Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0TWD0

Protein Details
Accession A0A4U0TWD0    Localization Confidence High Confidence Score 21.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
132-160AEEEGKGKGKRKKRAYKPRDPNAPKRPLTBasic
296-316PPPPIKATPKSERKKGKQSAVHydrophilic
361-382VETAPSAKKRGRKPNAEKVTAGHydrophilic
404-423ENPGVAELAKKKRKRKSEAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
136-157GKGKGKRKKRAYKPRDPNAPKR
304-311PKSERKKG
368-374KKRGRKP
412-422AKKKRKRKSEA
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 13, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MASHQIDPQFSSLQHDNNSFMHNFIHQVPAPPQADMVPATGSMPARKMVSVDVGEFIRTRDGLLSAYMNLSSHIDSAVKAYVEHTNVVINGDGALNVSYLMQPFEQLNQTAQIAQQAMLHTLQNGGSAVAGAEEEGKGKGKRKKRAYKPRDPNAPKRPLTAYFRYLQEQRPLLATEMAEAHNGVPQKPGDLSKEATARWNLLTPEEQQPYRDAYGEAVKLYTVEVAKYKALGGKVSPLADSTEIDAKDEDGEDDAPAEMVDHIDAKAAKIDDDDDESSSSEESSSEEDDDEPAMPPPPPIKATPKSERKKGKQSAVAITPQFSSINPELIAPAPATNSSSPERKRKASALATEAPTESPAVETAPSAKKRGRKPNAEKVTAGADPTPAKLSTPAPIAQMQTISENPGVAELAKKKRKRKSEAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.34
3 0.34
4 0.33
5 0.38
6 0.31
7 0.28
8 0.25
9 0.21
10 0.22
11 0.2
12 0.25
13 0.22
14 0.26
15 0.27
16 0.34
17 0.34
18 0.31
19 0.3
20 0.24
21 0.25
22 0.21
23 0.2
24 0.13
25 0.12
26 0.12
27 0.15
28 0.15
29 0.15
30 0.16
31 0.17
32 0.17
33 0.17
34 0.18
35 0.16
36 0.21
37 0.2
38 0.2
39 0.2
40 0.19
41 0.2
42 0.19
43 0.18
44 0.15
45 0.13
46 0.13
47 0.12
48 0.12
49 0.12
50 0.13
51 0.14
52 0.12
53 0.13
54 0.13
55 0.11
56 0.11
57 0.12
58 0.11
59 0.1
60 0.1
61 0.09
62 0.09
63 0.11
64 0.13
65 0.11
66 0.11
67 0.12
68 0.16
69 0.17
70 0.18
71 0.16
72 0.15
73 0.15
74 0.16
75 0.14
76 0.09
77 0.08
78 0.08
79 0.07
80 0.06
81 0.06
82 0.05
83 0.05
84 0.06
85 0.06
86 0.06
87 0.07
88 0.07
89 0.08
90 0.08
91 0.11
92 0.13
93 0.13
94 0.14
95 0.14
96 0.15
97 0.14
98 0.14
99 0.14
100 0.13
101 0.12
102 0.13
103 0.12
104 0.13
105 0.13
106 0.13
107 0.11
108 0.11
109 0.11
110 0.09
111 0.09
112 0.07
113 0.06
114 0.06
115 0.05
116 0.04
117 0.04
118 0.03
119 0.04
120 0.04
121 0.05
122 0.06
123 0.09
124 0.11
125 0.19
126 0.27
127 0.35
128 0.45
129 0.55
130 0.65
131 0.73
132 0.83
133 0.86
134 0.89
135 0.91
136 0.91
137 0.92
138 0.89
139 0.88
140 0.87
141 0.86
142 0.76
143 0.69
144 0.63
145 0.57
146 0.56
147 0.51
148 0.44
149 0.38
150 0.39
151 0.39
152 0.38
153 0.36
154 0.35
155 0.31
156 0.28
157 0.26
158 0.25
159 0.22
160 0.2
161 0.16
162 0.11
163 0.12
164 0.12
165 0.1
166 0.09
167 0.08
168 0.09
169 0.09
170 0.09
171 0.09
172 0.09
173 0.1
174 0.11
175 0.13
176 0.14
177 0.15
178 0.16
179 0.18
180 0.2
181 0.19
182 0.21
183 0.2
184 0.18
185 0.16
186 0.18
187 0.15
188 0.14
189 0.15
190 0.15
191 0.21
192 0.22
193 0.22
194 0.2
195 0.21
196 0.22
197 0.21
198 0.19
199 0.12
200 0.11
201 0.14
202 0.14
203 0.13
204 0.1
205 0.09
206 0.09
207 0.09
208 0.09
209 0.06
210 0.06
211 0.07
212 0.08
213 0.09
214 0.09
215 0.09
216 0.1
217 0.1
218 0.1
219 0.1
220 0.12
221 0.14
222 0.14
223 0.14
224 0.12
225 0.12
226 0.12
227 0.12
228 0.1
229 0.13
230 0.12
231 0.13
232 0.12
233 0.11
234 0.11
235 0.11
236 0.09
237 0.06
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.05
243 0.05
244 0.05
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.04
250 0.06
251 0.07
252 0.06
253 0.09
254 0.09
255 0.09
256 0.09
257 0.1
258 0.09
259 0.13
260 0.14
261 0.12
262 0.12
263 0.13
264 0.13
265 0.12
266 0.11
267 0.07
268 0.06
269 0.06
270 0.08
271 0.08
272 0.09
273 0.09
274 0.09
275 0.1
276 0.1
277 0.1
278 0.09
279 0.09
280 0.09
281 0.09
282 0.1
283 0.1
284 0.12
285 0.14
286 0.17
287 0.25
288 0.3
289 0.38
290 0.47
291 0.57
292 0.61
293 0.69
294 0.76
295 0.76
296 0.81
297 0.81
298 0.8
299 0.77
300 0.75
301 0.73
302 0.67
303 0.64
304 0.54
305 0.46
306 0.38
307 0.31
308 0.26
309 0.19
310 0.21
311 0.16
312 0.18
313 0.17
314 0.17
315 0.17
316 0.17
317 0.18
318 0.11
319 0.11
320 0.09
321 0.1
322 0.12
323 0.11
324 0.15
325 0.17
326 0.25
327 0.31
328 0.4
329 0.46
330 0.48
331 0.53
332 0.54
333 0.6
334 0.6
335 0.6
336 0.57
337 0.58
338 0.55
339 0.51
340 0.46
341 0.37
342 0.3
343 0.24
344 0.17
345 0.11
346 0.09
347 0.09
348 0.08
349 0.08
350 0.14
351 0.22
352 0.25
353 0.28
354 0.33
355 0.4
356 0.49
357 0.6
358 0.65
359 0.67
360 0.75
361 0.82
362 0.87
363 0.84
364 0.75
365 0.66
366 0.61
367 0.5
368 0.42
369 0.31
370 0.25
371 0.21
372 0.22
373 0.23
374 0.18
375 0.18
376 0.19
377 0.2
378 0.21
379 0.24
380 0.24
381 0.24
382 0.27
383 0.28
384 0.27
385 0.26
386 0.23
387 0.22
388 0.22
389 0.22
390 0.2
391 0.18
392 0.16
393 0.16
394 0.15
395 0.12
396 0.18
397 0.22
398 0.33
399 0.42
400 0.5
401 0.59
402 0.68
403 0.78