FuNGI

A0A4U0VG28

Protein Details

Accession

A0A4U0VG28

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
153-178	AKALRRKDKTEDAKRKPKKQAESDED	Basic
424-446	RGRGEHPKTGKFKKRVTPEQITI	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
142-173	KEKIEKKAAKEAKALRRKDKTEDAKRKPKKQA
181-203	KPLIKKQKNATVKKEAKPIKKEE
208-232	VPLKKKAPAKKVKKEVVSPVKKGKT
378-391	KKALPAADKKKLKA
430-437	PKTGKFKK

Subcellular Location(s)

nucl 16, cyto_nucl 14, cyto 10

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013034 DNA_topo_DNA_db_N_dom1 IPR013030 DNA_topo_DNA_db_N_dom2 IPR008336 TopoI_DNA-bd_euk IPR036202 TopoI_DNA-bd_euk_N_sf
Gene Ontology	GO:0005694 C:chromosome GO:0003677 F:DNA binding GO:0003917 F:DNA topoisomerase type I (single strand cut, ATP-independent) activity GO:0006265 P:DNA topological change
Pfam	View protein in Pfam PF02919 Topoisom_I_N
CDD	cd00660 Topoisomer_IB_N

Amino Acid Sequences

MSDSEDDRPLKAKAKSKDVISKAEDAAMDKQIPTNGHVNPGISIAMGPVTDMEVNKPISNGHTNGISNGKRKVSLANGKSYKDDSDSDDDIPLQKKRKTDTVSSDDDIPLKKVVKPPKVTAAMVGEESDDDVPIGQKLQLEKEKIEKKAAKEAKALRRKDKTEDAKRKPKKQAESDEDDDKPLIKKQKNATVKKEAKPIKKEEFDDDVPLKKKAPAKKVKKEVVSPVKKGKTTSKVKQEDKSADDEEGEDEEEEYRWWEDQAKGDGTVKWNTLEHNGVVFPPEYEPLPKHVKMLYDKTPVTMKPDAEEIAYAFGSMLSSAHNVENPTFRKNFFADFKDMLDETGHAKDKDGNTIKIKQLEKCDFQPIFDHVEAERSAKKALPAADKKKLKAEKDEKEAAFMYCMWDGRKQKVGNFPVEPPGLFRGRGEHPKTGKFKKRVTPEQITINIGKEAMVPKPPDGHSWKEVKHDKEGTWLAMWQENINGAYKVRLLN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.55
2	0.59
3	0.63
4	0.7
5	0.67
6	0.67
7	0.63
8	0.61
9	0.52
10	0.49
11	0.42
12	0.35
13	0.34
14	0.3
15	0.27
16	0.22
17	0.24
18	0.24
19	0.25
20	0.25
21	0.28
22	0.25
23	0.29
24	0.3
25	0.28
26	0.25
27	0.25
28	0.22
29	0.15
30	0.14
31	0.09
32	0.08
33	0.07
34	0.07
35	0.06
36	0.07
37	0.09
38	0.09
39	0.11
40	0.15
41	0.17
42	0.18
43	0.18
44	0.17
45	0.21
46	0.26
47	0.25
48	0.23
49	0.25
50	0.25
51	0.28
52	0.35
53	0.34
54	0.34
55	0.37
56	0.38
57	0.34
58	0.35
59	0.37
60	0.39
61	0.45
62	0.45
63	0.5
64	0.52
65	0.52
66	0.54
67	0.51
68	0.43
69	0.37
70	0.34
71	0.29
72	0.31
73	0.32
74	0.3
75	0.29
76	0.27
77	0.28
78	0.3
79	0.3
80	0.31
81	0.32
82	0.35
83	0.39
84	0.47
85	0.48
86	0.52
87	0.56
88	0.56
89	0.59
90	0.56
91	0.54
92	0.46
93	0.44
94	0.37
95	0.29
96	0.26
97	0.21
98	0.23
99	0.27
100	0.36
101	0.42
102	0.46
103	0.49
104	0.54
105	0.57
106	0.54
107	0.5
108	0.44
109	0.36
110	0.31
111	0.27
112	0.18
113	0.13
114	0.14
115	0.11
116	0.07
117	0.06
118	0.06
119	0.06
120	0.06
121	0.07
122	0.07
123	0.09
124	0.1
125	0.17
126	0.22
127	0.24
128	0.25
129	0.34
130	0.4
131	0.4
132	0.48
133	0.46
134	0.44
135	0.52
136	0.56
137	0.51
138	0.52
139	0.58
140	0.6
141	0.64
142	0.67
143	0.65
144	0.68
145	0.67
146	0.66
147	0.67
148	0.68
149	0.7
150	0.75
151	0.76
152	0.79
153	0.85
154	0.88
155	0.88
156	0.85
157	0.83
158	0.82
159	0.82
160	0.79
161	0.78
162	0.73
163	0.68
164	0.6
165	0.51
166	0.42
167	0.32
168	0.26
169	0.23
170	0.27
171	0.25
172	0.31
173	0.36
174	0.46
175	0.54
176	0.6
177	0.63
178	0.66
179	0.71
180	0.69
181	0.72
182	0.71
183	0.69
184	0.68
185	0.68
186	0.65
187	0.62
188	0.6
189	0.55
190	0.54
191	0.46
192	0.44
193	0.39
194	0.36
195	0.32
196	0.31
197	0.27
198	0.25
199	0.3
200	0.32
201	0.4
202	0.46
203	0.54
204	0.63
205	0.72
206	0.75
207	0.73
208	0.7
209	0.7
210	0.7
211	0.66
212	0.6
213	0.59
214	0.56
215	0.53
216	0.52
217	0.49
218	0.48
219	0.5
220	0.53
221	0.56
222	0.6
223	0.64
224	0.66
225	0.64
226	0.59
227	0.53
228	0.5
229	0.4
230	0.32
231	0.27
232	0.23
233	0.18
234	0.13
235	0.11
236	0.07
237	0.06
238	0.06
239	0.06
240	0.06
241	0.06
242	0.06
243	0.05
244	0.06
245	0.08
246	0.09
247	0.12
248	0.16
249	0.16
250	0.16
251	0.18
252	0.19
253	0.19
254	0.2
255	0.17
256	0.15
257	0.15
258	0.15
259	0.15
260	0.15
261	0.13
262	0.12
263	0.11
264	0.1
265	0.11
266	0.1
267	0.08
268	0.07
269	0.08
270	0.07
271	0.09
272	0.1
273	0.14
274	0.2
275	0.2
276	0.21
277	0.22
278	0.26
279	0.3
280	0.35
281	0.36
282	0.36
283	0.36
284	0.36
285	0.37
286	0.33
287	0.34
288	0.32
289	0.25
290	0.2
291	0.21
292	0.2
293	0.17
294	0.17
295	0.11
296	0.1
297	0.09
298	0.08
299	0.06
300	0.06
301	0.05
302	0.05
303	0.05
304	0.04
305	0.05
306	0.06
307	0.07
308	0.08
309	0.09
310	0.11
311	0.17
312	0.19
313	0.23
314	0.23
315	0.23
316	0.25
317	0.26
318	0.3
319	0.28
320	0.31
321	0.31
322	0.31
323	0.31
324	0.3
325	0.28
326	0.24
327	0.19
328	0.16
329	0.13
330	0.16
331	0.19
332	0.16
333	0.17
334	0.21
335	0.22
336	0.31
337	0.33
338	0.34
339	0.36
340	0.41
341	0.44
342	0.47
343	0.49
344	0.43
345	0.48
346	0.49
347	0.49
348	0.46
349	0.51
350	0.44
351	0.42
352	0.41
353	0.34
354	0.34
355	0.3
356	0.28
357	0.19
358	0.23
359	0.22
360	0.22
361	0.22
362	0.17
363	0.18
364	0.18
365	0.2
366	0.2
367	0.25
368	0.32
369	0.4
370	0.46
371	0.55
372	0.59
373	0.6
374	0.65
375	0.67
376	0.61
377	0.62
378	0.65
379	0.63
380	0.66
381	0.73
382	0.64
383	0.6
384	0.57
385	0.46
386	0.37
387	0.29
388	0.23
389	0.17
390	0.18
391	0.16
392	0.23
393	0.26
394	0.29
395	0.38
396	0.37
397	0.41
398	0.5
399	0.54
400	0.53
401	0.52
402	0.5
403	0.48
404	0.47
405	0.41
406	0.34
407	0.34
408	0.29
409	0.26
410	0.24
411	0.23
412	0.29
413	0.39
414	0.41
415	0.45
416	0.48
417	0.57
418	0.66
419	0.71
420	0.74
421	0.72
422	0.76
423	0.76
424	0.81
425	0.83
426	0.83
427	0.82
428	0.77
429	0.77
430	0.72
431	0.67
432	0.58
433	0.5
434	0.41
435	0.32
436	0.27
437	0.21
438	0.2
439	0.19
440	0.23
441	0.23
442	0.24
443	0.31
444	0.32
445	0.36
446	0.4
447	0.43
448	0.44
449	0.51
450	0.52
451	0.56
452	0.62
453	0.59
454	0.63
455	0.62
456	0.55
457	0.56
458	0.57
459	0.49
460	0.43
461	0.41
462	0.34
463	0.32
464	0.32
465	0.23
466	0.21
467	0.21
468	0.2
469	0.21
470	0.19
471	0.16
472	0.18

A0A4U0VG28

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer