Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0XCQ0

Protein Details
Accession A0A4U0XCQ0    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
189-210LDLSKDKYVKQPKKKKAGAAAGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
198-225KQPKKKKAGAAAGGKAGGASKKKKAAAA
238-256EKGKGKGKAAAKGKGRAKK
Subcellular Location(s) mito 19.5, cyto_mito 12.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008921  DNA_pol3_clamp-load_cplx_C  
IPR013725  DNA_replication_fac_RFC1_C  
Gene Ontology GO:0005663  C:DNA replication factor C complex  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003689  F:DNA clamp loader activity  
GO:0006260  P:DNA replication  
Pfam View protein in Pfam  
PF08519  RFC1  
Amino Acid Sequences MFAFVRPASFIYGSLAGHGQTRFTAWLRKNSNQSKLVRMVKEIQGHMRLRVSADRHEVRQTYLPLMYERLIKRLRVEGKEAVPEVIELMDSYFLTKDDWEAIHELGVGEADWERAENKIETQAKATFTRLYNQQSHPLPFTKASRVLALKRAPAKERPDLEEALEESADEAGDAAEAAAAAEANEEEDLDLSKDKYVKQPKKKKAGAAAGGKAGGASKKKKAAAASKDEEEEEDEEEEKGKGKGKAAAKGKGRAKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.18
3 0.14
4 0.17
5 0.17
6 0.14
7 0.12
8 0.14
9 0.16
10 0.17
11 0.26
12 0.27
13 0.36
14 0.43
15 0.5
16 0.58
17 0.63
18 0.69
19 0.68
20 0.67
21 0.65
22 0.67
23 0.68
24 0.59
25 0.55
26 0.52
27 0.5
28 0.53
29 0.48
30 0.45
31 0.45
32 0.44
33 0.43
34 0.39
35 0.34
36 0.3
37 0.33
38 0.31
39 0.28
40 0.35
41 0.36
42 0.36
43 0.41
44 0.39
45 0.37
46 0.39
47 0.36
48 0.3
49 0.28
50 0.27
51 0.22
52 0.23
53 0.21
54 0.23
55 0.22
56 0.26
57 0.27
58 0.27
59 0.28
60 0.35
61 0.4
62 0.36
63 0.41
64 0.39
65 0.39
66 0.41
67 0.39
68 0.31
69 0.24
70 0.21
71 0.16
72 0.11
73 0.08
74 0.05
75 0.04
76 0.05
77 0.04
78 0.05
79 0.05
80 0.05
81 0.06
82 0.06
83 0.06
84 0.07
85 0.08
86 0.09
87 0.1
88 0.1
89 0.09
90 0.09
91 0.09
92 0.07
93 0.06
94 0.05
95 0.04
96 0.04
97 0.04
98 0.03
99 0.04
100 0.04
101 0.05
102 0.07
103 0.07
104 0.07
105 0.15
106 0.17
107 0.17
108 0.2
109 0.21
110 0.22
111 0.23
112 0.24
113 0.2
114 0.18
115 0.21
116 0.23
117 0.25
118 0.27
119 0.28
120 0.33
121 0.32
122 0.33
123 0.32
124 0.29
125 0.26
126 0.24
127 0.25
128 0.22
129 0.23
130 0.22
131 0.23
132 0.25
133 0.25
134 0.29
135 0.29
136 0.3
137 0.32
138 0.34
139 0.34
140 0.37
141 0.41
142 0.41
143 0.42
144 0.42
145 0.4
146 0.38
147 0.35
148 0.31
149 0.26
150 0.2
151 0.16
152 0.12
153 0.09
154 0.08
155 0.07
156 0.05
157 0.04
158 0.03
159 0.03
160 0.03
161 0.02
162 0.02
163 0.02
164 0.02
165 0.02
166 0.02
167 0.02
168 0.03
169 0.03
170 0.03
171 0.03
172 0.03
173 0.03
174 0.04
175 0.05
176 0.06
177 0.07
178 0.07
179 0.09
180 0.11
181 0.13
182 0.22
183 0.33
184 0.42
185 0.52
186 0.63
187 0.71
188 0.8
189 0.84
190 0.82
191 0.8
192 0.8
193 0.77
194 0.74
195 0.67
196 0.58
197 0.52
198 0.45
199 0.35
200 0.27
201 0.22
202 0.21
203 0.23
204 0.27
205 0.34
206 0.37
207 0.4
208 0.46
209 0.52
210 0.55
211 0.59
212 0.59
213 0.56
214 0.55
215 0.52
216 0.46
217 0.39
218 0.31
219 0.23
220 0.19
221 0.16
222 0.15
223 0.15
224 0.15
225 0.14
226 0.14
227 0.18
228 0.19
229 0.22
230 0.3
231 0.34
232 0.43
233 0.49
234 0.56
235 0.57
236 0.64