FuNGI

A0A4U0UXY5

Protein Details

Accession

A0A4U0UXY5

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
336-356	LASGRHKKRKGAKTNTTNYSM	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
340-346	RHKKRKG

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, cyto_nucl 10.5, mito 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MPRRKFIDKKNATTFSLVHRAQNDPLIHDENAPSMVFAEKQISTTRPQEDDYPYSDTGSAISGTSSYRSNKVRQRGDLEDEFGGGFKPNEGQAAQHGVFYDDTEYDYMQHMRDLGGVEGGVTWVDSSAAPAKGKGKQKLEDALRDMGLDGRSSVAGESMASSSARSLLPEEVLPSEFVTRRTYQDQQDVPDEIAGFQPDMDPRLRQVLEALDDEEYVDDEEDVFGELTRDGYEIDRDEWERLGEQQVFDDDEGWESDHTVRAASPHPAGEPVALQLDDGEAAVPPADTQAQTPADPTSGAWLDEFKKFKQSTKPSDKPIPAHPTPSALDASVLSSLASGRHKKRKGAKTNTTNYSMTSSALFRTDQQTLLDSRFDKILEREDMMDDLADDEGSQMPDTASLASGMTGLSKSSRISRYSNASGLSGVSGISSYSRMTDSEAPQLERADFSGIMDEFLGGHSKAGKGGKYIKRFGPQTGMEQLDEVRKGLGPARVKSASRQAAS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.6
2	0.56
3	0.56
4	0.48
5	0.42
6	0.4
7	0.41
8	0.4
9	0.45
10	0.39
11	0.32
12	0.36
13	0.35
14	0.33
15	0.32
16	0.3
17	0.24
18	0.25
19	0.22
20	0.16
21	0.13
22	0.13
23	0.12
24	0.12
25	0.15
26	0.13
27	0.15
28	0.19
29	0.2
30	0.24
31	0.3
32	0.34
33	0.32
34	0.34
35	0.38
36	0.41
37	0.43
38	0.41
39	0.41
40	0.36
41	0.35
42	0.33
43	0.27
44	0.21
45	0.18
46	0.15
47	0.09
48	0.09
49	0.08
50	0.09
51	0.1
52	0.14
53	0.16
54	0.22
55	0.27
56	0.35
57	0.42
58	0.52
59	0.58
60	0.61
61	0.65
62	0.64
63	0.67
64	0.62
65	0.57
66	0.47
67	0.39
68	0.33
69	0.26
70	0.2
71	0.13
72	0.11
73	0.08
74	0.09
75	0.09
76	0.11
77	0.11
78	0.12
79	0.13
80	0.21
81	0.2
82	0.19
83	0.19
84	0.18
85	0.18
86	0.18
87	0.17
88	0.1
89	0.1
90	0.1
91	0.1
92	0.1
93	0.13
94	0.13
95	0.12
96	0.12
97	0.12
98	0.11
99	0.13
100	0.12
101	0.1
102	0.09
103	0.09
104	0.08
105	0.07
106	0.07
107	0.05
108	0.04
109	0.04
110	0.03
111	0.04
112	0.04
113	0.06
114	0.1
115	0.13
116	0.13
117	0.15
118	0.19
119	0.26
120	0.34
121	0.39
122	0.42
123	0.44
124	0.48
125	0.55
126	0.56
127	0.55
128	0.5
129	0.45
130	0.39
131	0.35
132	0.3
133	0.24
134	0.2
135	0.14
136	0.1
137	0.09
138	0.09
139	0.09
140	0.08
141	0.06
142	0.05
143	0.05
144	0.06
145	0.06
146	0.06
147	0.06
148	0.06
149	0.06
150	0.08
151	0.08
152	0.08
153	0.09
154	0.09
155	0.1
156	0.1
157	0.12
158	0.11
159	0.11
160	0.11
161	0.1
162	0.12
163	0.12
164	0.14
165	0.17
166	0.17
167	0.2
168	0.25
169	0.3
170	0.31
171	0.37
172	0.38
173	0.36
174	0.37
175	0.35
176	0.3
177	0.26
178	0.22
179	0.14
180	0.13
181	0.1
182	0.07
183	0.06
184	0.07
185	0.07
186	0.09
187	0.09
188	0.09
189	0.1
190	0.15
191	0.15
192	0.14
193	0.15
194	0.15
195	0.16
196	0.16
197	0.16
198	0.11
199	0.1
200	0.1
201	0.09
202	0.07
203	0.05
204	0.05
205	0.04
206	0.04
207	0.04
208	0.04
209	0.04
210	0.04
211	0.04
212	0.04
213	0.04
214	0.04
215	0.05
216	0.05
217	0.05
218	0.05
219	0.07
220	0.07
221	0.08
222	0.1
223	0.1
224	0.11
225	0.11
226	0.11
227	0.1
228	0.1
229	0.12
230	0.11
231	0.1
232	0.1
233	0.1
234	0.11
235	0.1
236	0.1
237	0.07
238	0.06
239	0.06
240	0.07
241	0.06
242	0.06
243	0.07
244	0.07
245	0.07
246	0.07
247	0.06
248	0.08
249	0.1
250	0.11
251	0.11
252	0.1
253	0.11
254	0.11
255	0.11
256	0.1
257	0.08
258	0.07
259	0.07
260	0.07
261	0.06
262	0.05
263	0.05
264	0.05
265	0.04
266	0.04
267	0.03
268	0.03
269	0.03
270	0.03
271	0.03
272	0.03
273	0.04
274	0.04
275	0.05
276	0.09
277	0.1
278	0.1
279	0.11
280	0.11
281	0.11
282	0.11
283	0.1
284	0.1
285	0.09
286	0.1
287	0.09
288	0.11
289	0.13
290	0.17
291	0.2
292	0.17
293	0.25
294	0.26
295	0.31
296	0.38
297	0.45
298	0.51
299	0.6
300	0.65
301	0.64
302	0.71
303	0.7
304	0.64
305	0.63
306	0.61
307	0.51
308	0.49
309	0.42
310	0.38
311	0.34
312	0.33
313	0.25
314	0.17
315	0.16
316	0.12
317	0.13
318	0.09
319	0.08
320	0.06
321	0.06
322	0.06
323	0.08
324	0.13
325	0.19
326	0.27
327	0.37
328	0.41
329	0.48
330	0.59
331	0.67
332	0.73
333	0.76
334	0.79
335	0.8
336	0.85
337	0.82
338	0.77
339	0.67
340	0.57
341	0.49
342	0.39
343	0.29
344	0.22
345	0.18
346	0.14
347	0.15
348	0.14
349	0.12
350	0.16
351	0.17
352	0.17
353	0.17
354	0.18
355	0.18
356	0.2
357	0.22
358	0.18
359	0.18
360	0.18
361	0.18
362	0.17
363	0.18
364	0.22
365	0.21
366	0.21
367	0.22
368	0.21
369	0.21
370	0.19
371	0.17
372	0.11
373	0.09
374	0.08
375	0.06
376	0.05
377	0.05
378	0.07
379	0.07
380	0.07
381	0.07
382	0.07
383	0.07
384	0.08
385	0.08
386	0.06
387	0.06
388	0.06
389	0.06
390	0.06
391	0.06
392	0.06
393	0.06
394	0.06
395	0.07
396	0.08
397	0.1
398	0.16
399	0.21
400	0.24
401	0.28
402	0.33
403	0.4
404	0.44
405	0.45
406	0.4
407	0.36
408	0.32
409	0.28
410	0.23
411	0.15
412	0.1
413	0.07
414	0.06
415	0.06
416	0.06
417	0.07
418	0.06
419	0.08
420	0.09
421	0.09
422	0.14
423	0.2
424	0.22
425	0.3
426	0.33
427	0.34
428	0.35
429	0.36
430	0.32
431	0.26
432	0.25
433	0.19
434	0.16
435	0.14
436	0.17
437	0.16
438	0.15
439	0.15
440	0.14
441	0.1
442	0.11
443	0.14
444	0.09
445	0.09
446	0.11
447	0.11
448	0.16
449	0.2
450	0.2
451	0.23
452	0.34
453	0.42
454	0.48
455	0.53
456	0.55
457	0.61
458	0.62
459	0.6
460	0.59
461	0.53
462	0.51
463	0.52
464	0.48
465	0.4
466	0.38
467	0.36
468	0.33
469	0.31
470	0.26
471	0.19
472	0.18
473	0.19
474	0.23
475	0.27
476	0.29
477	0.31
478	0.38
479	0.42
480	0.43
481	0.47
482	0.53

A0A4U0UXY5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer