FuNGI

A0A4U0WCS3

Protein Details

Accession

A0A4U0WCS3

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
71-98	EEDEEGRERRREKRKRRREEKEVEDENL	Acidic
115-140	RVQAQQSKFKRLKRGHREERPASEAR	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
77-89	RERRREKRKRRRE
124-131	KRLKRGHR

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 14, cyto 7.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012337 RNaseH-like_sf IPR010994 RuvA_2-like IPR028083 Spt6_acidic_N_dom IPR032706 Spt6_HHH IPR028088 Spt6_HTH_DNA-bd_dom IPR028231 Spt6_YqgF IPR023323 Tex-like_dom_sf IPR023319 Tex-like_HTH_dom_sf IPR017072 TF_Spt6 IPR037027 YqgF/RNaseH-like_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006139 P:nucleobase-containing compound metabolic process GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF14635 HHH_7 PF14641 HTH_44 PF14632 SPT6_acidic PF14639 YqgF

Amino Acid Sequences

MDGFFETTAVEGSEEEEEADDVDEETGEVVSRSGKSKARNGDLGDSSEEEEDDDEEEARRIREGFIVDDPEEDEEGRERRREKRKRRREEKEVEDENLDEEDLELIGVTHPDEDRVQAQQSKFKRLKRGHREERPASEARGVEDIFSDDDEGAEGATAGRGRAFDYQGDDLGDFIEEDEFPDEERGGIDEDLGIRAPKRAGYADIQNLKDSGLGEAALEDMRHAFGDGDEFGWALAAEAEHNEENLDPDKPLELKDVFEPSQLIEKMLTEEDNIIRMTDVPERFQLARKPYKDLTQLSGEQMEARNAEEAAWIATYMYPHKRNLGLSLREPFEQAIKKVLHFMNVEDFEPPFIFPNRKDYLIHSEQVPNSPDPNNPNAPKYTIRAEKLLSQDDLWTIVEHDLKFRTFDEKRDAIHKSLETLKDVLPEFSDTVFDDLIPLAAQIDDLQDVQDYLNFQYSQQLREHNVEQAEANGTQKRARGTRSVWDKVRAGPAYHLVRAFGIAADAIAQNAERAGNRTYTEDSDKRPDDLADTLVQEPEFKTGEDVLTAGKAMFVEEMVMSPRVRRLLRKVYYEQLVFDVHRTDKGLKQIDEDHPYYEFKYLRNQEIKNIFDQPELFLRMLKAESEGLVEVHVRLPREKTVKNELYRAIESDSFSEVADAWNALRRECVDVAFAKLHKVIARGVKDTIKNECENRIGADCRKAYNEKLDQAAYRPTGMVLGTIPRVLALSNGAGNRGDAVCWAYMEENGRVQETGKFIELRPGNPEKFLEDGKDIAAFVELVERRKPDVIAVSGWSVETRNVYKDMKTIIESRQLMGAPYEDQDEDRERQDPLDVVIVNDEVARLYQTSKRAEAEFPAMPPLTRYCIALARYMQDPMKEYASLGKDIVSISFDANQQLIPDEKLLKYLETSMVDMVNLVGVDINEAVADAYTGNLLQYICGLGQRKAAQMIKMINLNGGE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.09
2	0.09
3	0.09
4	0.09
5	0.09
6	0.1
7	0.08
8	0.08
9	0.08
10	0.07
11	0.07
12	0.07
13	0.07
14	0.06
15	0.06
16	0.06
17	0.09
18	0.11
19	0.14
20	0.2
21	0.24
22	0.31
23	0.39
24	0.48
25	0.52
26	0.56
27	0.57
28	0.59
29	0.58
30	0.54
31	0.49
32	0.41
33	0.35
34	0.29
35	0.25
36	0.18
37	0.15
38	0.13
39	0.11
40	0.1
41	0.1
42	0.1
43	0.12
44	0.14
45	0.14
46	0.15
47	0.15
48	0.15
49	0.18
50	0.2
51	0.21
52	0.24
53	0.28
54	0.26
55	0.26
56	0.26
57	0.24
58	0.23
59	0.19
60	0.16
61	0.16
62	0.2
63	0.24
64	0.29
65	0.32
66	0.41
67	0.52
68	0.62
69	0.69
70	0.75
71	0.83
72	0.88
73	0.94
74	0.95
75	0.95
76	0.95
77	0.93
78	0.92
79	0.87
80	0.78
81	0.69
82	0.58
83	0.48
84	0.38
85	0.28
86	0.17
87	0.12
88	0.09
89	0.07
90	0.07
91	0.05
92	0.05
93	0.05
94	0.06
95	0.06
96	0.07
97	0.07
98	0.09
99	0.1
100	0.12
101	0.14
102	0.17
103	0.21
104	0.26
105	0.28
106	0.34
107	0.38
108	0.47
109	0.51
110	0.55
111	0.6
112	0.64
113	0.73
114	0.76
115	0.83
116	0.83
117	0.87
118	0.91
119	0.89
120	0.86
121	0.81
122	0.73
123	0.64
124	0.58
125	0.49
126	0.4
127	0.37
128	0.29
129	0.23
130	0.2
131	0.19
132	0.15
133	0.14
134	0.13
135	0.09
136	0.08
137	0.09
138	0.08
139	0.06
140	0.05
141	0.05
142	0.04
143	0.06
144	0.06
145	0.06
146	0.07
147	0.07
148	0.09
149	0.13
150	0.15
151	0.15
152	0.19
153	0.21
154	0.21
155	0.22
156	0.2
157	0.16
158	0.14
159	0.13
160	0.08
161	0.07
162	0.07
163	0.05
164	0.07
165	0.08
166	0.08
167	0.09
168	0.1
169	0.1
170	0.09
171	0.09
172	0.09
173	0.1
174	0.09
175	0.09
176	0.09
177	0.09
178	0.1
179	0.1
180	0.1
181	0.08
182	0.1
183	0.11
184	0.12
185	0.14
186	0.14
187	0.17
188	0.2
189	0.27
190	0.33
191	0.39
192	0.39
193	0.37
194	0.36
195	0.33
196	0.3
197	0.23
198	0.16
199	0.09
200	0.08
201	0.07
202	0.07
203	0.08
204	0.07
205	0.06
206	0.05
207	0.05
208	0.06
209	0.06
210	0.06
211	0.06
212	0.06
213	0.08
214	0.08
215	0.08
216	0.08
217	0.07
218	0.07
219	0.07
220	0.06
221	0.04
222	0.04
223	0.04
224	0.04
225	0.05
226	0.07
227	0.07
228	0.07
229	0.08
230	0.07
231	0.1
232	0.11
233	0.11
234	0.09
235	0.09
236	0.12
237	0.12
238	0.13
239	0.16
240	0.15
241	0.15
242	0.18
243	0.23
244	0.21
245	0.21
246	0.21
247	0.17
248	0.23
249	0.22
250	0.2
251	0.15
252	0.15
253	0.16
254	0.16
255	0.16
256	0.09
257	0.12
258	0.11
259	0.13
260	0.12
261	0.11
262	0.1
263	0.1
264	0.12
265	0.16
266	0.16
267	0.17
268	0.18
269	0.21
270	0.22
271	0.26
272	0.29
273	0.31
274	0.39
275	0.39
276	0.44
277	0.43
278	0.48
279	0.51
280	0.48
281	0.43
282	0.4
283	0.4
284	0.35
285	0.34
286	0.27
287	0.22
288	0.2
289	0.18
290	0.13
291	0.12
292	0.11
293	0.1
294	0.1
295	0.08
296	0.08
297	0.07
298	0.06
299	0.06
300	0.05
301	0.06
302	0.06
303	0.1
304	0.17
305	0.19
306	0.2
307	0.23
308	0.26
309	0.26
310	0.32
311	0.36
312	0.34
313	0.35
314	0.39
315	0.38
316	0.35
317	0.35
318	0.29
319	0.26
320	0.25
321	0.21
322	0.23
323	0.22
324	0.22
325	0.27
326	0.27
327	0.26
328	0.24
329	0.24
330	0.25
331	0.25
332	0.25
333	0.2
334	0.19
335	0.15
336	0.15
337	0.15
338	0.1
339	0.11
340	0.14
341	0.14
342	0.21
343	0.23
344	0.24
345	0.25
346	0.27
347	0.33
348	0.34
349	0.34
350	0.29
351	0.31
352	0.3
353	0.32
354	0.31
355	0.23
356	0.22
357	0.22
358	0.23
359	0.22
360	0.26
361	0.29
362	0.29
363	0.3
364	0.29
365	0.31
366	0.31
367	0.3
368	0.32
369	0.31
370	0.31
371	0.31
372	0.3
373	0.32
374	0.33
375	0.33
376	0.27
377	0.21
378	0.2
379	0.18
380	0.18
381	0.13
382	0.1
383	0.08
384	0.09
385	0.12
386	0.11
387	0.12
388	0.13
389	0.13
390	0.13
391	0.13
392	0.2
393	0.18
394	0.22
395	0.27
396	0.28
397	0.29
398	0.34
399	0.35
400	0.29
401	0.31
402	0.28
403	0.23
404	0.26
405	0.26
406	0.23
407	0.22
408	0.21
409	0.21
410	0.21
411	0.18
412	0.13
413	0.13
414	0.12
415	0.11
416	0.11
417	0.08
418	0.08
419	0.08
420	0.07
421	0.06
422	0.06
423	0.05
424	0.05
425	0.04
426	0.03
427	0.03
428	0.03
429	0.03
430	0.04
431	0.04
432	0.04
433	0.04
434	0.04
435	0.04
436	0.04
437	0.05
438	0.06
439	0.06
440	0.08
441	0.08
442	0.08
443	0.15
444	0.16
445	0.17
446	0.18
447	0.21
448	0.2
449	0.23
450	0.25
451	0.21
452	0.2
453	0.18
454	0.17
455	0.15
456	0.14
457	0.11
458	0.11
459	0.1
460	0.1
461	0.11
462	0.13
463	0.15
464	0.16
465	0.18
466	0.21
467	0.22
468	0.29
469	0.36
470	0.4
471	0.39
472	0.41
473	0.4
474	0.37
475	0.41
476	0.34
477	0.26
478	0.22
479	0.26
480	0.25
481	0.25
482	0.23
483	0.17
484	0.16
485	0.15
486	0.14
487	0.08
488	0.05
489	0.04
490	0.04
491	0.04
492	0.04
493	0.03
494	0.03
495	0.03
496	0.03
497	0.04
498	0.04
499	0.04
500	0.06
501	0.08
502	0.09
503	0.1
504	0.12
505	0.14
506	0.15
507	0.21
508	0.22
509	0.23
510	0.29
511	0.29
512	0.28
513	0.27
514	0.25
515	0.2
516	0.19
517	0.18
518	0.12
519	0.13
520	0.12
521	0.12
522	0.12
523	0.11
524	0.1
525	0.1
526	0.1
527	0.08
528	0.08
529	0.08
530	0.09
531	0.08
532	0.08
533	0.06
534	0.06
535	0.06
536	0.05
537	0.04
538	0.04
539	0.04
540	0.04
541	0.04
542	0.04
543	0.04
544	0.04
545	0.05
546	0.07
547	0.07
548	0.07
549	0.09
550	0.14
551	0.15
552	0.19
553	0.25
554	0.34
555	0.39
556	0.45
557	0.47
558	0.47
559	0.5
560	0.47
561	0.39
562	0.31
563	0.27
564	0.21
565	0.18
566	0.16
567	0.13
568	0.13
569	0.15
570	0.15
571	0.17
572	0.24
573	0.28
574	0.26
575	0.28
576	0.33
577	0.36
578	0.39
579	0.37
580	0.3
581	0.27
582	0.27
583	0.25
584	0.23
585	0.2
586	0.16
587	0.24
588	0.27
589	0.33
590	0.39
591	0.39
592	0.42
593	0.47
594	0.48
595	0.41
596	0.42
597	0.35
598	0.29
599	0.29
600	0.24
601	0.21
602	0.21
603	0.19
604	0.15
605	0.14
606	0.14
607	0.14
608	0.12
609	0.1
610	0.08
611	0.08
612	0.09
613	0.09
614	0.08
615	0.08
616	0.08
617	0.07
618	0.09
619	0.11
620	0.11
621	0.12
622	0.14
623	0.2
624	0.26
625	0.28
626	0.31
627	0.4
628	0.47
629	0.48
630	0.5
631	0.48
632	0.46
633	0.44
634	0.4
635	0.32
636	0.26
637	0.24
638	0.21
639	0.19
640	0.15
641	0.14
642	0.13
643	0.1
644	0.09
645	0.08
646	0.07
647	0.06
648	0.11
649	0.11
650	0.11
651	0.12
652	0.12
653	0.16
654	0.17
655	0.17
656	0.14
657	0.15
658	0.18
659	0.2
660	0.19
661	0.17
662	0.17
663	0.18
664	0.17
665	0.17
666	0.19
667	0.22
668	0.25
669	0.26
670	0.28
671	0.32
672	0.34
673	0.35
674	0.37
675	0.35
676	0.35
677	0.35
678	0.36
679	0.33
680	0.3
681	0.3
682	0.27
683	0.27
684	0.27
685	0.31
686	0.29
687	0.29
688	0.33
689	0.34
690	0.32
691	0.37
692	0.4
693	0.36
694	0.37
695	0.37
696	0.34
697	0.33
698	0.36
699	0.27
700	0.23
701	0.2
702	0.16
703	0.15
704	0.14
705	0.12
706	0.08
707	0.09
708	0.09
709	0.09
710	0.09
711	0.08
712	0.08
713	0.08
714	0.07
715	0.06
716	0.07
717	0.1
718	0.1
719	0.11
720	0.11
721	0.11
722	0.13
723	0.11
724	0.1
725	0.08
726	0.09
727	0.09
728	0.09
729	0.09
730	0.08
731	0.1
732	0.13
733	0.13
734	0.15
735	0.15
736	0.16
737	0.15
738	0.16
739	0.17
740	0.17
741	0.17
742	0.17
743	0.18
744	0.17
745	0.25
746	0.26
747	0.24
748	0.29
749	0.35
750	0.33
751	0.34
752	0.34
753	0.28
754	0.29
755	0.29
756	0.25
757	0.2
758	0.2
759	0.18
760	0.18
761	0.15
762	0.13
763	0.12
764	0.08
765	0.07
766	0.13
767	0.14
768	0.16
769	0.19
770	0.2
771	0.22
772	0.24
773	0.25
774	0.2
775	0.24
776	0.23
777	0.22
778	0.23
779	0.22
780	0.2
781	0.2
782	0.18
783	0.13
784	0.12
785	0.14
786	0.14
787	0.16
788	0.2
789	0.22
790	0.23
791	0.26
792	0.28
793	0.26
794	0.27
795	0.29
796	0.28
797	0.35
798	0.35
799	0.32
800	0.33
801	0.3
802	0.28
803	0.25
804	0.22
805	0.14
806	0.14
807	0.16
808	0.13
809	0.13
810	0.16
811	0.2
812	0.21
813	0.22
814	0.23
815	0.21
816	0.21
817	0.23
818	0.2
819	0.17
820	0.2
821	0.18
822	0.16
823	0.17
824	0.16
825	0.14
826	0.13
827	0.12
828	0.07
829	0.07
830	0.07
831	0.07
832	0.1
833	0.14
834	0.2
835	0.25
836	0.28
837	0.31
838	0.32
839	0.33
840	0.34
841	0.35
842	0.31
843	0.28
844	0.3
845	0.27
846	0.24
847	0.25
848	0.24
849	0.23
850	0.22
851	0.22
852	0.2
853	0.25
854	0.26
855	0.3
856	0.29
857	0.27
858	0.28
859	0.31
860	0.3
861	0.27
862	0.29
863	0.26
864	0.27
865	0.24
866	0.23
867	0.26
868	0.27
869	0.27
870	0.23
871	0.21
872	0.19
873	0.2
874	0.2
875	0.14
876	0.12
877	0.12
878	0.15
879	0.15
880	0.15
881	0.15
882	0.15
883	0.14
884	0.15
885	0.16
886	0.14
887	0.16
888	0.19
889	0.18
890	0.22
891	0.22
892	0.21
893	0.21
894	0.22
895	0.24
896	0.22
897	0.24
898	0.21
899	0.21
900	0.19
901	0.18
902	0.15
903	0.11
904	0.08
905	0.07
906	0.06
907	0.06
908	0.07
909	0.07
910	0.07
911	0.05
912	0.06
913	0.06
914	0.05
915	0.05
916	0.04
917	0.04
918	0.05
919	0.05
920	0.05
921	0.07
922	0.07
923	0.07
924	0.08
925	0.09
926	0.09
927	0.14
928	0.17
929	0.16
930	0.23
931	0.26
932	0.28
933	0.35
934	0.38
935	0.35
936	0.39
937	0.42
938	0.39
939	0.41
940	0.38

A0A4U0WCS3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer