Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0UBQ6

Protein Details
Accession A0A4U0UBQ6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
385-406MDPHLGRRLDKRPSKKKKGGRRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
391-406RRLDKRPSKKKKGGRR
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12, cyto 6.5, mito 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR001005  SANT/Myb  
IPR013867  Telomere_rpt-bd_fac_dimer_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0042803  F:protein homodimerization activity  
GO:0042162  F:telomeric DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF08558  TRF  
CDD cd11660  SANT_TRF  
Amino Acid Sequences MRGNETEEGQAYITLKNLFDQTRKVYSRETPFIDAIAIQMFQPSQQELIRKANIATFVSSILGAHDVSFFHLNEYFMETFVPSGHRLLKWQGAIFLELKTQTYISAIMNSDGSPEAMLDELFPSDLDALILTRHPDAPSLSPSEQDFIDRCRLRRSYLLPEPMTEDAVQKLPKKYQWNDFVREFASYISKNVDGIMNVPTRSQAGFGGAHAEKRAANGAQNGQDSLAGGSHNGGPIKFTVEASHGSGILNVPTLTHQGSLTEKKAPVPSSTIRQTWTKPEEEALLAGLDKVNGPHWSQILALYGRGGSVSEVLKDRNQVQLKDKARNLKLQYLKIGKDVPVALRGVTGELRKRGGARARAALGLLDEEQEGGAEVNGGDGEGENMDPHLGRRLDKRPSKKKKGGRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.16
3 0.17
4 0.21
5 0.23
6 0.26
7 0.31
8 0.34
9 0.42
10 0.45
11 0.45
12 0.46
13 0.51
14 0.56
15 0.57
16 0.56
17 0.51
18 0.49
19 0.46
20 0.41
21 0.33
22 0.25
23 0.19
24 0.14
25 0.09
26 0.1
27 0.09
28 0.09
29 0.11
30 0.11
31 0.13
32 0.15
33 0.2
34 0.23
35 0.31
36 0.32
37 0.32
38 0.32
39 0.32
40 0.33
41 0.3
42 0.27
43 0.2
44 0.18
45 0.17
46 0.16
47 0.13
48 0.1
49 0.1
50 0.08
51 0.08
52 0.08
53 0.08
54 0.11
55 0.13
56 0.12
57 0.13
58 0.15
59 0.15
60 0.15
61 0.2
62 0.18
63 0.15
64 0.16
65 0.14
66 0.12
67 0.13
68 0.14
69 0.1
70 0.12
71 0.16
72 0.16
73 0.19
74 0.23
75 0.27
76 0.28
77 0.27
78 0.28
79 0.24
80 0.26
81 0.24
82 0.21
83 0.18
84 0.16
85 0.16
86 0.14
87 0.13
88 0.1
89 0.1
90 0.11
91 0.1
92 0.12
93 0.12
94 0.12
95 0.13
96 0.12
97 0.13
98 0.11
99 0.11
100 0.07
101 0.07
102 0.06
103 0.06
104 0.06
105 0.05
106 0.05
107 0.05
108 0.05
109 0.05
110 0.05
111 0.05
112 0.05
113 0.05
114 0.04
115 0.04
116 0.05
117 0.06
118 0.06
119 0.07
120 0.09
121 0.09
122 0.1
123 0.12
124 0.14
125 0.16
126 0.21
127 0.2
128 0.2
129 0.2
130 0.2
131 0.19
132 0.18
133 0.17
134 0.14
135 0.23
136 0.24
137 0.25
138 0.3
139 0.32
140 0.32
141 0.37
142 0.39
143 0.39
144 0.44
145 0.5
146 0.44
147 0.43
148 0.44
149 0.38
150 0.34
151 0.26
152 0.19
153 0.13
154 0.15
155 0.17
156 0.18
157 0.2
158 0.22
159 0.26
160 0.34
161 0.37
162 0.42
163 0.49
164 0.51
165 0.54
166 0.52
167 0.49
168 0.41
169 0.37
170 0.29
171 0.2
172 0.18
173 0.13
174 0.13
175 0.12
176 0.12
177 0.11
178 0.12
179 0.11
180 0.08
181 0.09
182 0.12
183 0.12
184 0.12
185 0.12
186 0.11
187 0.11
188 0.11
189 0.11
190 0.07
191 0.08
192 0.08
193 0.08
194 0.13
195 0.12
196 0.12
197 0.12
198 0.13
199 0.1
200 0.11
201 0.13
202 0.08
203 0.09
204 0.12
205 0.14
206 0.17
207 0.17
208 0.16
209 0.14
210 0.14
211 0.13
212 0.1
213 0.08
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.06
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.08
223 0.1
224 0.1
225 0.09
226 0.09
227 0.1
228 0.12
229 0.13
230 0.13
231 0.11
232 0.1
233 0.11
234 0.1
235 0.08
236 0.08
237 0.06
238 0.05
239 0.06
240 0.08
241 0.08
242 0.08
243 0.08
244 0.09
245 0.13
246 0.17
247 0.18
248 0.21
249 0.21
250 0.23
251 0.28
252 0.28
253 0.25
254 0.27
255 0.28
256 0.3
257 0.34
258 0.33
259 0.31
260 0.33
261 0.34
262 0.37
263 0.39
264 0.34
265 0.3
266 0.3
267 0.29
268 0.26
269 0.24
270 0.16
271 0.12
272 0.1
273 0.09
274 0.08
275 0.06
276 0.06
277 0.06
278 0.07
279 0.09
280 0.1
281 0.12
282 0.12
283 0.13
284 0.13
285 0.14
286 0.16
287 0.14
288 0.13
289 0.12
290 0.11
291 0.1
292 0.1
293 0.09
294 0.05
295 0.08
296 0.08
297 0.1
298 0.12
299 0.14
300 0.16
301 0.19
302 0.2
303 0.26
304 0.31
305 0.32
306 0.37
307 0.45
308 0.49
309 0.54
310 0.57
311 0.58
312 0.57
313 0.62
314 0.6
315 0.6
316 0.61
317 0.57
318 0.61
319 0.58
320 0.55
321 0.51
322 0.49
323 0.41
324 0.38
325 0.36
326 0.29
327 0.26
328 0.25
329 0.21
330 0.19
331 0.18
332 0.16
333 0.17
334 0.2
335 0.22
336 0.25
337 0.27
338 0.28
339 0.29
340 0.35
341 0.4
342 0.43
343 0.43
344 0.46
345 0.46
346 0.45
347 0.43
348 0.36
349 0.28
350 0.22
351 0.18
352 0.12
353 0.1
354 0.09
355 0.09
356 0.08
357 0.08
358 0.06
359 0.05
360 0.05
361 0.05
362 0.05
363 0.05
364 0.05
365 0.05
366 0.04
367 0.05
368 0.06
369 0.06
370 0.06
371 0.06
372 0.07
373 0.08
374 0.09
375 0.16
376 0.18
377 0.21
378 0.29
379 0.38
380 0.47
381 0.57
382 0.67
383 0.71
384 0.8
385 0.88
386 0.9