Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0VHT0

Protein Details
Accession A0A4U0VHT0    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
22-45LADCEEYRKVKRKTKTNAPPGAGAHydrophilic
247-266ATNKKKPIVKKAAKAKKKSAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
208-216PKKIKKAVK
244-266RGGATNKKKPIVKKAAKAKKKSA
Subcellular Location(s) cyto 14.5, cyto_nucl 12.833, nucl 10, mito_nucl 6.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010920  LSM_dom_sf  
IPR047575  Sm  
IPR001163  Sm_dom_euk/arc  
IPR019835  SWIB_domain  
IPR036885  SWIB_MDM2_dom_sf  
IPR003121  SWIB_MDM2_domain  
Pfam View protein in Pfam  
PF01423  LSM  
PF02201  SWIB  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS52002  SM  
PS51925  SWIB_MDM2  
CDD cd01717  Sm_B  
cd10567  SWIB-MDM2_like  
Amino Acid Sequences MKDGRQLVGQMLAFDKHMNLVLADCEEYRKVKRKTKTNAPPGAGAAQQTVETEEKRMLGLAIVRGAHVVSCSVDGPPPADPTARLGTSAPGGGAPSVMQAGPAGFAPPGFGGGPPPGFAPQGFQPPPNGRGLIMERFDKVQREREAHTNDNSEKPAPPTTNGVSHAKKATNGAAVKTESASASPSNKRKADDSDDSDSLSDVKDSPPPKKIKKAVKSKSQAETDEQIARRLQAEFSAGTGRATRGGATNKKKPIVKKAAKAKKKSATKVHSDDDSAVESSGSPKPEKEKKGGFHKLMNLSEPLQALLGVSQLSRPQTVKQIWAYVKERELQDPSDKRQIRCDEPMRAVFKSDKVHMFTMNKILSPQLYPAEEV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.17
3 0.13
4 0.14
5 0.13
6 0.11
7 0.11
8 0.12
9 0.13
10 0.14
11 0.13
12 0.14
13 0.16
14 0.2
15 0.27
16 0.36
17 0.43
18 0.51
19 0.6
20 0.67
21 0.75
22 0.82
23 0.85
24 0.86
25 0.86
26 0.8
27 0.74
28 0.66
29 0.59
30 0.49
31 0.39
32 0.29
33 0.2
34 0.17
35 0.15
36 0.15
37 0.15
38 0.14
39 0.15
40 0.15
41 0.15
42 0.15
43 0.15
44 0.12
45 0.11
46 0.13
47 0.13
48 0.15
49 0.14
50 0.14
51 0.14
52 0.14
53 0.12
54 0.1
55 0.09
56 0.06
57 0.07
58 0.08
59 0.09
60 0.1
61 0.1
62 0.11
63 0.12
64 0.14
65 0.14
66 0.15
67 0.14
68 0.18
69 0.22
70 0.2
71 0.2
72 0.18
73 0.18
74 0.18
75 0.18
76 0.13
77 0.09
78 0.09
79 0.08
80 0.07
81 0.06
82 0.05
83 0.06
84 0.06
85 0.05
86 0.05
87 0.05
88 0.06
89 0.06
90 0.06
91 0.05
92 0.05
93 0.06
94 0.05
95 0.07
96 0.07
97 0.06
98 0.07
99 0.09
100 0.1
101 0.1
102 0.1
103 0.1
104 0.1
105 0.1
106 0.12
107 0.12
108 0.21
109 0.21
110 0.21
111 0.26
112 0.29
113 0.31
114 0.31
115 0.29
116 0.2
117 0.23
118 0.26
119 0.25
120 0.23
121 0.22
122 0.2
123 0.22
124 0.24
125 0.25
126 0.24
127 0.28
128 0.3
129 0.32
130 0.34
131 0.4
132 0.45
133 0.44
134 0.44
135 0.42
136 0.39
137 0.39
138 0.38
139 0.31
140 0.26
141 0.25
142 0.26
143 0.21
144 0.21
145 0.22
146 0.22
147 0.24
148 0.26
149 0.29
150 0.26
151 0.27
152 0.29
153 0.26
154 0.25
155 0.23
156 0.22
157 0.22
158 0.21
159 0.2
160 0.19
161 0.19
162 0.18
163 0.17
164 0.15
165 0.09
166 0.09
167 0.09
168 0.08
169 0.12
170 0.18
171 0.23
172 0.28
173 0.3
174 0.31
175 0.32
176 0.35
177 0.38
178 0.38
179 0.39
180 0.38
181 0.36
182 0.35
183 0.33
184 0.28
185 0.21
186 0.15
187 0.1
188 0.06
189 0.06
190 0.11
191 0.13
192 0.16
193 0.23
194 0.31
195 0.35
196 0.43
197 0.51
198 0.57
199 0.64
200 0.72
201 0.73
202 0.76
203 0.79
204 0.76
205 0.75
206 0.69
207 0.61
208 0.53
209 0.48
210 0.41
211 0.39
212 0.33
213 0.28
214 0.24
215 0.23
216 0.21
217 0.19
218 0.16
219 0.1
220 0.12
221 0.1
222 0.11
223 0.12
224 0.11
225 0.11
226 0.11
227 0.11
228 0.11
229 0.11
230 0.1
231 0.12
232 0.2
233 0.28
234 0.34
235 0.42
236 0.46
237 0.51
238 0.55
239 0.55
240 0.59
241 0.61
242 0.62
243 0.63
244 0.69
245 0.74
246 0.79
247 0.81
248 0.79
249 0.78
250 0.79
251 0.78
252 0.78
253 0.74
254 0.74
255 0.74
256 0.68
257 0.61
258 0.53
259 0.46
260 0.37
261 0.32
262 0.24
263 0.18
264 0.14
265 0.12
266 0.13
267 0.15
268 0.16
269 0.14
270 0.16
271 0.25
272 0.34
273 0.38
274 0.43
275 0.48
276 0.53
277 0.63
278 0.71
279 0.67
280 0.63
281 0.66
282 0.65
283 0.59
284 0.54
285 0.45
286 0.38
287 0.36
288 0.3
289 0.23
290 0.16
291 0.14
292 0.11
293 0.09
294 0.08
295 0.06
296 0.06
297 0.07
298 0.1
299 0.11
300 0.14
301 0.15
302 0.17
303 0.26
304 0.28
305 0.33
306 0.34
307 0.4
308 0.4
309 0.47
310 0.48
311 0.44
312 0.44
313 0.44
314 0.43
315 0.4
316 0.41
317 0.37
318 0.44
319 0.46
320 0.49
321 0.54
322 0.58
323 0.54
324 0.6
325 0.63
326 0.6
327 0.63
328 0.64
329 0.62
330 0.63
331 0.69
332 0.64
333 0.57
334 0.54
335 0.48
336 0.46
337 0.44
338 0.43
339 0.42
340 0.42
341 0.44
342 0.47
343 0.46
344 0.44
345 0.47
346 0.43
347 0.37
348 0.34
349 0.34
350 0.29
351 0.28
352 0.27
353 0.24