Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0UPF1

Protein Details
Accession A0A4U0UPF1    Localization Confidence High Confidence Score 19.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
13-47RVKGVDHAKERQKKFQKHAEKRKSKKQRSEIDVGABasic
392-421GRRGGDEGPNRKRQKKDEKHGFGGKKRFAKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-40RKLKAALERVKGVDHAKERQKKFQKHAEKRKSKKQR
302-322RKKASSDARRQRDLKKFGKAV
326-349KLQERDRAKRDTLDKIGALKRKRA
377-426RAARRAKGAKGGREGGRRGGDEGPNRKRQKKDEKHGFGGKKRFAKSNDAR
435-457SVKKMKGGKGAMRPGKSKRAKRT
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 13, mito 3, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008610  Ebp2  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0042254  P:ribosome biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF05890  Ebp2  
Amino Acid Sequences MAKDRKLKAALERVKGVDHAKERQKKFQKHAEKRKSKKQRSEIDVGALEESVAGAEEDAEAHKLAGDPAESQKEEVAAKWASLMEKANGEADGWETDGSEDAEGLGEDEDDDEGDEGEEEGGVIIETFEDESESDSDEDQTFYTAAASSPAKVRMNGDAAPEGDEDEDAVEAGDDEEIPLSDIESLASDEKGDVIPYQRLTINNTAALQRSLKSFAHPPGLPFTATQSLTTAEPVEIADVEDDLNRELSFYQQSLHAVKEARIQLKKEGVPFSRPADYFAEMVKNEEQMGKVRQKMVDEAARKKASSDARRQRDLKKFGKAVQVVKLQERDRAKRDTLDKIGALKRKRAGGAELRANEDDMFDVALEDAAVTDKADRAARRAKGAKGGREGGRRGGDEGPNRKRQKKDEKHGFGGKKRFAKSNDARSTAEGDGYSVKKMKGGKGAMRPGKSKRAKRT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.52
3 0.46
4 0.43
5 0.41
6 0.44
7 0.49
8 0.58
9 0.61
10 0.69
11 0.76
12 0.77
13 0.8
14 0.82
15 0.83
16 0.85
17 0.91
18 0.92
19 0.92
20 0.92
21 0.94
22 0.95
23 0.94
24 0.94
25 0.92
26 0.91
27 0.89
28 0.87
29 0.79
30 0.74
31 0.65
32 0.55
33 0.46
34 0.35
35 0.26
36 0.18
37 0.14
38 0.07
39 0.05
40 0.04
41 0.03
42 0.04
43 0.04
44 0.05
45 0.06
46 0.07
47 0.07
48 0.07
49 0.07
50 0.08
51 0.08
52 0.09
53 0.09
54 0.11
55 0.16
56 0.21
57 0.21
58 0.21
59 0.21
60 0.22
61 0.22
62 0.2
63 0.21
64 0.15
65 0.15
66 0.15
67 0.16
68 0.14
69 0.16
70 0.18
71 0.15
72 0.15
73 0.16
74 0.16
75 0.14
76 0.14
77 0.12
78 0.11
79 0.1
80 0.09
81 0.09
82 0.08
83 0.08
84 0.09
85 0.09
86 0.07
87 0.06
88 0.06
89 0.06
90 0.06
91 0.06
92 0.05
93 0.04
94 0.04
95 0.05
96 0.05
97 0.04
98 0.05
99 0.04
100 0.04
101 0.05
102 0.05
103 0.05
104 0.04
105 0.04
106 0.04
107 0.04
108 0.03
109 0.03
110 0.03
111 0.03
112 0.03
113 0.03
114 0.03
115 0.03
116 0.04
117 0.04
118 0.06
119 0.07
120 0.08
121 0.09
122 0.09
123 0.11
124 0.11
125 0.11
126 0.09
127 0.1
128 0.08
129 0.08
130 0.08
131 0.06
132 0.06
133 0.08
134 0.09
135 0.09
136 0.12
137 0.17
138 0.17
139 0.18
140 0.19
141 0.2
142 0.23
143 0.23
144 0.23
145 0.19
146 0.19
147 0.19
148 0.18
149 0.15
150 0.11
151 0.1
152 0.08
153 0.06
154 0.06
155 0.04
156 0.04
157 0.03
158 0.03
159 0.03
160 0.03
161 0.03
162 0.03
163 0.03
164 0.03
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.05
173 0.05
174 0.06
175 0.05
176 0.05
177 0.06
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.07
182 0.1
183 0.1
184 0.12
185 0.13
186 0.14
187 0.17
188 0.2
189 0.2
190 0.18
191 0.19
192 0.18
193 0.17
194 0.18
195 0.15
196 0.12
197 0.12
198 0.14
199 0.13
200 0.15
201 0.18
202 0.19
203 0.24
204 0.23
205 0.23
206 0.23
207 0.24
208 0.22
209 0.18
210 0.19
211 0.17
212 0.17
213 0.16
214 0.13
215 0.13
216 0.13
217 0.13
218 0.11
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.05
224 0.05
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.07
236 0.07
237 0.07
238 0.08
239 0.08
240 0.11
241 0.11
242 0.12
243 0.13
244 0.12
245 0.13
246 0.19
247 0.22
248 0.26
249 0.28
250 0.29
251 0.3
252 0.35
253 0.36
254 0.34
255 0.35
256 0.31
257 0.32
258 0.33
259 0.33
260 0.32
261 0.3
262 0.29
263 0.26
264 0.26
265 0.23
266 0.21
267 0.22
268 0.17
269 0.19
270 0.17
271 0.14
272 0.14
273 0.14
274 0.14
275 0.14
276 0.19
277 0.22
278 0.24
279 0.26
280 0.27
281 0.27
282 0.29
283 0.3
284 0.32
285 0.33
286 0.35
287 0.41
288 0.4
289 0.39
290 0.37
291 0.39
292 0.41
293 0.43
294 0.49
295 0.52
296 0.57
297 0.65
298 0.69
299 0.72
300 0.73
301 0.74
302 0.7
303 0.68
304 0.65
305 0.62
306 0.67
307 0.62
308 0.56
309 0.53
310 0.53
311 0.46
312 0.46
313 0.48
314 0.4
315 0.42
316 0.45
317 0.45
318 0.44
319 0.47
320 0.46
321 0.46
322 0.5
323 0.52
324 0.49
325 0.46
326 0.43
327 0.44
328 0.48
329 0.48
330 0.46
331 0.44
332 0.43
333 0.43
334 0.44
335 0.39
336 0.4
337 0.42
338 0.46
339 0.48
340 0.46
341 0.45
342 0.44
343 0.42
344 0.35
345 0.27
346 0.2
347 0.12
348 0.11
349 0.07
350 0.07
351 0.06
352 0.05
353 0.05
354 0.04
355 0.04
356 0.05
357 0.05
358 0.05
359 0.06
360 0.07
361 0.09
362 0.14
363 0.15
364 0.2
365 0.28
366 0.31
367 0.39
368 0.44
369 0.44
370 0.5
371 0.56
372 0.58
373 0.56
374 0.61
375 0.58
376 0.6
377 0.59
378 0.56
379 0.54
380 0.47
381 0.44
382 0.42
383 0.42
384 0.44
385 0.52
386 0.54
387 0.6
388 0.67
389 0.71
390 0.73
391 0.77
392 0.8
393 0.81
394 0.84
395 0.85
396 0.86
397 0.87
398 0.89
399 0.87
400 0.85
401 0.83
402 0.8
403 0.77
404 0.72
405 0.71
406 0.65
407 0.67
408 0.68
409 0.7
410 0.7
411 0.67
412 0.65
413 0.59
414 0.6
415 0.5
416 0.42
417 0.31
418 0.23
419 0.25
420 0.24
421 0.26
422 0.25
423 0.24
424 0.26
425 0.3
426 0.34
427 0.37
428 0.44
429 0.48
430 0.54
431 0.65
432 0.69
433 0.71
434 0.72
435 0.7
436 0.74
437 0.75