Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0X8R4

Protein Details
Accession A0A4U0X8R4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
943-969EVQALLLAKRKRRRKKMGSNPTKDCANHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
951-959KRKRRRKKM
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12.333, cyto 6, cyto_mito 4.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001610  PAC  
IPR000014  PAS  
IPR035965  PAS-like_dom_sf  
IPR013655  PAS_fold_3  
IPR000679  Znf_GATA  
IPR013088  Znf_NHR/GATA  
Gene Ontology GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF00320  GATA  
PF08447  PAS_3  
PF13426  PAS_9  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00344  GATA_ZN_FINGER_1  
PS50114  GATA_ZN_FINGER_2  
PS50112  PAS  
CDD cd00130  PAS  
cd00202  ZnF_GATA  
Amino Acid Sequences MPSAVDSDSVPPPSSLGAAAGITPTRGACHPEDHRTYNGPYDSIQMAPHERYGGHNTVMMMGQEGGGHDGVGPQSLDDIVNQSGNTMRRQSMPQRYGTDPRDADREMRRMSMMDYSGASSAGTMNNFGYEHNNGSMDQSGMLSGPSSAHPGQVHPRRSQSRRESNDDVDMKINYGASQQSYNAMLANTASYAAQSATQGAVDMSMNSPYLDVNMGMPMGYGVHPQHPSNNSGQDAMNMHMYSQPQFNHTTVSSPLHQVPQHGMPNVPRGAAQDQGGSNGMNTHPAQSVTPKNQAESNDQQSPPPQHHQSFPVQPHRPQSGSVEDRGMGEPIRRYDGLNGPYPVDPLNYNPNNQGFAWEPPQGGWPSTMVGKPHMSSSYKNAYSSTGFDMLGVLMRVATRPNPEINIGSVDLSCAFVVCDAEKDDIPIVYCSDNFERLTGYTKHMILGRNCRFLQSPDGNVEPGIRRKYVDDHSVLYLKNTINLRQEAQISIINYRRGGQPFMNLLTMIPITWETEQVKYFVGFQVDLVEQPNAVTNKNPNGSYQVNYQRGMIMPRYNMSAPEMNNIKPDLGQTVPRDDVSAILTTIGTGESEYAKRMWDKVLLENTDDVVHVLSLKGLFQWISPSALRVLEYEPSEIIGTALSSVCHPSDIVPVTRELKDTSSGASVNVVFRIRRKNSGYMWFEGHGSLHTEQGKGRKSIIMVGRERPVYALSKTGIVTAGGIGESELWTKMSTSGMFLFVSSNVRSLLDRQPDELVGVSIQSLMRSESKTDFGRILEHARTGKKASVKHEMIHRKGHALSAYTTLYPGDATEGQKPTFIVAQTRLIKYGSKQAHPTRPSIYSKTERNSNDSIQTTFPLRQGSVAPSMNGDETPHSVVSEPQFQTTDGSAATYGGHNGLALGHQDASPASEDNLFDELKTTKSSSWQYEIRQLEKRNRMLAEEVQALLLAKRKRRRKKMGSNPTKDCANCHTKATPEWRRGPSGMRDLCNSCGLRWAKLNGRVSPRTSRHSGGAASDIGSRASASPVHTTSAIAGGSAQLSSVVKTESPGLINTSIQQPLSNAVTSGSITERRESAEAGKLVEGHGAKMGVAARVPEKIEESIEPE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.15
3 0.12
4 0.11
5 0.1
6 0.1
7 0.11
8 0.11
9 0.1
10 0.11
11 0.1
12 0.11
13 0.12
14 0.17
15 0.17
16 0.26
17 0.33
18 0.41
19 0.48
20 0.5
21 0.53
22 0.53
23 0.54
24 0.53
25 0.48
26 0.4
27 0.34
28 0.34
29 0.31
30 0.27
31 0.25
32 0.22
33 0.24
34 0.25
35 0.26
36 0.23
37 0.22
38 0.26
39 0.31
40 0.31
41 0.28
42 0.28
43 0.27
44 0.27
45 0.28
46 0.22
47 0.17
48 0.13
49 0.12
50 0.1
51 0.1
52 0.1
53 0.09
54 0.09
55 0.07
56 0.09
57 0.09
58 0.1
59 0.1
60 0.07
61 0.08
62 0.09
63 0.09
64 0.08
65 0.11
66 0.11
67 0.13
68 0.13
69 0.13
70 0.17
71 0.19
72 0.23
73 0.24
74 0.24
75 0.27
76 0.34
77 0.43
78 0.5
79 0.52
80 0.55
81 0.57
82 0.6
83 0.66
84 0.62
85 0.61
86 0.53
87 0.5
88 0.49
89 0.45
90 0.46
91 0.45
92 0.49
93 0.42
94 0.42
95 0.4
96 0.35
97 0.36
98 0.35
99 0.28
100 0.22
101 0.2
102 0.2
103 0.19
104 0.18
105 0.16
106 0.1
107 0.11
108 0.11
109 0.11
110 0.1
111 0.1
112 0.12
113 0.12
114 0.13
115 0.15
116 0.15
117 0.18
118 0.18
119 0.19
120 0.18
121 0.19
122 0.2
123 0.16
124 0.14
125 0.12
126 0.1
127 0.09
128 0.09
129 0.07
130 0.06
131 0.07
132 0.07
133 0.13
134 0.12
135 0.16
136 0.17
137 0.2
138 0.3
139 0.38
140 0.42
141 0.42
142 0.52
143 0.58
144 0.62
145 0.69
146 0.7
147 0.72
148 0.74
149 0.77
150 0.74
151 0.68
152 0.73
153 0.65
154 0.56
155 0.48
156 0.4
157 0.33
158 0.28
159 0.24
160 0.14
161 0.14
162 0.14
163 0.13
164 0.14
165 0.14
166 0.15
167 0.16
168 0.16
169 0.15
170 0.13
171 0.12
172 0.1
173 0.1
174 0.08
175 0.07
176 0.07
177 0.06
178 0.06
179 0.06
180 0.07
181 0.07
182 0.08
183 0.08
184 0.08
185 0.08
186 0.07
187 0.08
188 0.07
189 0.08
190 0.07
191 0.08
192 0.08
193 0.08
194 0.09
195 0.07
196 0.08
197 0.08
198 0.07
199 0.07
200 0.07
201 0.07
202 0.07
203 0.07
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.08
208 0.09
209 0.14
210 0.17
211 0.18
212 0.24
213 0.25
214 0.28
215 0.3
216 0.34
217 0.3
218 0.3
219 0.29
220 0.26
221 0.25
222 0.23
223 0.22
224 0.17
225 0.16
226 0.17
227 0.18
228 0.17
229 0.19
230 0.19
231 0.18
232 0.21
233 0.21
234 0.22
235 0.21
236 0.22
237 0.21
238 0.24
239 0.23
240 0.23
241 0.25
242 0.26
243 0.27
244 0.26
245 0.27
246 0.3
247 0.32
248 0.3
249 0.3
250 0.28
251 0.33
252 0.32
253 0.28
254 0.22
255 0.22
256 0.22
257 0.22
258 0.21
259 0.18
260 0.17
261 0.19
262 0.19
263 0.15
264 0.13
265 0.13
266 0.12
267 0.12
268 0.13
269 0.13
270 0.14
271 0.15
272 0.15
273 0.19
274 0.26
275 0.27
276 0.35
277 0.34
278 0.34
279 0.36
280 0.38
281 0.4
282 0.4
283 0.42
284 0.41
285 0.4
286 0.4
287 0.42
288 0.43
289 0.4
290 0.4
291 0.4
292 0.35
293 0.38
294 0.42
295 0.43
296 0.48
297 0.5
298 0.53
299 0.51
300 0.53
301 0.56
302 0.56
303 0.51
304 0.44
305 0.41
306 0.4
307 0.38
308 0.36
309 0.31
310 0.27
311 0.28
312 0.27
313 0.24
314 0.15
315 0.14
316 0.16
317 0.16
318 0.19
319 0.18
320 0.18
321 0.22
322 0.28
323 0.29
324 0.31
325 0.3
326 0.28
327 0.28
328 0.28
329 0.23
330 0.18
331 0.15
332 0.13
333 0.22
334 0.22
335 0.23
336 0.26
337 0.27
338 0.28
339 0.27
340 0.26
341 0.19
342 0.2
343 0.22
344 0.2
345 0.19
346 0.17
347 0.21
348 0.2
349 0.18
350 0.16
351 0.13
352 0.12
353 0.14
354 0.15
355 0.12
356 0.14
357 0.15
358 0.15
359 0.17
360 0.19
361 0.19
362 0.2
363 0.25
364 0.31
365 0.3
366 0.3
367 0.29
368 0.28
369 0.27
370 0.28
371 0.24
372 0.17
373 0.16
374 0.15
375 0.15
376 0.12
377 0.12
378 0.09
379 0.06
380 0.04
381 0.05
382 0.05
383 0.06
384 0.08
385 0.1
386 0.12
387 0.14
388 0.15
389 0.16
390 0.17
391 0.17
392 0.17
393 0.15
394 0.13
395 0.12
396 0.11
397 0.09
398 0.09
399 0.08
400 0.05
401 0.05
402 0.05
403 0.05
404 0.05
405 0.06
406 0.07
407 0.09
408 0.08
409 0.09
410 0.1
411 0.09
412 0.1
413 0.1
414 0.09
415 0.08
416 0.09
417 0.11
418 0.12
419 0.14
420 0.13
421 0.13
422 0.13
423 0.13
424 0.18
425 0.16
426 0.18
427 0.18
428 0.18
429 0.19
430 0.22
431 0.26
432 0.25
433 0.34
434 0.35
435 0.39
436 0.39
437 0.39
438 0.37
439 0.34
440 0.38
441 0.3
442 0.28
443 0.24
444 0.25
445 0.24
446 0.23
447 0.23
448 0.18
449 0.2
450 0.2
451 0.18
452 0.17
453 0.19
454 0.24
455 0.26
456 0.28
457 0.25
458 0.24
459 0.26
460 0.28
461 0.26
462 0.22
463 0.21
464 0.16
465 0.19
466 0.18
467 0.19
468 0.2
469 0.22
470 0.23
471 0.21
472 0.22
473 0.18
474 0.19
475 0.17
476 0.14
477 0.16
478 0.18
479 0.17
480 0.16
481 0.17
482 0.19
483 0.19
484 0.21
485 0.18
486 0.18
487 0.19
488 0.2
489 0.19
490 0.15
491 0.14
492 0.12
493 0.11
494 0.08
495 0.06
496 0.05
497 0.06
498 0.06
499 0.09
500 0.09
501 0.11
502 0.11
503 0.12
504 0.12
505 0.11
506 0.12
507 0.11
508 0.1
509 0.08
510 0.08
511 0.1
512 0.09
513 0.09
514 0.09
515 0.08
516 0.07
517 0.07
518 0.11
519 0.09
520 0.09
521 0.1
522 0.11
523 0.16
524 0.19
525 0.19
526 0.16
527 0.2
528 0.22
529 0.22
530 0.27
531 0.3
532 0.31
533 0.31
534 0.3
535 0.26
536 0.25
537 0.26
538 0.21
539 0.15
540 0.12
541 0.13
542 0.14
543 0.14
544 0.13
545 0.14
546 0.15
547 0.13
548 0.17
549 0.18
550 0.17
551 0.18
552 0.18
553 0.15
554 0.13
555 0.13
556 0.1
557 0.09
558 0.13
559 0.13
560 0.15
561 0.16
562 0.16
563 0.16
564 0.14
565 0.14
566 0.11
567 0.1
568 0.07
569 0.07
570 0.06
571 0.06
572 0.06
573 0.05
574 0.04
575 0.03
576 0.04
577 0.05
578 0.06
579 0.07
580 0.07
581 0.08
582 0.09
583 0.1
584 0.1
585 0.13
586 0.14
587 0.18
588 0.23
589 0.23
590 0.23
591 0.22
592 0.22
593 0.18
594 0.16
595 0.11
596 0.06
597 0.05
598 0.05
599 0.04
600 0.04
601 0.04
602 0.04
603 0.04
604 0.04
605 0.04
606 0.04
607 0.07
608 0.07
609 0.09
610 0.09
611 0.1
612 0.11
613 0.11
614 0.12
615 0.1
616 0.11
617 0.11
618 0.12
619 0.12
620 0.11
621 0.11
622 0.1
623 0.09
624 0.08
625 0.05
626 0.04
627 0.04
628 0.05
629 0.04
630 0.04
631 0.06
632 0.06
633 0.06
634 0.06
635 0.06
636 0.1
637 0.12
638 0.13
639 0.12
640 0.15
641 0.18
642 0.18
643 0.18
644 0.15
645 0.15
646 0.16
647 0.15
648 0.14
649 0.13
650 0.13
651 0.11
652 0.12
653 0.11
654 0.1
655 0.11
656 0.11
657 0.1
658 0.14
659 0.23
660 0.24
661 0.31
662 0.34
663 0.38
664 0.41
665 0.5
666 0.5
667 0.43
668 0.43
669 0.37
670 0.33
671 0.28
672 0.23
673 0.14
674 0.14
675 0.12
676 0.14
677 0.14
678 0.14
679 0.16
680 0.22
681 0.25
682 0.23
683 0.24
684 0.22
685 0.21
686 0.26
687 0.3
688 0.31
689 0.3
690 0.33
691 0.35
692 0.34
693 0.33
694 0.27
695 0.24
696 0.19
697 0.17
698 0.16
699 0.13
700 0.15
701 0.15
702 0.15
703 0.14
704 0.11
705 0.1
706 0.08
707 0.07
708 0.05
709 0.05
710 0.04
711 0.04
712 0.04
713 0.05
714 0.05
715 0.05
716 0.05
717 0.06
718 0.07
719 0.08
720 0.08
721 0.09
722 0.1
723 0.11
724 0.11
725 0.11
726 0.11
727 0.1
728 0.13
729 0.11
730 0.11
731 0.1
732 0.11
733 0.11
734 0.14
735 0.2
736 0.25
737 0.25
738 0.26
739 0.26
740 0.26
741 0.26
742 0.22
743 0.16
744 0.09
745 0.08
746 0.06
747 0.06
748 0.06
749 0.06
750 0.06
751 0.07
752 0.1
753 0.11
754 0.13
755 0.14
756 0.19
757 0.2
758 0.21
759 0.21
760 0.19
761 0.21
762 0.21
763 0.23
764 0.2
765 0.22
766 0.25
767 0.25
768 0.27
769 0.26
770 0.28
771 0.29
772 0.32
773 0.34
774 0.4
775 0.41
776 0.42
777 0.49
778 0.55
779 0.54
780 0.56
781 0.52
782 0.45
783 0.43
784 0.43
785 0.35
786 0.28
787 0.25
788 0.21
789 0.22
790 0.18
791 0.18
792 0.15
793 0.13
794 0.11
795 0.09
796 0.09
797 0.11
798 0.13
799 0.18
800 0.21
801 0.21
802 0.22
803 0.22
804 0.2
805 0.2
806 0.19
807 0.16
808 0.16
809 0.25
810 0.29
811 0.3
812 0.3
813 0.28
814 0.28
815 0.27
816 0.33
817 0.3
818 0.29
819 0.37
820 0.44
821 0.52
822 0.53
823 0.55
824 0.5
825 0.51
826 0.53
827 0.49
828 0.49
829 0.46
830 0.51
831 0.52
832 0.56
833 0.52
834 0.52
835 0.53
836 0.48
837 0.47
838 0.42
839 0.39
840 0.32
841 0.32
842 0.28
843 0.26
844 0.25
845 0.21
846 0.19
847 0.19
848 0.2
849 0.21
850 0.24
851 0.23
852 0.21
853 0.2
854 0.21
855 0.2
856 0.18
857 0.16
858 0.11
859 0.13
860 0.15
861 0.14
862 0.13
863 0.13
864 0.16
865 0.18
866 0.25
867 0.23
868 0.23
869 0.23
870 0.23
871 0.25
872 0.23
873 0.21
874 0.12
875 0.12
876 0.1
877 0.1
878 0.1
879 0.08
880 0.08
881 0.08
882 0.07
883 0.06
884 0.06
885 0.06
886 0.06
887 0.07
888 0.07
889 0.08
890 0.08
891 0.08
892 0.08
893 0.09
894 0.1
895 0.1
896 0.1
897 0.11
898 0.11
899 0.13
900 0.15
901 0.14
902 0.12
903 0.14
904 0.14
905 0.14
906 0.16
907 0.16
908 0.15
909 0.22
910 0.27
911 0.29
912 0.35
913 0.38
914 0.4
915 0.47
916 0.51
917 0.5
918 0.52
919 0.54
920 0.58
921 0.62
922 0.64
923 0.61
924 0.57
925 0.54
926 0.51
927 0.48
928 0.43
929 0.37
930 0.32
931 0.25
932 0.24
933 0.22
934 0.18
935 0.21
936 0.2
937 0.26
938 0.35
939 0.45
940 0.56
941 0.67
942 0.77
943 0.82
944 0.89
945 0.92
946 0.95
947 0.95
948 0.94
949 0.9
950 0.83
951 0.78
952 0.67
953 0.6
954 0.56
955 0.53
956 0.45
957 0.44
958 0.42
959 0.4
960 0.46
961 0.53
962 0.54
963 0.54
964 0.61
965 0.61
966 0.63
967 0.62
968 0.61
969 0.59
970 0.6
971 0.57
972 0.51
973 0.51
974 0.49
975 0.49
976 0.5
977 0.43
978 0.32
979 0.35
980 0.34
981 0.33
982 0.35
983 0.38
984 0.39
985 0.46
986 0.53
987 0.51
988 0.58
989 0.6
990 0.6
991 0.64
992 0.62
993 0.61
994 0.59
995 0.55
996 0.5
997 0.49
998 0.45
999 0.38
1000 0.35
1001 0.29
1002 0.25
1003 0.24
1004 0.21
1005 0.17
1006 0.15
1007 0.13
1008 0.11
1009 0.12
1010 0.13
1011 0.13
1012 0.18
1013 0.19
1014 0.22
1015 0.21
1016 0.21
1017 0.2
1018 0.21
1019 0.18
1020 0.13
1021 0.12
1022 0.1
1023 0.1
1024 0.09
1025 0.08
1026 0.07
1027 0.08
1028 0.08
1029 0.1
1030 0.1
1031 0.1
1032 0.11
1033 0.15
1034 0.15
1035 0.17
1036 0.17
1037 0.2
1038 0.2
1039 0.21
1040 0.22
1041 0.23
1042 0.23
1043 0.22
1044 0.21
1045 0.18
1046 0.21
1047 0.23
1048 0.21
1049 0.17
1050 0.15
1051 0.16
1052 0.15
1053 0.16
1054 0.16
1055 0.19
1056 0.2
1057 0.23
1058 0.23
1059 0.25
1060 0.27
1061 0.27
1062 0.27
1063 0.3
1064 0.29
1065 0.29
1066 0.29
1067 0.26
1068 0.25
1069 0.28
1070 0.24
1071 0.17
1072 0.18
1073 0.16
1074 0.14
1075 0.17
1076 0.18
1077 0.14
1078 0.15
1079 0.16
1080 0.16
1081 0.19
1082 0.2
1083 0.19
1084 0.21
1085 0.21
1086 0.23