Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0VHA9

Protein Details
Accession A0A4U0VHA9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
9-31KGKSDFKKFEKARELKKHIDTIRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
316-322RENKKGG
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 13, cyto 9.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011010  DNA_brk_join_enz  
IPR001631  TopoI  
IPR025834  TopoI_C_dom  
IPR014711  TopoI_cat_a-hlx-sub_euk  
IPR014727  TopoI_cat_a/b-sub_euk  
IPR013500  TopoI_cat_euk  
IPR013499  TopoI_euk  
Gene Ontology GO:0005694  C:chromosome  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003917  F:DNA topoisomerase type I (single strand cut, ATP-independent) activity  
GO:0006265  P:DNA topological change  
Pfam View protein in Pfam  
PF14370  Topo_C_assoc  
PF01028  Topoisom_I  
CDD cd00659  Topo_IB_C  
Amino Acid Sequences MLAANSDIKGKSDFKKFEKARELKKHIDTIRKDYHQELRSDVMATRQRATAVYLIDQFALRAGNEKGEEEADTVGCCSLKFEHVTLRPPETVIFDFLGKDSIRFYDEVKVDAQVFKNLKLFKRAPKTEGDEIFDRLTTSGLNKHLSNYMQGLTAKVFRTYNASWTMANLLRDMKAEGTIADKVLAYNAANRKVAILCNHKRTVAATHGAQMEKMEGRIDGLRYQQYRLKQQMLDLETPAKLKKKRGEAYFALPEGLDEEWVAKHQEALVEETRDKIRKKFEKENEKLAAEGQKEMKGKELEERMEVADEMEAKFKRENKKGGKIEAEGKGPTVEKLEAGVEKLDVRIATLKIQSEDRESNKEVALGTSKIVSHDTNYIDPRLTVVFSKKFDVPIERFFSKTLREKFDWAIKSVEEDWEF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.59
3 0.61
4 0.66
5 0.72
6 0.74
7 0.75
8 0.78
9 0.81
10 0.79
11 0.82
12 0.81
13 0.77
14 0.78
15 0.73
16 0.72
17 0.74
18 0.7
19 0.66
20 0.63
21 0.65
22 0.6
23 0.56
24 0.5
25 0.44
26 0.4
27 0.39
28 0.33
29 0.32
30 0.33
31 0.34
32 0.33
33 0.3
34 0.3
35 0.29
36 0.31
37 0.26
38 0.21
39 0.22
40 0.22
41 0.21
42 0.21
43 0.2
44 0.17
45 0.15
46 0.14
47 0.1
48 0.11
49 0.11
50 0.14
51 0.15
52 0.16
53 0.16
54 0.16
55 0.17
56 0.14
57 0.15
58 0.12
59 0.11
60 0.11
61 0.1
62 0.09
63 0.08
64 0.09
65 0.1
66 0.13
67 0.15
68 0.16
69 0.24
70 0.27
71 0.34
72 0.36
73 0.39
74 0.36
75 0.35
76 0.34
77 0.3
78 0.27
79 0.23
80 0.2
81 0.16
82 0.16
83 0.16
84 0.18
85 0.14
86 0.13
87 0.12
88 0.12
89 0.13
90 0.13
91 0.15
92 0.19
93 0.2
94 0.21
95 0.2
96 0.2
97 0.2
98 0.23
99 0.22
100 0.22
101 0.22
102 0.23
103 0.27
104 0.3
105 0.31
106 0.36
107 0.4
108 0.42
109 0.51
110 0.53
111 0.51
112 0.53
113 0.58
114 0.57
115 0.55
116 0.5
117 0.41
118 0.4
119 0.37
120 0.31
121 0.24
122 0.17
123 0.14
124 0.1
125 0.1
126 0.12
127 0.14
128 0.17
129 0.17
130 0.18
131 0.21
132 0.21
133 0.21
134 0.19
135 0.17
136 0.17
137 0.17
138 0.16
139 0.14
140 0.17
141 0.16
142 0.16
143 0.16
144 0.13
145 0.19
146 0.19
147 0.22
148 0.22
149 0.23
150 0.2
151 0.21
152 0.24
153 0.2
154 0.2
155 0.17
156 0.14
157 0.14
158 0.14
159 0.14
160 0.11
161 0.09
162 0.09
163 0.08
164 0.09
165 0.09
166 0.08
167 0.08
168 0.08
169 0.07
170 0.07
171 0.08
172 0.06
173 0.1
174 0.14
175 0.17
176 0.17
177 0.17
178 0.18
179 0.18
180 0.2
181 0.2
182 0.27
183 0.29
184 0.35
185 0.36
186 0.35
187 0.35
188 0.34
189 0.32
190 0.25
191 0.23
192 0.17
193 0.19
194 0.21
195 0.21
196 0.19
197 0.16
198 0.14
199 0.11
200 0.11
201 0.08
202 0.06
203 0.07
204 0.08
205 0.09
206 0.09
207 0.12
208 0.16
209 0.16
210 0.19
211 0.21
212 0.23
213 0.29
214 0.32
215 0.34
216 0.3
217 0.31
218 0.35
219 0.35
220 0.33
221 0.27
222 0.24
223 0.21
224 0.21
225 0.22
226 0.22
227 0.21
228 0.27
229 0.32
230 0.41
231 0.47
232 0.5
233 0.55
234 0.51
235 0.55
236 0.52
237 0.46
238 0.37
239 0.29
240 0.25
241 0.19
242 0.16
243 0.09
244 0.05
245 0.06
246 0.05
247 0.06
248 0.08
249 0.06
250 0.07
251 0.07
252 0.09
253 0.09
254 0.14
255 0.16
256 0.17
257 0.17
258 0.2
259 0.23
260 0.26
261 0.27
262 0.27
263 0.35
264 0.41
265 0.49
266 0.57
267 0.64
268 0.7
269 0.73
270 0.77
271 0.72
272 0.64
273 0.56
274 0.48
275 0.44
276 0.33
277 0.32
278 0.25
279 0.25
280 0.26
281 0.26
282 0.29
283 0.25
284 0.25
285 0.28
286 0.31
287 0.28
288 0.28
289 0.29
290 0.24
291 0.23
292 0.22
293 0.16
294 0.11
295 0.11
296 0.1
297 0.14
298 0.14
299 0.15
300 0.19
301 0.25
302 0.33
303 0.4
304 0.49
305 0.53
306 0.63
307 0.67
308 0.7
309 0.69
310 0.64
311 0.64
312 0.58
313 0.52
314 0.42
315 0.37
316 0.32
317 0.27
318 0.24
319 0.19
320 0.15
321 0.12
322 0.13
323 0.15
324 0.13
325 0.14
326 0.14
327 0.12
328 0.12
329 0.12
330 0.12
331 0.1
332 0.11
333 0.14
334 0.14
335 0.17
336 0.2
337 0.22
338 0.22
339 0.26
340 0.26
341 0.28
342 0.34
343 0.34
344 0.38
345 0.39
346 0.39
347 0.37
348 0.37
349 0.3
350 0.26
351 0.26
352 0.2
353 0.18
354 0.17
355 0.17
356 0.17
357 0.19
358 0.17
359 0.16
360 0.2
361 0.23
362 0.27
363 0.29
364 0.3
365 0.28
366 0.27
367 0.26
368 0.23
369 0.21
370 0.19
371 0.24
372 0.28
373 0.3
374 0.34
375 0.35
376 0.36
377 0.39
378 0.44
379 0.41
380 0.43
381 0.48
382 0.47
383 0.45
384 0.44
385 0.43
386 0.43
387 0.48
388 0.47
389 0.48
390 0.5
391 0.53
392 0.58
393 0.64
394 0.59
395 0.52
396 0.47
397 0.39
398 0.41
399 0.38