FuNGI

A0A4U0XVT1

Protein Details

Accession

A0A4U0XVT1

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
47-67	ELYASTPKQKRRRVEVEDEAE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 12.5, cyto_nucl 10.5, cyto 7.5, pero 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027417 P-loop_NTPase IPR003395 RecF/RecN/SMC_N IPR027131 SMC5
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0030915 C:Smc5-Smc6 complex GO:0005524 F:ATP binding GO:0016887 F:ATP hydrolysis activity GO:0000724 P:double-strand break repair via homologous recombination
Pfam	View protein in Pfam PF02463 SMC_N

Amino Acid Sequences

MDDAPLTPTTSPSSATAMSHSSVDRRRRRSIESLNGGDESLNETDEELYASTPKQKRRRVEVEDEAEPEEFDVSEDGVGSQEGSLLPDSYRRSPKGNGKGPARQTGKHQPGSIVRVRLHDFVTYSNAEFNPGPNLNMVIGPNGTGKSTLVCAICLGLGWKPDNLGRAKNIGEFVKHGAKQAEIEIELAADPAKHASNITVKTRIWVGRKQAEFHVNGKKTTQQVLLKLMRSFSIQVDNLCQFLPQDRVVEFAGLSPVRLLTETLQAAAPPQMYDWHRELKDLRKEQKSRLDDQQLNLNNLANNERRQNDQHAQVERLRERLILQERVAALDKLKPFPRYRQAQRQFHEAKTRHKDADKDLKQLQRQAEPNLKAEKAKEAYMKRVNVVVEKRGKLVERGEQNASRINTGIEASEEKVKDCETELKNERKVAEAARNGMPKLNDEKAKLERAMQNPPEDVDFADYNERTREKTREIRAIDDRIQEIGQEKGSLGQLIRQREQVVDRAEAEKASLNTQAGQQANKLRLVARDTYVAWEWIQRNGNRFQGEIYGPPIVSCSVKNPRNAAAVESVLGLGEMSAFTATSREDYSRLSNALYGELKLDSIYIRQSSQPLAAFKPPTSPEHLNSLGLEGWILDLLDGPEPVLAMLCDNRNIHSTAYANQNLSLAAMDALKAPNSPVTSWVTPEGTCRVTRRREYGDKASSTQATALKKAKYFTDAPASANEDAELDERVADARRAMEEYGEQKRRLSDEYGEKAAQKKELETSKRAIEDEKARKQRALAEFNALPTKLQGVQRKIDEATEKIEGSVRKRREIVDRGDELTIEKGQLAIDYANAVNSLRDLIVSHVEAQIWGIEARSDVEKLKARTVEEKERLKAREIEVAQLLEVKARTKAAGEELRGACQQVGLLFERDEKLRDVHDEIEEKAWDPAQLDTEIESLHARLDMTDGGPGGQHMLREYEERAKKIEMLIKKRDSVQADLEELEGRIAEIRGQWEPRLDELVAEISDAFAENFGRIQCVGEVGVHKDEDFELWAIQIRVKFRDNEPLSLLDAHRQSGGERAVSTIFYLMALQRLTRAPFRVVDEINQGMDPRNERLVHSRMVEIACGNGEEGGGGGSQYFLITPKLLPGLEYREGMRVLCIASGDFMPGDYQKLDFGRLARRAVEVRGGA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.21
2	0.22
3	0.23
4	0.21
5	0.22
6	0.22
7	0.22
8	0.26
9	0.32
10	0.42
11	0.49
12	0.54
13	0.62
14	0.66
15	0.72
16	0.75
17	0.77
18	0.77
19	0.77
20	0.74
21	0.67
22	0.61
23	0.54
24	0.44
25	0.34
26	0.27
27	0.18
28	0.14
29	0.11
30	0.11
31	0.12
32	0.12
33	0.12
34	0.09
35	0.09
36	0.1
37	0.12
38	0.21
39	0.27
40	0.36
41	0.45
42	0.53
43	0.62
44	0.7
45	0.79
46	0.79
47	0.82
48	0.83
49	0.79
50	0.75
51	0.68
52	0.59
53	0.49
54	0.4
55	0.31
56	0.21
57	0.14
58	0.11
59	0.09
60	0.07
61	0.07
62	0.07
63	0.07
64	0.07
65	0.07
66	0.07
67	0.06
68	0.07
69	0.07
70	0.08
71	0.09
72	0.09
73	0.1
74	0.15
75	0.2
76	0.27
77	0.35
78	0.36
79	0.4
80	0.48
81	0.58
82	0.63
83	0.68
84	0.68
85	0.68
86	0.74
87	0.75
88	0.77
89	0.71
90	0.63
91	0.62
92	0.65
93	0.66
94	0.63
95	0.58
96	0.54
97	0.56
98	0.61
99	0.59
100	0.54
101	0.47
102	0.47
103	0.49
104	0.46
105	0.4
106	0.35
107	0.3
108	0.26
109	0.29
110	0.25
111	0.22
112	0.24
113	0.22
114	0.23
115	0.22
116	0.21
117	0.24
118	0.23
119	0.23
120	0.19
121	0.2
122	0.18
123	0.19
124	0.19
125	0.13
126	0.12
127	0.12
128	0.14
129	0.13
130	0.13
131	0.11
132	0.11
133	0.11
134	0.12
135	0.15
136	0.14
137	0.13
138	0.13
139	0.13
140	0.13
141	0.11
142	0.11
143	0.09
144	0.12
145	0.13
146	0.13
147	0.15
148	0.17
149	0.22
150	0.25
151	0.27
152	0.26
153	0.29
154	0.31
155	0.31
156	0.34
157	0.3
158	0.28
159	0.26
160	0.28
161	0.32
162	0.32
163	0.32
164	0.3
165	0.29
166	0.28
167	0.28
168	0.26
169	0.18
170	0.18
171	0.15
172	0.14
173	0.12
174	0.11
175	0.09
176	0.06
177	0.06
178	0.07
179	0.08
180	0.08
181	0.08
182	0.11
183	0.18
184	0.23
185	0.28
186	0.31
187	0.31
188	0.32
189	0.38
190	0.4
191	0.39
192	0.4
193	0.44
194	0.47
195	0.5
196	0.51
197	0.52
198	0.53
199	0.51
200	0.51
201	0.53
202	0.47
203	0.45
204	0.44
205	0.43
206	0.39
207	0.4
208	0.41
209	0.35
210	0.37
211	0.44
212	0.48
213	0.46
214	0.44
215	0.4
216	0.34
217	0.31
218	0.29
219	0.22
220	0.24
221	0.21
222	0.21
223	0.25
224	0.25
225	0.24
226	0.22
227	0.2
228	0.14
229	0.15
230	0.18
231	0.15
232	0.16
233	0.16
234	0.18
235	0.19
236	0.19
237	0.16
238	0.12
239	0.16
240	0.13
241	0.13
242	0.11
243	0.11
244	0.1
245	0.11
246	0.11
247	0.08
248	0.14
249	0.14
250	0.14
251	0.14
252	0.14
253	0.14
254	0.15
255	0.14
256	0.09
257	0.09
258	0.14
259	0.15
260	0.2
261	0.22
262	0.29
263	0.28
264	0.32
265	0.36
266	0.39
267	0.48
268	0.53
269	0.58
270	0.6
271	0.64
272	0.69
273	0.74
274	0.7
275	0.66
276	0.66
277	0.67
278	0.6
279	0.58
280	0.59
281	0.53
282	0.5
283	0.45
284	0.38
285	0.29
286	0.26
287	0.3
288	0.24
289	0.23
290	0.26
291	0.27
292	0.3
293	0.33
294	0.39
295	0.4
296	0.44
297	0.48
298	0.46
299	0.48
300	0.47
301	0.51
302	0.45
303	0.42
304	0.35
305	0.29
306	0.26
307	0.3
308	0.34
309	0.3
310	0.29
311	0.3
312	0.29
313	0.3
314	0.31
315	0.23
316	0.18
317	0.19
318	0.21
319	0.23
320	0.26
321	0.3
322	0.32
323	0.39
324	0.48
325	0.52
326	0.59
327	0.65
328	0.72
329	0.75
330	0.75
331	0.77
332	0.72
333	0.67
334	0.68
335	0.61
336	0.61
337	0.61
338	0.63
339	0.57
340	0.56
341	0.56
342	0.54
343	0.61
344	0.55
345	0.53
346	0.54
347	0.56
348	0.55
349	0.57
350	0.52
351	0.47
352	0.46
353	0.46
354	0.49
355	0.45
356	0.46
357	0.45
358	0.42
359	0.37
360	0.34
361	0.35
362	0.29
363	0.3
364	0.32
365	0.31
366	0.38
367	0.43
368	0.44
369	0.37
370	0.38
371	0.36
372	0.35
373	0.35
374	0.34
375	0.35
376	0.34
377	0.34
378	0.34
379	0.34
380	0.3
381	0.31
382	0.3
383	0.28
384	0.31
385	0.34
386	0.33
387	0.34
388	0.36
389	0.33
390	0.27
391	0.22
392	0.19
393	0.15
394	0.14
395	0.13
396	0.08
397	0.09
398	0.1
399	0.14
400	0.14
401	0.14
402	0.14
403	0.14
404	0.13
405	0.14
406	0.21
407	0.18
408	0.27
409	0.33
410	0.4
411	0.42
412	0.45
413	0.43
414	0.37
415	0.37
416	0.32
417	0.33
418	0.28
419	0.29
420	0.31
421	0.32
422	0.3
423	0.3
424	0.27
425	0.22
426	0.25
427	0.26
428	0.25
429	0.25
430	0.29
431	0.31
432	0.34
433	0.32
434	0.32
435	0.34
436	0.34
437	0.41
438	0.39
439	0.37
440	0.33
441	0.33
442	0.29
443	0.23
444	0.19
445	0.14
446	0.12
447	0.11
448	0.14
449	0.13
450	0.13
451	0.16
452	0.17
453	0.16
454	0.2
455	0.23
456	0.26
457	0.34
458	0.39
459	0.45
460	0.45
461	0.48
462	0.49
463	0.5
464	0.47
465	0.41
466	0.36
467	0.29
468	0.27
469	0.22
470	0.18
471	0.15
472	0.11
473	0.09
474	0.08
475	0.09
476	0.09
477	0.09
478	0.08
479	0.11
480	0.15
481	0.19
482	0.2
483	0.2
484	0.2
485	0.21
486	0.23
487	0.24
488	0.22
489	0.2
490	0.2
491	0.19
492	0.19
493	0.17
494	0.16
495	0.13
496	0.11
497	0.11
498	0.11
499	0.1
500	0.11
501	0.12
502	0.16
503	0.15
504	0.14
505	0.16
506	0.19
507	0.2
508	0.2
509	0.2
510	0.16
511	0.17
512	0.2
513	0.19
514	0.16
515	0.16
516	0.16
517	0.18
518	0.17
519	0.15
520	0.12
521	0.15
522	0.15
523	0.18
524	0.22
525	0.22
526	0.25
527	0.27
528	0.32
529	0.28
530	0.27
531	0.23
532	0.21
533	0.2
534	0.17
535	0.16
536	0.13
537	0.12
538	0.11
539	0.11
540	0.09
541	0.09
542	0.08
543	0.12
544	0.2
545	0.24
546	0.27
547	0.28
548	0.3
549	0.32
550	0.32
551	0.28
552	0.21
553	0.17
554	0.15
555	0.14
556	0.11
557	0.07
558	0.07
559	0.05
560	0.03
561	0.03
562	0.02
563	0.02
564	0.02
565	0.02
566	0.02
567	0.03
568	0.03
569	0.04
570	0.06
571	0.06
572	0.07
573	0.09
574	0.11
575	0.12
576	0.13
577	0.12
578	0.13
579	0.12
580	0.14
581	0.12
582	0.1
583	0.1
584	0.09
585	0.09
586	0.07
587	0.07
588	0.05
589	0.05
590	0.07
591	0.07
592	0.08
593	0.08
594	0.1
595	0.1
596	0.12
597	0.14
598	0.14
599	0.15
600	0.18
601	0.18
602	0.17
603	0.21
604	0.21
605	0.2
606	0.25
607	0.26
608	0.24
609	0.29
610	0.29
611	0.25
612	0.23
613	0.22
614	0.16
615	0.13
616	0.11
617	0.06
618	0.05
619	0.04
620	0.04
621	0.03
622	0.03
623	0.03
624	0.04
625	0.04
626	0.04
627	0.04
628	0.04
629	0.04
630	0.04
631	0.03
632	0.03
633	0.05
634	0.05
635	0.08
636	0.09
637	0.1
638	0.12
639	0.13
640	0.13
641	0.13
642	0.14
643	0.14
644	0.2
645	0.21
646	0.2
647	0.19
648	0.19
649	0.17
650	0.16
651	0.13
652	0.06
653	0.05
654	0.05
655	0.05
656	0.05
657	0.06
658	0.06
659	0.06
660	0.06
661	0.08
662	0.09
663	0.09
664	0.1
665	0.15
666	0.15
667	0.16
668	0.18
669	0.17
670	0.16
671	0.17
672	0.18
673	0.15
674	0.16
675	0.19
676	0.24
677	0.3
678	0.34
679	0.38
680	0.43
681	0.48
682	0.53
683	0.58
684	0.58
685	0.53
686	0.51
687	0.48
688	0.41
689	0.34
690	0.3
691	0.26
692	0.2
693	0.23
694	0.25
695	0.25
696	0.27
697	0.27
698	0.25
699	0.26
700	0.26
701	0.25
702	0.28
703	0.27
704	0.26
705	0.27
706	0.29
707	0.25
708	0.23
709	0.2
710	0.12
711	0.11
712	0.11
713	0.09
714	0.06
715	0.06
716	0.06
717	0.06
718	0.07
719	0.07
720	0.07
721	0.07
722	0.08
723	0.09
724	0.09
725	0.09
726	0.11
727	0.16
728	0.25
729	0.29
730	0.28
731	0.28
732	0.3
733	0.31
734	0.31
735	0.28
736	0.26
737	0.3
738	0.33
739	0.36
740	0.35
741	0.34
742	0.36
743	0.35
744	0.33
745	0.25
746	0.22
747	0.25
748	0.32
749	0.35
750	0.34
751	0.36
752	0.36
753	0.37
754	0.36
755	0.31
756	0.29
757	0.34
758	0.4
759	0.46
760	0.51
761	0.5
762	0.51
763	0.51
764	0.53
765	0.51
766	0.48
767	0.39
768	0.37
769	0.36
770	0.38
771	0.38
772	0.3
773	0.22
774	0.17
775	0.17
776	0.16
777	0.21
778	0.26
779	0.28
780	0.32
781	0.34
782	0.36
783	0.34
784	0.33
785	0.3
786	0.24
787	0.23
788	0.21
789	0.19
790	0.17
791	0.2
792	0.2
793	0.23
794	0.3
795	0.3
796	0.32
797	0.34
798	0.37
799	0.43
800	0.47
801	0.49
802	0.48
803	0.48
804	0.46
805	0.44
806	0.41
807	0.33
808	0.28
809	0.21
810	0.13
811	0.1
812	0.08
813	0.08
814	0.08
815	0.08
816	0.06
817	0.05
818	0.07
819	0.07
820	0.07
821	0.07
822	0.07
823	0.06
824	0.06
825	0.07
826	0.05
827	0.05
828	0.06
829	0.07
830	0.09
831	0.1
832	0.11
833	0.11
834	0.11
835	0.11
836	0.11
837	0.09
838	0.08
839	0.07
840	0.06
841	0.05
842	0.06
843	0.07
844	0.08
845	0.09
846	0.09
847	0.15
848	0.2
849	0.22
850	0.27
851	0.28
852	0.29
853	0.37
854	0.42
855	0.47
856	0.5
857	0.54
858	0.53
859	0.57
860	0.57
861	0.53
862	0.52
863	0.43
864	0.44
865	0.39
866	0.37
867	0.33
868	0.31
869	0.27
870	0.24
871	0.22
872	0.15
873	0.15
874	0.13
875	0.12
876	0.12
877	0.13
878	0.12
879	0.13
880	0.19
881	0.23
882	0.24
883	0.3
884	0.3
885	0.33
886	0.32
887	0.31
888	0.23
889	0.18
890	0.17
891	0.1
892	0.12
893	0.11
894	0.12
895	0.12
896	0.14
897	0.16
898	0.16
899	0.18
900	0.17
901	0.16
902	0.17
903	0.2
904	0.2
905	0.21
906	0.25
907	0.25
908	0.24
909	0.26
910	0.24
911	0.22
912	0.2
913	0.18
914	0.14
915	0.13
916	0.13
917	0.12
918	0.13
919	0.12
920	0.12
921	0.12
922	0.11
923	0.11
924	0.11
925	0.08
926	0.08
927	0.08
928	0.07
929	0.07
930	0.08
931	0.09
932	0.08
933	0.1
934	0.09
935	0.08
936	0.09
937	0.08
938	0.1
939	0.09
940	0.09
941	0.09
942	0.11
943	0.12
944	0.15
945	0.18
946	0.25
947	0.29
948	0.3
949	0.33
950	0.32
951	0.32
952	0.35
953	0.39
954	0.38
955	0.42
956	0.5
957	0.51
958	0.52
959	0.54
960	0.56
961	0.52
962	0.47
963	0.45
964	0.38
965	0.36
966	0.33
967	0.31
968	0.25
969	0.22
970	0.18
971	0.11
972	0.08
973	0.08
974	0.08
975	0.08
976	0.09
977	0.12
978	0.16
979	0.19
980	0.2
981	0.23
982	0.25
983	0.25
984	0.27
985	0.24
986	0.2
987	0.19
988	0.2
989	0.16
990	0.14
991	0.12
992	0.08
993	0.08
994	0.09
995	0.07
996	0.05
997	0.06
998	0.06
999	0.08
1000	0.08
1001	0.1
1002	0.09
1003	0.11
1004	0.1
1005	0.11
1006	0.11
1007	0.12
1008	0.14
1009	0.16
1010	0.18
1011	0.17
1012	0.17
1013	0.17
1014	0.16
1015	0.15
1016	0.15
1017	0.12
1018	0.1
1019	0.1
1020	0.14
1021	0.13
1022	0.16
1023	0.18
1024	0.19
1025	0.23
1026	0.26
1027	0.29
1028	0.29
1029	0.39
1030	0.4
1031	0.41
1032	0.4
1033	0.38
1034	0.36
1035	0.36
1036	0.34
1037	0.3
1038	0.28
1039	0.25
1040	0.23
1041	0.21
1042	0.2
1043	0.23
1044	0.24
1045	0.2
1046	0.19
1047	0.2
1048	0.19
1049	0.19
1050	0.19
1051	0.14
1052	0.11
1053	0.09
1054	0.1
1055	0.09
1056	0.12
1057	0.12
1058	0.11
1059	0.14
1060	0.17
1061	0.21
1062	0.24
1063	0.27
1064	0.27
1065	0.3
1066	0.35
1067	0.39
1068	0.37
1069	0.37
1070	0.38
1071	0.36
1072	0.34
1073	0.31
1074	0.26
1075	0.23
1076	0.25
1077	0.25
1078	0.23
1079	0.28
1080	0.27
1081	0.3
1082	0.36
1083	0.38
1084	0.38
1085	0.38
1086	0.36
1087	0.33
1088	0.33
1089	0.32
1090	0.25
1091	0.22
1092	0.17
1093	0.15
1094	0.14
1095	0.1
1096	0.09
1097	0.07
1098	0.07
1099	0.06
1100	0.05
1101	0.05
1102	0.04
1103	0.04
1104	0.05
1105	0.05
1106	0.05
1107	0.06
1108	0.08
1109	0.09
1110	0.1
1111	0.13
1112	0.16
1113	0.16
1114	0.17
1115	0.2
1116	0.25
1117	0.28
1118	0.29
1119	0.27
1120	0.28
1121	0.29
1122	0.28
1123	0.25
1124	0.19
1125	0.16
1126	0.15
1127	0.14
1128	0.11
1129	0.12
1130	0.12
1131	0.12
1132	0.1
1133	0.1
1134	0.11
1135	0.11
1136	0.13
1137	0.13
1138	0.13
1139	0.16
1140	0.17
1141	0.2
1142	0.21
1143	0.24
1144	0.31
1145	0.35
1146	0.37
1147	0.35
1148	0.38
1149	0.38
1150	0.38

A0A4U0XVT1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer