Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0X544

Protein Details
Accession A0A4U0X544    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
8-31SIPTSSDRRSHRPTKKRALTPVSQHydrophilic
126-147VSERNRAKREKAKLRAKKGKAGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
116-150KAEQRRRDEEVSERNRAKREKAKLRAKKGKAGKAG
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12, cyto 4.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009548  Prkrip1  
Gene Ontology GO:0003725  F:double-stranded RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF06658  DUF1168  
Amino Acid Sequences MSEPIPESIPTSSDRRSHRPTKKRALTPVSQQSAQVEALFAHPDRPINLPPSSTSLGKNLAPPLEIVTNVQGSSAGAGSGEFHVYKASRRREYERLRVMDEEVAREEADREFEAKKAEQRRRDEEVSERNRAKREKAKLRAKKGKAGKAGQGGGVVEEGGGNSAGGDGGVKKKLAPRKMDLTERDADGRADGHEAREAMRQDGQASGEDGGGITFHDED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.43
3 0.51
4 0.6
5 0.67
6 0.73
7 0.78
8 0.83
9 0.87
10 0.86
11 0.87
12 0.84
13 0.8
14 0.79
15 0.79
16 0.73
17 0.64
18 0.56
19 0.47
20 0.42
21 0.37
22 0.26
23 0.17
24 0.12
25 0.12
26 0.14
27 0.12
28 0.11
29 0.12
30 0.13
31 0.14
32 0.17
33 0.19
34 0.21
35 0.22
36 0.22
37 0.22
38 0.27
39 0.28
40 0.26
41 0.24
42 0.23
43 0.25
44 0.24
45 0.26
46 0.22
47 0.2
48 0.19
49 0.18
50 0.18
51 0.15
52 0.14
53 0.12
54 0.12
55 0.12
56 0.11
57 0.11
58 0.08
59 0.07
60 0.07
61 0.07
62 0.05
63 0.04
64 0.04
65 0.05
66 0.05
67 0.06
68 0.06
69 0.06
70 0.07
71 0.08
72 0.13
73 0.2
74 0.27
75 0.32
76 0.37
77 0.43
78 0.51
79 0.59
80 0.63
81 0.64
82 0.59
83 0.55
84 0.51
85 0.46
86 0.4
87 0.33
88 0.24
89 0.17
90 0.15
91 0.12
92 0.11
93 0.11
94 0.08
95 0.09
96 0.08
97 0.08
98 0.08
99 0.09
100 0.11
101 0.12
102 0.17
103 0.25
104 0.32
105 0.38
106 0.44
107 0.49
108 0.53
109 0.54
110 0.51
111 0.48
112 0.52
113 0.5
114 0.51
115 0.48
116 0.45
117 0.49
118 0.49
119 0.49
120 0.47
121 0.52
122 0.55
123 0.62
124 0.7
125 0.74
126 0.83
127 0.86
128 0.81
129 0.79
130 0.77
131 0.75
132 0.72
133 0.66
134 0.61
135 0.57
136 0.54
137 0.45
138 0.38
139 0.3
140 0.22
141 0.18
142 0.12
143 0.06
144 0.05
145 0.04
146 0.04
147 0.04
148 0.03
149 0.03
150 0.03
151 0.03
152 0.03
153 0.04
154 0.05
155 0.08
156 0.1
157 0.1
158 0.12
159 0.18
160 0.26
161 0.33
162 0.38
163 0.41
164 0.49
165 0.55
166 0.62
167 0.59
168 0.57
169 0.54
170 0.5
171 0.46
172 0.38
173 0.31
174 0.24
175 0.21
176 0.16
177 0.17
178 0.15
179 0.14
180 0.16
181 0.16
182 0.17
183 0.22
184 0.23
185 0.21
186 0.24
187 0.24
188 0.22
189 0.24
190 0.23
191 0.19
192 0.19
193 0.17
194 0.13
195 0.13
196 0.11
197 0.09
198 0.08
199 0.07