Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4R583

Protein Details
Accession C4R583    Localization Confidence High Confidence Score 16.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
292-311DQKMNERKNNINKENRKAIDHydrophilic
367-395SADASSKRKQSGRRRQRRRKHSRKVSQNEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
373-390KRKQSGRRRQRRRKHSRK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 15
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031398  She3  
Gene Ontology GO:0005789  C:endoplasmic reticulum membrane  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0048309  P:endoplasmic reticulum inheritance  
GO:0051028  P:mRNA transport  
KEGG ppa:PAS_chr3_0671  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF17078  SHE3  
Amino Acid Sequences MSDFGDSLRSPTKSSGTSRVIESLHQQINSYSQSLEESNLELNEYKRKYSAVQKRLDSVTDQLENSKYQQDTVASMLRRKERKIADLEHEFTDAMNRLETAETEIADLKKQLNDVKLKESQERNELERIATAYETISEGQESYRRHYEREINRLRTSFDLFVLDNQRRLQENVDSLGGTNADLGKAFSALRTNTKKVEILTSSKDESIKETLSELASEAKWHETQIMKVLIECEDVFRRSKFDLAKFPNIAGYKKELEEILAAERTDTRDIGHSKVEHERTIVGSIPNDKLDQKMNERKNNINKENRKAIDSGQYQGIDVFNPRIGEDTPSLSVESTTELSEPSSFSFEKPDTSYDNGHLDNGQNGSADASSKRKQSGRRRQRRRKHSRKVSQNE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.44
3 0.43
4 0.44
5 0.44
6 0.45
7 0.41
8 0.38
9 0.37
10 0.36
11 0.36
12 0.33
13 0.32
14 0.28
15 0.32
16 0.32
17 0.29
18 0.2
19 0.16
20 0.18
21 0.18
22 0.19
23 0.16
24 0.15
25 0.16
26 0.16
27 0.17
28 0.16
29 0.17
30 0.24
31 0.25
32 0.25
33 0.25
34 0.26
35 0.3
36 0.38
37 0.47
38 0.47
39 0.53
40 0.55
41 0.59
42 0.6
43 0.57
44 0.48
45 0.41
46 0.38
47 0.33
48 0.31
49 0.28
50 0.28
51 0.27
52 0.27
53 0.29
54 0.23
55 0.21
56 0.23
57 0.21
58 0.21
59 0.23
60 0.27
61 0.23
62 0.27
63 0.32
64 0.38
65 0.41
66 0.42
67 0.47
68 0.46
69 0.51
70 0.55
71 0.55
72 0.55
73 0.57
74 0.58
75 0.5
76 0.46
77 0.38
78 0.31
79 0.28
80 0.21
81 0.15
82 0.12
83 0.11
84 0.11
85 0.11
86 0.12
87 0.13
88 0.12
89 0.11
90 0.12
91 0.15
92 0.15
93 0.15
94 0.16
95 0.13
96 0.14
97 0.16
98 0.19
99 0.22
100 0.28
101 0.3
102 0.35
103 0.39
104 0.4
105 0.46
106 0.47
107 0.44
108 0.45
109 0.46
110 0.43
111 0.41
112 0.38
113 0.31
114 0.27
115 0.25
116 0.18
117 0.15
118 0.12
119 0.08
120 0.08
121 0.09
122 0.08
123 0.07
124 0.06
125 0.07
126 0.07
127 0.12
128 0.13
129 0.16
130 0.24
131 0.25
132 0.26
133 0.31
134 0.39
135 0.42
136 0.52
137 0.56
138 0.54
139 0.57
140 0.56
141 0.53
142 0.46
143 0.42
144 0.32
145 0.23
146 0.19
147 0.16
148 0.19
149 0.24
150 0.22
151 0.21
152 0.21
153 0.22
154 0.22
155 0.23
156 0.21
157 0.17
158 0.18
159 0.17
160 0.17
161 0.15
162 0.13
163 0.13
164 0.11
165 0.07
166 0.06
167 0.05
168 0.04
169 0.05
170 0.04
171 0.04
172 0.05
173 0.05
174 0.05
175 0.07
176 0.08
177 0.15
178 0.2
179 0.22
180 0.23
181 0.24
182 0.25
183 0.23
184 0.26
185 0.22
186 0.21
187 0.22
188 0.23
189 0.23
190 0.23
191 0.23
192 0.19
193 0.19
194 0.18
195 0.15
196 0.13
197 0.12
198 0.12
199 0.11
200 0.11
201 0.09
202 0.08
203 0.08
204 0.08
205 0.08
206 0.09
207 0.1
208 0.1
209 0.12
210 0.12
211 0.12
212 0.17
213 0.18
214 0.16
215 0.16
216 0.17
217 0.14
218 0.14
219 0.14
220 0.11
221 0.11
222 0.13
223 0.14
224 0.14
225 0.16
226 0.15
227 0.2
228 0.23
229 0.25
230 0.33
231 0.37
232 0.43
233 0.42
234 0.41
235 0.41
236 0.38
237 0.35
238 0.27
239 0.26
240 0.21
241 0.21
242 0.21
243 0.16
244 0.15
245 0.15
246 0.14
247 0.12
248 0.12
249 0.11
250 0.11
251 0.12
252 0.13
253 0.13
254 0.12
255 0.11
256 0.15
257 0.18
258 0.19
259 0.23
260 0.21
261 0.24
262 0.32
263 0.33
264 0.28
265 0.27
266 0.26
267 0.23
268 0.24
269 0.23
270 0.16
271 0.16
272 0.18
273 0.19
274 0.19
275 0.19
276 0.18
277 0.18
278 0.23
279 0.26
280 0.32
281 0.4
282 0.48
283 0.54
284 0.58
285 0.65
286 0.7
287 0.75
288 0.75
289 0.76
290 0.75
291 0.75
292 0.8
293 0.73
294 0.66
295 0.57
296 0.51
297 0.5
298 0.44
299 0.38
300 0.33
301 0.31
302 0.29
303 0.28
304 0.25
305 0.17
306 0.16
307 0.15
308 0.13
309 0.13
310 0.13
311 0.14
312 0.14
313 0.17
314 0.17
315 0.19
316 0.18
317 0.19
318 0.19
319 0.17
320 0.17
321 0.13
322 0.14
323 0.12
324 0.11
325 0.1
326 0.1
327 0.11
328 0.12
329 0.12
330 0.11
331 0.15
332 0.15
333 0.15
334 0.21
335 0.2
336 0.23
337 0.25
338 0.27
339 0.27
340 0.3
341 0.33
342 0.3
343 0.34
344 0.31
345 0.3
346 0.28
347 0.25
348 0.25
349 0.23
350 0.2
351 0.15
352 0.15
353 0.15
354 0.13
355 0.14
356 0.14
357 0.2
358 0.24
359 0.28
360 0.35
361 0.4
362 0.5
363 0.59
364 0.67
365 0.72
366 0.78
367 0.86
368 0.9
369 0.95
370 0.96
371 0.97
372 0.97
373 0.97
374 0.97
375 0.96