Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0XQ49

Protein Details
Accession A0A4U0XQ49    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
34-57TKLKYPPPAVSPPRPKRPPSPPHEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
30-52AKKATKLKYPPPAVSPPRPKRPP
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028942  WHIM1_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF15612  WHIM1  
Amino Acid Sequences MSDNDSDSSGLSSVAPEEEVQKLAPIFVKAKKATKLKYPPPAVSPPRPKRPPSPPHEDSFPDNPDIAFIVMFRSRFNEVMPAKLPNYGPQDIERGVTDQPPSPEAQSLLCALLSLVLNRKKPVERGHHGRALEEAVLSQKAQWPHGWNGINPLHGPRDFNMMSPSERLNLLRTLIHWSLTTSEAVSAMIKEKYKQVRHNDDENQPLSVQPWGVDGDKRRYFLVQGLEDTHFRVYREGSRYTKNAHWYNVAGNVPELQTLVKKLEEVDGTQAARRLAIKMTAAVPTFEASETKRLRREQRQIKRAAFTRPEPGFSMYEGRTRGKRARYNYEDDDDGAFDSDATSTRRSGRQSTRGTPLSDGPTYTLSGRQSRQPRTGQYGESLLRNSLGVDGTDELAMGSSGEEGGSEPPTTLGRATRSAGKPAVSGATNPRKRKHIDGYNDIDDMSAEDDAAPSGEDDWDSDRNDVEDEPVPDADEPDEEPSEAEVDDEIEDEPKSFVVKLKVSPASRRKSDDSYRAKAEVPRDTTDVDDAALTSAGATKIEPQHQMANGIPNGHAGTNLAPGRHLAATPPSGVSAYPTPASTSFSAAADTKPAVAYPSADLAQQHHATMAQHSRVGEYGGQPGVNGY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.1
3 0.09
4 0.12
5 0.13
6 0.14
7 0.14
8 0.16
9 0.15
10 0.16
11 0.18
12 0.2
13 0.23
14 0.27
15 0.36
16 0.39
17 0.46
18 0.52
19 0.58
20 0.6
21 0.65
22 0.7
23 0.71
24 0.76
25 0.76
26 0.72
27 0.7
28 0.75
29 0.73
30 0.73
31 0.75
32 0.74
33 0.78
34 0.82
35 0.81
36 0.8
37 0.83
38 0.83
39 0.79
40 0.8
41 0.74
42 0.71
43 0.72
44 0.65
45 0.61
46 0.57
47 0.52
48 0.44
49 0.4
50 0.34
51 0.29
52 0.26
53 0.2
54 0.13
55 0.1
56 0.12
57 0.14
58 0.14
59 0.14
60 0.16
61 0.19
62 0.19
63 0.2
64 0.26
65 0.24
66 0.29
67 0.31
68 0.32
69 0.3
70 0.34
71 0.33
72 0.31
73 0.37
74 0.33
75 0.32
76 0.3
77 0.34
78 0.31
79 0.31
80 0.25
81 0.21
82 0.2
83 0.21
84 0.21
85 0.2
86 0.21
87 0.22
88 0.23
89 0.22
90 0.22
91 0.2
92 0.19
93 0.17
94 0.16
95 0.15
96 0.13
97 0.11
98 0.09
99 0.11
100 0.1
101 0.11
102 0.17
103 0.22
104 0.25
105 0.27
106 0.32
107 0.33
108 0.38
109 0.46
110 0.48
111 0.52
112 0.59
113 0.65
114 0.66
115 0.63
116 0.57
117 0.49
118 0.41
119 0.32
120 0.23
121 0.16
122 0.12
123 0.13
124 0.12
125 0.11
126 0.13
127 0.15
128 0.17
129 0.2
130 0.23
131 0.26
132 0.34
133 0.35
134 0.31
135 0.37
136 0.37
137 0.35
138 0.31
139 0.3
140 0.26
141 0.25
142 0.27
143 0.2
144 0.26
145 0.24
146 0.24
147 0.25
148 0.22
149 0.23
150 0.23
151 0.23
152 0.17
153 0.18
154 0.18
155 0.17
156 0.17
157 0.17
158 0.15
159 0.15
160 0.21
161 0.2
162 0.2
163 0.18
164 0.17
165 0.17
166 0.18
167 0.17
168 0.1
169 0.1
170 0.09
171 0.09
172 0.09
173 0.08
174 0.09
175 0.12
176 0.12
177 0.13
178 0.2
179 0.29
180 0.35
181 0.43
182 0.5
183 0.58
184 0.63
185 0.7
186 0.69
187 0.66
188 0.66
189 0.59
190 0.5
191 0.39
192 0.34
193 0.26
194 0.2
195 0.15
196 0.08
197 0.09
198 0.09
199 0.1
200 0.13
201 0.17
202 0.25
203 0.28
204 0.29
205 0.28
206 0.27
207 0.27
208 0.28
209 0.3
210 0.23
211 0.21
212 0.23
213 0.24
214 0.24
215 0.24
216 0.21
217 0.16
218 0.15
219 0.15
220 0.14
221 0.19
222 0.23
223 0.28
224 0.3
225 0.33
226 0.35
227 0.38
228 0.4
229 0.41
230 0.41
231 0.37
232 0.36
233 0.32
234 0.32
235 0.32
236 0.29
237 0.21
238 0.17
239 0.16
240 0.14
241 0.13
242 0.11
243 0.07
244 0.07
245 0.08
246 0.09
247 0.08
248 0.08
249 0.08
250 0.11
251 0.11
252 0.11
253 0.13
254 0.14
255 0.14
256 0.15
257 0.16
258 0.13
259 0.13
260 0.13
261 0.12
262 0.1
263 0.11
264 0.11
265 0.1
266 0.11
267 0.13
268 0.13
269 0.12
270 0.11
271 0.1
272 0.1
273 0.09
274 0.09
275 0.07
276 0.15
277 0.18
278 0.21
279 0.26
280 0.31
281 0.39
282 0.48
283 0.57
284 0.6
285 0.67
286 0.73
287 0.75
288 0.73
289 0.7
290 0.64
291 0.6
292 0.53
293 0.45
294 0.45
295 0.38
296 0.37
297 0.33
298 0.32
299 0.25
300 0.22
301 0.24
302 0.16
303 0.19
304 0.19
305 0.2
306 0.19
307 0.23
308 0.27
309 0.31
310 0.36
311 0.39
312 0.47
313 0.5
314 0.55
315 0.54
316 0.51
317 0.44
318 0.39
319 0.33
320 0.23
321 0.18
322 0.12
323 0.08
324 0.06
325 0.06
326 0.05
327 0.06
328 0.07
329 0.08
330 0.09
331 0.12
332 0.16
333 0.18
334 0.25
335 0.31
336 0.39
337 0.44
338 0.47
339 0.52
340 0.51
341 0.5
342 0.44
343 0.4
344 0.35
345 0.29
346 0.25
347 0.19
348 0.17
349 0.17
350 0.16
351 0.15
352 0.14
353 0.18
354 0.19
355 0.25
356 0.32
357 0.36
358 0.42
359 0.44
360 0.45
361 0.49
362 0.5
363 0.44
364 0.38
365 0.37
366 0.32
367 0.29
368 0.26
369 0.18
370 0.16
371 0.14
372 0.13
373 0.09
374 0.08
375 0.06
376 0.07
377 0.07
378 0.07
379 0.07
380 0.07
381 0.05
382 0.05
383 0.05
384 0.04
385 0.03
386 0.03
387 0.03
388 0.03
389 0.03
390 0.04
391 0.05
392 0.06
393 0.06
394 0.06
395 0.07
396 0.08
397 0.08
398 0.09
399 0.1
400 0.12
401 0.14
402 0.16
403 0.23
404 0.24
405 0.28
406 0.29
407 0.27
408 0.25
409 0.23
410 0.24
411 0.16
412 0.16
413 0.21
414 0.3
415 0.37
416 0.42
417 0.44
418 0.48
419 0.51
420 0.58
421 0.59
422 0.57
423 0.58
424 0.62
425 0.65
426 0.61
427 0.58
428 0.5
429 0.4
430 0.3
431 0.23
432 0.15
433 0.08
434 0.05
435 0.05
436 0.05
437 0.05
438 0.05
439 0.05
440 0.04
441 0.04
442 0.05
443 0.05
444 0.06
445 0.09
446 0.12
447 0.13
448 0.14
449 0.13
450 0.14
451 0.15
452 0.14
453 0.14
454 0.15
455 0.15
456 0.16
457 0.16
458 0.16
459 0.15
460 0.15
461 0.13
462 0.1
463 0.1
464 0.11
465 0.12
466 0.11
467 0.11
468 0.11
469 0.11
470 0.1
471 0.09
472 0.06
473 0.06
474 0.06
475 0.07
476 0.07
477 0.07
478 0.07
479 0.08
480 0.08
481 0.07
482 0.08
483 0.08
484 0.12
485 0.17
486 0.2
487 0.22
488 0.29
489 0.36
490 0.39
491 0.48
492 0.53
493 0.56
494 0.58
495 0.61
496 0.59
497 0.61
498 0.66
499 0.66
500 0.66
501 0.64
502 0.63
503 0.59
504 0.57
505 0.53
506 0.51
507 0.49
508 0.45
509 0.42
510 0.4
511 0.38
512 0.36
513 0.34
514 0.28
515 0.2
516 0.15
517 0.11
518 0.1
519 0.09
520 0.07
521 0.06
522 0.08
523 0.07
524 0.07
525 0.07
526 0.13
527 0.18
528 0.23
529 0.25
530 0.26
531 0.31
532 0.32
533 0.35
534 0.31
535 0.33
536 0.3
537 0.29
538 0.26
539 0.23
540 0.23
541 0.2
542 0.18
543 0.12
544 0.11
545 0.17
546 0.19
547 0.17
548 0.16
549 0.17
550 0.2
551 0.2
552 0.19
553 0.14
554 0.18
555 0.19
556 0.21
557 0.21
558 0.18
559 0.18
560 0.17
561 0.19
562 0.17
563 0.18
564 0.18
565 0.18
566 0.19
567 0.2
568 0.24
569 0.21
570 0.22
571 0.2
572 0.19
573 0.21
574 0.2
575 0.2
576 0.19
577 0.18
578 0.16
579 0.14
580 0.14
581 0.14
582 0.13
583 0.15
584 0.14
585 0.17
586 0.17
587 0.18
588 0.18
589 0.2
590 0.27
591 0.26
592 0.24
593 0.2
594 0.22
595 0.22
596 0.28
597 0.32
598 0.27
599 0.29
600 0.29
601 0.3
602 0.28
603 0.3
604 0.26
605 0.21
606 0.23
607 0.23
608 0.22