Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0U8W3

Protein Details
Accession A0A4U0U8W3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
313-336LSHPLHKSKPPSPKARKKTTAQVAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
319-330KSKPPSPKARKK
Subcellular Location(s) nucl 12, mito 10.5, cyto_mito 6.5, plas 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MATAAVARPANVLRQRRTDAPRLTLGKRVNPSSMDGNETAQLAKRRKLAEPYVRNNDYVLKKHKGKQASIVVHLHNNYWKFGGQDSSFGYDSQMAVVLKHLRRGTVPHEMMAELLGEQVLWYDGCLIVEVHNHRTAEGKEKGKARDDAMKFSMHAYNEHITPSAMAPYPTKARTDEDGAKANGTSGSEEAQADKLKDKAKDGPKVFTTVLHPTELSRHHELLIFARTPASDMRSKKKGSTDTPTSAQPPTPSLSVPPTPPMTTRGPLTKDQKMCLEGGELNSFLADILVSTEPPLYLEPVDNPHDAQRILDMLSHPLHKSKPPSPKARKKTTAQVAADDAQAAEAERRMLIMDERIKPSARTGAGAAAESNQATAASLGFSRFKTIEMVRQKHEENQIIKKEEADRAAVEKKLHDEQNTIRQQQILHQQKQREMAVQLQQQGNNHTMAQKQALLHAQRQQQALQQRDAQIAATREHHGHPNAAANAMMQAQQQHLANSQQQAQNMAMQGSPVMQQNTPSGMMNSSPMMHNGGFAMVPTSSQGAGSPARPPSAIMQNRNVQMARQASQQHHGSQNNTPQLPQGTPSMPQVMPNRQMTQTPRLPPGSPASAMHGTPTSANGLPMTMPTPHMMQGNAGVNLTQEQIMMLQAQQRNLQQAGGHAGSPAAGVQGGGGHNMQNLTPEQVQQINRQHQMRQQALMHVQQQQAQANGQPVQMTPQQQQNYVKMQMMRRAQMAQLQAQQQAQQMQQMGMVNGAAGSPAPPQPGMQQPTPTPQMAHAHPQTPQQQAQTQQQQHQQANGGGQPGDFQRQQMAIAHHRAQAIAAQRQAHTQLLAMAHQYGGNLAQIPANVAATLPGPARQMLQQQLGKQTEMRQAQTQMQQMRAQQHLQQQNGQQGGGGPVGGGGQGGGGDGVVPAGQPNPVYMQQLRHNQALLSNHMAQQQALQQQQQQNGGGMGMNGMGMNGMNGMNMGGQTFGVNGNGGGQPQQQPQPQQGGGGGGNDLNQYFLNMQNALERQNSGQGNGMQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.54
3 0.6
4 0.66
5 0.68
6 0.67
7 0.64
8 0.67
9 0.65
10 0.63
11 0.61
12 0.6
13 0.58
14 0.58
15 0.56
16 0.51
17 0.47
18 0.48
19 0.48
20 0.44
21 0.41
22 0.35
23 0.33
24 0.3
25 0.29
26 0.26
27 0.24
28 0.3
29 0.3
30 0.35
31 0.39
32 0.41
33 0.46
34 0.54
35 0.59
36 0.62
37 0.67
38 0.71
39 0.75
40 0.74
41 0.68
42 0.61
43 0.59
44 0.55
45 0.53
46 0.51
47 0.5
48 0.56
49 0.63
50 0.69
51 0.69
52 0.66
53 0.67
54 0.69
55 0.66
56 0.65
57 0.63
58 0.58
59 0.56
60 0.53
61 0.46
62 0.42
63 0.37
64 0.32
65 0.29
66 0.27
67 0.22
68 0.24
69 0.28
70 0.22
71 0.25
72 0.26
73 0.29
74 0.28
75 0.27
76 0.26
77 0.21
78 0.2
79 0.17
80 0.18
81 0.13
82 0.12
83 0.17
84 0.24
85 0.24
86 0.3
87 0.31
88 0.28
89 0.3
90 0.35
91 0.36
92 0.39
93 0.39
94 0.34
95 0.34
96 0.33
97 0.31
98 0.27
99 0.21
100 0.1
101 0.09
102 0.07
103 0.05
104 0.05
105 0.05
106 0.05
107 0.04
108 0.05
109 0.05
110 0.06
111 0.06
112 0.07
113 0.07
114 0.08
115 0.14
116 0.18
117 0.21
118 0.25
119 0.25
120 0.25
121 0.29
122 0.3
123 0.33
124 0.38
125 0.38
126 0.4
127 0.46
128 0.51
129 0.52
130 0.54
131 0.49
132 0.51
133 0.49
134 0.5
135 0.46
136 0.43
137 0.37
138 0.36
139 0.36
140 0.27
141 0.26
142 0.24
143 0.24
144 0.23
145 0.24
146 0.21
147 0.17
148 0.17
149 0.17
150 0.15
151 0.14
152 0.14
153 0.15
154 0.18
155 0.24
156 0.25
157 0.26
158 0.25
159 0.28
160 0.3
161 0.36
162 0.39
163 0.38
164 0.42
165 0.41
166 0.39
167 0.35
168 0.32
169 0.26
170 0.19
171 0.16
172 0.1
173 0.11
174 0.12
175 0.12
176 0.13
177 0.15
178 0.17
179 0.17
180 0.18
181 0.22
182 0.25
183 0.27
184 0.3
185 0.36
186 0.42
187 0.5
188 0.51
189 0.53
190 0.5
191 0.52
192 0.49
193 0.42
194 0.38
195 0.35
196 0.34
197 0.28
198 0.27
199 0.23
200 0.28
201 0.29
202 0.31
203 0.29
204 0.28
205 0.28
206 0.3
207 0.3
208 0.29
209 0.3
210 0.24
211 0.19
212 0.19
213 0.18
214 0.17
215 0.18
216 0.19
217 0.2
218 0.25
219 0.32
220 0.39
221 0.41
222 0.44
223 0.5
224 0.54
225 0.54
226 0.58
227 0.58
228 0.55
229 0.56
230 0.55
231 0.5
232 0.44
233 0.39
234 0.31
235 0.26
236 0.23
237 0.21
238 0.19
239 0.18
240 0.22
241 0.23
242 0.23
243 0.24
244 0.24
245 0.25
246 0.25
247 0.28
248 0.27
249 0.26
250 0.28
251 0.3
252 0.31
253 0.38
254 0.43
255 0.46
256 0.45
257 0.45
258 0.46
259 0.42
260 0.38
261 0.31
262 0.27
263 0.21
264 0.2
265 0.19
266 0.15
267 0.13
268 0.13
269 0.12
270 0.09
271 0.07
272 0.04
273 0.03
274 0.05
275 0.06
276 0.06
277 0.06
278 0.07
279 0.07
280 0.08
281 0.08
282 0.07
283 0.08
284 0.09
285 0.1
286 0.14
287 0.17
288 0.17
289 0.17
290 0.19
291 0.2
292 0.19
293 0.18
294 0.15
295 0.12
296 0.12
297 0.13
298 0.11
299 0.12
300 0.14
301 0.16
302 0.16
303 0.18
304 0.19
305 0.22
306 0.28
307 0.32
308 0.41
309 0.47
310 0.58
311 0.66
312 0.75
313 0.8
314 0.84
315 0.84
316 0.79
317 0.81
318 0.79
319 0.77
320 0.67
321 0.6
322 0.53
323 0.46
324 0.41
325 0.31
326 0.21
327 0.12
328 0.11
329 0.09
330 0.06
331 0.05
332 0.05
333 0.05
334 0.05
335 0.05
336 0.06
337 0.07
338 0.12
339 0.18
340 0.21
341 0.24
342 0.26
343 0.26
344 0.26
345 0.27
346 0.27
347 0.22
348 0.19
349 0.17
350 0.18
351 0.18
352 0.18
353 0.16
354 0.11
355 0.11
356 0.1
357 0.09
358 0.06
359 0.05
360 0.05
361 0.05
362 0.04
363 0.04
364 0.05
365 0.06
366 0.08
367 0.08
368 0.1
369 0.1
370 0.11
371 0.14
372 0.15
373 0.22
374 0.3
375 0.34
376 0.34
377 0.38
378 0.38
379 0.4
380 0.45
381 0.43
382 0.38
383 0.42
384 0.46
385 0.45
386 0.44
387 0.4
388 0.37
389 0.34
390 0.3
391 0.24
392 0.19
393 0.2
394 0.23
395 0.23
396 0.2
397 0.18
398 0.2
399 0.24
400 0.25
401 0.23
402 0.23
403 0.25
404 0.34
405 0.39
406 0.36
407 0.32
408 0.31
409 0.3
410 0.31
411 0.38
412 0.37
413 0.39
414 0.42
415 0.44
416 0.46
417 0.51
418 0.46
419 0.39
420 0.31
421 0.29
422 0.3
423 0.3
424 0.32
425 0.29
426 0.3
427 0.28
428 0.29
429 0.25
430 0.2
431 0.17
432 0.14
433 0.13
434 0.13
435 0.13
436 0.13
437 0.12
438 0.13
439 0.18
440 0.18
441 0.2
442 0.25
443 0.29
444 0.3
445 0.31
446 0.3
447 0.29
448 0.34
449 0.34
450 0.31
451 0.29
452 0.26
453 0.26
454 0.25
455 0.22
456 0.18
457 0.16
458 0.15
459 0.14
460 0.14
461 0.15
462 0.16
463 0.19
464 0.17
465 0.17
466 0.16
467 0.18
468 0.17
469 0.16
470 0.14
471 0.11
472 0.11
473 0.1
474 0.1
475 0.06
476 0.06
477 0.07
478 0.08
479 0.09
480 0.09
481 0.09
482 0.1
483 0.12
484 0.13
485 0.17
486 0.17
487 0.17
488 0.18
489 0.17
490 0.17
491 0.15
492 0.14
493 0.1
494 0.08
495 0.08
496 0.07
497 0.08
498 0.08
499 0.08
500 0.08
501 0.09
502 0.1
503 0.11
504 0.12
505 0.11
506 0.09
507 0.08
508 0.09
509 0.08
510 0.08
511 0.07
512 0.07
513 0.07
514 0.09
515 0.08
516 0.08
517 0.07
518 0.07
519 0.06
520 0.06
521 0.06
522 0.04
523 0.04
524 0.04
525 0.05
526 0.05
527 0.05
528 0.05
529 0.07
530 0.08
531 0.09
532 0.11
533 0.11
534 0.12
535 0.12
536 0.13
537 0.14
538 0.22
539 0.26
540 0.27
541 0.3
542 0.35
543 0.36
544 0.37
545 0.34
546 0.24
547 0.24
548 0.24
549 0.2
550 0.2
551 0.23
552 0.22
553 0.27
554 0.29
555 0.28
556 0.31
557 0.32
558 0.3
559 0.31
560 0.36
561 0.35
562 0.34
563 0.3
564 0.26
565 0.26
566 0.23
567 0.2
568 0.17
569 0.13
570 0.14
571 0.15
572 0.18
573 0.16
574 0.21
575 0.24
576 0.26
577 0.3
578 0.31
579 0.32
580 0.29
581 0.33
582 0.32
583 0.35
584 0.36
585 0.34
586 0.36
587 0.35
588 0.35
589 0.34
590 0.34
591 0.29
592 0.24
593 0.21
594 0.22
595 0.21
596 0.21
597 0.19
598 0.16
599 0.13
600 0.12
601 0.13
602 0.1
603 0.09
604 0.09
605 0.08
606 0.08
607 0.08
608 0.08
609 0.09
610 0.07
611 0.07
612 0.08
613 0.09
614 0.11
615 0.11
616 0.11
617 0.1
618 0.13
619 0.15
620 0.14
621 0.13
622 0.11
623 0.11
624 0.11
625 0.12
626 0.08
627 0.05
628 0.05
629 0.05
630 0.05
631 0.06
632 0.06
633 0.1
634 0.12
635 0.13
636 0.16
637 0.17
638 0.2
639 0.2
640 0.2
641 0.15
642 0.14
643 0.17
644 0.15
645 0.14
646 0.11
647 0.11
648 0.1
649 0.09
650 0.08
651 0.04
652 0.03
653 0.03
654 0.03
655 0.05
656 0.05
657 0.06
658 0.06
659 0.06
660 0.07
661 0.08
662 0.08
663 0.08
664 0.08
665 0.11
666 0.11
667 0.12
668 0.13
669 0.18
670 0.2
671 0.25
672 0.33
673 0.36
674 0.41
675 0.43
676 0.44
677 0.42
678 0.49
679 0.45
680 0.41
681 0.35
682 0.34
683 0.35
684 0.36
685 0.35
686 0.32
687 0.31
688 0.3
689 0.32
690 0.29
691 0.27
692 0.24
693 0.22
694 0.2
695 0.21
696 0.17
697 0.15
698 0.13
699 0.16
700 0.19
701 0.2
702 0.2
703 0.26
704 0.27
705 0.31
706 0.35
707 0.35
708 0.37
709 0.36
710 0.37
711 0.34
712 0.35
713 0.38
714 0.38
715 0.36
716 0.33
717 0.32
718 0.3
719 0.3
720 0.29
721 0.26
722 0.27
723 0.27
724 0.28
725 0.27
726 0.28
727 0.25
728 0.26
729 0.23
730 0.21
731 0.19
732 0.17
733 0.18
734 0.17
735 0.15
736 0.12
737 0.11
738 0.08
739 0.07
740 0.07
741 0.04
742 0.03
743 0.04
744 0.06
745 0.07
746 0.08
747 0.09
748 0.1
749 0.13
750 0.21
751 0.25
752 0.26
753 0.28
754 0.29
755 0.35
756 0.38
757 0.34
758 0.27
759 0.27
760 0.29
761 0.28
762 0.35
763 0.32
764 0.3
765 0.32
766 0.38
767 0.4
768 0.4
769 0.4
770 0.36
771 0.37
772 0.4
773 0.47
774 0.51
775 0.5
776 0.5
777 0.54
778 0.58
779 0.56
780 0.53
781 0.47
782 0.39
783 0.37
784 0.32
785 0.27
786 0.2
787 0.18
788 0.17
789 0.15
790 0.19
791 0.17
792 0.16
793 0.17
794 0.17
795 0.18
796 0.21
797 0.25
798 0.26
799 0.32
800 0.34
801 0.34
802 0.34
803 0.33
804 0.29
805 0.27
806 0.27
807 0.25
808 0.26
809 0.25
810 0.25
811 0.27
812 0.29
813 0.26
814 0.2
815 0.16
816 0.16
817 0.15
818 0.15
819 0.14
820 0.12
821 0.11
822 0.11
823 0.11
824 0.08
825 0.08
826 0.08
827 0.08
828 0.08
829 0.09
830 0.08
831 0.1
832 0.1
833 0.1
834 0.09
835 0.08
836 0.08
837 0.07
838 0.09
839 0.08
840 0.09
841 0.1
842 0.11
843 0.13
844 0.15
845 0.2
846 0.23
847 0.31
848 0.32
849 0.34
850 0.42
851 0.43
852 0.41
853 0.38
854 0.38
855 0.39
856 0.4
857 0.4
858 0.36
859 0.38
860 0.43
861 0.46
862 0.48
863 0.43
864 0.43
865 0.43
866 0.43
867 0.46
868 0.43
869 0.4
870 0.38
871 0.44
872 0.47
873 0.46
874 0.47
875 0.46
876 0.49
877 0.47
878 0.42
879 0.33
880 0.27
881 0.25
882 0.2
883 0.16
884 0.09
885 0.08
886 0.08
887 0.07
888 0.06
889 0.03
890 0.03
891 0.03
892 0.03
893 0.03
894 0.03
895 0.03
896 0.03
897 0.03
898 0.03
899 0.03
900 0.04
901 0.05
902 0.06
903 0.06
904 0.07
905 0.12
906 0.14
907 0.19
908 0.21
909 0.27
910 0.34
911 0.43
912 0.46
913 0.44
914 0.43
915 0.39
916 0.41
917 0.39
918 0.36
919 0.32
920 0.31
921 0.31
922 0.33
923 0.33
924 0.29
925 0.27
926 0.29
927 0.29
928 0.3
929 0.3
930 0.33
931 0.38
932 0.43
933 0.44
934 0.39
935 0.34
936 0.31
937 0.29
938 0.23
939 0.17
940 0.13
941 0.09
942 0.07
943 0.06
944 0.05
945 0.05
946 0.04
947 0.04
948 0.05
949 0.05
950 0.05
951 0.05
952 0.05
953 0.06
954 0.06
955 0.06
956 0.05
957 0.05
958 0.06
959 0.06
960 0.07
961 0.07
962 0.07
963 0.07
964 0.1
965 0.11
966 0.11
967 0.13
968 0.16
969 0.2
970 0.25
971 0.32
972 0.34
973 0.38
974 0.42
975 0.48
976 0.45
977 0.41
978 0.37
979 0.34
980 0.29
981 0.27
982 0.22
983 0.15
984 0.15
985 0.15
986 0.13
987 0.11
988 0.1
989 0.11
990 0.12
991 0.14
992 0.17
993 0.16
994 0.17
995 0.21
996 0.23
997 0.25
998 0.25
999 0.24
1000 0.22
1001 0.3
1002 0.3
1003 0.25