Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0V4Y2

Protein Details
Accession A0A4U0V4Y2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
87-111GKVASAEEPKRKKRKVGKSESGADAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
95-104PKRKKRKVGK
439-466KHRKKKGVVEGREAGGAAEAAHGKGKRK
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 14, cyto 10.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019544  Tetratricopeptide_SHNi-TPR_dom  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF10516  SHNi-TPR  
Amino Acid Sequences MADTPAEDLTNPTAPADLTTKLDHLKAAATQQYSLKNYTAAAESFSEAAELQDQLNGEMSLENVDLLYQYGRCLYHVAISNSDVLGGKVASAEEPKRKKRKVGKSESGADALGGAGVVGDALKGGEQKLGEDEAVAVTEEEKDGMLVDEPVPATAKPFFQITGDENWTDSEADDDDDDDAQANGEADAEEEEDDFAIAYEILDTARILLSRKLEAAQETAGKGTIPSPETRQLKERLADTHDLQAEISLENERFQDAIQDTRDALALKLDLYPQESSLIAEAHFKLSLALEFASVTSTADAGGDAEAGGDGVAQVDEGMRKESAAEMEKAIASCRLRISKEEEACTAESDAAKADERRKAVAEVKEMVADMEQRLRDLRNPAVSMSGVSGVLAGSGVEGGGSVPLRGVLGAMLGESGVEQRKRVAEATEKANDLTGLVKHRKKKGVVEGREAGGAAEAAHGKGKRKAEEVDGDSGGGATNGKKAKVENAGSG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.18
3 0.19
4 0.17
5 0.17
6 0.19
7 0.22
8 0.23
9 0.24
10 0.22
11 0.2
12 0.2
13 0.19
14 0.23
15 0.26
16 0.25
17 0.27
18 0.31
19 0.37
20 0.38
21 0.38
22 0.33
23 0.28
24 0.27
25 0.27
26 0.26
27 0.19
28 0.18
29 0.17
30 0.17
31 0.17
32 0.16
33 0.14
34 0.11
35 0.11
36 0.1
37 0.09
38 0.08
39 0.1
40 0.1
41 0.1
42 0.12
43 0.11
44 0.1
45 0.09
46 0.09
47 0.09
48 0.09
49 0.08
50 0.06
51 0.06
52 0.06
53 0.07
54 0.08
55 0.07
56 0.07
57 0.1
58 0.11
59 0.11
60 0.13
61 0.13
62 0.17
63 0.24
64 0.26
65 0.25
66 0.26
67 0.27
68 0.25
69 0.25
70 0.2
71 0.13
72 0.12
73 0.09
74 0.08
75 0.07
76 0.07
77 0.07
78 0.12
79 0.17
80 0.25
81 0.35
82 0.45
83 0.55
84 0.59
85 0.68
86 0.74
87 0.8
88 0.82
89 0.84
90 0.84
91 0.82
92 0.84
93 0.77
94 0.68
95 0.56
96 0.45
97 0.34
98 0.23
99 0.15
100 0.08
101 0.04
102 0.03
103 0.02
104 0.02
105 0.02
106 0.02
107 0.02
108 0.02
109 0.03
110 0.04
111 0.05
112 0.07
113 0.07
114 0.08
115 0.1
116 0.11
117 0.1
118 0.1
119 0.1
120 0.08
121 0.08
122 0.08
123 0.06
124 0.05
125 0.06
126 0.05
127 0.05
128 0.05
129 0.04
130 0.05
131 0.05
132 0.05
133 0.06
134 0.06
135 0.08
136 0.08
137 0.08
138 0.09
139 0.08
140 0.1
141 0.1
142 0.11
143 0.1
144 0.11
145 0.11
146 0.11
147 0.13
148 0.14
149 0.17
150 0.19
151 0.18
152 0.18
153 0.18
154 0.18
155 0.16
156 0.13
157 0.09
158 0.07
159 0.08
160 0.07
161 0.07
162 0.07
163 0.07
164 0.07
165 0.06
166 0.06
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.05
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.03
184 0.03
185 0.03
186 0.03
187 0.03
188 0.03
189 0.04
190 0.03
191 0.04
192 0.04
193 0.05
194 0.06
195 0.08
196 0.1
197 0.1
198 0.11
199 0.12
200 0.12
201 0.13
202 0.13
203 0.12
204 0.12
205 0.12
206 0.11
207 0.1
208 0.09
209 0.08
210 0.08
211 0.09
212 0.09
213 0.1
214 0.13
215 0.21
216 0.24
217 0.25
218 0.29
219 0.3
220 0.32
221 0.33
222 0.32
223 0.27
224 0.28
225 0.29
226 0.25
227 0.26
228 0.23
229 0.21
230 0.19
231 0.16
232 0.13
233 0.1
234 0.1
235 0.06
236 0.06
237 0.07
238 0.07
239 0.07
240 0.06
241 0.06
242 0.09
243 0.09
244 0.12
245 0.12
246 0.13
247 0.12
248 0.13
249 0.14
250 0.1
251 0.1
252 0.07
253 0.07
254 0.06
255 0.07
256 0.07
257 0.07
258 0.09
259 0.09
260 0.08
261 0.09
262 0.09
263 0.08
264 0.09
265 0.09
266 0.07
267 0.09
268 0.09
269 0.09
270 0.09
271 0.08
272 0.08
273 0.08
274 0.08
275 0.06
276 0.06
277 0.05
278 0.05
279 0.06
280 0.06
281 0.06
282 0.06
283 0.05
284 0.04
285 0.04
286 0.04
287 0.04
288 0.04
289 0.04
290 0.03
291 0.03
292 0.03
293 0.03
294 0.03
295 0.03
296 0.02
297 0.02
298 0.02
299 0.02
300 0.02
301 0.02
302 0.03
303 0.04
304 0.05
305 0.07
306 0.07
307 0.07
308 0.07
309 0.08
310 0.11
311 0.13
312 0.13
313 0.12
314 0.13
315 0.14
316 0.14
317 0.14
318 0.15
319 0.13
320 0.14
321 0.17
322 0.2
323 0.21
324 0.24
325 0.3
326 0.35
327 0.38
328 0.39
329 0.36
330 0.35
331 0.34
332 0.33
333 0.26
334 0.19
335 0.15
336 0.13
337 0.12
338 0.1
339 0.12
340 0.14
341 0.19
342 0.22
343 0.23
344 0.25
345 0.26
346 0.29
347 0.34
348 0.35
349 0.34
350 0.32
351 0.32
352 0.3
353 0.28
354 0.25
355 0.18
356 0.15
357 0.11
358 0.13
359 0.13
360 0.13
361 0.15
362 0.16
363 0.19
364 0.23
365 0.27
366 0.28
367 0.29
368 0.29
369 0.29
370 0.28
371 0.24
372 0.2
373 0.16
374 0.1
375 0.09
376 0.09
377 0.06
378 0.06
379 0.05
380 0.04
381 0.03
382 0.03
383 0.03
384 0.02
385 0.03
386 0.03
387 0.04
388 0.05
389 0.05
390 0.05
391 0.05
392 0.05
393 0.05
394 0.05
395 0.04
396 0.04
397 0.04
398 0.04
399 0.04
400 0.04
401 0.04
402 0.04
403 0.07
404 0.12
405 0.13
406 0.13
407 0.16
408 0.19
409 0.21
410 0.23
411 0.25
412 0.28
413 0.33
414 0.4
415 0.41
416 0.4
417 0.38
418 0.37
419 0.32
420 0.24
421 0.21
422 0.17
423 0.21
424 0.29
425 0.36
426 0.43
427 0.52
428 0.59
429 0.62
430 0.68
431 0.71
432 0.73
433 0.74
434 0.74
435 0.71
436 0.64
437 0.59
438 0.5
439 0.39
440 0.28
441 0.21
442 0.12
443 0.1
444 0.09
445 0.09
446 0.14
447 0.16
448 0.2
449 0.27
450 0.33
451 0.35
452 0.39
453 0.42
454 0.45
455 0.52
456 0.52
457 0.51
458 0.45
459 0.41
460 0.36
461 0.32
462 0.25
463 0.16
464 0.12
465 0.07
466 0.14
467 0.16
468 0.18
469 0.2
470 0.21
471 0.29
472 0.37