Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0X459

Protein Details
Accession A0A4U0X459    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
887-920DEEFERRQRETRERKERKFKSKLNELKKRTRVDABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
893-926RQRETRERKERKFKSKLNELKKRTRVDAYKRARG
Subcellular Location(s) nucl 14, mito 7, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009061  DNA-bd_dom_put_sf  
IPR020472  G-protein_beta_WD-40_rep  
IPR013890  Tscrpt_rep_Tup1_N  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
IPR000465  XPA  
IPR022656  XPA_C  
IPR022658  XPA_CS  
IPR037129  XPA_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF08581  Tup_N  
PF00400  WD40  
PF05181  XPA_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
PS00753  XPA_2  
CDD cd21077  DBD_Rad14  
cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences MYPHRAQQPPPNRLGELLDQVRAEFEAQSHRSNDFDQAIAGQLHELELVKTKIWQLEQTHLGMKSKYEEEIQRLHHELEQRGGPSQPGHGANAQPPPPAIGHGPANLFQGIMAGAGQGGPGLAPPPQDQQGQPGMPGHMQSQGPPVLNAPPGPPNNPFAYGQPQGPALNGYGPQPPQSIASPGPGKPRVGPPHLGGPATPQQGQVNPYPGSPGVARPTPPPQNQQIAPDFQYTHAQLDQIGNQLSELDPEKLPPHFKRQGEDWHAVFNPRVHRRLDVELVFNLAHQSVVCCVRFSQDGRFVATGCNRSAQIFDVNTGKQVCHLQDHQTTPDGDLYIRSVCFSPDGRYLATGAEDKIIRVWDIATKTIRHSFSGHDQDIYSLDFASDGRYIASGSGDRTIRLWDIQENQCVLTLAIEDGVTTVAISPDGRYVAAGSLDKSVRIWDCQTAVMVERTEGEQGHKDSVYSVAFSPTGTHLVSGSLDKTIRMWKLGNREFQQRMQPGSQTTSGECVRVFEGHKDFVLSVALTPDGSWVMSGSKDRGVQFWDPDTGHAQLMLQGHKNSVISVAPSPVGGLFATGSGDMKARIWSPSNSAKAEHDFTFQTADKEVTLSGLAMDITPEQVRRMEESRLKAKALRSQQESASRTAQPSRPGYPVTATAGQKRPYSTVANAVTAPPTNRDARNTPPKPGSNHGLASMQDDTDIRAARKFQKYVEYDFSKMTDTKGGFMTAEDDPHNKALHAPEADGKPANMTMKEWERQQLQRRLRDARAGPFEPGLSVLDKREITKKCRECGSLEIDWQWEELLHCCVCHTCKEKFPERYSLLTKTEAKDDYLLTDPELRDEGLLPHLEKPNPHKSTWNNMMLYLRFQVEEYAFSERKWGSSEALDEEFERRQRETRERKERKFKSKLNELKKRTRVDAYKRARGGGGGEFGDVMGGGRHEHEWGRSVEDPETGMTRKSCVECGMEVEELEF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.48
3 0.46
4 0.4
5 0.37
6 0.32
7 0.31
8 0.3
9 0.26
10 0.22
11 0.14
12 0.13
13 0.2
14 0.23
15 0.27
16 0.29
17 0.3
18 0.31
19 0.32
20 0.36
21 0.28
22 0.26
23 0.22
24 0.2
25 0.22
26 0.2
27 0.18
28 0.13
29 0.1
30 0.1
31 0.11
32 0.1
33 0.08
34 0.13
35 0.15
36 0.15
37 0.17
38 0.2
39 0.23
40 0.25
41 0.31
42 0.29
43 0.36
44 0.39
45 0.4
46 0.42
47 0.4
48 0.41
49 0.34
50 0.32
51 0.3
52 0.28
53 0.27
54 0.28
55 0.3
56 0.32
57 0.38
58 0.41
59 0.42
60 0.43
61 0.43
62 0.4
63 0.42
64 0.39
65 0.37
66 0.36
67 0.32
68 0.31
69 0.3
70 0.29
71 0.24
72 0.24
73 0.25
74 0.23
75 0.25
76 0.26
77 0.28
78 0.31
79 0.37
80 0.36
81 0.31
82 0.29
83 0.29
84 0.26
85 0.25
86 0.22
87 0.19
88 0.2
89 0.22
90 0.24
91 0.24
92 0.25
93 0.23
94 0.2
95 0.16
96 0.14
97 0.1
98 0.08
99 0.07
100 0.04
101 0.04
102 0.04
103 0.04
104 0.03
105 0.03
106 0.03
107 0.03
108 0.04
109 0.05
110 0.08
111 0.1
112 0.15
113 0.18
114 0.21
115 0.21
116 0.26
117 0.32
118 0.31
119 0.3
120 0.28
121 0.27
122 0.25
123 0.26
124 0.22
125 0.2
126 0.2
127 0.19
128 0.22
129 0.24
130 0.24
131 0.23
132 0.23
133 0.21
134 0.22
135 0.22
136 0.19
137 0.23
138 0.25
139 0.28
140 0.29
141 0.3
142 0.31
143 0.33
144 0.31
145 0.27
146 0.31
147 0.3
148 0.29
149 0.27
150 0.26
151 0.23
152 0.23
153 0.21
154 0.14
155 0.14
156 0.14
157 0.14
158 0.17
159 0.17
160 0.19
161 0.19
162 0.19
163 0.19
164 0.2
165 0.22
166 0.18
167 0.24
168 0.26
169 0.27
170 0.35
171 0.36
172 0.35
173 0.35
174 0.44
175 0.45
176 0.45
177 0.47
178 0.41
179 0.47
180 0.48
181 0.44
182 0.35
183 0.33
184 0.35
185 0.35
186 0.33
187 0.25
188 0.25
189 0.28
190 0.31
191 0.28
192 0.27
193 0.24
194 0.23
195 0.24
196 0.22
197 0.22
198 0.2
199 0.2
200 0.19
201 0.21
202 0.22
203 0.24
204 0.32
205 0.38
206 0.42
207 0.44
208 0.45
209 0.5
210 0.5
211 0.53
212 0.49
213 0.44
214 0.42
215 0.39
216 0.33
217 0.28
218 0.31
219 0.26
220 0.24
221 0.21
222 0.18
223 0.17
224 0.18
225 0.18
226 0.17
227 0.17
228 0.14
229 0.13
230 0.14
231 0.12
232 0.12
233 0.12
234 0.12
235 0.11
236 0.13
237 0.15
238 0.17
239 0.24
240 0.25
241 0.33
242 0.39
243 0.4
244 0.43
245 0.46
246 0.54
247 0.54
248 0.56
249 0.47
250 0.43
251 0.42
252 0.4
253 0.36
254 0.3
255 0.33
256 0.33
257 0.36
258 0.33
259 0.35
260 0.38
261 0.41
262 0.43
263 0.36
264 0.32
265 0.29
266 0.3
267 0.26
268 0.22
269 0.18
270 0.12
271 0.09
272 0.07
273 0.07
274 0.08
275 0.12
276 0.12
277 0.12
278 0.13
279 0.15
280 0.18
281 0.2
282 0.23
283 0.27
284 0.28
285 0.3
286 0.31
287 0.29
288 0.29
289 0.32
290 0.28
291 0.21
292 0.22
293 0.19
294 0.19
295 0.2
296 0.17
297 0.17
298 0.15
299 0.16
300 0.18
301 0.17
302 0.2
303 0.2
304 0.18
305 0.15
306 0.18
307 0.17
308 0.18
309 0.2
310 0.23
311 0.28
312 0.31
313 0.3
314 0.3
315 0.29
316 0.26
317 0.25
318 0.2
319 0.15
320 0.13
321 0.12
322 0.11
323 0.11
324 0.11
325 0.09
326 0.09
327 0.12
328 0.12
329 0.14
330 0.16
331 0.18
332 0.18
333 0.18
334 0.18
335 0.16
336 0.16
337 0.14
338 0.1
339 0.11
340 0.11
341 0.1
342 0.11
343 0.11
344 0.1
345 0.09
346 0.09
347 0.1
348 0.12
349 0.15
350 0.16
351 0.17
352 0.2
353 0.26
354 0.26
355 0.24
356 0.24
357 0.23
358 0.3
359 0.36
360 0.34
361 0.29
362 0.28
363 0.27
364 0.26
365 0.23
366 0.15
367 0.07
368 0.07
369 0.06
370 0.06
371 0.07
372 0.07
373 0.06
374 0.06
375 0.06
376 0.06
377 0.06
378 0.07
379 0.06
380 0.07
381 0.11
382 0.11
383 0.11
384 0.11
385 0.12
386 0.12
387 0.12
388 0.12
389 0.11
390 0.18
391 0.2
392 0.22
393 0.22
394 0.21
395 0.21
396 0.2
397 0.17
398 0.1
399 0.08
400 0.05
401 0.05
402 0.05
403 0.04
404 0.04
405 0.04
406 0.04
407 0.03
408 0.03
409 0.03
410 0.03
411 0.04
412 0.04
413 0.05
414 0.05
415 0.05
416 0.05
417 0.06
418 0.06
419 0.07
420 0.07
421 0.07
422 0.1
423 0.1
424 0.1
425 0.1
426 0.11
427 0.11
428 0.12
429 0.12
430 0.11
431 0.12
432 0.12
433 0.12
434 0.11
435 0.11
436 0.11
437 0.1
438 0.08
439 0.08
440 0.08
441 0.09
442 0.08
443 0.09
444 0.1
445 0.11
446 0.13
447 0.12
448 0.12
449 0.11
450 0.13
451 0.12
452 0.1
453 0.09
454 0.08
455 0.09
456 0.08
457 0.09
458 0.08
459 0.09
460 0.08
461 0.08
462 0.07
463 0.08
464 0.08
465 0.08
466 0.07
467 0.07
468 0.07
469 0.07
470 0.08
471 0.12
472 0.12
473 0.13
474 0.14
475 0.16
476 0.26
477 0.31
478 0.36
479 0.34
480 0.41
481 0.42
482 0.43
483 0.47
484 0.39
485 0.37
486 0.32
487 0.31
488 0.25
489 0.25
490 0.24
491 0.18
492 0.16
493 0.17
494 0.17
495 0.16
496 0.14
497 0.13
498 0.11
499 0.13
500 0.13
501 0.13
502 0.15
503 0.15
504 0.15
505 0.15
506 0.14
507 0.12
508 0.12
509 0.08
510 0.06
511 0.05
512 0.06
513 0.05
514 0.05
515 0.05
516 0.04
517 0.04
518 0.04
519 0.04
520 0.04
521 0.05
522 0.06
523 0.07
524 0.09
525 0.12
526 0.13
527 0.13
528 0.16
529 0.17
530 0.18
531 0.18
532 0.19
533 0.16
534 0.17
535 0.18
536 0.16
537 0.14
538 0.12
539 0.11
540 0.11
541 0.13
542 0.13
543 0.14
544 0.13
545 0.13
546 0.14
547 0.14
548 0.11
549 0.1
550 0.09
551 0.08
552 0.08
553 0.09
554 0.08
555 0.08
556 0.08
557 0.07
558 0.07
559 0.05
560 0.05
561 0.04
562 0.04
563 0.05
564 0.05
565 0.05
566 0.05
567 0.05
568 0.05
569 0.06
570 0.07
571 0.08
572 0.1
573 0.12
574 0.12
575 0.17
576 0.24
577 0.28
578 0.27
579 0.28
580 0.28
581 0.29
582 0.31
583 0.27
584 0.22
585 0.19
586 0.18
587 0.21
588 0.19
589 0.17
590 0.14
591 0.14
592 0.12
593 0.12
594 0.11
595 0.08
596 0.07
597 0.06
598 0.05
599 0.05
600 0.05
601 0.04
602 0.05
603 0.04
604 0.05
605 0.06
606 0.06
607 0.07
608 0.09
609 0.1
610 0.13
611 0.16
612 0.21
613 0.25
614 0.31
615 0.37
616 0.37
617 0.37
618 0.37
619 0.38
620 0.39
621 0.42
622 0.44
623 0.43
624 0.43
625 0.46
626 0.51
627 0.5
628 0.46
629 0.41
630 0.36
631 0.33
632 0.35
633 0.34
634 0.32
635 0.34
636 0.34
637 0.32
638 0.32
639 0.31
640 0.28
641 0.27
642 0.25
643 0.27
644 0.25
645 0.29
646 0.34
647 0.36
648 0.36
649 0.35
650 0.33
651 0.3
652 0.32
653 0.27
654 0.29
655 0.28
656 0.27
657 0.26
658 0.25
659 0.22
660 0.2
661 0.2
662 0.14
663 0.16
664 0.18
665 0.2
666 0.24
667 0.26
668 0.34
669 0.44
670 0.44
671 0.47
672 0.5
673 0.53
674 0.53
675 0.55
676 0.5
677 0.43
678 0.42
679 0.38
680 0.33
681 0.28
682 0.27
683 0.23
684 0.18
685 0.14
686 0.13
687 0.12
688 0.13
689 0.15
690 0.12
691 0.14
692 0.18
693 0.26
694 0.32
695 0.33
696 0.33
697 0.4
698 0.42
699 0.46
700 0.51
701 0.47
702 0.42
703 0.41
704 0.39
705 0.33
706 0.3
707 0.26
708 0.23
709 0.19
710 0.19
711 0.19
712 0.19
713 0.16
714 0.16
715 0.18
716 0.13
717 0.15
718 0.14
719 0.14
720 0.16
721 0.18
722 0.18
723 0.15
724 0.17
725 0.17
726 0.21
727 0.2
728 0.2
729 0.23
730 0.24
731 0.27
732 0.25
733 0.22
734 0.18
735 0.19
736 0.2
737 0.15
738 0.15
739 0.19
740 0.24
741 0.27
742 0.28
743 0.31
744 0.35
745 0.42
746 0.51
747 0.55
748 0.57
749 0.62
750 0.67
751 0.68
752 0.65
753 0.66
754 0.61
755 0.59
756 0.59
757 0.53
758 0.47
759 0.42
760 0.38
761 0.3
762 0.26
763 0.19
764 0.13
765 0.13
766 0.13
767 0.17
768 0.17
769 0.2
770 0.27
771 0.31
772 0.35
773 0.45
774 0.5
775 0.51
776 0.57
777 0.57
778 0.52
779 0.53
780 0.54
781 0.46
782 0.42
783 0.38
784 0.33
785 0.3
786 0.27
787 0.2
788 0.14
789 0.12
790 0.11
791 0.14
792 0.13
793 0.12
794 0.13
795 0.16
796 0.17
797 0.24
798 0.27
799 0.28
800 0.35
801 0.44
802 0.53
803 0.59
804 0.62
805 0.65
806 0.63
807 0.65
808 0.63
809 0.6
810 0.54
811 0.51
812 0.51
813 0.43
814 0.45
815 0.4
816 0.36
817 0.33
818 0.3
819 0.27
820 0.26
821 0.24
822 0.19
823 0.24
824 0.22
825 0.22
826 0.22
827 0.19
828 0.16
829 0.16
830 0.16
831 0.15
832 0.17
833 0.17
834 0.21
835 0.26
836 0.28
837 0.31
838 0.37
839 0.44
840 0.45
841 0.46
842 0.48
843 0.49
844 0.58
845 0.62
846 0.62
847 0.52
848 0.51
849 0.54
850 0.47
851 0.44
852 0.36
853 0.28
854 0.21
855 0.2
856 0.21
857 0.17
858 0.18
859 0.17
860 0.23
861 0.22
862 0.21
863 0.28
864 0.25
865 0.25
866 0.27
867 0.27
868 0.21
869 0.24
870 0.27
871 0.25
872 0.27
873 0.26
874 0.24
875 0.25
876 0.27
877 0.28
878 0.27
879 0.26
880 0.3
881 0.37
882 0.47
883 0.56
884 0.62
885 0.69
886 0.78
887 0.86
888 0.91
889 0.93
890 0.93
891 0.93
892 0.9
893 0.88
894 0.89
895 0.88
896 0.88
897 0.89
898 0.86
899 0.87
900 0.87
901 0.84
902 0.78
903 0.78
904 0.77
905 0.76
906 0.78
907 0.77
908 0.78
909 0.74
910 0.7
911 0.61
912 0.52
913 0.45
914 0.39
915 0.34
916 0.25
917 0.23
918 0.2
919 0.19
920 0.18
921 0.14
922 0.09
923 0.06
924 0.06
925 0.06
926 0.08
927 0.09
928 0.12
929 0.14
930 0.16
931 0.2
932 0.21
933 0.26
934 0.29
935 0.3
936 0.29
937 0.29
938 0.28
939 0.25
940 0.28
941 0.23
942 0.23
943 0.21
944 0.22
945 0.26
946 0.28
947 0.28
948 0.27
949 0.3
950 0.27
951 0.31
952 0.32
953 0.28