Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0XC27

Protein Details
Accession A0A4U0XC27    Localization Confidence High Confidence Score 21.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
60-86VDEAAPAKPKKRTKSPAKKPRTVTEAAHydrophilic
109-151PENSEPEKAKKPRKPRAKAGEASTTAPKKPARPRKAKVTFQEDHydrophilic
423-453AQDLRIRVQRQKAKKSVKGRKKKGAEGSAEAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
53-80RKPRKKTVDEAAPAKPKKRTKSPAKKPR
115-145EKAKKPRKPRAKAGEASTTAPKKPARPRKAK
431-447QRQKAKKSVKGRKKKGA
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 10.5, mito 6, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018574  Structure-sp_endonuc_su_Slx4  
Gene Ontology GO:0033557  C:Slx1-Slx4 complex  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006260  P:DNA replication  
GO:0006996  P:organelle organization  
Pfam View protein in Pfam  
PF09494  Slx4  
Amino Acid Sequences MDSVNSPRKPLSELIGNLSYTAPAEKRHLSGETTIKRRRIELQDPAATSVLARKPRKKTVDEAAPAKPKKRTKSPAKKPRTVTEAATAAYQIPPAPVEPTSAASKFFAPENSEPEKAKKPRKPRAKAGEASTTAPKKPARPRKAKVTFQEDLPPSLFSPQHANQQAEQQCFLFGTSSQLAAEESPTFIRQMQAAIIESELIPSTQAMGISPAKMSCARVPTAPHGTSLSVGQADSEHWRAASRDWNGGLLREKSGLKVRKKAAAPAVNLLKEAEVNGRPPEVTPPAQIVPSHVEQPQQILASEPDSFIDIDDISDHEPPPTPSPPRRKASAPLIPVRPLTFNITFPSAPAPVKQPEKIILASSAVLKVTDTQWPLIKAQLFPQVTAAVKAAARSTDPARPSWNQKILLYDPIVLEDLTAWLNAQDLRIRVQRQKAKKSVKGRKKKGAEGSAEAALRSEPDFEEVREEVQGWMVQKWCEEKSVCCLWKEGLRGGVRSNY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.41
3 0.39
4 0.36
5 0.33
6 0.28
7 0.2
8 0.21
9 0.16
10 0.16
11 0.21
12 0.24
13 0.26
14 0.29
15 0.31
16 0.3
17 0.35
18 0.42
19 0.45
20 0.51
21 0.56
22 0.58
23 0.58
24 0.59
25 0.61
26 0.6
27 0.6
28 0.61
29 0.63
30 0.63
31 0.63
32 0.62
33 0.53
34 0.43
35 0.35
36 0.32
37 0.29
38 0.32
39 0.39
40 0.45
41 0.53
42 0.63
43 0.71
44 0.68
45 0.7
46 0.71
47 0.73
48 0.72
49 0.69
50 0.68
51 0.7
52 0.68
53 0.66
54 0.64
55 0.62
56 0.63
57 0.69
58 0.71
59 0.73
60 0.81
61 0.87
62 0.89
63 0.91
64 0.91
65 0.87
66 0.85
67 0.8
68 0.72
69 0.64
70 0.6
71 0.52
72 0.44
73 0.38
74 0.3
75 0.23
76 0.2
77 0.17
78 0.11
79 0.09
80 0.09
81 0.09
82 0.11
83 0.1
84 0.12
85 0.13
86 0.15
87 0.19
88 0.19
89 0.2
90 0.19
91 0.2
92 0.18
93 0.19
94 0.19
95 0.2
96 0.22
97 0.28
98 0.31
99 0.33
100 0.34
101 0.37
102 0.44
103 0.47
104 0.55
105 0.57
106 0.63
107 0.7
108 0.8
109 0.83
110 0.84
111 0.86
112 0.86
113 0.83
114 0.78
115 0.76
116 0.67
117 0.61
118 0.58
119 0.5
120 0.41
121 0.4
122 0.37
123 0.37
124 0.45
125 0.53
126 0.57
127 0.64
128 0.7
129 0.76
130 0.83
131 0.84
132 0.81
133 0.78
134 0.7
135 0.61
136 0.63
137 0.53
138 0.46
139 0.38
140 0.31
141 0.23
142 0.24
143 0.22
144 0.15
145 0.21
146 0.21
147 0.28
148 0.32
149 0.33
150 0.31
151 0.39
152 0.43
153 0.38
154 0.36
155 0.28
156 0.24
157 0.22
158 0.21
159 0.13
160 0.08
161 0.11
162 0.1
163 0.1
164 0.1
165 0.1
166 0.1
167 0.1
168 0.11
169 0.07
170 0.07
171 0.08
172 0.08
173 0.09
174 0.09
175 0.09
176 0.08
177 0.09
178 0.08
179 0.09
180 0.09
181 0.09
182 0.08
183 0.08
184 0.07
185 0.07
186 0.06
187 0.05
188 0.04
189 0.04
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.08
195 0.09
196 0.09
197 0.1
198 0.09
199 0.09
200 0.1
201 0.12
202 0.12
203 0.14
204 0.14
205 0.16
206 0.18
207 0.22
208 0.27
209 0.26
210 0.24
211 0.22
212 0.22
213 0.21
214 0.19
215 0.14
216 0.08
217 0.08
218 0.07
219 0.06
220 0.06
221 0.09
222 0.09
223 0.09
224 0.08
225 0.09
226 0.1
227 0.11
228 0.17
229 0.16
230 0.17
231 0.17
232 0.2
233 0.19
234 0.2
235 0.22
236 0.17
237 0.16
238 0.15
239 0.15
240 0.15
241 0.23
242 0.29
243 0.3
244 0.36
245 0.38
246 0.42
247 0.43
248 0.46
249 0.46
250 0.44
251 0.41
252 0.39
253 0.41
254 0.34
255 0.33
256 0.29
257 0.2
258 0.15
259 0.14
260 0.12
261 0.09
262 0.1
263 0.11
264 0.11
265 0.11
266 0.11
267 0.14
268 0.15
269 0.15
270 0.14
271 0.17
272 0.17
273 0.18
274 0.18
275 0.16
276 0.16
277 0.16
278 0.18
279 0.16
280 0.17
281 0.16
282 0.18
283 0.17
284 0.14
285 0.12
286 0.11
287 0.11
288 0.11
289 0.11
290 0.1
291 0.08
292 0.08
293 0.08
294 0.07
295 0.07
296 0.06
297 0.05
298 0.06
299 0.06
300 0.07
301 0.08
302 0.08
303 0.08
304 0.1
305 0.12
306 0.16
307 0.2
308 0.25
309 0.32
310 0.42
311 0.5
312 0.53
313 0.55
314 0.54
315 0.56
316 0.59
317 0.59
318 0.55
319 0.53
320 0.52
321 0.5
322 0.47
323 0.42
324 0.34
325 0.28
326 0.27
327 0.22
328 0.21
329 0.21
330 0.23
331 0.21
332 0.2
333 0.21
334 0.18
335 0.17
336 0.17
337 0.19
338 0.22
339 0.26
340 0.27
341 0.27
342 0.28
343 0.31
344 0.3
345 0.27
346 0.22
347 0.19
348 0.18
349 0.17
350 0.14
351 0.11
352 0.1
353 0.09
354 0.09
355 0.1
356 0.14
357 0.14
358 0.15
359 0.18
360 0.2
361 0.21
362 0.23
363 0.24
364 0.2
365 0.23
366 0.3
367 0.27
368 0.26
369 0.27
370 0.25
371 0.23
372 0.24
373 0.2
374 0.14
375 0.13
376 0.14
377 0.13
378 0.11
379 0.12
380 0.14
381 0.17
382 0.2
383 0.22
384 0.23
385 0.28
386 0.32
387 0.39
388 0.46
389 0.49
390 0.47
391 0.46
392 0.51
393 0.47
394 0.48
395 0.41
396 0.34
397 0.27
398 0.25
399 0.24
400 0.18
401 0.15
402 0.1
403 0.1
404 0.08
405 0.08
406 0.06
407 0.05
408 0.07
409 0.08
410 0.09
411 0.11
412 0.12
413 0.18
414 0.24
415 0.29
416 0.35
417 0.44
418 0.52
419 0.59
420 0.68
421 0.73
422 0.77
423 0.81
424 0.86
425 0.87
426 0.89
427 0.9
428 0.9
429 0.9
430 0.88
431 0.89
432 0.88
433 0.85
434 0.8
435 0.75
436 0.68
437 0.62
438 0.54
439 0.45
440 0.35
441 0.26
442 0.21
443 0.16
444 0.14
445 0.1
446 0.13
447 0.15
448 0.15
449 0.2
450 0.19
451 0.2
452 0.19
453 0.2
454 0.16
455 0.17
456 0.19
457 0.16
458 0.18
459 0.2
460 0.2
461 0.22
462 0.27
463 0.25
464 0.29
465 0.3
466 0.29
467 0.34
468 0.43
469 0.44
470 0.4
471 0.41
472 0.39
473 0.42
474 0.44
475 0.41
476 0.39
477 0.39
478 0.4