Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0XYF8

Protein Details
Accession A0A4U0XYF8    Localization Confidence High Confidence Score 17.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
354-384RASAAKEGKEKREERKRRRKSRPNAGGTATSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
306-308KRR
315-324EKKTREAREK
334-376SPKPAEKVKPPTPPPVFTEARASAAKEGKEKREERKRRRKSRP
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007018  Mediator_Med6  
IPR038566  Mediator_Med6_sf  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF04934  Med6  
Amino Acid Sequences MTAPPPPPVDETISRRTDVLQWWLSDDKNGLPPPPYTWMEERFIHRYFTETPFFDWSTKNGLIFTHAQTNIPTYELIHNRKELEATLTKNPGVEYVISHEPQLVAKGPGVVEGQKSNVWVLRKQERLFGQQQGSSTPANSSSVTETRGTYYIINENVYQAPSVADVVENRLLSAVVGLEKMFGKAASLPSFTPTTGHTYLPSAKERKSASGSTAASTQGSPARSRSASLAPETAQSLRSGSLGATGDITSASGASAQSSDDLLATRLLADSLRQTSSHGDDFMDENPLIGEPGSLKFTFSSAAIKKRRADDEAAEKKTREAREKVLASGAASTSPKPAEKVKPPTPPPVFTEARASAAKEGKEKREERKRRRKSRPNAGGTATSPTTPKSATSALGSAG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.43
3 0.41
4 0.4
5 0.37
6 0.39
7 0.35
8 0.32
9 0.36
10 0.38
11 0.37
12 0.33
13 0.3
14 0.25
15 0.28
16 0.3
17 0.28
18 0.27
19 0.28
20 0.3
21 0.35
22 0.34
23 0.31
24 0.35
25 0.37
26 0.4
27 0.43
28 0.45
29 0.43
30 0.43
31 0.4
32 0.35
33 0.34
34 0.34
35 0.35
36 0.36
37 0.31
38 0.32
39 0.35
40 0.37
41 0.34
42 0.31
43 0.28
44 0.29
45 0.29
46 0.27
47 0.23
48 0.21
49 0.23
50 0.25
51 0.26
52 0.27
53 0.26
54 0.26
55 0.26
56 0.28
57 0.24
58 0.22
59 0.19
60 0.13
61 0.21
62 0.28
63 0.32
64 0.33
65 0.35
66 0.35
67 0.36
68 0.35
69 0.28
70 0.27
71 0.27
72 0.27
73 0.3
74 0.32
75 0.31
76 0.31
77 0.3
78 0.24
79 0.21
80 0.17
81 0.12
82 0.15
83 0.19
84 0.19
85 0.19
86 0.18
87 0.17
88 0.17
89 0.18
90 0.14
91 0.11
92 0.11
93 0.12
94 0.12
95 0.13
96 0.14
97 0.13
98 0.13
99 0.13
100 0.14
101 0.13
102 0.14
103 0.13
104 0.15
105 0.17
106 0.18
107 0.24
108 0.3
109 0.37
110 0.37
111 0.42
112 0.42
113 0.47
114 0.48
115 0.47
116 0.42
117 0.37
118 0.36
119 0.32
120 0.3
121 0.24
122 0.2
123 0.15
124 0.13
125 0.12
126 0.12
127 0.12
128 0.14
129 0.15
130 0.17
131 0.17
132 0.16
133 0.17
134 0.17
135 0.17
136 0.14
137 0.14
138 0.16
139 0.16
140 0.16
141 0.15
142 0.16
143 0.15
144 0.15
145 0.13
146 0.09
147 0.08
148 0.07
149 0.08
150 0.06
151 0.05
152 0.05
153 0.08
154 0.1
155 0.1
156 0.09
157 0.09
158 0.09
159 0.08
160 0.08
161 0.06
162 0.04
163 0.04
164 0.04
165 0.05
166 0.05
167 0.06
168 0.06
169 0.05
170 0.05
171 0.07
172 0.09
173 0.1
174 0.11
175 0.11
176 0.13
177 0.14
178 0.13
179 0.12
180 0.11
181 0.16
182 0.16
183 0.16
184 0.15
185 0.16
186 0.2
187 0.22
188 0.26
189 0.23
190 0.22
191 0.27
192 0.27
193 0.29
194 0.3
195 0.27
196 0.24
197 0.28
198 0.28
199 0.23
200 0.24
201 0.2
202 0.17
203 0.16
204 0.15
205 0.11
206 0.12
207 0.12
208 0.12
209 0.15
210 0.15
211 0.16
212 0.17
213 0.18
214 0.19
215 0.2
216 0.2
217 0.17
218 0.18
219 0.18
220 0.16
221 0.13
222 0.11
223 0.1
224 0.09
225 0.09
226 0.08
227 0.07
228 0.09
229 0.09
230 0.09
231 0.09
232 0.09
233 0.09
234 0.08
235 0.08
236 0.05
237 0.04
238 0.04
239 0.04
240 0.04
241 0.04
242 0.04
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.06
247 0.05
248 0.06
249 0.06
250 0.06
251 0.06
252 0.06
253 0.05
254 0.06
255 0.05
256 0.06
257 0.08
258 0.1
259 0.11
260 0.11
261 0.13
262 0.15
263 0.19
264 0.2
265 0.17
266 0.15
267 0.15
268 0.17
269 0.16
270 0.17
271 0.13
272 0.11
273 0.11
274 0.11
275 0.09
276 0.08
277 0.07
278 0.06
279 0.07
280 0.11
281 0.1
282 0.11
283 0.11
284 0.12
285 0.12
286 0.12
287 0.18
288 0.19
289 0.29
290 0.34
291 0.39
292 0.44
293 0.49
294 0.53
295 0.49
296 0.49
297 0.46
298 0.52
299 0.56
300 0.57
301 0.54
302 0.49
303 0.49
304 0.52
305 0.51
306 0.48
307 0.43
308 0.44
309 0.51
310 0.52
311 0.5
312 0.46
313 0.41
314 0.33
315 0.3
316 0.24
317 0.17
318 0.16
319 0.16
320 0.16
321 0.17
322 0.18
323 0.19
324 0.26
325 0.32
326 0.4
327 0.5
328 0.55
329 0.63
330 0.66
331 0.74
332 0.73
333 0.68
334 0.63
335 0.61
336 0.55
337 0.46
338 0.5
339 0.41
340 0.39
341 0.37
342 0.33
343 0.32
344 0.34
345 0.35
346 0.36
347 0.41
348 0.45
349 0.53
350 0.58
351 0.62
352 0.69
353 0.77
354 0.8
355 0.85
356 0.88
357 0.9
358 0.95
359 0.96
360 0.96
361 0.96
362 0.95
363 0.93
364 0.89
365 0.82
366 0.76
367 0.66
368 0.62
369 0.51
370 0.42
371 0.34
372 0.28
373 0.26
374 0.22
375 0.22
376 0.2
377 0.21
378 0.22
379 0.25