Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0UP60

Protein Details
Accession A0A4U0UP60    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
276-304VREVSKGPLKKKERKRVDRKNAKKTNVHLBasic
685-711TPMPEVVTKKPKKQKFEKPTPEQYPLPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
281-299KGPLKKKERKRVDRKNAKK
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto_nucl 11, cyto 7, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001623  DnaJ_domain  
IPR036869  J_dom_sf  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
IPR040501  TFA2_Winged_2  
IPR016656  TFIIE-bsu  
IPR003166  TFIIE_bsu_DNA-bd  
IPR010233  UbiG_MeTrfase  
Gene Ontology GO:0031314  C:extrinsic component of mitochondrial inner membrane  
GO:0005673  C:transcription factor TFIIE complex  
GO:0008425  F:2-polyprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methyltransferase activity  
GO:0008689  F:3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase activity  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0004395  F:hexaprenyldihydroxybenzoate methyltransferase activity  
GO:0032259  P:methylation  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
GO:0006744  P:ubiquinone biosynthetic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF00226  DnaJ  
PF13489  Methyltransf_23  
PF18121  TFA2_Winged_2  
PF02186  TFIIE_beta  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50076  DNAJ_2  
PS51351  TFIIE_BETA_C  
CDD cd02440  AdoMet_MTases  
cd06257  DnaJ  
Amino Acid Sequences MSLADSLKAFKSERAEVVSRNAAHSRPTTTGPISRTSTPKPSSGANNNEKRTHDAAFSSSRGVAGGEIMRLVVGAVEKLKDNDFKPLSWLELLRYMSLPLDLRGAKGEATFKRALQSHHRLQYIHAKDSADGLESFRYKPLHPVTNGEELRDYLARLETAQGVPVKELKDGWPDCIPTLDRLEKVGCILVSRSKKDGTPHRVYPDNPRYHITTAPTKSSTKTTKAAESSSSAAALQEVVKISPDFQAFYSNIRLPANDNDLRAELEKAGLTPTSAVREVSKGPLKKKERKRVDRKNAKKTNVHLAGLLKDYSKVKAAKAANVIASTAKPYTTATTPPPPESSVNHTEVSHFSALAASWWDPYGSSRLLHLMNPLRHDFLRRCLSASPPDPAQKLDILDIGCGGGIFAESAARLSMAQSVTAIDPTPECIAVAKRHQRSDPLLMEAGRLNYLQTSIEELHNHTTTANSASARGDREMKQYDIITLFEVIEHIRRPYPFLSSILPHLKPGGWLIGSTIARHPVSWFTTKFMAEDILGLVPRGTHEWSQYLMPGEIREWARREAELNTSEGLGWRTMGVVYVPGIGWREVRGSEEVGNYFFGVNTMATFNYRYFQARFSIPDPYYVLDLKKGCTPSEAQRAYIKLALLVHPDKAVDPTNATELRQRNELAGLLNAAYDVYKKHLLAATPMPEVVTKKPKKQKFEKPTPEQYPLPEDVRWVSRGRVRNWQCTWFFREPECTQWKGRKAAEVPPGHVRQSHVSTAWRTV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.39
3 0.38
4 0.43
5 0.47
6 0.42
7 0.41
8 0.41
9 0.35
10 0.37
11 0.37
12 0.35
13 0.31
14 0.34
15 0.35
16 0.36
17 0.41
18 0.39
19 0.42
20 0.42
21 0.44
22 0.47
23 0.48
24 0.53
25 0.5
26 0.51
27 0.46
28 0.47
29 0.51
30 0.54
31 0.58
32 0.59
33 0.65
34 0.68
35 0.7
36 0.68
37 0.65
38 0.59
39 0.51
40 0.44
41 0.37
42 0.36
43 0.36
44 0.34
45 0.3
46 0.27
47 0.25
48 0.22
49 0.2
50 0.15
51 0.13
52 0.13
53 0.11
54 0.1
55 0.1
56 0.09
57 0.09
58 0.08
59 0.06
60 0.05
61 0.06
62 0.08
63 0.09
64 0.11
65 0.13
66 0.17
67 0.21
68 0.22
69 0.3
70 0.31
71 0.3
72 0.33
73 0.33
74 0.32
75 0.3
76 0.3
77 0.23
78 0.27
79 0.28
80 0.25
81 0.24
82 0.21
83 0.19
84 0.2
85 0.19
86 0.13
87 0.18
88 0.16
89 0.17
90 0.18
91 0.18
92 0.17
93 0.18
94 0.25
95 0.21
96 0.27
97 0.29
98 0.27
99 0.32
100 0.34
101 0.37
102 0.4
103 0.47
104 0.5
105 0.55
106 0.57
107 0.52
108 0.53
109 0.58
110 0.54
111 0.48
112 0.42
113 0.36
114 0.34
115 0.36
116 0.33
117 0.24
118 0.19
119 0.17
120 0.18
121 0.19
122 0.2
123 0.21
124 0.22
125 0.21
126 0.29
127 0.34
128 0.37
129 0.37
130 0.42
131 0.43
132 0.51
133 0.5
134 0.43
135 0.37
136 0.3
137 0.31
138 0.26
139 0.22
140 0.13
141 0.14
142 0.13
143 0.12
144 0.13
145 0.13
146 0.13
147 0.16
148 0.17
149 0.16
150 0.17
151 0.2
152 0.19
153 0.17
154 0.18
155 0.17
156 0.24
157 0.25
158 0.27
159 0.27
160 0.27
161 0.27
162 0.29
163 0.28
164 0.21
165 0.27
166 0.27
167 0.23
168 0.25
169 0.25
170 0.22
171 0.22
172 0.21
173 0.15
174 0.12
175 0.14
176 0.19
177 0.24
178 0.27
179 0.29
180 0.28
181 0.31
182 0.38
183 0.46
184 0.48
185 0.5
186 0.53
187 0.55
188 0.58
189 0.58
190 0.61
191 0.61
192 0.58
193 0.52
194 0.49
195 0.48
196 0.45
197 0.47
198 0.4
199 0.39
200 0.35
201 0.38
202 0.38
203 0.36
204 0.35
205 0.4
206 0.41
207 0.36
208 0.39
209 0.37
210 0.4
211 0.42
212 0.41
213 0.36
214 0.33
215 0.31
216 0.25
217 0.23
218 0.16
219 0.14
220 0.12
221 0.11
222 0.08
223 0.07
224 0.07
225 0.07
226 0.08
227 0.08
228 0.09
229 0.12
230 0.12
231 0.12
232 0.11
233 0.16
234 0.15
235 0.18
236 0.21
237 0.19
238 0.21
239 0.21
240 0.21
241 0.19
242 0.22
243 0.27
244 0.25
245 0.24
246 0.23
247 0.23
248 0.24
249 0.22
250 0.19
251 0.12
252 0.1
253 0.1
254 0.09
255 0.09
256 0.08
257 0.07
258 0.07
259 0.08
260 0.1
261 0.1
262 0.11
263 0.11
264 0.13
265 0.14
266 0.19
267 0.24
268 0.26
269 0.3
270 0.4
271 0.48
272 0.56
273 0.65
274 0.7
275 0.75
276 0.82
277 0.89
278 0.9
279 0.93
280 0.94
281 0.94
282 0.94
283 0.92
284 0.87
285 0.82
286 0.74
287 0.73
288 0.67
289 0.57
290 0.48
291 0.4
292 0.35
293 0.31
294 0.28
295 0.17
296 0.14
297 0.15
298 0.14
299 0.17
300 0.16
301 0.15
302 0.22
303 0.23
304 0.25
305 0.27
306 0.28
307 0.24
308 0.23
309 0.23
310 0.16
311 0.15
312 0.12
313 0.1
314 0.08
315 0.07
316 0.08
317 0.1
318 0.1
319 0.13
320 0.15
321 0.22
322 0.24
323 0.25
324 0.26
325 0.26
326 0.27
327 0.26
328 0.29
329 0.27
330 0.28
331 0.27
332 0.26
333 0.25
334 0.24
335 0.25
336 0.18
337 0.13
338 0.1
339 0.09
340 0.09
341 0.08
342 0.08
343 0.05
344 0.05
345 0.06
346 0.06
347 0.05
348 0.06
349 0.09
350 0.09
351 0.09
352 0.09
353 0.11
354 0.12
355 0.12
356 0.16
357 0.2
358 0.21
359 0.23
360 0.24
361 0.23
362 0.23
363 0.26
364 0.22
365 0.24
366 0.28
367 0.25
368 0.26
369 0.25
370 0.27
371 0.29
372 0.3
373 0.25
374 0.22
375 0.24
376 0.23
377 0.23
378 0.21
379 0.17
380 0.15
381 0.14
382 0.13
383 0.11
384 0.1
385 0.09
386 0.08
387 0.06
388 0.06
389 0.05
390 0.02
391 0.02
392 0.02
393 0.02
394 0.02
395 0.02
396 0.03
397 0.03
398 0.03
399 0.03
400 0.04
401 0.07
402 0.07
403 0.07
404 0.07
405 0.08
406 0.08
407 0.08
408 0.08
409 0.05
410 0.05
411 0.07
412 0.07
413 0.06
414 0.06
415 0.07
416 0.09
417 0.12
418 0.2
419 0.27
420 0.31
421 0.34
422 0.35
423 0.37
424 0.39
425 0.43
426 0.37
427 0.32
428 0.29
429 0.27
430 0.27
431 0.24
432 0.2
433 0.13
434 0.11
435 0.09
436 0.07
437 0.08
438 0.07
439 0.06
440 0.09
441 0.09
442 0.11
443 0.12
444 0.13
445 0.17
446 0.17
447 0.16
448 0.13
449 0.12
450 0.11
451 0.13
452 0.13
453 0.1
454 0.1
455 0.11
456 0.13
457 0.15
458 0.15
459 0.17
460 0.18
461 0.24
462 0.26
463 0.25
464 0.25
465 0.24
466 0.24
467 0.21
468 0.2
469 0.14
470 0.12
471 0.11
472 0.08
473 0.09
474 0.07
475 0.08
476 0.09
477 0.09
478 0.12
479 0.12
480 0.15
481 0.16
482 0.19
483 0.19
484 0.2
485 0.21
486 0.2
487 0.26
488 0.29
489 0.28
490 0.25
491 0.24
492 0.22
493 0.2
494 0.2
495 0.16
496 0.1
497 0.1
498 0.1
499 0.16
500 0.16
501 0.16
502 0.16
503 0.18
504 0.18
505 0.18
506 0.19
507 0.16
508 0.2
509 0.24
510 0.23
511 0.22
512 0.25
513 0.25
514 0.24
515 0.21
516 0.18
517 0.13
518 0.13
519 0.11
520 0.09
521 0.08
522 0.08
523 0.07
524 0.06
525 0.07
526 0.08
527 0.1
528 0.1
529 0.12
530 0.13
531 0.15
532 0.15
533 0.17
534 0.17
535 0.15
536 0.14
537 0.13
538 0.12
539 0.16
540 0.18
541 0.2
542 0.21
543 0.23
544 0.24
545 0.24
546 0.25
547 0.22
548 0.26
549 0.24
550 0.23
551 0.2
552 0.19
553 0.18
554 0.18
555 0.16
556 0.1
557 0.09
558 0.08
559 0.08
560 0.07
561 0.07
562 0.06
563 0.06
564 0.06
565 0.07
566 0.06
567 0.07
568 0.09
569 0.09
570 0.09
571 0.1
572 0.11
573 0.11
574 0.13
575 0.14
576 0.15
577 0.16
578 0.19
579 0.19
580 0.18
581 0.18
582 0.16
583 0.14
584 0.12
585 0.1
586 0.08
587 0.07
588 0.07
589 0.08
590 0.08
591 0.09
592 0.1
593 0.11
594 0.11
595 0.13
596 0.16
597 0.16
598 0.18
599 0.2
600 0.22
601 0.25
602 0.26
603 0.32
604 0.29
605 0.31
606 0.3
607 0.28
608 0.28
609 0.26
610 0.25
611 0.22
612 0.23
613 0.21
614 0.25
615 0.26
616 0.24
617 0.25
618 0.28
619 0.31
620 0.4
621 0.4
622 0.37
623 0.4
624 0.41
625 0.41
626 0.4
627 0.31
628 0.23
629 0.23
630 0.22
631 0.24
632 0.24
633 0.22
634 0.2
635 0.21
636 0.19
637 0.2
638 0.21
639 0.16
640 0.17
641 0.18
642 0.23
643 0.24
644 0.25
645 0.29
646 0.31
647 0.33
648 0.35
649 0.33
650 0.28
651 0.29
652 0.29
653 0.24
654 0.19
655 0.17
656 0.13
657 0.12
658 0.11
659 0.09
660 0.08
661 0.07
662 0.07
663 0.11
664 0.14
665 0.15
666 0.19
667 0.21
668 0.22
669 0.27
670 0.32
671 0.32
672 0.29
673 0.29
674 0.26
675 0.26
676 0.28
677 0.3
678 0.34
679 0.37
680 0.46
681 0.56
682 0.63
683 0.71
684 0.79
685 0.83
686 0.83
687 0.88
688 0.89
689 0.89
690 0.92
691 0.89
692 0.85
693 0.76
694 0.69
695 0.64
696 0.58
697 0.51
698 0.41
699 0.36
700 0.33
701 0.35
702 0.33
703 0.29
704 0.3
705 0.34
706 0.42
707 0.44
708 0.5
709 0.54
710 0.61
711 0.64
712 0.68
713 0.65
714 0.64
715 0.68
716 0.64
717 0.61
718 0.55
719 0.58
720 0.52
721 0.56
722 0.56
723 0.52
724 0.52
725 0.57
726 0.61
727 0.61
728 0.61
729 0.61
730 0.58
731 0.62
732 0.64
733 0.6
734 0.57
735 0.58
736 0.59
737 0.52
738 0.51
739 0.46
740 0.43
741 0.44
742 0.44
743 0.38
744 0.4