FuNGI

A0A4U0WGK6

Protein Details

Accession

A0A4U0WGK6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
368-392	RDDRKRYITLFKKKKREEKLTPDEE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
379-383	KKKKR

Subcellular Location(s)

nucl 16, cyto 9.5, cyto_mito 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR026847 VPS13 IPR026854 VPS13-like_N IPR031646 VPS13_extend_chorein IPR031642 VPS13_mid_RBG
Pfam	View protein in Pfam PF12624 Chorein_N PF16908 VPS13 PF16910 VPS13_mid_rpt

Amino Acid Sequences

MLESLVANLLNRVLGMYVRNFDPKQLNVGIWSGDVTLRNLELRREALDQFHLPLNVVEGHITSLVLKIPWSNLRGQPVRINIEDVFLLAAPKEDEEYNAAEEEKRAHAVKMEKLDSAELLKERNTEGMSQEEEKKQQSFTAALTTTIIDNVQIQVKNVHIRYEDAVSDPGHPFAAGLTLQELSAVSTDENWRPTWIQSTSATTHKLATLGALAVYWDTDANLIGEGTGSKDAKAQGIDRDAVLDKFREMIVKSDSPTVKEHQFILKPVSGRAGLEMDKTGKHDRPKMKARLLFNELGFVLDDEQYRDALMLVDLFHYFIRHQEYRKWQPEKRPKEDPKAWLQFAGKAVLDGIHDKNKRWSWAYFAERRDDRKRYITLFKKKKREEKLTPDEEKELDALEHKSTYEDLRFWRSLARNELRKENIGVKKEQPKSTWSSYIWGGAKKPEETHDDSQMNEQQRKELYQAIDFDEKKSLTEAVDMPKEAVKMQVDMSLKSGGVTLRRDPHGKKTDILRLLFDDFSTEFTQRTDSTLMNLSLGGMRLYDGSTEGNMYEEMLRVKDAPPVPDSERITELGDDEKEKFKDAKADAAGDEEDEDEPDPFFTMAFEQNPLDGHADSAVNLKLKAMEIVYNPNFVVQVTKFFKPPAQHNESIGALMEAAGSTVEGLRQQTRAGLEYALQEHKTIDLQLDLQAPLIIVPDSVTKKSTICLILDAGHVSVRSDLIDKRHIEEIQNKQKQQYTEADYHQLESLMYDKFQLKLESTQVLIGTTVDETKKQLDEKAASKDFHVVERINVDFTIQSCIIPNSPDLTKFKIVGHLPVLHAILSDAKYKSLMKVLDFAIPKFNDEEKKE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.08
2	0.11
3	0.14
4	0.17
5	0.19
6	0.27
7	0.27
8	0.32
9	0.36
10	0.35
11	0.38
12	0.37
13	0.35
14	0.31
15	0.32
16	0.27
17	0.21
18	0.2
19	0.15
20	0.14
21	0.15
22	0.14
23	0.15
24	0.15
25	0.19
26	0.2
27	0.22
28	0.23
29	0.24
30	0.26
31	0.28
32	0.28
33	0.27
34	0.31
35	0.3
36	0.29
37	0.31
38	0.28
39	0.25
40	0.23
41	0.22
42	0.18
43	0.16
44	0.14
45	0.11
46	0.12
47	0.11
48	0.11
49	0.09
50	0.09
51	0.1
52	0.1
53	0.1
54	0.1
55	0.15
56	0.2
57	0.22
58	0.27
59	0.3
60	0.4
61	0.43
62	0.46
63	0.47
64	0.48
65	0.51
66	0.46
67	0.46
68	0.37
69	0.34
70	0.31
71	0.24
72	0.18
73	0.13
74	0.12
75	0.08
76	0.09
77	0.08
78	0.08
79	0.1
80	0.09
81	0.11
82	0.13
83	0.15
84	0.15
85	0.16
86	0.16
87	0.15
88	0.16
89	0.17
90	0.17
91	0.19
92	0.18
93	0.18
94	0.23
95	0.28
96	0.33
97	0.38
98	0.38
99	0.35
100	0.35
101	0.36
102	0.31
103	0.28
104	0.25
105	0.19
106	0.18
107	0.19
108	0.19
109	0.19
110	0.21
111	0.2
112	0.18
113	0.19
114	0.21
115	0.23
116	0.25
117	0.3
118	0.31
119	0.34
120	0.36
121	0.35
122	0.32
123	0.3
124	0.29
125	0.25
126	0.22
127	0.24
128	0.21
129	0.2
130	0.2
131	0.19
132	0.17
133	0.15
134	0.14
135	0.08
136	0.08
137	0.09
138	0.14
139	0.14
140	0.15
141	0.16
142	0.19
143	0.26
144	0.26
145	0.28
146	0.23
147	0.25
148	0.26
149	0.27
150	0.25
151	0.2
152	0.22
153	0.19
154	0.21
155	0.2
156	0.18
157	0.15
158	0.14
159	0.12
160	0.1
161	0.11
162	0.08
163	0.07
164	0.08
165	0.08
166	0.08
167	0.08
168	0.08
169	0.06
170	0.07
171	0.07
172	0.05
173	0.08
174	0.12
175	0.14
176	0.16
177	0.17
178	0.19
179	0.19
180	0.21
181	0.25
182	0.22
183	0.23
184	0.23
185	0.28
186	0.29
187	0.31
188	0.32
189	0.27
190	0.27
191	0.24
192	0.22
193	0.17
194	0.14
195	0.11
196	0.09
197	0.08
198	0.07
199	0.06
200	0.05
201	0.06
202	0.05
203	0.04
204	0.04
205	0.04
206	0.05
207	0.05
208	0.05
209	0.05
210	0.04
211	0.05
212	0.05
213	0.06
214	0.09
215	0.09
216	0.09
217	0.12
218	0.13
219	0.15
220	0.16
221	0.17
222	0.18
223	0.2
224	0.21
225	0.18
226	0.2
227	0.19
228	0.19
229	0.18
230	0.14
231	0.12
232	0.12
233	0.12
234	0.13
235	0.12
236	0.14
237	0.19
238	0.2
239	0.21
240	0.27
241	0.28
242	0.28
243	0.3
244	0.3
245	0.28
246	0.27
247	0.28
248	0.27
249	0.29
250	0.28
251	0.3
252	0.29
253	0.27
254	0.26
255	0.26
256	0.2
257	0.18
258	0.18
259	0.16
260	0.13
261	0.14
262	0.15
263	0.13
264	0.14
265	0.17
266	0.21
267	0.23
268	0.28
269	0.36
270	0.41
271	0.49
272	0.59
273	0.63
274	0.66
275	0.68
276	0.66
277	0.65
278	0.64
279	0.58
280	0.48
281	0.42
282	0.33
283	0.28
284	0.23
285	0.16
286	0.11
287	0.09
288	0.09
289	0.09
290	0.09
291	0.09
292	0.08
293	0.08
294	0.07
295	0.06
296	0.06
297	0.05
298	0.05
299	0.06
300	0.06
301	0.06
302	0.06
303	0.06
304	0.07
305	0.08
306	0.15
307	0.17
308	0.19
309	0.26
310	0.36
311	0.45
312	0.55
313	0.6
314	0.58
315	0.66
316	0.75
317	0.77
318	0.75
319	0.76
320	0.74
321	0.76
322	0.78
323	0.73
324	0.72
325	0.69
326	0.63
327	0.55
328	0.49
329	0.42
330	0.36
331	0.33
332	0.22
333	0.15
334	0.15
335	0.11
336	0.11
337	0.11
338	0.12
339	0.18
340	0.19
341	0.2
342	0.27
343	0.29
344	0.31
345	0.31
346	0.3
347	0.28
348	0.35
349	0.41
350	0.4
351	0.4
352	0.44
353	0.44
354	0.51
355	0.52
356	0.48
357	0.45
358	0.45
359	0.46
360	0.44
361	0.5
362	0.53
363	0.57
364	0.63
365	0.68
366	0.73
367	0.77
368	0.81
369	0.81
370	0.81
371	0.8
372	0.79
373	0.81
374	0.79
375	0.75
376	0.68
377	0.6
378	0.5
379	0.41
380	0.3
381	0.21
382	0.12
383	0.11
384	0.1
385	0.09
386	0.09
387	0.08
388	0.08
389	0.09
390	0.1
391	0.1
392	0.1
393	0.12
394	0.17
395	0.17
396	0.17
397	0.22
398	0.24
399	0.26
400	0.33
401	0.37
402	0.38
403	0.4
404	0.45
405	0.41
406	0.39
407	0.37
408	0.37
409	0.36
410	0.33
411	0.33
412	0.34
413	0.41
414	0.45
415	0.46
416	0.39
417	0.38
418	0.41
419	0.42
420	0.4
421	0.31
422	0.28
423	0.26
424	0.29
425	0.28
426	0.23
427	0.21
428	0.19
429	0.21
430	0.19
431	0.19
432	0.17
433	0.21
434	0.26
435	0.28
436	0.31
437	0.3
438	0.3
439	0.32
440	0.33
441	0.32
442	0.29
443	0.27
444	0.22
445	0.23
446	0.23
447	0.22
448	0.22
449	0.19
450	0.18
451	0.2
452	0.2
453	0.25
454	0.24
455	0.24
456	0.22
457	0.21
458	0.19
459	0.18
460	0.16
461	0.1
462	0.12
463	0.13
464	0.14
465	0.15
466	0.15
467	0.14
468	0.15
469	0.15
470	0.13
471	0.13
472	0.1
473	0.1
474	0.11
475	0.15
476	0.15
477	0.15
478	0.16
479	0.15
480	0.14
481	0.13
482	0.14
483	0.09
484	0.12
485	0.14
486	0.16
487	0.19
488	0.22
489	0.26
490	0.27
491	0.37
492	0.41
493	0.41
494	0.4
495	0.41
496	0.47
497	0.48
498	0.46
499	0.37
500	0.32
501	0.32
502	0.29
503	0.23
504	0.17
505	0.12
506	0.15
507	0.15
508	0.13
509	0.11
510	0.11
511	0.14
512	0.12
513	0.14
514	0.13
515	0.11
516	0.13
517	0.16
518	0.16
519	0.14
520	0.14
521	0.12
522	0.11
523	0.11
524	0.09
525	0.05
526	0.05
527	0.05
528	0.06
529	0.05
530	0.05
531	0.06
532	0.06
533	0.06
534	0.06
535	0.06
536	0.06
537	0.07
538	0.06
539	0.07
540	0.08
541	0.08
542	0.08
543	0.09
544	0.09
545	0.15
546	0.16
547	0.17
548	0.18
549	0.21
550	0.24
551	0.29
552	0.3
553	0.27
554	0.27
555	0.26
556	0.25
557	0.21
558	0.19
559	0.16
560	0.15
561	0.14
562	0.15
563	0.18
564	0.18
565	0.2
566	0.2
567	0.19
568	0.26
569	0.25
570	0.29
571	0.26
572	0.27
573	0.25
574	0.26
575	0.25
576	0.17
577	0.16
578	0.11
579	0.09
580	0.08
581	0.08
582	0.07
583	0.07
584	0.07
585	0.07
586	0.06
587	0.06
588	0.06
589	0.07
590	0.1
591	0.1
592	0.12
593	0.11
594	0.12
595	0.13
596	0.14
597	0.13
598	0.11
599	0.1
600	0.1
601	0.1
602	0.1
603	0.12
604	0.12
605	0.11
606	0.11
607	0.11
608	0.11
609	0.11
610	0.12
611	0.1
612	0.11
613	0.12
614	0.21
615	0.21
616	0.22
617	0.21
618	0.21
619	0.2
620	0.17
621	0.19
622	0.11
623	0.19
624	0.22
625	0.23
626	0.24
627	0.25
628	0.29
629	0.3
630	0.38
631	0.39
632	0.43
633	0.44
634	0.45
635	0.47
636	0.43
637	0.39
638	0.3
639	0.2
640	0.12
641	0.1
642	0.08
643	0.04
644	0.04
645	0.03
646	0.03
647	0.03
648	0.03
649	0.04
650	0.05
651	0.08
652	0.1
653	0.11
654	0.11
655	0.14
656	0.15
657	0.17
658	0.16
659	0.15
660	0.14
661	0.17
662	0.2
663	0.21
664	0.2
665	0.18
666	0.18
667	0.18
668	0.18
669	0.15
670	0.12
671	0.1
672	0.1
673	0.13
674	0.15
675	0.14
676	0.13
677	0.13
678	0.12
679	0.11
680	0.11
681	0.08
682	0.05
683	0.06
684	0.11
685	0.14
686	0.16
687	0.17
688	0.17
689	0.18
690	0.19
691	0.23
692	0.2
693	0.18
694	0.19
695	0.19
696	0.19
697	0.2
698	0.2
699	0.15
700	0.13
701	0.12
702	0.11
703	0.1
704	0.09
705	0.09
706	0.11
707	0.14
708	0.17
709	0.24
710	0.25
711	0.28
712	0.33
713	0.34
714	0.36
715	0.42
716	0.48
717	0.52
718	0.59
719	0.57
720	0.56
721	0.6
722	0.57
723	0.53
724	0.51
725	0.46
726	0.45
727	0.47
728	0.49
729	0.45
730	0.44
731	0.4
732	0.32
733	0.25
734	0.19
735	0.18
736	0.12
737	0.12
738	0.13
739	0.14
740	0.16
741	0.19
742	0.2
743	0.2
744	0.23
745	0.27
746	0.26
747	0.25
748	0.25
749	0.22
750	0.21
751	0.18
752	0.14
753	0.11
754	0.1
755	0.13
756	0.12
757	0.13
758	0.14
759	0.18
760	0.21
761	0.22
762	0.25
763	0.29
764	0.34
765	0.39
766	0.46
767	0.48
768	0.45
769	0.44
770	0.47
771	0.42
772	0.39
773	0.38
774	0.3
775	0.27
776	0.31
777	0.31
778	0.26
779	0.24
780	0.22
781	0.18
782	0.18
783	0.22
784	0.17
785	0.16
786	0.17
787	0.19
788	0.2
789	0.2
790	0.2
791	0.18
792	0.2
793	0.25
794	0.27
795	0.31
796	0.33
797	0.34
798	0.34
799	0.38
800	0.38
801	0.37
802	0.39
803	0.37
804	0.34
805	0.35
806	0.34
807	0.26
808	0.24
809	0.2
810	0.19
811	0.17
812	0.21
813	0.19
814	0.19
815	0.22
816	0.23
817	0.25
818	0.27
819	0.29
820	0.25
821	0.3
822	0.3
823	0.35
824	0.36
825	0.34
826	0.36
827	0.33
828	0.33
829	0.32
830	0.37

A0A4U0WGK6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer