Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0Y1W4

Protein Details
Accession A0A4U0Y1W4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
639-661LTIENKRLKRRLRRYERLHDSHLBasic
953-974STEGPRKRPKLSHGRNTRSSVCHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto 6, cysk 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR018554  FRQ  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0004386  F:helicase activity  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0007623  P:circadian rhythm  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF09421  FRQ  
PF00271  Helicase_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd18787  SF2_C_DEAD  
Amino Acid Sequences MSGATAVYSTAMLEEQKAQPYNSMKGRLQQPLLQALEKKGYGYMTPVQEKVLTQLPSFTSDCLVRAKTGTGKTIAFLLPSLHSVLTSRNTRAGEVSILIVSPTRELAMQIKAECDMLTSELKPAVECHTAFGGTAKDRYLKAFLNGKPTVLVATPGRLNDYLSDRYVAEKFNNLHTLILDEADTMLEAGFLPAITEILRRLPPKSNGWQGMCFSATMPPKIKPVLSKVLRADHAEISTVDPNETPTIEQVDQYSAIIPKISDTFSSLAALIAQERQRSPDALKAIIFGTTANGVGLLYDLFKNLLGREINVFELHSRLSQPARTRTTEEFKKAASGLMFASDVIGRGMDFPNVDLVIQVGLPSNGEQYVHRVGRTARAGNQGRAVILLTDREKYFLAVNRHLPIKPYTLDISSTAAQATPPIEQAFIGVEESAKSKAYQAYLGFNKSFTKQLRLDNVGLVALANEYAGAMGCPEPPVIDKSVVGKMGLRGTHGLNVGIVQKGPNPGRHQGGGGASNGGPRRPREAPNGGQSNGGAGMNGGAGGRRGATWAWPSLKARAREGSGESSSAEAWFERSNNAVREQGASFSDDEPPFFMRHSSSSETSLGARSNVHPDFGTGLMQLGTDESSAGVFRSIIDDLTIENKRLKRRLRRYERLHDSHLAEEKLFEVRIHDLPAEKKRELEEILRTFAANLGRKPESGFPSNGDEGVPPMLQAHKATLSRAKDSAYASMPNSATMTESAKKRLAVNRLEQLFTGRGPGNLGHQQPLQQQEVSRIAAHADRSELEKQGQRTRNEGAREARIMAHDSDDPKQDSSDDASSGLQAPAETTIGQQVFAERGRNQPAPEQWPTRTHDLDPHRAQQPRENMAYFRHLGFSPLADRVPEEGHGWIYLNLLINMAQLHTLNVTVEFVRKALGEYSTQLELSSDGRKVRWNGGRLASRVSSESEGCDPSSTEGPRKRPKLSHGRNTRSSVCNARQAQDPAVSRPQADHRSLAYSPTLSHRMAAGEESYSSSDADHRVAETLPPRFVQILHGAEARRRSRTASHKQTVATRPSNSPPSELPPARGFRPCTHDGQEDDDSDADGEMSTSPESPGAFTLSPAPLPIHLPSADSDDEYEEEGSDDSDAESDSSLDFLAAARQADPESIRAQERAYDAHMAERLAEEVPGG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.18
3 0.25
4 0.27
5 0.27
6 0.32
7 0.37
8 0.43
9 0.45
10 0.48
11 0.44
12 0.5
13 0.57
14 0.58
15 0.58
16 0.54
17 0.52
18 0.52
19 0.53
20 0.49
21 0.45
22 0.4
23 0.42
24 0.38
25 0.34
26 0.27
27 0.26
28 0.22
29 0.24
30 0.27
31 0.29
32 0.33
33 0.33
34 0.33
35 0.33
36 0.33
37 0.32
38 0.32
39 0.26
40 0.23
41 0.26
42 0.26
43 0.29
44 0.3
45 0.27
46 0.23
47 0.22
48 0.24
49 0.25
50 0.25
51 0.21
52 0.22
53 0.25
54 0.29
55 0.32
56 0.34
57 0.32
58 0.31
59 0.3
60 0.33
61 0.29
62 0.23
63 0.2
64 0.18
65 0.15
66 0.16
67 0.17
68 0.13
69 0.13
70 0.13
71 0.17
72 0.22
73 0.26
74 0.27
75 0.31
76 0.32
77 0.32
78 0.34
79 0.31
80 0.26
81 0.22
82 0.21
83 0.16
84 0.15
85 0.14
86 0.13
87 0.11
88 0.1
89 0.09
90 0.08
91 0.08
92 0.1
93 0.14
94 0.18
95 0.21
96 0.21
97 0.21
98 0.22
99 0.22
100 0.2
101 0.17
102 0.13
103 0.12
104 0.15
105 0.14
106 0.16
107 0.17
108 0.18
109 0.17
110 0.17
111 0.2
112 0.22
113 0.21
114 0.22
115 0.22
116 0.22
117 0.21
118 0.22
119 0.21
120 0.18
121 0.2
122 0.19
123 0.21
124 0.22
125 0.25
126 0.27
127 0.25
128 0.29
129 0.36
130 0.37
131 0.42
132 0.42
133 0.4
134 0.36
135 0.34
136 0.29
137 0.21
138 0.22
139 0.14
140 0.17
141 0.19
142 0.18
143 0.21
144 0.2
145 0.2
146 0.2
147 0.25
148 0.24
149 0.23
150 0.25
151 0.21
152 0.25
153 0.26
154 0.25
155 0.21
156 0.24
157 0.25
158 0.29
159 0.33
160 0.3
161 0.28
162 0.26
163 0.26
164 0.2
165 0.19
166 0.13
167 0.09
168 0.08
169 0.08
170 0.07
171 0.05
172 0.05
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.05
181 0.05
182 0.06
183 0.07
184 0.11
185 0.16
186 0.17
187 0.21
188 0.29
189 0.34
190 0.4
191 0.48
192 0.53
193 0.56
194 0.58
195 0.58
196 0.51
197 0.49
198 0.42
199 0.34
200 0.25
201 0.24
202 0.24
203 0.25
204 0.26
205 0.25
206 0.28
207 0.3
208 0.32
209 0.3
210 0.34
211 0.39
212 0.4
213 0.45
214 0.45
215 0.49
216 0.5
217 0.48
218 0.45
219 0.37
220 0.34
221 0.29
222 0.25
223 0.23
224 0.24
225 0.21
226 0.18
227 0.15
228 0.17
229 0.16
230 0.16
231 0.13
232 0.11
233 0.16
234 0.16
235 0.16
236 0.15
237 0.16
238 0.16
239 0.16
240 0.16
241 0.12
242 0.12
243 0.12
244 0.11
245 0.1
246 0.12
247 0.13
248 0.11
249 0.13
250 0.13
251 0.14
252 0.15
253 0.13
254 0.11
255 0.1
256 0.1
257 0.08
258 0.12
259 0.14
260 0.15
261 0.16
262 0.19
263 0.2
264 0.22
265 0.23
266 0.24
267 0.25
268 0.24
269 0.24
270 0.22
271 0.2
272 0.19
273 0.17
274 0.11
275 0.09
276 0.08
277 0.08
278 0.06
279 0.06
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.04
284 0.05
285 0.05
286 0.05
287 0.06
288 0.07
289 0.07
290 0.07
291 0.12
292 0.11
293 0.12
294 0.14
295 0.15
296 0.16
297 0.16
298 0.16
299 0.12
300 0.12
301 0.12
302 0.11
303 0.11
304 0.12
305 0.14
306 0.19
307 0.25
308 0.32
309 0.36
310 0.38
311 0.42
312 0.45
313 0.52
314 0.54
315 0.53
316 0.46
317 0.41
318 0.41
319 0.37
320 0.33
321 0.24
322 0.18
323 0.13
324 0.12
325 0.12
326 0.09
327 0.1
328 0.08
329 0.08
330 0.06
331 0.06
332 0.05
333 0.07
334 0.07
335 0.08
336 0.08
337 0.07
338 0.09
339 0.09
340 0.09
341 0.07
342 0.06
343 0.06
344 0.06
345 0.06
346 0.05
347 0.04
348 0.05
349 0.05
350 0.06
351 0.06
352 0.07
353 0.07
354 0.11
355 0.18
356 0.19
357 0.18
358 0.2
359 0.2
360 0.27
361 0.31
362 0.3
363 0.27
364 0.35
365 0.39
366 0.38
367 0.4
368 0.34
369 0.29
370 0.27
371 0.23
372 0.13
373 0.11
374 0.13
375 0.11
376 0.13
377 0.13
378 0.14
379 0.14
380 0.14
381 0.17
382 0.2
383 0.24
384 0.26
385 0.3
386 0.31
387 0.34
388 0.33
389 0.32
390 0.29
391 0.27
392 0.23
393 0.22
394 0.21
395 0.19
396 0.2
397 0.18
398 0.19
399 0.16
400 0.16
401 0.13
402 0.11
403 0.1
404 0.1
405 0.1
406 0.07
407 0.08
408 0.08
409 0.08
410 0.08
411 0.08
412 0.08
413 0.07
414 0.07
415 0.05
416 0.05
417 0.06
418 0.07
419 0.08
420 0.07
421 0.07
422 0.09
423 0.11
424 0.12
425 0.15
426 0.15
427 0.21
428 0.23
429 0.26
430 0.24
431 0.23
432 0.24
433 0.22
434 0.27
435 0.21
436 0.25
437 0.26
438 0.31
439 0.37
440 0.39
441 0.39
442 0.33
443 0.32
444 0.25
445 0.21
446 0.16
447 0.09
448 0.05
449 0.04
450 0.03
451 0.03
452 0.02
453 0.02
454 0.02
455 0.02
456 0.03
457 0.03
458 0.04
459 0.05
460 0.05
461 0.05
462 0.06
463 0.08
464 0.1
465 0.1
466 0.1
467 0.13
468 0.15
469 0.15
470 0.14
471 0.13
472 0.13
473 0.16
474 0.15
475 0.13
476 0.13
477 0.13
478 0.16
479 0.15
480 0.13
481 0.1
482 0.11
483 0.11
484 0.1
485 0.09
486 0.07
487 0.08
488 0.14
489 0.16
490 0.19
491 0.22
492 0.25
493 0.27
494 0.28
495 0.26
496 0.23
497 0.23
498 0.2
499 0.16
500 0.14
501 0.12
502 0.14
503 0.14
504 0.14
505 0.14
506 0.14
507 0.19
508 0.22
509 0.26
510 0.3
511 0.36
512 0.39
513 0.45
514 0.48
515 0.43
516 0.4
517 0.36
518 0.29
519 0.22
520 0.18
521 0.09
522 0.05
523 0.05
524 0.04
525 0.04
526 0.04
527 0.03
528 0.03
529 0.03
530 0.04
531 0.03
532 0.04
533 0.04
534 0.06
535 0.08
536 0.11
537 0.13
538 0.15
539 0.17
540 0.23
541 0.28
542 0.28
543 0.29
544 0.28
545 0.27
546 0.27
547 0.28
548 0.25
549 0.21
550 0.19
551 0.17
552 0.15
553 0.14
554 0.12
555 0.1
556 0.05
557 0.06
558 0.07
559 0.07
560 0.07
561 0.08
562 0.11
563 0.13
564 0.14
565 0.14
566 0.14
567 0.16
568 0.15
569 0.15
570 0.13
571 0.12
572 0.12
573 0.11
574 0.15
575 0.13
576 0.13
577 0.13
578 0.13
579 0.13
580 0.12
581 0.12
582 0.08
583 0.1
584 0.14
585 0.16
586 0.16
587 0.18
588 0.19
589 0.19
590 0.18
591 0.18
592 0.14
593 0.11
594 0.11
595 0.1
596 0.15
597 0.15
598 0.15
599 0.13
600 0.13
601 0.14
602 0.13
603 0.13
604 0.07
605 0.07
606 0.06
607 0.06
608 0.06
609 0.04
610 0.04
611 0.04
612 0.04
613 0.03
614 0.03
615 0.04
616 0.04
617 0.04
618 0.03
619 0.04
620 0.05
621 0.05
622 0.05
623 0.05
624 0.05
625 0.06
626 0.11
627 0.11
628 0.11
629 0.15
630 0.19
631 0.24
632 0.31
633 0.39
634 0.45
635 0.55
636 0.65
637 0.72
638 0.78
639 0.83
640 0.86
641 0.88
642 0.82
643 0.75
644 0.68
645 0.59
646 0.52
647 0.47
648 0.37
649 0.27
650 0.22
651 0.18
652 0.15
653 0.14
654 0.1
655 0.08
656 0.1
657 0.11
658 0.12
659 0.12
660 0.13
661 0.18
662 0.25
663 0.29
664 0.26
665 0.26
666 0.27
667 0.29
668 0.29
669 0.27
670 0.28
671 0.25
672 0.27
673 0.26
674 0.24
675 0.22
676 0.22
677 0.24
678 0.18
679 0.17
680 0.2
681 0.2
682 0.21
683 0.23
684 0.25
685 0.24
686 0.25
687 0.25
688 0.23
689 0.27
690 0.27
691 0.25
692 0.2
693 0.16
694 0.13
695 0.14
696 0.11
697 0.07
698 0.07
699 0.08
700 0.08
701 0.09
702 0.09
703 0.12
704 0.12
705 0.14
706 0.19
707 0.21
708 0.23
709 0.23
710 0.23
711 0.22
712 0.23
713 0.24
714 0.2
715 0.2
716 0.18
717 0.22
718 0.2
719 0.18
720 0.17
721 0.14
722 0.13
723 0.11
724 0.14
725 0.14
726 0.16
727 0.19
728 0.21
729 0.22
730 0.26
731 0.31
732 0.35
733 0.35
734 0.39
735 0.43
736 0.43
737 0.42
738 0.38
739 0.35
740 0.28
741 0.23
742 0.21
743 0.14
744 0.13
745 0.13
746 0.14
747 0.16
748 0.2
749 0.21
750 0.2
751 0.2
752 0.23
753 0.25
754 0.29
755 0.26
756 0.22
757 0.21
758 0.24
759 0.26
760 0.24
761 0.21
762 0.17
763 0.16
764 0.17
765 0.17
766 0.13
767 0.11
768 0.11
769 0.14
770 0.16
771 0.16
772 0.18
773 0.21
774 0.24
775 0.33
776 0.39
777 0.37
778 0.39
779 0.42
780 0.45
781 0.44
782 0.45
783 0.4
784 0.37
785 0.37
786 0.34
787 0.3
788 0.26
789 0.25
790 0.2
791 0.18
792 0.16
793 0.18
794 0.19
795 0.22
796 0.22
797 0.2
798 0.2
799 0.18
800 0.17
801 0.18
802 0.17
803 0.14
804 0.14
805 0.13
806 0.13
807 0.14
808 0.13
809 0.09
810 0.08
811 0.07
812 0.07
813 0.08
814 0.07
815 0.06
816 0.11
817 0.1
818 0.11
819 0.1
820 0.1
821 0.12
822 0.13
823 0.17
824 0.14
825 0.19
826 0.25
827 0.27
828 0.28
829 0.31
830 0.35
831 0.38
832 0.42
833 0.42
834 0.39
835 0.42
836 0.45
837 0.45
838 0.42
839 0.37
840 0.39
841 0.41
842 0.48
843 0.47
844 0.48
845 0.49
846 0.51
847 0.52
848 0.5
849 0.52
850 0.48
851 0.47
852 0.43
853 0.38
854 0.37
855 0.41
856 0.35
857 0.27
858 0.24
859 0.21
860 0.21
861 0.2
862 0.19
863 0.16
864 0.16
865 0.16
866 0.13
867 0.14
868 0.14
869 0.15
870 0.14
871 0.13
872 0.12
873 0.12
874 0.12
875 0.13
876 0.11
877 0.1
878 0.11
879 0.11
880 0.1
881 0.1
882 0.09
883 0.09
884 0.09
885 0.08
886 0.07
887 0.06
888 0.06
889 0.06
890 0.07
891 0.06
892 0.07
893 0.08
894 0.07
895 0.09
896 0.09
897 0.09
898 0.1
899 0.09
900 0.1
901 0.11
902 0.12
903 0.12
904 0.13
905 0.16
906 0.17
907 0.16
908 0.15
909 0.14
910 0.13
911 0.14
912 0.15
913 0.15
914 0.16
915 0.17
916 0.23
917 0.25
918 0.33
919 0.38
920 0.38
921 0.41
922 0.48
923 0.53
924 0.49
925 0.51
926 0.43
927 0.37
928 0.35
929 0.32
930 0.26
931 0.21
932 0.22
933 0.2
934 0.2
935 0.19
936 0.18
937 0.16
938 0.16
939 0.22
940 0.22
941 0.27
942 0.33
943 0.42
944 0.51
945 0.56
946 0.61
947 0.61
948 0.68
949 0.72
950 0.75
951 0.76
952 0.78
953 0.81
954 0.81
955 0.81
956 0.78
957 0.7
958 0.65
959 0.63
960 0.57
961 0.58
962 0.53
963 0.5
964 0.5
965 0.49
966 0.46
967 0.44
968 0.42
969 0.38
970 0.42
971 0.4
972 0.33
973 0.34
974 0.39
975 0.39
976 0.39
977 0.37
978 0.32
979 0.36
980 0.36
981 0.35
982 0.29
983 0.23
984 0.22
985 0.25
986 0.28
987 0.23
988 0.23
989 0.22
990 0.21
991 0.2
992 0.21
993 0.16
994 0.12
995 0.13
996 0.14
997 0.14
998 0.13
999 0.13
1000 0.12
1001 0.13
1002 0.14
1003 0.15
1004 0.14
1005 0.13
1006 0.14
1007 0.14
1008 0.18
1009 0.22
1010 0.24
1011 0.24
1012 0.24
1013 0.25
1014 0.24
1015 0.24
1016 0.24
1017 0.25
1018 0.24
1019 0.25
1020 0.28
1021 0.27
1022 0.3
1023 0.39
1024 0.38
1025 0.36
1026 0.34
1027 0.35
1028 0.41
1029 0.5
1030 0.58
1031 0.6
1032 0.63
1033 0.63
1034 0.65
1035 0.7
1036 0.7
1037 0.68
1038 0.63
1039 0.56
1040 0.55
1041 0.57
1042 0.62
1043 0.54
1044 0.5
1045 0.44
1046 0.44
1047 0.5
1048 0.46
1049 0.44
1050 0.44
1051 0.47
1052 0.47
1053 0.5
1054 0.49
1055 0.44
1056 0.51
1057 0.5
1058 0.49
1059 0.5
1060 0.51
1061 0.47
1062 0.49
1063 0.47
1064 0.4
1065 0.38
1066 0.32
1067 0.27
1068 0.22
1069 0.19
1070 0.13
1071 0.09
1072 0.08
1073 0.06
1074 0.08
1075 0.08
1076 0.08
1077 0.09
1078 0.1
1079 0.1
1080 0.11
1081 0.12
1082 0.15
1083 0.14
1084 0.14
1085 0.19
1086 0.19
1087 0.19
1088 0.19
1089 0.19
1090 0.16
1091 0.19
1092 0.19
1093 0.19
1094 0.17
1095 0.18
1096 0.18
1097 0.23
1098 0.22
1099 0.2
1100 0.2
1101 0.18
1102 0.19
1103 0.19
1104 0.18
1105 0.13
1106 0.13
1107 0.12
1108 0.11
1109 0.09
1110 0.09
1111 0.07
1112 0.07
1113 0.08
1114 0.07
1115 0.07
1116 0.07
1117 0.07
1118 0.07
1119 0.07
1120 0.06
1121 0.06
1122 0.06
1123 0.09
1124 0.1
1125 0.11
1126 0.11
1127 0.13
1128 0.14
1129 0.17
1130 0.18
1131 0.18
1132 0.18
1133 0.21
1134 0.23
1135 0.23
1136 0.23
1137 0.25
1138 0.26
1139 0.26
1140 0.26
1141 0.28
1142 0.25
1143 0.29
1144 0.3
1145 0.26
1146 0.24
1147 0.22
1148 0.21
1149 0.16