Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0UUP4

Protein Details
Accession A0A4U0UUP4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
15-35AHPCQQPCGKPKKVCGHPDENHydrophilic
374-395GNKVTFAKKKPEKVKVKAKAAIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
381-391KKKPEKVKVKA
Subcellular Location(s) cyto_nucl 13.333, cyto 12.5, nucl 11, mito_nucl 6.999
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034078  NFX1_fam  
IPR001374  R3H_dom  
IPR036867  R3H_dom_sf  
Gene Ontology GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF01424  R3H  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51061  R3H  
CDD cd06008  NF-X1-zinc-finger  
Amino Acid Sequences MFDVARLNVCEEEDAHPCQQPCGKPKKVCGHPDENICHSPFSCKEDQPCHSKIFVTCACQAQKQEMKCNASKTSEGNNDKTLPCNEECARLERNRRLALALNIDQSSHQDGGDHIPYSTETLNLFAQHVKWSQTQEREFRVFATSDDEKRLRFKPMKARERAFVHALAEDFGLDSESMDPEPHRHVMVWKTPRFVSAPNKTLAEALRIRTGIASATASANVSDTEGAAKKVKASNEVGEPYNAFVISHPRFGLTVDELRTELAKLQSSALAFDVEFLPSDEVMLKASSKTLSAQLVDQILRSLKPALVAAITTRGFGSAQLCTTDTSLNILRRESDAPSGDGWSRVAAKKAASRFLTPNAGLGGTNSFAALQGGNKVTFAKKKPEKVKVKAKAAIVDDWEAAEQAEEDREGLKSGEEDGGAAVGTSVVDEAAGLPASAEIPALGPEDDGKDARPGEETEVYGDKSATKDEESATTVDEGAALDTEHEAQPGKESLTKGEEGSTKGEESSTKDEKSATKGEESATKGEESGTKGEKSAGTDDERVTLHAEHGTQPGETLSWAEEVEQAL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.25
3 0.28
4 0.28
5 0.31
6 0.36
7 0.39
8 0.45
9 0.51
10 0.58
11 0.6
12 0.7
13 0.76
14 0.79
15 0.81
16 0.8
17 0.79
18 0.76
19 0.79
20 0.75
21 0.71
22 0.66
23 0.58
24 0.51
25 0.42
26 0.42
27 0.36
28 0.38
29 0.38
30 0.38
31 0.44
32 0.51
33 0.56
34 0.57
35 0.57
36 0.54
37 0.49
38 0.48
39 0.41
40 0.41
41 0.4
42 0.37
43 0.38
44 0.41
45 0.43
46 0.43
47 0.43
48 0.43
49 0.46
50 0.45
51 0.51
52 0.52
53 0.55
54 0.55
55 0.59
56 0.54
57 0.52
58 0.5
59 0.44
60 0.46
61 0.49
62 0.51
63 0.49
64 0.49
65 0.5
66 0.48
67 0.48
68 0.42
69 0.37
70 0.32
71 0.36
72 0.32
73 0.36
74 0.37
75 0.37
76 0.41
77 0.43
78 0.51
79 0.52
80 0.59
81 0.54
82 0.53
83 0.51
84 0.49
85 0.47
86 0.46
87 0.41
88 0.36
89 0.32
90 0.32
91 0.29
92 0.27
93 0.26
94 0.18
95 0.15
96 0.12
97 0.13
98 0.18
99 0.21
100 0.19
101 0.15
102 0.15
103 0.15
104 0.17
105 0.17
106 0.13
107 0.1
108 0.12
109 0.13
110 0.13
111 0.14
112 0.13
113 0.14
114 0.16
115 0.18
116 0.19
117 0.21
118 0.26
119 0.32
120 0.38
121 0.44
122 0.46
123 0.5
124 0.5
125 0.47
126 0.42
127 0.39
128 0.31
129 0.25
130 0.26
131 0.24
132 0.23
133 0.29
134 0.3
135 0.28
136 0.32
137 0.34
138 0.37
139 0.38
140 0.44
141 0.48
142 0.58
143 0.67
144 0.7
145 0.71
146 0.69
147 0.68
148 0.65
149 0.57
150 0.48
151 0.39
152 0.32
153 0.29
154 0.22
155 0.17
156 0.12
157 0.09
158 0.07
159 0.07
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.06
164 0.06
165 0.07
166 0.07
167 0.09
168 0.12
169 0.13
170 0.13
171 0.13
172 0.17
173 0.22
174 0.3
175 0.38
176 0.37
177 0.39
178 0.38
179 0.4
180 0.37
181 0.38
182 0.38
183 0.37
184 0.39
185 0.38
186 0.38
187 0.36
188 0.37
189 0.32
190 0.28
191 0.22
192 0.2
193 0.21
194 0.2
195 0.2
196 0.18
197 0.17
198 0.12
199 0.1
200 0.09
201 0.06
202 0.07
203 0.07
204 0.07
205 0.07
206 0.07
207 0.06
208 0.06
209 0.05
210 0.05
211 0.07
212 0.07
213 0.09
214 0.11
215 0.11
216 0.13
217 0.16
218 0.17
219 0.19
220 0.21
221 0.22
222 0.24
223 0.26
224 0.24
225 0.22
226 0.21
227 0.17
228 0.15
229 0.12
230 0.08
231 0.06
232 0.14
233 0.14
234 0.16
235 0.15
236 0.15
237 0.15
238 0.16
239 0.17
240 0.12
241 0.14
242 0.13
243 0.14
244 0.13
245 0.14
246 0.13
247 0.12
248 0.11
249 0.09
250 0.09
251 0.09
252 0.1
253 0.11
254 0.11
255 0.11
256 0.09
257 0.08
258 0.07
259 0.07
260 0.07
261 0.06
262 0.06
263 0.06
264 0.06
265 0.05
266 0.06
267 0.05
268 0.05
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.06
274 0.06
275 0.06
276 0.07
277 0.09
278 0.09
279 0.1
280 0.1
281 0.11
282 0.12
283 0.12
284 0.11
285 0.1
286 0.09
287 0.09
288 0.1
289 0.09
290 0.07
291 0.08
292 0.08
293 0.07
294 0.07
295 0.07
296 0.06
297 0.1
298 0.09
299 0.09
300 0.09
301 0.09
302 0.09
303 0.09
304 0.1
305 0.07
306 0.08
307 0.08
308 0.09
309 0.09
310 0.1
311 0.1
312 0.08
313 0.1
314 0.13
315 0.16
316 0.17
317 0.16
318 0.16
319 0.18
320 0.2
321 0.19
322 0.19
323 0.17
324 0.17
325 0.17
326 0.18
327 0.16
328 0.15
329 0.14
330 0.11
331 0.13
332 0.13
333 0.14
334 0.14
335 0.15
336 0.2
337 0.22
338 0.27
339 0.26
340 0.28
341 0.29
342 0.31
343 0.33
344 0.28
345 0.27
346 0.21
347 0.2
348 0.16
349 0.14
350 0.11
351 0.08
352 0.08
353 0.06
354 0.06
355 0.05
356 0.06
357 0.06
358 0.05
359 0.08
360 0.09
361 0.09
362 0.1
363 0.11
364 0.14
365 0.2
366 0.23
367 0.31
368 0.36
369 0.46
370 0.54
371 0.64
372 0.71
373 0.74
374 0.81
375 0.8
376 0.82
377 0.77
378 0.7
379 0.65
380 0.58
381 0.5
382 0.42
383 0.34
384 0.25
385 0.21
386 0.18
387 0.13
388 0.1
389 0.08
390 0.06
391 0.05
392 0.05
393 0.05
394 0.05
395 0.06
396 0.06
397 0.07
398 0.07
399 0.07
400 0.07
401 0.09
402 0.09
403 0.09
404 0.08
405 0.08
406 0.07
407 0.07
408 0.06
409 0.04
410 0.03
411 0.03
412 0.03
413 0.03
414 0.02
415 0.02
416 0.03
417 0.03
418 0.04
419 0.04
420 0.04
421 0.04
422 0.04
423 0.05
424 0.05
425 0.04
426 0.04
427 0.04
428 0.05
429 0.06
430 0.06
431 0.06
432 0.07
433 0.09
434 0.11
435 0.11
436 0.11
437 0.14
438 0.14
439 0.15
440 0.16
441 0.16
442 0.19
443 0.21
444 0.2
445 0.2
446 0.22
447 0.22
448 0.2
449 0.19
450 0.16
451 0.14
452 0.16
453 0.15
454 0.14
455 0.15
456 0.16
457 0.18
458 0.19
459 0.18
460 0.18
461 0.16
462 0.15
463 0.13
464 0.12
465 0.09
466 0.07
467 0.07
468 0.06
469 0.06
470 0.06
471 0.09
472 0.08
473 0.09
474 0.1
475 0.09
476 0.13
477 0.14
478 0.16
479 0.18
480 0.18
481 0.21
482 0.25
483 0.26
484 0.24
485 0.26
486 0.27
487 0.25
488 0.28
489 0.27
490 0.23
491 0.22
492 0.22
493 0.2
494 0.22
495 0.29
496 0.31
497 0.29
498 0.3
499 0.33
500 0.35
501 0.39
502 0.4
503 0.35
504 0.33
505 0.34
506 0.35
507 0.38
508 0.38
509 0.36
510 0.31
511 0.28
512 0.25
513 0.25
514 0.26
515 0.23
516 0.26
517 0.27
518 0.25
519 0.26
520 0.29
521 0.29
522 0.29
523 0.3
524 0.28
525 0.29
526 0.32
527 0.32
528 0.32
529 0.31
530 0.28
531 0.27
532 0.23
533 0.2
534 0.19
535 0.2
536 0.19
537 0.22
538 0.22
539 0.19
540 0.19
541 0.18
542 0.15
543 0.14
544 0.12
545 0.1
546 0.11
547 0.11
548 0.11