FuNGI

A0A4U0XD34

Protein Details

Accession

A0A4U0XD34

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-20	MGKKRRRERDRPKGAPEAFY	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
3-14	KKRRRERDRPKG

Subcellular Location(s)

mito 11, nucl 9, cyto 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR035426 Gemin2/Brr1
Gene Ontology	GO:0000387 P:spliceosomal snRNP assembly
Pfam	View protein in Pfam PF04938 SIP1

Amino Acid Sequences

MGKKRRRERDRPKGAPEAFYNPNKRVLLSYASDDEHEDGLEQAAGTGHPGAIDNVTANYQIAAYRDDDEQSLGEDDAVGPVPDSVDATGGSKKTDEEPNESGIFSRGTTKDPTTGQWPALGSTPYQWEEEEDEEGFVYESTEEEAMAYLRAVRNERQTMPAVFHAPYHDEAEELYSSGVGDGRGYFEDGAYVGRPIIGPTMPESARTMVEPQEAYTRALKQRFLETREGMHVKPDSAALATLDEKHPTAFIDGNNKAHASWLRLLKTGMPHPVQVQTLDIGSVGRLLELIMQLFLVREQHLAKITSVWIWSLLARLDEVGTMSNDEVYAIREFGKKAVLVQLSLHDPAAAAQLEGVSWSPEAVPVSTNSAVARNETDGDEPAPEIDQSLPKTPDTDSSAAENTLATLDMIITIVGEVFGQRDLLEFRRPM

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.82
2	0.77
3	0.7
4	0.66
5	0.62
6	0.62
7	0.6
8	0.52
9	0.57
10	0.51
11	0.47
12	0.43
13	0.39
14	0.36
15	0.32
16	0.35
17	0.3
18	0.31
19	0.3
20	0.29
21	0.27
22	0.22
23	0.19
24	0.14
25	0.11
26	0.11
27	0.11
28	0.09
29	0.07
30	0.07
31	0.07
32	0.07
33	0.07
34	0.07
35	0.07
36	0.07
37	0.08
38	0.08
39	0.09
40	0.08
41	0.09
42	0.1
43	0.1
44	0.09
45	0.09
46	0.08
47	0.09
48	0.1
49	0.1
50	0.11
51	0.13
52	0.14
53	0.15
54	0.15
55	0.15
56	0.14
57	0.14
58	0.13
59	0.11
60	0.1
61	0.09
62	0.09
63	0.09
64	0.09
65	0.07
66	0.06
67	0.06
68	0.06
69	0.06
70	0.07
71	0.06
72	0.06
73	0.06
74	0.08
75	0.12
76	0.12
77	0.13
78	0.13
79	0.14
80	0.17
81	0.24
82	0.26
83	0.29
84	0.31
85	0.35
86	0.35
87	0.34
88	0.3
89	0.24
90	0.21
91	0.15
92	0.19
93	0.16
94	0.17
95	0.21
96	0.22
97	0.25
98	0.26
99	0.28
100	0.27
101	0.29
102	0.26
103	0.25
104	0.24
105	0.21
106	0.22
107	0.2
108	0.15
109	0.14
110	0.18
111	0.17
112	0.17
113	0.16
114	0.15
115	0.17
116	0.18
117	0.18
118	0.14
119	0.13
120	0.12
121	0.12
122	0.11
123	0.08
124	0.07
125	0.05
126	0.04
127	0.05
128	0.05
129	0.05
130	0.05
131	0.05
132	0.05
133	0.05
134	0.05
135	0.06
136	0.08
137	0.1
138	0.13
139	0.15
140	0.22
141	0.26
142	0.28
143	0.29
144	0.31
145	0.29
146	0.29
147	0.28
148	0.24
149	0.2
150	0.19
151	0.17
152	0.16
153	0.17
154	0.16
155	0.14
156	0.12
157	0.11
158	0.13
159	0.11
160	0.09
161	0.08
162	0.06
163	0.06
164	0.06
165	0.06
166	0.04
167	0.04
168	0.04
169	0.06
170	0.06
171	0.07
172	0.07
173	0.06
174	0.06
175	0.06
176	0.06
177	0.05
178	0.05
179	0.04
180	0.05
181	0.05
182	0.05
183	0.06
184	0.06
185	0.06
186	0.07
187	0.12
188	0.11
189	0.12
190	0.13
191	0.13
192	0.13
193	0.14
194	0.13
195	0.1
196	0.12
197	0.11
198	0.11
199	0.13
200	0.14
201	0.15
202	0.15
203	0.18
204	0.21
205	0.23
206	0.24
207	0.22
208	0.29
209	0.32
210	0.34
211	0.35
212	0.32
213	0.31
214	0.34
215	0.35
216	0.27
217	0.26
218	0.23
219	0.18
220	0.17
221	0.16
222	0.11
223	0.09
224	0.09
225	0.06
226	0.07
227	0.07
228	0.08
229	0.08
230	0.09
231	0.09
232	0.09
233	0.09
234	0.08
235	0.09
236	0.1
237	0.11
238	0.18
239	0.2
240	0.21
241	0.22
242	0.22
243	0.2
244	0.21
245	0.2
246	0.16
247	0.19
248	0.23
249	0.23
250	0.24
251	0.25
252	0.25
253	0.27
254	0.27
255	0.28
256	0.24
257	0.24
258	0.24
259	0.27
260	0.25
261	0.21
262	0.18
263	0.13
264	0.12
265	0.11
266	0.09
267	0.06
268	0.05
269	0.06
270	0.05
271	0.04
272	0.04
273	0.04
274	0.05
275	0.06
276	0.06
277	0.05
278	0.05
279	0.05
280	0.05
281	0.06
282	0.06
283	0.06
284	0.08
285	0.09
286	0.11
287	0.14
288	0.15
289	0.15
290	0.15
291	0.16
292	0.15
293	0.15
294	0.13
295	0.1
296	0.1
297	0.1
298	0.1
299	0.1
300	0.08
301	0.08
302	0.08
303	0.08
304	0.07
305	0.07
306	0.07
307	0.07
308	0.08
309	0.08
310	0.07
311	0.07
312	0.07
313	0.07
314	0.08
315	0.09
316	0.08
317	0.11
318	0.13
319	0.14
320	0.14
321	0.17
322	0.15
323	0.16
324	0.22
325	0.21
326	0.19
327	0.2
328	0.22
329	0.22
330	0.22
331	0.21
332	0.13
333	0.12
334	0.12
335	0.14
336	0.11
337	0.08
338	0.08
339	0.08
340	0.07
341	0.08
342	0.08
343	0.06
344	0.05
345	0.06
346	0.06
347	0.08
348	0.09
349	0.09
350	0.1
351	0.1
352	0.16
353	0.16
354	0.17
355	0.16
356	0.19
357	0.19
358	0.2
359	0.21
360	0.17
361	0.18
362	0.19
363	0.19
364	0.17
365	0.18
366	0.17
367	0.15
368	0.14
369	0.13
370	0.11
371	0.11
372	0.12
373	0.16
374	0.18
375	0.25
376	0.26
377	0.26
378	0.27
379	0.27
380	0.31
381	0.32
382	0.32
383	0.27
384	0.29
385	0.31
386	0.29
387	0.28
388	0.22
389	0.16
390	0.14
391	0.13
392	0.08
393	0.06
394	0.06
395	0.06
396	0.06
397	0.05
398	0.05
399	0.04
400	0.04
401	0.04
402	0.04
403	0.04
404	0.05
405	0.06
406	0.06
407	0.06
408	0.08
409	0.12
410	0.16

A0A4U0XD34

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer