Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0WX16

Protein Details
Accession A0A4U0WX16    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
88-108ASPARKRPTDASRPRSKTRETHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
76-104RKPTQIKIRPRPASPARKRPTDASRPRSK
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 12.5, cyto 9.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019474  Ub_conjug_fac_E4_core  
IPR045132  UBE4  
IPR003613  Ubox_domain  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0000151  C:ubiquitin ligase complex  
GO:0034450  F:ubiquitin-ubiquitin ligase activity  
GO:0016567  P:protein ubiquitination  
GO:0030433  P:ubiquitin-dependent ERAD pathway  
Pfam View protein in Pfam  
PF04564  U-box  
PF10408  Ufd2P_core  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51698  U_BOX  
CDD cd16657  RING-Ubox_UBE4A  
Amino Acid Sequences MADSTMSDADKIRQKRLAKLGGLPTNSSNATPPPSAPAAEPVASPSPPESQKSPPTTEASGNPFAQLGMKEQEPERKPTQIKIRPRPASPARKRPTDASRPRSKTRETESLEAWQDRNLRAIFRVTLKPEETRDTHGHTLMFLSSTREDLDDGPLLMNTNMLEGAITEAASHAPGNKPFEYLLTCFKRVSRGLRNGRFDGEVERKREILREARRLCMSYCIFAVTMPEMYGENVPASNPLVDHLLQDPECDTGICTDFLDEANARIDEDDSIKDALVGAAEELSTRLAGVDLLGDYRQYVGGLRNLIRYKKFADAITQSPMWAPPDIAAVDLETKTLLGPFFRLSPMQLDVARSYFSAPKTRDRGYIANAQNACRVTLRTHQDELHRITDQIVRSGAGPKERMLDWFALCVNKNHKKRAIRVDYKIVSSDGFMVNVTNALDQLCEPFMDAQFGKIEKIDVDYLRRNPRVDISEETKINADQKTADEFYAVKAEGTSNFISEVFFLTVASHHYGTEAAQERHATLKKTVKRMEQDLAGFETERQQYANDPRYLARFEEHVNRYKTSIDDNWSTIHATYGVLSDDLNQARSMQFMRYVIVWLMGLASRQDLPAKAQLQLPLQTDQPDVFRTLPEYFLEDIVDNFKFIVANIPHIITPQQSEEIVQICVTFLRNSEYVKNPGVKSGLVTILFYGVQPFHNHARGLLGDLLIGSPFAHKHLLHALMKFYIEAESTGTHTQFYDKFNIRFEIFQVIRCIWTNTMYRENLAKEATVNTEFFVQFVNMIVNDVTFVLDESLSSFAKIHELTNELKSAAFAALDEEQKKEKTELLESEKGKAKSYMQLTRESMETLILFTETLANAFTMPEVVSRLAAMLDYNLDIMVGDKRTNLRIENAAEYKFDPKALLQDIIKVFLNLRDKPNFISAIVHDGRSYKQHNFTNATTLMKSKMVMAPEEVQAWESLARRVAHAAAELAQEEEELGEPPDEFLDPLMSELMTDPVILPSSRTTMDRSTIKQHLLSDPTDPFNRVPLRIEDVVADVEMRGRIDEWRAERMVARRAEKEKAAMESGVAAGEGEPMDMSS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.54
3 0.62
4 0.64
5 0.59
6 0.63
7 0.66
8 0.66
9 0.64
10 0.57
11 0.49
12 0.45
13 0.42
14 0.34
15 0.27
16 0.24
17 0.26
18 0.25
19 0.24
20 0.25
21 0.27
22 0.27
23 0.26
24 0.27
25 0.26
26 0.26
27 0.25
28 0.24
29 0.25
30 0.24
31 0.24
32 0.22
33 0.25
34 0.27
35 0.31
36 0.31
37 0.36
38 0.45
39 0.5
40 0.53
41 0.51
42 0.52
43 0.52
44 0.52
45 0.5
46 0.48
47 0.47
48 0.41
49 0.37
50 0.32
51 0.29
52 0.27
53 0.22
54 0.19
55 0.17
56 0.18
57 0.21
58 0.24
59 0.33
60 0.34
61 0.4
62 0.4
63 0.45
64 0.47
65 0.53
66 0.61
67 0.6
68 0.68
69 0.72
70 0.78
71 0.76
72 0.76
73 0.78
74 0.77
75 0.8
76 0.79
77 0.79
78 0.76
79 0.78
80 0.79
81 0.77
82 0.77
83 0.76
84 0.77
85 0.75
86 0.79
87 0.78
88 0.83
89 0.81
90 0.77
91 0.75
92 0.72
93 0.73
94 0.68
95 0.65
96 0.6
97 0.6
98 0.59
99 0.53
100 0.45
101 0.4
102 0.38
103 0.34
104 0.37
105 0.31
106 0.27
107 0.26
108 0.29
109 0.28
110 0.3
111 0.35
112 0.33
113 0.38
114 0.39
115 0.41
116 0.41
117 0.44
118 0.41
119 0.42
120 0.42
121 0.43
122 0.43
123 0.41
124 0.38
125 0.32
126 0.3
127 0.24
128 0.21
129 0.15
130 0.15
131 0.14
132 0.15
133 0.15
134 0.14
135 0.15
136 0.15
137 0.18
138 0.15
139 0.15
140 0.15
141 0.14
142 0.15
143 0.13
144 0.13
145 0.09
146 0.08
147 0.07
148 0.06
149 0.06
150 0.05
151 0.07
152 0.07
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.07
157 0.07
158 0.08
159 0.08
160 0.12
161 0.17
162 0.22
163 0.22
164 0.23
165 0.23
166 0.25
167 0.26
168 0.25
169 0.3
170 0.31
171 0.32
172 0.32
173 0.33
174 0.37
175 0.38
176 0.45
177 0.45
178 0.5
179 0.59
180 0.67
181 0.72
182 0.68
183 0.65
184 0.58
185 0.49
186 0.46
187 0.45
188 0.42
189 0.4
190 0.39
191 0.38
192 0.38
193 0.4
194 0.38
195 0.38
196 0.42
197 0.48
198 0.49
199 0.54
200 0.55
201 0.54
202 0.49
203 0.47
204 0.4
205 0.31
206 0.28
207 0.24
208 0.21
209 0.2
210 0.2
211 0.13
212 0.12
213 0.1
214 0.1
215 0.09
216 0.1
217 0.11
218 0.1
219 0.09
220 0.08
221 0.08
222 0.09
223 0.1
224 0.09
225 0.08
226 0.08
227 0.11
228 0.11
229 0.12
230 0.13
231 0.16
232 0.15
233 0.16
234 0.16
235 0.14
236 0.14
237 0.12
238 0.11
239 0.09
240 0.11
241 0.11
242 0.1
243 0.1
244 0.1
245 0.1
246 0.12
247 0.1
248 0.1
249 0.12
250 0.12
251 0.11
252 0.11
253 0.11
254 0.1
255 0.12
256 0.11
257 0.11
258 0.11
259 0.11
260 0.1
261 0.1
262 0.09
263 0.07
264 0.06
265 0.04
266 0.04
267 0.04
268 0.04
269 0.04
270 0.05
271 0.04
272 0.04
273 0.04
274 0.04
275 0.04
276 0.04
277 0.05
278 0.04
279 0.05
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.06
284 0.06
285 0.05
286 0.07
287 0.08
288 0.12
289 0.15
290 0.17
291 0.23
292 0.26
293 0.31
294 0.31
295 0.31
296 0.31
297 0.33
298 0.35
299 0.29
300 0.31
301 0.31
302 0.32
303 0.34
304 0.31
305 0.26
306 0.23
307 0.24
308 0.19
309 0.15
310 0.13
311 0.09
312 0.11
313 0.11
314 0.11
315 0.09
316 0.08
317 0.1
318 0.1
319 0.09
320 0.07
321 0.07
322 0.06
323 0.07
324 0.07
325 0.05
326 0.07
327 0.08
328 0.09
329 0.1
330 0.11
331 0.11
332 0.13
333 0.14
334 0.15
335 0.15
336 0.16
337 0.16
338 0.16
339 0.16
340 0.14
341 0.14
342 0.15
343 0.16
344 0.22
345 0.24
346 0.31
347 0.36
348 0.38
349 0.4
350 0.4
351 0.41
352 0.38
353 0.45
354 0.4
355 0.41
356 0.4
357 0.37
358 0.36
359 0.33
360 0.3
361 0.21
362 0.2
363 0.16
364 0.22
365 0.27
366 0.29
367 0.31
368 0.33
369 0.36
370 0.41
371 0.42
372 0.37
373 0.32
374 0.28
375 0.27
376 0.28
377 0.25
378 0.21
379 0.17
380 0.14
381 0.14
382 0.19
383 0.19
384 0.18
385 0.19
386 0.17
387 0.2
388 0.2
389 0.2
390 0.17
391 0.18
392 0.15
393 0.15
394 0.16
395 0.15
396 0.16
397 0.18
398 0.25
399 0.31
400 0.36
401 0.41
402 0.47
403 0.51
404 0.59
405 0.66
406 0.68
407 0.67
408 0.67
409 0.69
410 0.64
411 0.59
412 0.52
413 0.42
414 0.31
415 0.23
416 0.21
417 0.12
418 0.1
419 0.09
420 0.08
421 0.07
422 0.07
423 0.07
424 0.05
425 0.05
426 0.05
427 0.05
428 0.05
429 0.06
430 0.05
431 0.05
432 0.06
433 0.06
434 0.07
435 0.09
436 0.09
437 0.09
438 0.1
439 0.11
440 0.11
441 0.1
442 0.1
443 0.08
444 0.1
445 0.11
446 0.11
447 0.15
448 0.19
449 0.25
450 0.32
451 0.34
452 0.33
453 0.31
454 0.34
455 0.33
456 0.32
457 0.3
458 0.28
459 0.31
460 0.3
461 0.3
462 0.26
463 0.24
464 0.24
465 0.19
466 0.15
467 0.11
468 0.12
469 0.15
470 0.15
471 0.15
472 0.12
473 0.12
474 0.12
475 0.13
476 0.12
477 0.08
478 0.07
479 0.08
480 0.08
481 0.11
482 0.1
483 0.08
484 0.09
485 0.09
486 0.09
487 0.08
488 0.09
489 0.06
490 0.06
491 0.06
492 0.05
493 0.06
494 0.07
495 0.09
496 0.08
497 0.07
498 0.08
499 0.08
500 0.08
501 0.13
502 0.16
503 0.15
504 0.15
505 0.16
506 0.16
507 0.21
508 0.23
509 0.19
510 0.19
511 0.26
512 0.3
513 0.38
514 0.42
515 0.42
516 0.44
517 0.46
518 0.44
519 0.39
520 0.35
521 0.28
522 0.25
523 0.2
524 0.16
525 0.13
526 0.15
527 0.12
528 0.12
529 0.11
530 0.1
531 0.13
532 0.2
533 0.26
534 0.23
535 0.23
536 0.24
537 0.26
538 0.27
539 0.23
540 0.17
541 0.13
542 0.14
543 0.22
544 0.24
545 0.29
546 0.3
547 0.3
548 0.3
549 0.29
550 0.28
551 0.23
552 0.23
553 0.2
554 0.19
555 0.19
556 0.19
557 0.19
558 0.19
559 0.15
560 0.12
561 0.09
562 0.07
563 0.07
564 0.06
565 0.06
566 0.05
567 0.05
568 0.06
569 0.1
570 0.1
571 0.1
572 0.09
573 0.1
574 0.1
575 0.11
576 0.11
577 0.08
578 0.09
579 0.09
580 0.1
581 0.09
582 0.1
583 0.09
584 0.09
585 0.08
586 0.06
587 0.06
588 0.05
589 0.05
590 0.04
591 0.05
592 0.05
593 0.06
594 0.07
595 0.07
596 0.09
597 0.14
598 0.15
599 0.16
600 0.18
601 0.2
602 0.21
603 0.24
604 0.24
605 0.2
606 0.2
607 0.19
608 0.18
609 0.16
610 0.15
611 0.12
612 0.12
613 0.11
614 0.11
615 0.12
616 0.13
617 0.13
618 0.12
619 0.14
620 0.13
621 0.13
622 0.13
623 0.1
624 0.1
625 0.12
626 0.11
627 0.08
628 0.08
629 0.07
630 0.07
631 0.07
632 0.13
633 0.11
634 0.14
635 0.14
636 0.15
637 0.15
638 0.15
639 0.16
640 0.1
641 0.11
642 0.09
643 0.1
644 0.09
645 0.1
646 0.11
647 0.11
648 0.11
649 0.1
650 0.08
651 0.07
652 0.08
653 0.08
654 0.07
655 0.06
656 0.09
657 0.11
658 0.13
659 0.17
660 0.2
661 0.23
662 0.26
663 0.3
664 0.27
665 0.28
666 0.27
667 0.23
668 0.2
669 0.19
670 0.18
671 0.13
672 0.13
673 0.11
674 0.11
675 0.11
676 0.1
677 0.08
678 0.07
679 0.08
680 0.09
681 0.12
682 0.15
683 0.18
684 0.18
685 0.17
686 0.18
687 0.17
688 0.18
689 0.16
690 0.12
691 0.09
692 0.09
693 0.09
694 0.07
695 0.06
696 0.04
697 0.04
698 0.05
699 0.06
700 0.09
701 0.09
702 0.11
703 0.16
704 0.22
705 0.23
706 0.24
707 0.24
708 0.22
709 0.22
710 0.2
711 0.16
712 0.1
713 0.08
714 0.08
715 0.08
716 0.07
717 0.1
718 0.12
719 0.11
720 0.11
721 0.11
722 0.13
723 0.15
724 0.17
725 0.22
726 0.26
727 0.27
728 0.3
729 0.32
730 0.31
731 0.28
732 0.27
733 0.28
734 0.24
735 0.25
736 0.25
737 0.22
738 0.23
739 0.23
740 0.24
741 0.15
742 0.19
743 0.2
744 0.21
745 0.27
746 0.26
747 0.27
748 0.28
749 0.29
750 0.27
751 0.24
752 0.2
753 0.15
754 0.16
755 0.18
756 0.16
757 0.15
758 0.13
759 0.16
760 0.15
761 0.14
762 0.14
763 0.1
764 0.09
765 0.09
766 0.1
767 0.06
768 0.07
769 0.07
770 0.06
771 0.06
772 0.06
773 0.06
774 0.05
775 0.05
776 0.05
777 0.05
778 0.05
779 0.06
780 0.08
781 0.08
782 0.08
783 0.09
784 0.08
785 0.12
786 0.12
787 0.12
788 0.11
789 0.14
790 0.17
791 0.18
792 0.19
793 0.16
794 0.16
795 0.15
796 0.14
797 0.11
798 0.09
799 0.06
800 0.08
801 0.11
802 0.14
803 0.15
804 0.16
805 0.19
806 0.2
807 0.22
808 0.2
809 0.21
810 0.2
811 0.24
812 0.29
813 0.34
814 0.41
815 0.4
816 0.44
817 0.48
818 0.46
819 0.43
820 0.38
821 0.33
822 0.32
823 0.39
824 0.41
825 0.36
826 0.42
827 0.42
828 0.42
829 0.4
830 0.34
831 0.27
832 0.2
833 0.18
834 0.11
835 0.1
836 0.08
837 0.07
838 0.07
839 0.08
840 0.07
841 0.07
842 0.07
843 0.07
844 0.07
845 0.07
846 0.07
847 0.05
848 0.06
849 0.06
850 0.08
851 0.08
852 0.08
853 0.08
854 0.08
855 0.07
856 0.07
857 0.07
858 0.05
859 0.06
860 0.06
861 0.06
862 0.06
863 0.05
864 0.05
865 0.06
866 0.09
867 0.1
868 0.1
869 0.12
870 0.15
871 0.18
872 0.21
873 0.21
874 0.22
875 0.26
876 0.28
877 0.33
878 0.34
879 0.32
880 0.31
881 0.31
882 0.3
883 0.26
884 0.23
885 0.17
886 0.15
887 0.2
888 0.21
889 0.24
890 0.21
891 0.27
892 0.27
893 0.29
894 0.28
895 0.23
896 0.21
897 0.22
898 0.28
899 0.26
900 0.31
901 0.33
902 0.34
903 0.36
904 0.4
905 0.36
906 0.3
907 0.29
908 0.24
909 0.29
910 0.28
911 0.26
912 0.22
913 0.23
914 0.24
915 0.27
916 0.31
917 0.28
918 0.35
919 0.4
920 0.46
921 0.5
922 0.49
923 0.5
924 0.48
925 0.44
926 0.37
927 0.34
928 0.3
929 0.26
930 0.25
931 0.21
932 0.22
933 0.2
934 0.2
935 0.22
936 0.23
937 0.23
938 0.24
939 0.21
940 0.19
941 0.17
942 0.16
943 0.16
944 0.14
945 0.14
946 0.18
947 0.19
948 0.19
949 0.21
950 0.21
951 0.19
952 0.19
953 0.18
954 0.15
955 0.15
956 0.15
957 0.13
958 0.12
959 0.11
960 0.09
961 0.09
962 0.07
963 0.07
964 0.08
965 0.07
966 0.08
967 0.08
968 0.09
969 0.09
970 0.08
971 0.08
972 0.09
973 0.09
974 0.1
975 0.1
976 0.09
977 0.09
978 0.09
979 0.1
980 0.08
981 0.08
982 0.08
983 0.09
984 0.11
985 0.1
986 0.11
987 0.12
988 0.15
989 0.17
990 0.18
991 0.21
992 0.23
993 0.3
994 0.35
995 0.37
996 0.41
997 0.46
998 0.48
999 0.47
1000 0.47
1001 0.46
1002 0.44
1003 0.42
1004 0.39
1005 0.37
1006 0.39
1007 0.38
1008 0.37
1009 0.31
1010 0.35
1011 0.37
1012 0.34
1013 0.35
1014 0.34
1015 0.38
1016 0.37
1017 0.37
1018 0.3
1019 0.28
1020 0.26
1021 0.22
1022 0.18
1023 0.11
1024 0.12
1025 0.12
1026 0.12
1027 0.1
1028 0.1
1029 0.13
1030 0.17
1031 0.24
1032 0.25
1033 0.31
1034 0.32
1035 0.33
1036 0.37
1037 0.4
1038 0.44
1039 0.45
1040 0.46
1041 0.47
1042 0.51
1043 0.55
1044 0.54
1045 0.54
1046 0.5
1047 0.47
1048 0.44
1049 0.37
1050 0.32
1051 0.28
1052 0.25
1053 0.19
1054 0.14
1055 0.1
1056 0.07
1057 0.09
1058 0.08
1059 0.07