
565 0.1
566 0.14
567 0.15
568 0.15
569 0.16
570 0.18
571 0.18
572 0.23
573 0.25
574 0.2
575 0.2
576 0.21
577 0.21
578 0.21
579 0.18
580 0.13
581 0.1
582 0.12
583 0.12
584 0.09
585 0.09
586 0.09
587 0.11
588 0.12
589 0.12
590 0.11
591 0.14
592 0.14
593 0.15
594 0.17
595 0.18
596 0.2
597 0.2
598 0.2
599 0.21
600 0.22
601 0.28
602 0.3
603 0.34
604 0.32
605 0.32
606 0.32
607 0.33
608 0.34
609 0.33
610 0.27
611 0.22
612 0.21
613 0.21
614 0.23
615 0.18
616 0.16
617 0.11
618 0.11
619 0.1
620 0.11
621 0.11
622 0.09
623 0.12
624 0.12
625 0.17
626 0.18
627 0.23
628 0.31
629 0.31
630 0.32
631 0.33
632 0.33
633 0.33
634 0.36
635 0.32
636 0.24
637 0.32
638 0.4
639 0.39
640 0.38
641 0.34
642 0.32
643 0.33
644 0.31
645 0.23
646 0.15
647 0.15
648 0.14
649 0.14
650 0.15
651 0.13
652 0.13
653 0.12
654 0.13
655 0.12
656 0.13
657 0.13
658 0.12
659 0.19
660 0.28
661 0.32
662 0.34
663 0.4
664 0.45
665 0.49
666 0.51
667 0.44
668 0.37
669 0.35
670 0.34
671 0.29
672 0.24
673 0.21
674 0.18
675 0.18
676 0.17
677 0.17
678 0.16
679 0.16
680 0.18
681 0.22
682 0.24
683 0.25
684 0.25
685 0.23
686 0.23
687 0.22
688 0.24
689 0.2
690 0.21
691 0.21
692 0.21
693 0.22
694 0.22
695 0.23
696 0.19
697 0.18
698 0.2
699 0.2
700 0.2
701 0.18
702 0.19
703 0.21
704 0.22
705 0.21
706 0.16
707 0.15
708 0.16
709 0.2
710 0.18
711 0.16
712 0.14
713 0.14
714 0.15
715 0.15
716 0.15
717 0.16
718 0.22
719 0.23
720 0.25
721 0.27
722 0.29
723 0.3
724 0.29
725 0.24
726 0.19
727 0.22
728 0.21
729 0.18
730 0.15
731 0.16
732 0.18
733 0.19
734 0.17
735 0.13
736 0.13
737 0.16
738 0.17
739 0.15
740 0.12
741 0.15
742 0.18
743 0.24
744 0.24
745 0.24
746 0.26
747 0.25
748 0.28
749 0.27
750 0.24
751 0.19
752 0.18
753 0.16
754 0.13
755 0.13
756 0.1
757 0.09
758 0.07
759 0.06
760 0.05
761 0.05
762 0.05
763 0.05
764 0.05
765 0.05
766 0.04
767 0.05
768 0.04
769 0.04
770 0.04
771 0.04
772 0.07
773 0.07
774 0.08
775 0.09
776 0.1
777 0.1
778 0.11
779 0.12
780 0.09
781 0.13
782 0.19
783 0.2
784 0.22
785 0.24
786 0.24
787 0.26
788 0.29
789 0.3
790 0.3
791 0.33
792 0.32
793 0.33
794 0.37
795 0.37
796 0.35
797 0.29
798 0.24
799 0.23
800 0.24
801 0.26
802 0.22
803 0.22
804 0.3
805 0.34
806 0.39
807 0.42
808 0.45
809 0.43
810 0.48
811 0.49
812 0.5
813 0.53
814 0.55
815 0.59
816 0.61
817 0.68
818 0.67
819 0.7
820 0.7
821 0.73
822 0.7
823 0.66
824 0.62
825 0.63
826 0.58
827 0.53
828 0.49
829 0.4
830 0.34
831 0.31
832 0.28
833 0.25
834 0.31
835 0.3
836 0.29
837 0.29
838 0.29
839 0.29
840 0.33
841 0.29
842 0.23
843 0.26
844 0.24
845 0.26
846 0.27
847 0.3
848 0.28
849 0.27
850 0.34
851 0.34
852 0.39
853 0.37
854 0.36
855 0.31
856 0.27
857 0.25
858 0.18
859 0.14
860 0.07
861 0.07
862 0.07
863 0.08
864 0.08
865 0.09
866 0.11
867 0.11
868 0.12
869 0.17
870 0.23
871 0.24
872 0.24
873 0.26
874 0.28
875 0.3
876 0.32
877 0.34
878 0.38
879 0.4
880 0.42
881 0.42
882 0.46
883 0.51
884 0.56
885 0.57
886 0.57
887 0.59
888 0.63
889 0.71
890 0.71
891 0.71
892 0.65
893 0.58
894 0.56
895 0.55
896 0.49
897 0.39
898 0.31
899 0.23
900 0.21
901 0.21
902 0.15
903 0.09
904 0.1
905 0.1
906 0.11
907 0.11
908 0.11
909 0.09
910 0.08
911 0.09
912 0.11
913 0.13
914 0.12
915 0.15
916 0.17
917 0.25
918 0.33
919 0.37
920 0.36
921 0.35
922 0.39
923 0.37
924 0.37
925 0.29
926 0.23
927 0.2
928 0.19
929 0.19
930 0.14
931 0.12
932 0.11
933 0.11
934 0.1
935 0.1
936 0.1
937 0.16
938 0.22
939 0.27
940 0.3
941 0.37
942 0.4
943 0.42
944 0.5
945 0.51
946 0.56
947 0.54
948 0.6
949 0.62
950 0.6
951 0.6
952 0.51
953 0.5
954 0.4
955 0.38
956 0.3
957 0.21
958 0.19
959 0.16
960 0.15
961 0.08
962 0.08
963 0.1
964 0.09
965 0.08
966 0.09
967 0.11
968 0.12
969 0.14
970 0.18
971 0.22
972 0.25
973 0.31
974 0.34
975 0.32
976 0.33
977 0.31
978 0.3
979 0.33
980 0.32
981 0.29
982 0.33
983 0.38
984 0.4
985 0.46
986 0.49
987 0.46
988 0.52
989 0.57
990 0.59
991 0.56
992 0.55
993 0.54
994 0.52
995 0.46
996 0.38
997 0.31
998 0.21
999 0.19
1000 0.18
1001 0.12
1002 0.12
1003 0.13
1004 0.16
1005 0.17
1006 0.18
1007 0.2
1008 0.23
1009 0.24
1010 0.22
1011 0.22
1012 0.2
1013 0.19
1014 0.26
1015 0.27
1016 0.31
1017 0.32
1018 0.32
1019 0.33
1020 0.34
1021 0.32
1022 0.26
1023 0.24
1024 0.19
1025 0.19
1026 0.18
1027 0.15
1028 0.14
1029 0.15
1030 0.15
1031 0.16
1032 0.15
1033 0.15
1034 0.15
1035 0.16
1036 0.17
1037 0.18
1038 0.18
1039 0.14
1040 0.13
1041 0.13
1042 0.11
1043 0.1
1044 0.09
1045 0.08
1046 0.08
1047 0.09
1048 0.09
1049 0.09
1050 0.13
1051 0.15
1052 0.18
1053 0.22
1054 0.23
1055 0.26
1056 0.29
1057 0.3
1058 0.3
1059 0.37
1060 0.34
1061 0.35
1062 0.35
1063 0.35
1064 0.33
1065 0.34
1066 0.35
1067 0.34
1068 0.35
1069 0.33
1070 0.32
1071 0.3
1072 0.29
1073 0.28
1074 0.33
1075 0.31
1076 0.36
1077 0.34
1078 0.35
1079 0.41
1080 0.49
1081 0.56
1082 0.51
1083 0.47
1084 0.46
1085 0.49
1086 0.52
1087 0.51
1088 0.48
1089 0.44
1090 0.44
1091 0.45
1092 0.38
1093 0.34
1094 0.3
1095 0.24
1096 0.18
1097 0.13
1098 0.11
1099 0.1
1100 0.1
1101 0.13
1102 0.15
1103 0.2
1104 0.26
1105 0.33
1106 0.37
1107 0.42
1108 0.46
1109 0.44
1110 0.5
1111 0.48
1112 0.47
1113 0.44
1114 0.41
1115 0.38
1116 0.39
1117 0.41
1118 0.37
1119 0.36
1120 0.34
1121 0.3
1122 0.33
1123 0.32
1124 0.3
1125 0.3
1126 0.31
1127 0.29
1128 0.27
1129 0.32
1130 0.3
1131 0.33
1132 0.35
1133 0.36
1134 0.34
1135 0.4
1136 0.5
1137 0.54
1138 0.55
1139 0.5
1140 0.52
1141 0.56
1142 0.65
1143 0.7
1144 0.7
1145 0.7
1146 0.76
1147 0.78
1148 0.81
1149 0.75
1150 0.73
1151 0.68
1152 0.62
1153 0.53
1154 0.44
1155 0.4
1156 0.31
1157 0.27
1158 0.18
1159 0.12
1160 0.07
1161 0.07
1162 0.06
1163 0.05
1164 0.07
1165 0.13
1166 0.21
1167 0.25
1168 0.34
1169 0.44
1170 0.5
1171 0.56
1172 0.64
1173 0.66
1174 0.69
1175 0.72
1176 0.73
1177 0.7
1178 0.65
1179 0.6
1180 0.54
1181 0.47
1182 0.39
1183 0.32
1184 0.23
1185 0.17
1186 0.16
1187 0.16
1188 0.15
1189 0.15
1190 0.14
1191 0.15
1192 0.15
1193 0.14
1194 0.15
1195 0.14
1196 0.12
1197 0.13
1198 0.12
1199 0.11
1200 0.13
1201 0.14
1202 0.14
1203 0.15
1204 0.14
1205 0.13
1206 0.12
1207 0.12
1208 0.09
1209 0.09
1210 0.08
1211 0.06
1212 0.07
1213 0.07
1214 0.07
1215 0.07